256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0053 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_0053  secretory protein YscJ/FliF  100 
 
 		 439 aa  898    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.259806  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2271  flagellar M-ring protein FliF  28.5 
 
 		 502 aa  140  3.9999999999999997e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2408  flagellar MS-ring protein  27.37 
 
 		 521 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0771  flagellar MS-ring protein  28.1 
 
 		 524 aa  125  1e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107573 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2947  flagellar MS-ring protein  29.15 
 
 		 571 aa  124  2e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.532246 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4180  flagellar MS-ring protein  28.35 
 
 		 583 aa  124  3e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0640  flagellar MS-ring protein  26.57 
 
 		 559 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.378287  normal  0.0508656 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0629  flagellar MS-ring protein  26.57 
 
 		 559 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.252464 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0608  flagellar MS-ring protein  26.73 
 
 		 570 aa  121  3e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.269822  normal  0.0804297 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1652  flagellar M-ring protein FliF  25.72 
 
 		 529 aa  120  4.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.202816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0790  flagellar M-ring protein FliF  27.13 
 
 		 533 aa  120  6e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0592385  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2287  flagellar M-ring protein FliF  28 
 
 		 539 aa  120  6e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.890637 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0269  flagellar M-ring protein FliF  27.88 
 
 		 551 aa  119  9.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16890  flagellar M-ring protein FliF  25.46 
 
 		 519 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3426  flagellar M-ring protein FliF  24.72 
 
 		 528 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2649  flagellar MS-ring protein  28.53 
 
 		 526 aa  118  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0166  flagellar MS-ring protein  26.63 
 
 		 600 aa  117  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.710453 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6413  flagellar MS-ring protein  25 
 
 		 587 aa  117  5e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.340617 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3029  flagellar M-ring protein FliF  27.59 
 
 		 537 aa  117  5e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1345  flagellar MS-ring protein  26.44 
 
 		 567 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1012  flagellar MS-ring protein  28.31 
 
 		 547 aa  115  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.357656  normal  0.896317 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3061  flagellar MS-ring protein  24.69 
 
 		 587 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3922  flagellar M-ring protein FliF  24.94 
 
 		 522 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0548473 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3083  flagellar MS-ring protein  25.39 
 
 		 587 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.869845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2450  flagellar MS-ring protein  25.39 
 
 		 587 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0278408  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3838  flagellar M-ring protein FliF  25.38 
 
 		 523 aa  114  3e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3064  flagellar MS-ring protein  25.39 
 
 		 587 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112496  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0353  flagellar M-ring protein FliF  25.57 
 
 		 539 aa  113  5e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1969  flagellar FliF M-ring protein  27.27 
 
 		 552 aa  113  5e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3770  flagellar MS-ring protein  26.37 
 
 		 603 aa  113  6e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.448077 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1765  flagellar MS-ring protein  25.2 
 
 		 518 aa  112  9e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.604512  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1681  flagellar MS-ring protein  26.11 
 
 		 546 aa  112  9e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0101093 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2359  flagellar FliF M-ring protein  26.51 
 
 		 567 aa  111  3e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1337  flagellar M-ring protein FliF  26.67 
 
 		 524 aa  110  6e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.435471  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2668  flagellar M-ring protein FliF  24.94 
 
 		 538 aa  110  6e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2931  flagellar MS-ring protein  25 
 
 		 593 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1192  flagellar M-ring protein FliF  26.39 
 
 		 519 aa  109  9.000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0410  flagellar M-ring protein FliF  26.3 
 
 		 527 aa  108  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0172  flagellar M-ring protein FliF  26.25 
 
 		 500 aa  109  1e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2975  flagellar MS-ring protein  24.61 
 
 		 587 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.260042 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0200  flagellar MS-ring protein  23.95 
 
 		 677 aa  109  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3109  flagellar MS-ring protein  24.61 
 
 		 587 aa  109  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3112  flagellar FliF M-ring protein  24.68 
 
 		 527 aa  107  3e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0417  flagellar MS-ring protein  23.53 
 
 		 598 aa  107  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0664966  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2184  flagellar M-ring protein FliF  26.4 
 
 		 552 aa  107  4e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.239668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0222  flagellar MS-ring protein  23.53 
 
 		 598 aa  107  4e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.88735  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0234  flagellar MS-ring protein  23.53 
 
 		 598 aa  107  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3458  flagellar MS-ring protein  28.49 
 
 		 547 aa  107  5e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.408666  normal  0.0942955 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3846  flagellar MS-ring protein  26.73 
 
 		 532 aa  107  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.184331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0424  flagellar M-ring protein FliF  27.54 
 
 		 530 aa  107  6e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4068  flagellar MS-ring protein  28.46 
 
