202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0068 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_0068  peptidase S33, prolyl aminopeptidase  100 
 
 		 521 aa  1079    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3977  TAP domain-containing protein  65.45 
 
 		 532 aa  642    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.692071  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0071  alpha/beta fold family hydrolase  61.97 
 
 		 539 aa  629  1e-179  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0072  TAP domain-containing protein  61.97 
 
 		 535 aa  625  1e-178  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0074  TAP domain-containing protein  60.66 
 
 		 535 aa  624  1e-177  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.523955 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0076  TAP domain-containing protein  60.86 
 
 		 539 aa  623  1e-177  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000458817 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0073  TAP domain protein  61.12 
 
 		 545 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0057  TAP domain-containing protein  58.68 
 
 		 546 aa  614  9.999999999999999e-175  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0071  TAP domain-containing protein  60.91 
 
 		 538 aa  609  1e-173  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0076  TAP domain-containing protein  61.62 
 
 		 549 aa  610  1e-173  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4278  TAP domain-containing protein  60.91 
 
 		 540 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3780  TAP domain-containing protein  61.94 
 
 		 517 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4460  TAP domain-containing protein  61.29 
 
 		 533 aa  598  1e-170  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.726615 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4190  TAP domain-containing protein  58.32 
 
 		 519 aa  598  1e-170  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4864  TAP domain-containing protein  56.42 
 
 		 527 aa  588  1e-167  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3575  alpha/beta fold family hydrolase  56.86 
 
 		 507 aa  554  1e-156  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0722  alpha/beta fold family hydrolase  36.26 
 
 		 480 aa  329  7e-89  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1447  TAP domain-containing protein  32.23 
 
 		 511 aa  216  9.999999999999999e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1502  proteinase  32.03 
 
 		 513 aa  214  2.9999999999999995e-54  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02798  cysteine proteinase  32.24 
 
 		 533 aa  208  2e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3874  TAP domain protein  31.42 
 
 		 508 aa  207  4e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3801  cysteine proteinase  32.09 
 
 		 502 aa  181  4e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0184346 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2826  TAP domain-containing protein  29.14 
 
 		 688 aa  179  1e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000578424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2538  TAP domain-containing protein  28.19 
 
 		 693 aa  177  4e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00112565 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0270  TAP domain-containing protein  29.81 
 
 		 670 aa  175  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.948991  hitchhiker  0.000175368 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0265  TAP domain-containing protein  29.33 
 
 		 669 aa  170  7e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0441544  normal  0.0338675 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0079  TAP domain-containing protein  28.64 
 
 		 485 aa  139  2e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2103  alpha/beta hydrolase fold  23.26 
 
 		 645 aa  136  9.999999999999999e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0418615  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0123  TAP domain protein  30.68 
 
 		 656 aa  125  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3647  alpha/beta fold family hydrolase  28.82 
 
 		 680 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.42321 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4546  beta-lactamase  30.16 
 
 		 740 aa  117  3.9999999999999997e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.207661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0998  alpha/beta hydrolase fold protein  25.6 
 
 		 675 aa  114  5e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3206  TAP domain-containing protein  25.15 
 
 		 475 aa  113  9e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.812713  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0147  alpha/beta fold family hydrolase  25.82 
 
 		 668 aa  110  5e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.557879  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24850  alpha/beta hydrolase family protein  26.64 
 
 		 515 aa  105  2e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6275  TAP domain-containing protein  24.27 
 
 		 476 aa  101  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4728  TAP domain-containing protein  23.9 
 
 		 506 aa  101  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2145  alpha/beta hydrolase fold protein  25.71 
 
 		 477 aa  98.6  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.157065 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3351  alpha/beta hydrolase fold protein  24.57 
 
 		 489 aa  99  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.172382  normal  0.0371725 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12253  exported protease  26.81 
 
 		 520 aa  99  2e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.499354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7044  hypothetical protein  24.75 
 
 		 522 aa  98.6  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.393484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2436  alpha/beta hydrolase fold protein  23.45 
 
 		 484 aa  97.8  5e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.425173  normal  0.0661487 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2780  tripeptidyl-peptidase B  25.05 
 
 		 500 aa  97.4  6e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.834234  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2979  alpha/beta hydrolase fold protein  21.96 
 
 		 480 aa  94.7  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.171473 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0118  alpha/beta hydrolase fold  26.29 
 
 		 503 aa  94.7  3e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.742968  normal  0.120342 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2906  alpha/beta hydrolase fold  30.36 
 
 		 505 aa  94.4  4e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.834545 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4537  TAP domain protein  25.18 
 
 		 506 aa  94  6e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2904  TAP domain-containing protein  25.6 
 
 		 495 aa  92.8  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.411145  normal  0.553721 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2416  TAP domain-containing protein  26.25 
 
 		 505 aa  92  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000258971  normal  0.152884 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2509  hypothetical protein  29.86 
 
