125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0088 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007954  Sden_0088  phospholipid/glycerol acyltransferase  100 
 
 
184 aa  382  1e-105  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4235  phospholipid/glycerol acyltransferase  69.06 
 
 
187 aa  274  6e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0119  phospholipid/glycerol acyltransferase  69.06 
 
 
187 aa  274  6e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0123  phospholipid/glycerol acyltransferase  69.06 
 
 
187 aa  274  6e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0119  phospholipid/glycerol acyltransferase  68.48 
 
 
186 aa  273  8e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0963438 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0124  phospholipid/glycerol acyltransferase  69.06 
 
 
187 aa  273  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0119  phospholipid/glycerol acyltransferase  68.48 
 
 
186 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0038904 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0114  phospholipid/glycerol acyltransferase  68.48 
 
 
186 aa  271  3e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.602427 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0120  phospholipid/glycerol acyltransferase  67.4 
 
 
187 aa  270  1e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.179228  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0123  acyltransferase family protein  66.3 
 
 
186 aa  266  1e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3750  phospholipid/glycerol acyltransferase  65.75 
 
 
183 aa  263  2e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00144073 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4156  phospholipid/glycerol acyltransferase  65.19 
 
 
183 aa  259  1e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3949  phospholipid/glycerol acyltransferase  63.39 
 
 
184 aa  259  2e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3630  acyltransferase family protein  64.64 
 
 
183 aa  253  1.0000000000000001e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4832  phospholipid/glycerol acyltransferase  62.43 
 
 
214 aa  252  2.0000000000000002e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4440  phospholipid/glycerol acyltransferase  62.09 
 
 
189 aa  252  3e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.439449  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2191  hypothetical protein  53.07 
 
 
187 aa  208  4e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2219  hypothetical protein  52.51 
 
 
187 aa  204  4e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01012  Acyltransferase family protein  40.91 
 
 
211 aa  157  8e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.501742  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3447  phospholipid/glycerol acyltransferase  42.44 
 
 
188 aa  150  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04680  hypothetical protein  41.36 
 
 
192 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4020  phospholipid/glycerol acyltransferase  39.16 
 
 
210 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4196  phospholipid/glycerol acyltransferase  41.72 
 
 
192 aa  139  3e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0451  hypothetical protein  41.36 
 
 
192 aa  138  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2802  phospholipid/glycerol acyltransferase  40.11 
 
 
183 aa  136  1e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.606207  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0561  phospholipid/glycerol acyltransferase  39.66 
 
 
203 aa  129  2.0000000000000002e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.233184  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2093  hypothetical protein  36.36 
 
 
244 aa  127  7.000000000000001e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.821432  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02764  acyltransferase  38.79 
 
 
209 aa  126  2.0000000000000002e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.229427  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2245  phospholipid/glycerol acyltransferase  38.73 
 
 
208 aa  125  3e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0239387  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2413  phospholipid/glycerol acyltransferase  37.21 
 
 
244 aa  122  2e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2166  phospholipid/glycerol acyltransferase  34.62 
 
 
205 aa  122  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.881132  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37610  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  37.71 
 
 
203 aa  122  4e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0488  phospholipid/glycerol acyltransferase  36.16 
 
 
188 aa  121  6e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0168  hypothetical protein  38.51 
 
 
209 aa  120  9.999999999999999e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0148  phospholipid/glycerol acyltransferase  38.51 
 
 
209 aa  120  9.999999999999999e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1355  acyltransferase, putative  37.21 
 
 
176 aa  119  1.9999999999999998e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2670  phospholipid/glycerol acyltransferase  36.93 
 
 
204 aa  120  1.9999999999999998e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0440614 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1051  hypothetical protein  35.43 
 
 
191 aa  119  1.9999999999999998e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.961359 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0180  phospholipid/glycerol acyltransferase  36.26 
 
 
200 aa  119  3e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1712  phospholipid/glycerol acyltransferase  34.62 
 
 
205 aa  119  3e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.10462  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2254  phospholipid/glycerol acyltransferase  35.03 
 
 
221 aa  118  4.9999999999999996e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1033  phospholipid/glycerol acyltransferase  39.02 
 
 
210 aa  116  9.999999999999999e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2518  pseudouridine synthase, RluD  35.5 
 
 
201 aa  115  3e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0958  phospholipid/glycerol acyltransferase  37.14 
 
 
198 aa  115  3e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.138738 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4324  phospholipid/glycerol acyltransferase  40.24 
 
