More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0070 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_0070  ABC transporter related  100 
 
 		 280 aa  565  1e-160  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4188  ABC transporter related  69.31 
 
 		 280 aa  382  1e-105  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4862  ABC transporter related  66.55 
 
 		 280 aa  375  1e-103  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3975  ABC transporter related  66.08 
 
 		 289 aa  375  1e-103  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3778  ABC transporter-related protein  66.55 
 
 		 283 aa  372  1e-102  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0076  ABC transporter related  67.02 
 
 		 287 aa  366  1e-100  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0074  ABC transporter related  67.02 
 
 		 287 aa  367  1e-100  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0078  ABC transporter related  67.02 
 
 		 287 aa  366  1e-100  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000932983 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0073  ABC transporter, ATP-binding protein  65.97 
 
 		 287 aa  363  2e-99  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0059  ABC transporter related  66.43 
 
 		 287 aa  360  1e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3573  ABC transporter, ATP-binding protein  62.37 
 
 		 284 aa  356  1.9999999999999998e-97  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0073  ABC transporter related  65 
 
 		 287 aa  355  3.9999999999999996e-97  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4276  ABC transporter related  65.36 
 
 		 287 aa  355  3.9999999999999996e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0075  ABC transporter related  65.36 
 
 		 287 aa  354  1e-96  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0078  ABC transporter related  65 
 
 		 287 aa  353  1e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3247  ABC transporter related  35.31 
 
 		 299 aa  158  1e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4865  ABC transporter, ATP-binding protein  36.69 
 
 		 295 aa  156  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0163871 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0881  ABC transporter related protein  38.08 
 
 		 297 aa  153  4e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.90656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2604  ABC transporter, ATP-binding protein  36.47 
 
 		 307 aa  152  5.9999999999999996e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2233  ABC transporter related  36.47 
 
 		 307 aa  152  5.9999999999999996e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.382121 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0446  ABC transporter, ATP-binding protein  32.73 
 
 		 287 aa  149  3e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0856868  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0437  ABC transporter  32.73 
 
 		 287 aa  150  3e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.595645  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0982  ABC transporter related  40.55 
 
 		 295 aa  148  1.0000000000000001e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.690635  hitchhiker  0.00232341 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1664  ABC transporter related  30.6 
 
 		 298 aa  144  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1901  ABC transporter, ATP-binding protein  33.03 
 
 		 282 aa  142  4e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4125  ABC transporter ATP-binding protein  29.67 
 
 		 290 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00364186  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3975  ABC transporter, ATP-binding protein  29.67 
 
 		 290 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00176043  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4444  ABC transporter ATP-binding protein  29.67 
 
 		 290 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000946464  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4241  ABC transporter, ATP-binding protein  29.67 
 
 		 290 aa  139  6e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0997  ABC transporter related  30.8 
 
 		 291 aa  138  8.999999999999999e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.437755 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3965  ABC transporter, ATP-binding protein  29.27 
 
 		 290 aa  137  1e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000372577  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2909  ABC transporter-related protein  30.88 
 
 		 290 aa  137  2e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000366915  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4332  ABC transporter, ATP-binding protein  29.27 
 
 		 290 aa  137  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000223791  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1164  ABC transporter related  30.47 
 
 		 302 aa  137  2e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000328478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1780  ABC transporter related  31.19 
 
 		 293 aa  137  2e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.09165  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4076  ABC transporter related  28.86 
 
 		 290 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00294748  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4298  ABC transporter, ATP-binding protein  28.86 
 
 		 290 aa  136  5e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000106879  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0454  ABC transporter related  33.18 
 
 		 286 aa  136  5e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4352  ABC transporter, ATP-binding protein  28.86 
 
 		 290 aa  135  5e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000295734  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2163  ABC transporter, ATP-binding protein  30.38 
 
 		 288 aa  135  5e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2970  ABC transporter related protein  34.36 
 
 		 283 aa  135  9e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.020184  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0372  ABC transporter related  31.43 
 
 		 265 aa  135  9e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1383  putative ABC transporter ATP-binding protein; RBL01943  32.26 
 
 		 288 aa  134  9.999999999999999e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0134891  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2249  ABC transporter related  27.37 
 
 		 299 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1722  ABC transporter related  28.62 
 
 		 293 aa  133  3e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0662  ABC transporter related  30.17 
 
 		 274 aa  133  3e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2605  ABC transporter related  27.72 
 
 		 299 aa  132  6e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2228  ABC transporter related protein  35.78 
 
 		 287 aa  132  6.999999999999999e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.367776  hitchhiker  0.00839495 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3651  ABC transporter ATP-binding protein  33.95 
 
 		 283 aa  130  3e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.058748  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0790  multidrug ABC transporter ATPase  36.44 
 
