244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0074 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_0074  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 141 aa  293  7e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4183  thioesterase superfamily protein  81.43 
 
 		 142 aa  246  7e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4456  thioesterase superfamily protein  77.14 
 
 		 144 aa  236  8e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4857  thioesterase superfamily protein  73.57 
 
 		 143 aa  230  6e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0084  thioesterase superfamily protein  76.43 
 
 		 154 aa  229  7.000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0081  thioesterase superfamily protein  76.43 
 
 		 154 aa  229  1e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0080  thioesterase superfamily protein  77.14 
 
 		 150 aa  229  1e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0066  thioesterase superfamily protein  77.14 
 
 		 146 aa  228  2e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4269  thioesterase superfamily protein  78.42 
 
 		 150 aa  228  3e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0080  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  76.43 
 
 		 142 aa  227  4e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0086  thioesterase superfamily protein  77.14 
 
 		 150 aa  227  5e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0083  thioesterase superfamily protein  77.14 
 
 		 142 aa  227  5e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0085  thioesterase superfamily protein  75.71 
 
 		 154 aa  226  1e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3968  thioesterase superfamily protein  70.71 
 
 		 140 aa  218  3e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3772  thioesterase superfamily protein  66.91 
 
 		 142 aa  199  9.999999999999999e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.478707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1527  hypothetical protein  59.57 
 
 		 149 aa  184  4e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0073  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  62.2 
 
 		 144 aa  175  2e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001138  predicted thioesterase  56.03 
 
 		 150 aa  174  4e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06649  thioesterase  57.58 
 
 		 150 aa  171  2.9999999999999996e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2836  thioesterase superfamily protein  40.43 
 
 		 146 aa  137  6e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5175  thioesterase superfamily protein  35.11 
 
 		 139 aa  103  6e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.641217 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0092  hypothetical protein  34.65 
 
 		 161 aa  98.2  4e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.190576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0101  thioesterase superfamily protein  37.5 
 
 		 161 aa  96.3  1e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2261  thioesterase superfamily protein  42.73 
 
 		 161 aa  95.9  2e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1167  acyl-CoA thioesterase  32.85 
 
 		 156 aa  92.8  1e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.862365 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1238  thioesterase superfamily protein  32.35 
 
 		 156 aa  89.4  2e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.546619  normal  0.661464 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1657  thioesterase superfamily protein  32.77 
 
 		 139 aa  84.3  5e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA04590  conserved hypothetical protein  32.82 
 
 		 291 aa  83.2  0.000000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1937  thioesterase superfamily protein  30.95 
 
 		 136 aa  81.6  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00538677  normal  0.170289 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01695  Predicted thioesterase  25.37 
 
 		 137 aa  78.6  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.431774  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2882  thioesterase superfamily protein  34.11 
 
 		 149 aa  79  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000187556  decreased coverage  0.00358104 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1523  thioesterase superfamily protein  33.59 
 
 		 134 aa  78.6  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.64895  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2925  hypothetical protein  29.31 
 
 		 130 aa  74.3  0.0000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2779  hypothetical protein  29.31 
 
 		 130 aa  72.4  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3014  thioesterase superfamily protein  28.93 
 
 		 139 aa  72  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.80515  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3983  thioesterase superfamily protein  32.77 
 
 		 139 aa  71.6  0.000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.813194  normal  0.0353277 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7358  thioesterase superfamily protein  32.77 
 
 		 167 aa  70.9  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.249412 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2763  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 		 132 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1364  putative thioesterase  28.35 
 
 		 134 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1565  thioesterase superfamily protein  28.23 
 
 		 142 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2611  thioesterase family protein  30 
 
 		 147 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1926  thioesterase superfamily protein  29.03 
 
 		 136 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.187016 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1898  thioesterase superfamily protein  29.6 
 
 		 140 aa  69.3  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.292723 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3287  thioesterase superfamily protein  28.91 
 
 		 140 aa  69.3  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0335707  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1441  thioesterase superfamily protein  29.37 
 
 		 132 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27910  hypothetical protein  32.26 
 
