185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0048 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_0048  flagellar L-ring protein  100 
 
 		 187 aa  377  1e-104  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.508164  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16550  flagellar L-ring protein  32.78 
 
 		 192 aa  101  5e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000577316  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2266  flagellar L-ring protein  32.78 
 
 		 201 aa  88.2  7e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.181453  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3156  flagellar basal body L-ring protein  30.23 
 
 		 234 aa  77.8  0.00000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0449895  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2508  flagellar L-ring protein  33.12 
 
 		 229 aa  75.5  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.153573  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0269  flagellar basal body L-ring protein  29.45 
 
 		 221 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.884119 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3725  flagellar basal body L-ring protein  27.54 
 
 		 231 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3365  flagellar basal body L-ring protein  29.45 
 
 		 221 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2604  flagellar L-ring protein  33.12 
 
 		 229 aa  73.2  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.735916  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3048  flagellar L-ring protein FlgH  28.66 
 
 		 221 aa  72.8  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3945  flagellar basal body L-ring protein  26.95 
 
 		 231 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1349  flagellar L-ring protein  34.38 
 
 		 229 aa  72.4  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00261084  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1503  flagellar basal body L-ring protein  26.35 
 
 		 231 aa  71.6  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773524 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0221  flagellar basal body L-ring protein  28.3 
 
 		 221 aa  70.9  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3474  flagellar basal body L-ring protein  27.54 
 
 		 237 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.214373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0899  flagellar L-ring protein  28.48 
 
 		 224 aa  70.5  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0645  flagellar basal body L-ring protein  28.3 
 
 		 221 aa  70.9  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004167  flagellar L-ring protein FlgH  27.53 
 
 		 259 aa  70.5  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1471  flagellar basal body L-ring protein  26.35 
 
 		 231 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0240352  normal  0.68969 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4384  flagellar basal body L-ring protein  26.35 
 
 		 231 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.821893 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1941  flagellar L-ring protein FlgH  26.95 
 
 		 237 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01293  flagellar basal body L-ring protein  26.4 
 
 		 260 aa  69.3  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0262  flagellar basal body L-ring protein  30.38 
 
 		 236 aa  68.6  0.00000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2332  flagellar basal body L-ring protein  25.41 
 
 		 261 aa  68.2  0.00000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1786  flagellar basal body L-ring protein  29.75 
 
 		 261 aa  67.8  0.00000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1900  flagellar basal body L-ring protein  30.91 
 
 		 230 aa  67  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0652089 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4294  flagellar basal body L-ring protein  26.35 
 
 		 231 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.667583  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4677  flagellar basal body L-ring protein  28.57 
 
 		 221 aa  67  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00039617 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50420  flagellar basal body L-ring protein  26.22 
 
 		 231 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.664762  hitchhiker  0.000989473 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0063  flagellar basal body L-ring protein  29.88 
 
 		 220 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1770  flagellar L-ring protein  28.66 
 
 		 230 aa  65.9  0.0000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1145  flagellar L-ring protein  28.21 
 
 		 192 aa  65.9  0.0000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000678845  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2426  flagellar basal body L-ring protein  27.91 
 
 		 238 aa  65.1  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.468869 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3279  flagellar L-ring protein  29.03 
 
 		 224 aa  63.5  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3098  flagellar L-ring protein  27.37 
 
 		 232 aa  63.2  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0394  flagellar basal body L-ring protein  25.58 
 
 		 239 aa  63.5  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1427  flagellar basal body L-ring protein  26.01 
 
 		 235 aa  63.2  0.000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00360883  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2407  flagellar basal body L-ring protein  28.98 
 
 		 229 aa  62.4  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3965  flagellar basal body L-ring protein  29.7 
 
 		 220 aa  62.8  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3649  flagellar L-ring protein  27.81 
 
 		 344 aa  62.4  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.284986  normal  0.903555 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0031  flagellar L-ring protein  25.9 
 
 		 233 aa  62.8  0.000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1265  flagellar L-ring protein  27.61 
 
 		 227 aa  62.8  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.2865  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1483  flagellar basal body L-ring protein  25.75 
 
 		 236 aa  62.4  0.000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0615716  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2372  flagellar L-ring protein  26.7 
 
 		 234 aa  62.4  0.000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2312  flagellar basal body L-ring protein  29.52 
 
 		 224 aa  62  0.000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.359463 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2844  flagellar basal body L-ring protein  25 
 
 		 240 aa  62  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0173222  normal  0.127078 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1654  flagellar L-ring protein  26.35 
 
 		 223 aa  62  0.000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0433  flagellar L-ring protein  26.75 
 
 		 226 aa  62  0.000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1154  flagellar biosynthesis, basal-body outer-membrane L (lipopolysaccharide layer) ring protein  27.17 
 
 		 231 aa  61.6  0.000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2207  Hpt sensor hybrid histidine kinase  24.22 
 
