99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0007 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0007  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  64.43 
 
 		 911 aa  1178    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000289605 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0007  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  100 
 
 		 913 aa  1863    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1588  HAD family hydrolase  36.1 
 
 		 835 aa  491  1e-137  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.570612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1229  PKD domain-containing protein  41.82 
 
 		 675 aa  455  1.0000000000000001e-126  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04405  hypothetical protein  35.2 
 
 		 469 aa  229  2e-58  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04415  hypothetical protein  34.34 
 
 		 424 aa  229  3e-58  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0155  hypothetical protein  32.94 
 
 		 538 aa  202  3e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.781085  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04410  hypothetical protein  30.49 
 
 		 501 aa  197  6e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07181  conserved hypothetical protein  29.06 
 
 		 452 aa  155  2.9999999999999998e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.882964  normal  0.428749 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3141  protease domain-containing protein  36.53 
 
 		 1393 aa  81.6  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2474  hypothetical protein  47.32 
 
 		 826 aa  81.3  0.00000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.552746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0797  protease domain-containing protein  31.94 
 
 		 1393 aa  81.3  0.00000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0832  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.91 
 
 		 1292 aa  78.2  0.0000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0781  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39.29 
 
 		 1283 aa  75.9  0.000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.223596  hitchhiker  0.00753256 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0819  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.69 
 
 		 1286 aa  71.6  0.00000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000454384 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2564  PKD domain-containing protein  39.13 
 
 		 1107 aa  70.1  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.543991 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3395  secreted protein  25.63 
 
 		 458 aa  67.4  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.201979  normal  0.899466 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3394  secreted protein  25.7 
 
 		 470 aa  66.2  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.118882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1516  pectate lyase protein  29.51 
 
 		 1031 aa  66.2  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000206035  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3915  PKD domain-containing protein  25.77 
 
 		 713 aa  65.5  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3050  protease-associated PA  36.36 
 
 		 1220 aa  65.5  0.000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000558142  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1733  hypothetical protein  38.39 
 
 		 746 aa  64.3  0.000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.658961  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0513  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.01 
 
 		 1212 aa  63.5  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2984  glycosyl hydrolase family chitinase  41.07 
 
 		 868 aa  62  0.00000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0825  protease domain-containing protein  33.33 
 
 		 1258 aa  60.5  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.184637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06955  chitinase  41 
 
 		 855 aa  60.5  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0248  PKD domain-containing protein  28.65 
 
 		 3278 aa  60.5  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.748556 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2805  glycosyl hydrolase family chitinase  40.74 
 
 		 868 aa  60.1  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1809  putative protease  32.54 
 
 		 656 aa  60.1  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.328878  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0783  hypothetical protein  34.71 
 
 		 528 aa  59.7  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.07808  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3393  putative secreted protein  24.88 
 
 		 471 aa  59.3  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.327426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2888  glycosyl hydrolase family chitinase  40.18 
 
 		 868 aa  58.9  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02194  hypothetical protein  35.2 
 
 		 985 aa  58.9  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2974  PKD domain-containing protein  32.06 
 
 		 833 aa  58.5  0.0000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1232  PKD domain-containing protein  41.57 
 
 		 2706 aa  58.9  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4498  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  28.06 
 
 		 1225 aa  58.2  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1906  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  25.71 
 
 		 2194 aa  58.2  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4998  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  28.91 
 
 		 1800 aa  57  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.329522  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3767  protease domain-containing protein  39.09 
 
 		 1311 aa  57.4  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000363962 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6125  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.61 
 
 		 1212 aa  56.6  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  unclonable  0.000714594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1284  glycoside hydrolase family 18  37.89 
 
 		 868 aa  57  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.113127  normal  0.562085 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3585  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40 
 
 		 1212 aa  56.2  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.591718  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3093  glycoside hydrolase family protein  37.89 
 
 		 868 aa  57  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.73338  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3083  glycoside hydrolase family 18  35.4 
 
 		 867 aa  55.8  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.204167  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2313  leucine-rich repeat-containing protein  35.42 
 
 		 450 aa  55.8  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3517  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40 
 
 		 1212 aa  56.2  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.183545 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3708  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40 
 
 		 1212 aa  56.2  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.342982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2139  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1011 aa  55.5  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000321254  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1428  chitinase  34.26 
 