 		 134 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2356  hypothetical protein  32.26 
 
 		 134 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2677  thioesterase superfamily protein  32.76 
 
 		 140 aa  67.4  0.00000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0981  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 		 146 aa  67  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1463  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 		 146 aa  67  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4608  thioesterase superfamily protein  27.78 
 
 		 143 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00844353  normal  0.865959 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1388  thioesterase superfamily protein  27.78 
 
 		 143 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1348  thioesterase superfamily protein  27.78 
 
 		 143 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2415  thioesterase superfamily protein  27.13 
 
 		 136 aa  66.6  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.334268  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4309  thioesterase superfamily protein  31.36 
 
 		 156 aa  66.2  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.515868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1786  thioesterase superfamily protein  38.75 
 
 		 213 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3704  thioesterase superfamily protein  28.68 
 
 		 153 aa  63.9  0.0000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3395  thioesterase superfamily protein  27.91 
 
 		 153 aa  63.5  0.0000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.435542  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03599  conserved hypothetical protein  31.16 
 
 		 294 aa  62.8  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0978  thioesterase superfamily protein  30.08 
 
 		 131 aa  62.8  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3586  thioesterase superfamily protein  28.68 
 
 		 153 aa  62.8  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2065  thioesterase superfamily protein  42.65 
 
 		 147 aa  62.4  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0110405 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2551  thioesterase superfamily protein  30.6 
 
 		 145 aa  61.2  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.571355 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1117  thioesterase superfamily protein  26.12 
 
 		 135 aa  60.8  0.000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.235483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04892  putative thioesterase  26.87 
 
 		 134 aa  60.5  0.000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000899406  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7357  thioesterase superfamily protein  30.4 
 
 		 137 aa  60.1  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3160  thioesterase superfamily protein  24.49 
 
 		 180 aa  59.7  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0944  thioesterase family protein  29.17 
 
 		 143 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1693  thioesterase family protein  29.17 
 
 		 159 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1114  thioesterase family protein  29.17 
 
 		 143 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0224064  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1871  thioesterase family protein  29.17 
 
 		 143 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0652374  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1863  thioesterase  23.19 
 
 		 147 aa  59.3  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000102626  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1717  thioesterase family protein  29.17 
 
 		 143 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1556  thioesterase family protein  29.17 
 
 		 143 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000380649  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0217  thioesterase family protein  29.17 
 
 		 143 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0748592  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1151  thioesterase superfamily protein  25.83 
 
 		 133 aa  57.8  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.758431  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2347  thioesterase superfamily protein  26.72 
 
 		 132 aa  58.2  0.00000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.754827  normal  0.0192186 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1267  thioesterase superfamily protein  39.39 
 
 		 133 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.384152  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0277  thioesterase superfamily protein  25.95 
 
 		 143 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0872113 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0815  thioesterase superfamily protein  26.4 
 
 		 139 aa  57.4  0.00000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.545456  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4411  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  25.95 
 
 		 148 aa  56.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4250  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  25.95 
 
 		 148 aa  56.6  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4751  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  25.95 
 
 		 148 aa  56.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1624  thioesterase superfamily protein  26.56 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4640  thioesterase superfamily protein  24.24 
 
 		 132 aa  56.6  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  hitchhiker  0.00279104 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1590  thioesterase superfamily protein  43.75 
 
 		 135 aa  56.6  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.359349  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4627  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  25.95 
 
 		 148 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4642  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase, putative  25.95 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4262  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  25.95 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2819  thioesterase superfamily protein  27.91 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.453856  normal  0.118463 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0612  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  25.55 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10164  hypothetical protein  24.64 
 
 		 151 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4643  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  25.95 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0499649  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0966  thioesterase superfamily protein  28.91 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07490  predicted thioesterase  34.04 
 
 		 155 aa  55.1  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.736623 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4343  thioesterase superfamily protein  25.95 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1882  thioesterase superfamily protein  26.36 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2367  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  26.79 
 
 		 115 aa  54.7  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3214  thioesterase superfamily protein  25.6 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0191  thioesterase superfamily protein  22.3 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>