 		 750 aa  91.3  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.689132 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2523  TAP domain protein  24.57 
 
 		 564 aa  89.7  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0464  TAP domain-containing protein  26.97 
 
 		 499 aa  88.2  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000978752 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3330  tripeptidyl-peptidase B  24.33 
 
 		 511 aa  88.2  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0380101  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3392  tripeptidyl-peptidase B  24.33 
 
 		 511 aa  88.2  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.365277 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3341  tripeptidyl-peptidase B  24.33 
 
 		 511 aa  88.2  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.175683  normal  0.108557 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4956  TAP domain protein  23.88 
 
 		 507 aa  88.2  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.562249  normal  0.30314 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3329  tripeptidyl-peptidase B  25.2 
 
 		 533 aa  87.8  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.224727  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3391  tripeptidyl-peptidase B  25.2 
 
 		 508 aa  87.8  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.349155 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3340  tripeptidyl-peptidase B  25.2 
 
 		 508 aa  87.8  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.478437  normal  0.109915 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1652  hypothetical protein  31.86 
 
 		 494 aa  86.7  9e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.916188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3599  TAP domain-containing protein  27.95 
 
 		 505 aa  86.3  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3464  TAP domain-containing protein  30.48 
 
 		 527 aa  85.1  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.660985  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2321  TAP domain-containing protein  23.54 
 
 		 612 aa  84.3  0.000000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.279811  normal  0.349466 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6091  TAP domain-containing protein  27.88 
 
 		 504 aa  82.8  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6093  TAP domain-containing protein  24.81 
 
 		 505 aa  82.8  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0715  TAP domain-containing protein  24.03 
 
 		 524 aa  82.4  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2767  TAP domain-containing protein  28.52 
 
 		 546 aa  82.4  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7303  hypothetical protein  31.66 
 
 		 532 aa  81.6  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1183  TAP domain-containing protein  22.64 
 
 		 495 aa  80.5  0.00000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1192  alpha/beta hydrolase fold  25.97 
 
 		 490 aa  80.1  0.00000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0577  TAP domain protein  25 
 
 		 508 aa  80.1  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.677702  hitchhiker  0.00225183 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4414  hypothetical protein  29.11 
 
 		 505 aa  79.3  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.694835  normal  0.0446961 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2331  putative protease  27.39 
 
 		 300 aa  79.3  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1042  TAP domain-containing protein  24.84 
 
 		 535 aa  79  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0225624 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0907  TAP domain protein  26.24 
 
 		 521 aa  78.2  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.996179  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5024  TAP domain protein  23.47 
 
 		 571 aa  78.2  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.412323  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0881  TAP domain protein  29.05 
 
 		 545 aa  77.4  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.478786  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2192  TAP domain protein  23.04 
 
 		 518 aa  77  0.0000000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12252  exported protease  26.73 
 
 		 520 aa  77  0.0000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.212366  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3616  TAP domain protein  27.55 
 
 		 546 aa  77  0.0000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.812667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32570  alpha/beta hydrolase family protein  23.39 
 
 		 541 aa  76.6  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0388  TAP domain-containing protein  27.23 
 
 		 521 aa  76.6  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3650  TAP domain-containing protein  28.25 
 
 		 475 aa  76.6  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0804319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4117  TAP domain-containing protein  28.06 
 
 		 556 aa  75.5  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3600  TAP domain-containing protein  23.33 
 
 		 516 aa  74.7  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.601455 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3316  TAP domain protein  29.65 
 
 		 484 aa  74.7  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0266981  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0491  TAP domain protein  23.77 
 
 		 515 aa  74.7  0.000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00557817 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3059  hypothetical protein  31.05 
 
 		 459 aa  73.6  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.253596 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0472  alpha/beta hydrolase fold protein  26.04 
 
 		 525 aa  73.6  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.562012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4710  TAP domain protein  23.37 
 
 		 504 aa  73.2  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0644  hypothetical protein  27.78 
 
 		 597 aa  72.8  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0356  TAP domain protein  24.36 
 
 		 523 aa  73.2  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3257  TAP domain-containing protein  26.64 
 
 		 499 aa  72.8  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.590122  normal  0.324088 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3369  TAP domain protein  23.11 
 
 		 547 aa  71.6  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0557447  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2687  TAP domain protein  24.03 
 
 		 643 aa  70.9  0.00000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.589968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2254  TAP domain-containing protein  25.51 
 
 		 486 aa  70.9  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.267716 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0663  TAP domain protein  24.55 
 
 		 525 aa  70.5  0.00000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.419459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2729  TAP domain protein  24.43 
 
 		 515 aa  70.1  0.00000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.196617  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07410  alpha/beta hydrolase family protein  23.02 
 
 		 525 aa  70.1  0.00000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2970  TAP domain protein  23.9 
 
 		 542 aa  70.1  0.00000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.32712  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>