 		 568 aa  106  7e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.979947  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0286  flagellar MS-ring protein  26.95 
 
 		 545 aa  106  7e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.722484  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0978  flagellar M-ring protein FliF  29.09 
 
 		 527 aa  105  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.102842  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4213  flagellar M-ring protein FliF  24.49 
 
 		 525 aa  105  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3304  flagellar M-ring protein FliF  24.56 
 
 		 530 aa  105  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1573  flagellar M-ring protein FliF  24.87 
 
 		 547 aa  104  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2044  flagellar MS-ring protein  27.19 
 
 		 498 aa  104  3e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04973  flagellar MS-ring protein  25.9 
 
 		 583 aa  104  3e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3281  flagellar MS-ring protein  23.28 
 
 		 598 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.481316  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3400  flagellar MS-ring protein  23.28 
 
 		 598 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1129  flagellar MS-ring protein  30.59 
 
 		 553 aa  104  4e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2946  flagellar MS-ring protein  23.28 
 
 		 598 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.945796  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2142  flagellar MS-ring protein  23.28 
 
 		 598 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0077  flagellar MS-ring protein  24.43 
 
 		 570 aa  103  5e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4731  flagellar M-ring protein FliF  23.42 
 
 		 611 aa  103  5e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.722282  normal  0.0591496 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3654  flagellar M-ring protein FliF  23.42 
 
 		 611 aa  103  5e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.238137 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001186  flagellar M-ring protein FliF  25.06 
 
 		 569 aa  103  6e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1016  flagellar M-ring protein FliF  25.12 
 
 		 576 aa  103  8e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0337  flagellar MS-ring protein  29.34 
 
 		 563 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.548751  normal  0.254086 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1457  flagellar MS-ring protein  26.46 
 
 		 538 aa  102  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0688  flagellar MS-ring protein  23.94 
 
 		 512 aa  101  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2188  flagellar MS-ring protein  24.69 
 
 		 556 aa  101  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0691  flagellar MS-ring protein  27.44 
 
 		 540 aa  101  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0305  flagellar MS-ring protein  28.96 
 
 		 563 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.243877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1272  flagellar MS-ring protein  24.83 
 
 		 532 aa  101  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.000378845  normal  0.795293 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1876  flagellar MS-ring protein  27.08 
 
 		 535 aa  101  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.518241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0242  flagellar MS-ring protein  29.07 
 
 		 557 aa  101  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.176969 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2559  flagellar M-ring protein FliF  27.46 
 
 		 533 aa  101  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00858256  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5126  flagellar MS-ring protein  25.41 
 
 		 539 aa  100  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0640822 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0599  flagellar MS-ring protein  26.26 
 
 		 541 aa  100  6e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5059  flagellar MS-ring protein  25.3 
 
 		 525 aa  100  7e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.48638  normal  0.955868 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1394  flagellar M-ring protein FliF  27.46 
 
 		 533 aa  99.4  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0124624  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2714  flagellar MS-ring protein  24.22 
 
 		 552 aa  99  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.586754 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0569  flagellar M-ring protein FliF  25.33 
 
 		 504 aa  99.4  1e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1704  flagellar MS-ring protein  24.57 
 
 		 552 aa  99.4  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.120721 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3225  flagellar MS-ring protein  23.88 
 
 		 572 aa  99.4  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0389507  normal  0.995627 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3264  flagellar MS-ring protein  26.54 
 
 		 558 aa  99.4  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6057  flagellar MS-ring protein  23.94 
 
 		 541 aa  99  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0632593  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1146  flagellar MS-ring protein  28.29 
 
 		 580 aa  98.6  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.29702  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1591  flagellar MS-ring protein  26.49 
 
 		 565 aa  98.6  2e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1051  flagellar MS-ring protein  28.29 
 
 		 568 aa  98.6  2e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1880  flagellar MS-ring protein  23.66 
 
 		 548 aa  98.2  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.364366  normal  0.660983 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0545  flagellar MS-ring protein  25.77 
 
 		 551 aa  98.6  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0137  flagellar M-ring protein FliF  26.84 
 
 		 513 aa  98.2  3e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0472  flagellar MS-ring protein  24.94 
 
 		 566 aa  97.8  3e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1642  flagellar M-ring protein FliF  26.49 
 
 		 536 aa  97.8  3e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0112721  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0267  flagellar MS-ring protein  24.74 
 
 		 568 aa  97.8  3e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0638  flagellar M-ring protein FliF  23.63 
 
 		 566 aa  96.7  8e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1105  flagellar MS-ring protein  27.35 
 
 		 544 aa  96.7  8e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.915781 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4200  flagellar MS-ring protein  27.91 
 
 		 579 aa  95.9  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>