 		 230 aa  61.6  0.000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3577  flagellar L-ring protein  35.48 
 
 		 283 aa  61.6  0.000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.116399  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2520  flagellar basal body L-ring protein  26.26 
 
 		 238 aa  61.2  0.000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3462  flagellar basal body L-ring protein  29.09 
 
 		 220 aa  61.2  0.000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3844  flagellar L-ring protein  27.78 
 
 		 229 aa  59.7  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0044385 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0291  flagellar basal body L-ring protein  26.92 
 
 		 235 aa  59.7  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.127273  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0596  flagellar L-ring protein  28.57 
 
 		 229 aa  59.7  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3760  flagellar L-ring protein  26.8 
 
 		 230 aa  59.3  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1223  flagellar L-ring protein  26.75 
 
 		 229 aa  59.3  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2941  flagellar basal body L-ring protein  25.9 
 
 		 224 aa  59.3  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2956  flagellar basal body L-ring protein  25.9 
 
 		 224 aa  59.3  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.656972  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2235  flagellar L-ring protein  30.07 
 
 		 193 aa  59.3  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1422  flagellar basal body L-ring protein  25.9 
 
 		 224 aa  58.9  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.474859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3094  flagellar basal body L-ring protein  25.9 
 
 		 224 aa  58.9  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3645  flagellar basal body L-ring protein  30 
 
 		 219 aa  59.3  0.00000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.651179  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0243  flagellar basal body L-ring protein  28.66 
 
 		 218 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1335  flagellar basal body L-ring protein  26.51 
 
 		 224 aa  58.5  0.00000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.599387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2591  flagellar basal body L-ring protein  27.11 
 
 		 224 aa  58.5  0.00000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3680  flagellar L-ring protein  24.4 
 
 		 232 aa  58.5  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0137828 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1265  flagellar basal body L-ring protein  26.51 
 
 		 224 aa  58.5  0.00000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0636  flagellar L-ring protein  26.95 
 
 		 235 aa  58.2  0.00000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.634416  normal  0.0843943 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0625  flagellar L-ring protein  26.95 
 
 		 235 aa  58.2  0.00000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.317328 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3243  flagellar basal body L-ring protein  26.51 
 
 		 224 aa  57.8  0.00000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4195  flagellar basal body L-ring protein  29.49 
 
 		 246 aa  57.8  0.00000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.417863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3045  flagellar basal body L-ring protein  29.94 
 
 		 250 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.737045 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0102  flagellar basal body L-ring protein  27.33 
 
 		 235 aa  57.4  0.0000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.354617  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0190  flagellar basal body L-ring protein  28.03 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1429  flagellar basal body L-ring protein  27.78 
 
 		 238 aa  57.8  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3094  flagellar basal body L-ring protein  24.72 
 
 		 230 aa  57.4  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1167  flagellar basal body L-ring protein  25.56 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0558946  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1327  flagellar basal body L-ring protein  26.51 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.821167  normal  0.0823128 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3269  flagellar basal body L-ring protein  29.94 
 
 		 250 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0710  flagellar basal body L-ring protein  29.3 
 
 		 232 aa  57.8  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.612163  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0212  flagellar basal body L-ring protein  27.59 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.144203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2918  flagellar L-ring protein  29.94 
 
 		 225 aa  57  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0212055  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2845  flagellar basal body L-ring protein  26.54 
 
 		 255 aa  56.2  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.456717  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0825  flagellar basal body L-ring protein  26.58 
 
 		 249 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0174696 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3243  flagellar basal body L-ring protein  29.3 
 
 		 250 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.233718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0395  flagellar L-ring protein  29.52 
 
 		 214 aa  57  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.11073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0603  flagellar L-ring protein  27.16 
 
 		 236 aa  57  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.754309  normal  0.243473 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1603  flagellar basal body L-ring protein  25.3 
 
 		 229 aa  56.6  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.153327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0814  flagellar basal body L-ring protein  25.64 
 
 		 234 aa  56.6  0.0000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3451  flagellar L-ring protein  25.32 
 
 		 225 aa  57  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3014  flagellar basal body L-ring protein  27.78 
 
 		 229 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.574242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04915  flagellar basal body L-ring protein  25.48 
 
 		 229 aa  57  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0638  flagellar basal body L-ring protein  28.21 
 
 		 233 aa  56.6  0.0000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.722941  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4710  flagellar basal body L-ring protein  28.21 
 
 		 246 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0294749  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1351  flagellar basal body L-ring protein  24.7 
 
 		 234 aa  57  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3038  flagellar basal body L-ring protein  27.78 
 
 		 229 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0932  flagellar L-ring protein  23.91 
 
 		 232 aa  56.2  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.315899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3019  flagellar basal body L-ring protein  27.78 
 
 		 229 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0180626  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>