209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0030 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_0030  coproporphyrinogen III oxidase  100 
 
 		 305 aa  633    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000103554  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0030  coproporphyrinogen III oxidase  84.95 
 
 		 310 aa  546  1e-154  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.210418  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0037  coproporphyrinogen III oxidase  84.11 
 
 		 323 aa  543  1e-153  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.430398  hitchhiker  0.000152839 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0033  coproporphyrinogen III oxidase  84.11 
 
 		 302 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0038  coproporphyrinogen III oxidase  84.11 
 
 		 302 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.893663  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0030  coproporphyrinogen III oxidase  83.44 
 
 		 302 aa  538  9.999999999999999e-153  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.378098  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0037  coproporphyrinogen III oxidase  83.44 
 
 		 302 aa  536  1e-151  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000149114 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0041  coproporphyrinogen III oxidase  82.78 
 
 		 302 aa  531  1e-150  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0219573  hitchhiker  0.00000553459 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0038  coproporphyrinogen III oxidase  82.45 
 
 		 302 aa  530  1e-149  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0045  coproporphyrinogen III oxidase  82.78 
 
 		 306 aa  530  1e-149  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.178865  normal  0.253632 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0035  coproporphyrinogen III oxidase  82.12 
 
 		 302 aa  530  1e-149  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.132201  hitchhiker  0.00964681 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0033  coproporphyrinogen III oxidase  82.12 
 
 		 302 aa  530  1e-149  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.011595 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3729  coproporphyrinogen III oxidase  82.33 
 
 		 303 aa  528  1e-149  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.186137  hitchhiker  0.00821912 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0042  coproporphyrinogen III oxidase  79.87 
 
 		 306 aa  518  1e-146  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0059194  normal  0.559288 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0038  coproporphyrinogen III oxidase  80.2 
 
 		 304 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.381478  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0050  coproporphyrinogen III oxidase  79.8 
 
 		 304 aa  512  1e-144  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.646189  normal  0.257858 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00383  coproporphyrinogen III oxidase  72.79 
 
 		 305 aa  478  1e-134  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002066  coproporphyrinogen III oxidase aerobic  72.13 
 
 		 305 aa  473  1e-132  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.358636  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0029  coproporphyrinogen III oxidase  73 
 
 		 307 aa  471  1e-132  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3211  Coproporphyrinogen oxidase  72.85 
 
 		 311 aa  472  1e-132  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3464  coproporphyrinogen III oxidase  74.66 
 
 		 306 aa  472  1e-132  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02336  coproporphyrinogen III oxidase  74.25 
 
 		 299 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1225  Coproporphyrinogen oxidase  73.91 
 
 		 299 aa  468  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02298  hypothetical protein  74.25 
 
 		 299 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2687  coproporphyrinogen III oxidase  75.25 
 
 		 299 aa  470  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.143173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2645  coproporphyrinogen III oxidase  74.58 
 
 		 299 aa  469  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2573  coproporphyrinogen III oxidase  73.91 
 
 		 299 aa  468  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2722  coproporphyrinogen III oxidase  73.91 
 
 		 299 aa  468  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2596  coproporphyrinogen III oxidase  74.58 
 
 		 299 aa  469  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2817  coproporphyrinogen III oxidase  74.58 
 
 		 299 aa  469  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.56731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2711  coproporphyrinogen III oxidase  74.58 
 
 		 299 aa  467  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00028  coproporphyrinogen III oxidase  75.43 
 
 		 310 aa  469  1.0000000000000001e-131  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.14394  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1243  coproporphyrinogen III oxidase  73.91 
 
 		 299 aa  468  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2808  coproporphyrinogen III oxidase  73.58 
 
 		 299 aa  466  9.999999999999999e-131  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3290  Coproporphyrinogen oxidase  72.19 
 
 		 312 aa  467  9.999999999999999e-131  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0025  coproporphyrinogen III oxidase  70.96 
 
 		 303 aa  464  1e-129  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0757  coproporphyrinogen III oxidase  71.1 
 
 		 310 aa  462  1e-129  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2591  coproporphyrinogen III oxidase  72.58 
 
 		 299 aa  461  1e-129  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2791  coproporphyrinogen III oxidase  68.42 
 
 		 304 aa  458  9.999999999999999e-129  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2784  coproporphyrinogen III oxidase  70.86 
 
 		 309 aa  459  9.999999999999999e-129  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00390735 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0993  coproporphyrinogen III oxidase  70.43 
 
 		 310 aa  459  9.999999999999999e-129  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1393  coproporphyrinogen III oxidase  70.86 
 
 		 309 aa  459  9.999999999999999e-129  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.586678  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1280  coproporphyrinogen III oxidase  70.53 
 
 		 309 aa  458  9.999999999999999e-129  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3666  coproporphyrinogen III oxidase  73.58 
 
 		 299 aa  457  1e-127  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.936359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2824  coproporphyrinogen III oxidase  68.44 
 
 		 317 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000193561  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2957  coproporphyrinogen III oxidase  71.24 
 
 		 299 aa  452  1.0000000000000001e-126  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.929595 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2465  coproporphyrinogen III oxidase  70.43 
 
 		 305 aa  449  1e-125  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00683566  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2279  Coproporphyrinogen oxidase  68.01 
 
 		 309 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.591559  normal  0.0202052 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0116  coproporphyrinogen III oxidase  69.49 
 
