150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_R0048 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_R0048  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1416  tRNA-Arg  90.91 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2137  tRNA-Arg  90.41 
 
 
77 bp  89.7  9e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00960478  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2212  tRNA-Arg  90.41 
 
 
77 bp  89.7  9e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.249062  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Arg-5  tRNA-Arg  88.31 
 
 
77 bp  81.8  0.00000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.581803  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1683  tRNA-Arg  89.04 
 
 
77 bp  81.8  0.00000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.792102  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1761  tRNA-Arg  88.31 
 
 
77 bp  81.8  0.00000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2040  tRNA-Arg  88.31 
 
 
77 bp  81.8  0.00000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000158642  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1468  tRNA-Arg  87.84 
 
 
74 bp  75.8  0.000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0624  tRNA-Arg  91.38 
 
 
79 bp  75.8  0.000000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00406719  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0043  tRNA-Arg  91.07 
 
 
74 bp  71.9  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0016  tRNA-Arg  89.66 
 
 
77 bp  67.9  0.0000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000514764  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0020  tRNA-Arg  86.3 
 
 
74 bp  65.9  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0062  tRNA-Arg  86.3 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0111  tRNA-Arg  86.3 
 
 
74 bp  65.9  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0015  tRNA-Arg  85.71 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000291538  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0050  tRNA-Arg  86.3 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000344943  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0070  tRNA-Arg  86.3 
 
 
74 bp  65.9  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0135947  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0023  tRNA-Arg  86.3 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.157994  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0080  tRNA-Arg  86.3 
 
 
74 bp  65.9  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0771  tRNA-Arg  89.47 
 
 
79 bp  65.9  0.000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0005  tRNA-Arg  91.67 
 
 
77 bp  63.9  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0003  tRNA-Arg  91.67 
 
 
77 bp  63.9  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000538631 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0003  tRNA-Arg  91.67 
 
 
77 bp  63.9  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0022  tRNA-Arg  90 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000193997 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0011  tRNA-Arg  93.02 
 
 
77 bp  61.9  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0036  tRNA-Arg  93.02 
 
 
77 bp  61.9  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.269516  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0001  tRNA-Arg  90.2 
 
 
77 bp  61.9  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000193558  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0022  tRNA-Arg  88.14 
 
 
74 bp  61.9  0.00000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0042  tRNA-Arg  89.66 
 
 
76 bp  60  0.00000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.802869 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0062  tRNA-Arg  92.86 
 
 
77 bp  60  0.00000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0906817  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19600  tRNA-Arg  89.66 
 
 
76 bp  60  0.00000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0108959  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0009  tRNA-Arg  84.93 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00246508  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0065  tRNA-Arg  86.15 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000631385  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0055  tRNA-Arg  86.15 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000183529  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0028  tRNA-Arg  87.72 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000221183 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0024  tRNA-Arg  86.15 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000092316  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0004  tRNA-Arg  92.68 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0024  tRNA-Arg  86.15 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000167821  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0033  tRNA-Arg  89.8 
 
 
76 bp  58  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000397698  normal  0.298215 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0055  tRNA-Arg  89.58 
 
 
77 bp  56  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0773774  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0036  tRNA-Arg  89.58 
 
 
74 bp  56  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  1.49468e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0048  tRNA-Arg  86.67 
 
 
77 bp  56  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.153389  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0037  tRNA-Arg  90.7 
 
 
77 bp  54  0.000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000022611  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0035  tRNA-Arg  92.31 
 
 
77 bp  54  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000000581838  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0009  tRNA-Arg  85.71 
 
 
77 bp  54  0.000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0048  tRNA-Arg  90.7 
 
 
77 bp  54  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.544929  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0029  tRNA-Arg  85.71 
 
 
77 bp  54  0.000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0023  tRNA-Arg  85.07 
 
 
74 bp  54  0.000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  3.2030600000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Arg-3  tRNA-Arg  90.48 
 
 
77 bp  52  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0473563  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0034  tRNA-Arg  90.48 
 
 
77 bp  52  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000100399  hitchhiker  0.00520953 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0088  tRNA-Arg  90.48 
 
 
77 bp  52  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.706466  normal  0.421027 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_R0070  tRNA-Arg  84.62 
 
 
78 bp  52  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.143256  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0084  tRNA-Arg  90.48 
 
 
77 bp  52  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000200461  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0063  tRNA-Arg  86.21 
 
 
77 bp  52  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.257054  normal  0.817877 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0007  tRNA-Arg  92.11 
 
 
77 bp  52  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0847038  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0042  tRNA-Arg  83.12 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0056  tRNA-Arg  90.24 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000671008  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t1223  tRNA-Arg  85.96 
 
 
74 bp  50.1  0.00008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0782259  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0098  tRNA-Arg  83.56 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000237653  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0038  tRNA-Arg  90.24 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000250994  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0060  tRNA-Arg  88.68 
 
 
76 bp  50.1  0.00008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000322774  normal  0.330331 
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Arg-3  tRNA-Arg  83.82 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000000427256  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t32  tRNA-Arg  83.33 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0011176  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0050  tRNA-Arg  88.64 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000000388549  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0038  tRNA-Arg  91.67 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.427754  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0012  tRNA-Arg  86.54 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.682919  normal  0.0699826 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0071  tRNA-Arg  87.5 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0216295  normal  0.909849 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0017  tRNA-Arg  85 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0023  tRNA-Arg  91.67 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.45343  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0055  tRNA-Arg  84.75 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0063  tRNA-Arg  84 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0053  tRNA-Arg  84.75 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.361533 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0025  tRNA-Arg  86.27 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000633418  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0096  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.157485 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0004  tRNA-Arg  93.55 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0058  tRNA-Arg  93.55 
 
 
78 bp  46.1  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0044  tRNA-Arg  84.75 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0001  tRNA-Arg  100 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.383152  normal  0.0513953 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0029  tRNA-Arg  93.55 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5726  tRNA-Arg  96.15 
 
 
74 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000859141  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Arg-3  tRNA-Arg  96.15 
 
 
80 bp  44.1  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000523953  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Arg-4  tRNA-Arg  96.15 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.353058  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Arg-5  tRNA-Arg  96.15 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Arg-1  tRNA-Arg  96.15 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000201078  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Arg-4  tRNA-Arg  96.15 
 
 
74 bp  44.1  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000500778  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0019  tRNA-Arg  96.15 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0987359  normal  0.649702 
 
 
-
 
NC_008309  HS_tArg01  tRNA-Arg  96.15 
 
 
80 bp  44.1  0.005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000000810736  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0040  tRNA-Arg  86 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0238659  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t0955  tRNA-Arg  86 
 
 
74 bp  44.1  0.005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0134122  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0014  tRNA-Arg  96.15 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000281617  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0056  tRNA-Arg  96.15 
 
 
74 bp  44.1  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0014  tRNA-Arg  96.15 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000388984  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0056  tRNA-Arg  96.15 
 
 
74 bp  44.1  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.771364  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0024  tRNA-Arg  96.15 
 
 
74 bp  44.1  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0232798  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0051  tRNA-Arg  96.15 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000784073  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0100  tRNA-Arg  96.15 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00184606  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0018  tRNA-Arg  86 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000134233  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5639  tRNA-Arg  96.15 
 
 
79 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.109335  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5672  tRNA-Arg  96.15 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000112746  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>