 		 972 aa  55.5  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000945  chitinase  35.09 
 
 		 848 aa  55.5  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3236  glycoside hydrolase family protein  36.84 
 
 		 868 aa  55.1  0.000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004053  hypothetical protein  33.67 
 
 		 994 aa  54.7  0.000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000445976  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1100  glycoside hydrolase family protein  38.95 
 
 		 863 aa  54.7  0.000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.167101  normal  0.565849 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2224  PKD domain-containing protein  42.24 
 
 		 460 aa  53.5  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3768  protease domain-containing protein  31.06 
 
 		 1265 aa  53.1  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000500867  hitchhiker  0.00925065 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1112  hypothetical protein  38.79 
 
 		 901 aa  53.5  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0403332  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1180  hypothetical protein  45.65 
 
 		 902 aa  52.8  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3185  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  27.9 
 
 		 768 aa  52.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4740  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37 
 
 		 1217 aa  52.8  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.51333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0106  chitinase  36.56 
 
 		 848 aa  52.4  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0046  putative secreted protein  26.44 
 
 		 636 aa  52.4  0.00004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1773  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  25.37 
 
 		 889 aa  52  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.403539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1644  PKD domain containing protein  38.95 
 
 		 820 aa  52  0.00005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6147  putative secreted protein  42.62 
 
 		 450 aa  52  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0413388 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3800  serine protease  36.96 
 
 		 1215 aa  52  0.00005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3882  leucine-rich repeat-containing protein  32.26 
 
 		 816 aa  52  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3237  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  35.64 
 
 		 1512 aa  51.6  0.00007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3239  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  36.07 
 
 		 1535 aa  51.2  0.00008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2489  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  26.99 
 
 		 1661 aa  50.8  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2136  chitinase  37.5 
 
 		 869 aa  51.2  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000620509  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  35.48 
 
 		 1750 aa  50.8  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4367  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  28.95 
 
 		 1269 aa  50.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3892  hypothetical protein  30.77 
 
 		 644 aa  50.1  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.810421  normal  0.0279299 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0728  protease domain-containing protein  34.31 
 
 		 1035 aa  50.1  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1670  PKD domain containing protein  37.23 
 
 		 635 aa  49.7  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.00387943  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4497  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  25.39 
 
 		 1222 aa  49.3  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1772  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  24.62 
 
 		 1340 aa  49.3  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2130  calx-beta domain-containing protein  27.03 
 
 		 932 aa  49.3  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.538147  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1743  PKD domain containing protein  37.23 
 
 		 635 aa  49.7  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.619925  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0044  hypothetical protein  37.5 
 
 		 568 aa  48.9  0.0005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.000379088  hitchhiker  0.00388829 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0657  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  24.88 
 
 		 1113 aa  48.5  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0893942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4429  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  29 
 
 		 1269 aa  48.5  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.332356 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0555  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.04 
 
 		 1399 aa  48.1  0.0008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0581373 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3001  chitinase  36.9 
 
 		 2310 aa  47.8  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426725  normal  0.0460481 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0100  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  27.73 
 
 		 928 aa  47.4  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3505  chitinase, cellulase  33.81 
 
 		 2305 aa  47  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0820772 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1395  putative secreted protein  34.25 
 
 		 486 aa  47  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.22547 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2008  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  28.87 
 
 		 3168 aa  47.8  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2254  PKD domain-containing protein  36.28 
 
 		 1011 aa  47.4  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000165849  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1843  FucA  27.19 
 
 		 750 aa  46.2  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3714  PKD domain containing protein  32.37 
 
 		 1771 aa  45.8  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.333758  normal  0.0659323 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4367  protease domain-containing protein  38.46 
 
 		 583 aa  45.8  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000129346  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5348  peptidase M36 fungalysin  31.63 
 
 		 950 aa  45.4  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2014  peptidase C25 gingipain  41.56 
 
 		 994 aa  45.4  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0011841  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01952  serine protease, subtilase family protein  30 
 
 		 1321 aa  45.4  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0601  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  24.88 
 
 		 1118 aa  45.4  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0423  hypothetical protein  35.06 
 
 		 809 aa  45.4  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4185  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  25.52 
 
 		 1029 aa  45.1  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.610735 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2588  hypothetical protein  34.02 
 
 		 1022 aa  44.7  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>