 		 304 aa  442  1e-123  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.998466  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1223  coproporphyrinogen III oxidase  65.54 
 
 		 311 aa  434  1e-120  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1223  coproporphyrinogen III oxidase  65.42 
 
 		 309 aa  434  1e-120  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2696  coproporphyrinogen III oxidase  63.69 
 
 		 333 aa  431  1e-120  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0480626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0047  coproporphyrinogen III oxidase  66.45 
 
 		 308 aa  431  1e-120  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3996  coproporphyrinogen III oxidase  68.15 
 
 		 312 aa  430  1e-119  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.218154  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0060  coproporphyrinogen III oxidase  66.67 
 
 		 304 aa  427  1e-118  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0017  coproporphyrinogen III oxidase  63.75 
 
 		 323 aa  422  1e-117  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.208175  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2863  coproporphyrinogen III oxidase  63.61 
 
 		 307 aa  423  1e-117  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0024  coproporphyrinogen III oxidase  64.88 
 
 		 304 aa  418  1e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3669  coproporphyrinogen III oxidase  65.66 
 
 		 298 aa  420  1e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00280  coproporphyrinogen III oxidase  65.76 
 
 		 305 aa  419  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.477574 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0170  coproporphyrinogen III oxidase, aerobic  64.65 
 
 		 304 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0022  coproporphyrinogen III oxidase  64.33 
 
 		 304 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0449808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0025  coproporphyrinogen III oxidase  65.42 
 
 		 305 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3938  coproporphyrinogen III oxidase  66.67 
 
 		 298 aa  413  1e-114  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.537037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0092  coproporphyrinogen III oxidase  64.31 
 
 		 303 aa  411  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.469648  hitchhiker  0.0000233392 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00220  coproporphyrinogen III oxidase  66.55 
 
 		 309 aa  412  1e-114  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.333342  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0089  coproporphyrinogen III oxidase  64.21 
 
 		 303 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.554189  hitchhiker  0.0000000000135583 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0073  coproporphyrinogen III oxidase  63.88 
 
 		 303 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.188544  hitchhiker  0.000371882 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0089  coproporphyrinogen III oxidase  64.55 
 
 		 303 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2634  coproporphyrinogen III oxidase  67.22 
 
 		 304 aa  410  1e-113  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0385786  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2092  Coproporphyrinogen oxidase  62.66 
 
 		 313 aa  407  1.0000000000000001e-112  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0593493  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0409  coproporphyrinogen III oxidase  59.55 
 
 		 332 aa  403  1e-111  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0203114 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03935  coproporphyrinogen III oxidase  65.31 
 
 		 299 aa  404  1e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0346  coproporphyrinogen III oxidase  61.28 
 
 		 302 aa  396  1e-109  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0017  coproporphyrinogen III oxidase  60.8 
 
 		 305 aa  393  1e-108  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0015  coproporphyrinogen III oxidase  61.28 
 
 		 331 aa  392  1e-108  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.91658  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2461  coproporphyrinogen III oxidase  60.6 
 
 		 303 aa  390  1e-107  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0061  coproporphyrinogen III oxidase  60.07 
 
 		 314 aa  387  1e-107  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0243  coproporphyrinogen III oxidase  57.42 
 
 		 336 aa  386  1e-106  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.571977  normal  0.975295 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2320  coproporphyrinogen III oxidase  60.88 
 
 		 306 aa  385  1e-106  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.216124  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0219  coproporphyrinogen III oxidase  57.74 
 
 		 336 aa  380  1e-104  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0901124 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5623  coproporphyrinogen III oxidase  58.94 
 
 		 307 aa  379  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0135  coproporphyrinogen III oxidase  59.18 
 
 		 299 aa  380  1e-104  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1684  coproporphyrinogen III oxidase  58.94 
 
 		 323 aa  378  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.254442  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2296  coproporphyrinogen III oxidase  58.94 
 
 		 323 aa  378  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.643346  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1299  coproporphyrinogen III oxidase  57.95 
 
 		 307 aa  378  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0514179 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2066  coproporphyrinogen III oxidase  56.95 
 
 		 310 aa  374  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.87254  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2319  coproporphyrinogen III oxidase  58.61 
 
 		 307 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.936275 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3261  coproporphyrinogen III oxidase  57.62 
 
 		 307 aa  376  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.77176  normal  0.974311 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0982  coproporphyrinogen III oxidase  58.61 
 
 		 307 aa  375  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0313583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1441  coproporphyrinogen III oxidase  62.13 
 
 		 302 aa  375  1e-103  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.545118  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2334  coproporphyrinogen III oxidase  58.61 
 
 		 306 aa  373  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.193122  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1339  coproporphyrinogen III oxidase  59.27 
 
 		 306 aa  373  1e-102  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2213  coproporphyrinogen III oxidase  58.94 
 
 		 306 aa  374  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0783  coproporphyrinogen III oxidase  57.48 
 
 		 303 aa  370  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00696662  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2390  coproporphyrinogen III oxidase  57.62 
 
 		 302 aa  369  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.967494  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1990  coproporphyrinogen III oxidase  57.95 
 
 		 302 aa  370  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0815567  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2192  coproporphyrinogen III oxidase  57.95 
 
 		 302 aa  367  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1013  coproporphyrinogen III oxidase  57.48 
 
 		 326 aa  367  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1730  coproporphyrinogen III oxidase  56.82 
 
 		 307 aa  366  1e-100  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.918171 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>