10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0006 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_0006  hypothetical protein  100 
 
 		 237 aa  481  1e-135  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0006  hypothetical protein  49.51 
 
 		 270 aa  214  7e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000157652 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1589  hypothetical protein  45.07 
 
 		 267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.134465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3800  hypothetical protein  39.64 
 
 		 354 aa  84.7  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00611211  normal  0.136347 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0146  hypothetical protein  28.89 
 
 		 300 aa  79.7  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03107  hypothetical protein  32.14 
 
 		 269 aa  75.1  0.0000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0635239  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2893  hypothetical protein  29.37 
 
 		 342 aa  59.3  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.213192 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2274  hypothetical protein  38.33 
 
 		 274 aa  45.1  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1601  hypothetical protein  32.14 
 
 		 247 aa  42.7  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.253838 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1860  hypothetical protein  31.03 
 
 		 546 aa  42.4  0.007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>