 		 306 aa  130  3e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0731  ABC transporter related  28.63 
 
 		 299 aa  129  4.0000000000000003e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0987759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6592  ABC transporter, ATP-binding protein  36.07 
 
 		 294 aa  129  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.363745  normal  0.761698 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1982  ABC transporter ATP-binding protein  30 
 
 		 288 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0191587  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2130  ABC transporter ATP-binding protein  30 
 
 		 288 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.718107  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3242  ABC transporter related  30.34 
 
 		 299 aa  129  8.000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6370  ABC transporter related  34.87 
 
 		 283 aa  128  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2159  ABC transporter related  28.99 
 
 		 293 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.548665  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3662  ABC transporter ATP-binding protein  33.95 
 
 		 283 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00862592  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2749  ABC transporter related  35.84 
 
 		 247 aa  127  2.0000000000000002e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.795075 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1051  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  31.48 
 
 		 302 aa  127  3e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3908  ABC transporter related  27.38 
 
 		 293 aa  125  9e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4147  ABC transporter, ATP-binding protein  28 
 
 		 293 aa  125  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0963  ABC transporter related  29.96 
 
 		 284 aa  125  1e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.63233  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1548  hypothetical protein  30.8 
 
 		 286 aa  124  1e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.626494  decreased coverage  0.00000786067 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4187  ABC transporter, ATP-binding protein  28.36 
 
 		 293 aa  124  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.15215  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0223  ABC transporter related  33.01 
 
 		 286 aa  124  2e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.862249  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0117  ABC transporter related  31.02 
 
 		 292 aa  123  3e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000514692  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0189  ABC transporter related  30.22 
 
 		 313 aa  123  3e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0323  ABC transporter related  30.4 
 
 		 302 aa  123  3e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.309009 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1477  ABC transporter, ATP-binding protein  29.47 
 
 		 304 aa  123  4e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.106136  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3988  ABC transporter ATP-binding protein  27.64 
 
 		 293 aa  123  4e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0928721  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4299  ABC transporter ATP-binding protein  27.64 
 
 		 293 aa  123  4e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.170218  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1051  ABC transporter, ATP-binding protein  28.36 
 
 		 293 aa  123  4e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00592378 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1186  ABC transporter related  27.75 
 
 		 290 aa  122  7e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3818  ABC transporter, ATP-binding protein  27.27 
 
 		 293 aa  122  8e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3834  ABC transporter, ATP-binding protein  27.64 
 
 		 293 aa  122  8e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.754725  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1341  ABC transporter related  39.05 
 
 		 317 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2306  ABC transporter related  34.6 
 
 		 296 aa  121  9.999999999999999e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000106852  hitchhiker  0.000394376 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4099  ABC transporter, ATP-binding protein  27.64 
 
 		 293 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.52273e-30 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2768  ABC transporter, ATP-binding protein  27.27 
 
 		 290 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3078  ABC transporter, ATP-binding protein  27.27 
 
 		 290 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3061  ABC transporter, ATP-binding protein  27.27 
 
 		 290 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4217  ABC transporter related  35.87 
 
 		 299 aa  121  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.175008  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2806  ABC transporter, ATP-binding protein  27.27 
 
 		 290 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00781434  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2548  ABC transporter related  31.82 
 
 		 232 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0517142  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4210  ABC transporter, ATP-binding protein  26.59 
 
 		 293 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000828015  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1222  ABC transporter related protein  29.96 
 
 		 297 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0276303  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1721  ABC transporter, ATP-binding protein  32.23 
 
 		 307 aa  120  3e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.847764  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1574  ABC transporter related  28.57 
 
 		 301 aa  120  3e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000043454  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0147  ABC transporter, ATP-binding protein  36.57 
 
 		 309 aa  120  3.9999999999999996e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000626362  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4023  ABC transporter ATP-binding protein  34.62 
 
 		 299 aa  119  7e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000993933 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1344  ABC transporter related  33.94 
 
 		 309 aa  119  7e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.331631  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1918  ABC transporter related  30.41 
 
 		 232 aa  118  9e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2834  ABC transporter ATP-binding protein  26.82 
 
 		 290 aa  118  9e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.287864  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1078  ABC transporter-related protein  29.17 
 
 		 232 aa  118  9e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3048  ABC transporter ATP-binding protein  26.82 
 
 		 290 aa  118  9e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.805565  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2559  ABC transporter related  31.35 
 
 		 309 aa  118  9e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3231  ABC transporter-related protein  30.8 
 
 		 312 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1757  ABC transporter related  34.48 
 
 		 306 aa  118  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000332956  normal  0.307261 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0539  ABC transporter related  29.83 
 
 		 284 aa  117  9.999999999999999e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000208242  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>