 
200 aa  112  3e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.270681 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1783  phospholipid/glycerol acyltransferase  37.27 
 
 
173 aa  112  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.175926  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3457  phospholipid/glycerol acyltransferase  37.57 
 
 
199 aa  107  1e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0632621 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3737  phospholipid/glycerol acyltransferase  35.47 
 
 
193 aa  103  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0472119 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0677  phospholipid/glycerol acyltransferase  33.52 
 
 
185 aa  102  3e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2517  phospholipid/glycerol acyltransferase  35.62 
 
 
201 aa  99.4  3e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.38065  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0134  phospholipid/glycerol acyltransferase  35.19 
 
 
191 aa  98.2  7e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22670  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  31.82 
 
 
197 aa  93.2  2e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0997  acyltransferase family protein  34.46 
 
 
290 aa  87  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.195621  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0195  phospholipid/glycerol acyltransferase  35.14 
 
 
172 aa  86.7  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.379626  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1325  phospholipid/glycerol acyltransferase  30.23 
 
 
203 aa  85.1  5e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3386  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  32.62 
 
 
196 aa  55.5  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000418539  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1470  phospholipid/glycerol acyltransferase  35.04 
 
 
211 aa  54.7  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.151456  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0644  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  33.63 
 
 
235 aa  53.5  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.54251e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1330  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferases  31.94 
 
 
193 aa  52.8  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000270973  normal  0.0367266 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13850  acyltransferase  27.32 
 
 
259 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.523346 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0026  phospholipid/glycerol acyltransferase  30.94 
 
 
214 aa  51.6  0.000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1453  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  29.15 
 
 
239 aa  51.2  0.000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2270  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  26.35 
 
 
239 aa  50.8  0.000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000119102  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2086  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  28.69 
 
 
239 aa  50.4  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000321882  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2026  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  28.69 
 
 
239 aa  50.4  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  5.718399999999999e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2024  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  29.51 
 
 
239 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000109948  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2240  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  28.69 
 
 
239 aa  50.4  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000101928  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2352  putative 1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  29.51 
 
 
239 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000249527  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2223  putative 1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  29.51 
 
 
239 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000296239  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3101  putative 1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  29.51 
 
 
239 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000192666  hitchhiker  6.55431e-16 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2267  putative 1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  28.69 
 
 
239 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.1632600000000004e-34 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3400  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.93 
 
 
254 aa  49.7  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0508  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  30.34 
 
 
257 aa  49.3  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.216043 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2065  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  27.87 
 
 
239 aa  48.9  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000189855  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0333  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  26.32 
 
 
245 aa  47.8  0.00009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3426  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  28.57 
 
 
245 aa  47.8  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2101  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  31.01 
 
 
194 aa  47.4  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.428689 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0780  acyltransferase family protein  30.89 
 
 
246 aa  47  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.220724  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2828  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  35.51 
 
 
244 aa  47  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3227  phospholipid/glycerol acyltransferase  38.36 
 
 
252 aa  47  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000000123121  hitchhiker  0.0000289484 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1643  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  27.42 
 
 
241 aa  46.6  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000254888  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1202  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  30.47 
 
 
212 aa  45.4  0.0004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.11547  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0340  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  26.35 
 
 
245 aa  45.4  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1844  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  26.44 
 
 
237 aa  44.7  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03651  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  29.66 
 
 
241 aa  44.7  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1925  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.57 
 
 
237 aa  44.3  0.0009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0681343  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14270  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  28.97 
 
 
244 aa  44.3  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.201477  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002416  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  28.29 
 
 
241 aa  43.9  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4258  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  27.33 
 
 
245 aa  44.3  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0010355 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0582  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  28.67 
 
 
243 aa  43.1  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0275  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  28.67 
 
 
243 aa  43.1  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0663  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  28.67 
 
 
243 aa  43.1  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3423  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  25.71 
 
 
245 aa  43.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13770  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  33.7 
 
 
235 aa  43.1  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0506817  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5999  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.67 
 
 
233 aa  42.7  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4653  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  32.26 
 
 
493 aa  42.7  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3040  phospholipid/glycerol acyltransferase  33.33 
 
 
236 aa  42.7  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3866  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  26.01 
 
 
237 aa  42.4  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.102376 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2213  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  28.14 
 
 
261 aa  42.7  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0965505  hitchhiker  0.00600362 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3354  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  25.71 
 
 
245 aa  42.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>