66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_R0045 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_R0045  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0036  tRNA-Ala  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.274154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0041  tRNA-Ala  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0076  tRNA-Ala  96.36 
 
 		 76 bp  93.7  5e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0810771  normal  0.223627 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0103  tRNA-Ala  91.43 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0320244  normal  0.194371 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0114  tRNA-Ala  91.43 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000000837994  normal  0.210709 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0048  tRNA-Ala  91.43 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00170622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0040  tRNA-Ala  91.43 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000000974841  normal  0.888378 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0071  tRNA-Ala  91.43 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000197346  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0085  tRNA-Ala  91.43 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000688408  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0035  tRNA-Ala  91.43 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000225526  normal  0.205533 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0047  tRNA-Ala  91.43 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.119582  normal  0.2002 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08330  tRNA-Ala  91.43 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0848374 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0023  tRNA-Ala  91.43 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0142272 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0048  tRNA-Ala  91.43 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.152542 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04600  tRNA-Ala  91.43 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0030  tRNA-Ala  94.55 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000491237  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0044  tRNA-Ala  94.55 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00000237327  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2090  tRNA-Ala  90 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.864431  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Ala-4  tRNA-Ala  90 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1766  tRNA-Ala  90 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0057  tRNA-Ala  94.23 
 
 		 73 bp  79.8  0.00000000000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000000000121136  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0037  tRNA-Ala  88.57 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000000412611  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0024  tRNA-Ala  88.57 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00134353 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0069  tRNA-Ala  88.57 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0028  tRNA-Ala  91.07 
 
 		 73 bp  71.9  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.148209  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0010  tRNA-Ala  92.16 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0605022 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0047  tRNA-Ala  89.66 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00354694  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0001  tRNA-Ala  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01010  tRNA-Ala  89.09 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna086  tRNA-Ala  89.09 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000772007  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2834  tRNA-Ala  89.09 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.0000118902  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Ala-2  tRNA-Ala  88.89 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0318084  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0065  tRNA-Ala  85.71 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.485715 
 
 
-
 
NC_002620  tRNA-Ala-1  tRNA-Ala  87.1 
 
 		 73 bp  60  0.00000008  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0019  tRNA-Ala  85.51 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.189321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0039  tRNA-Ala  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.980011 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3137t  tRNA-Ala  87.27 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00236079  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0002  tRNA-Ala  94.29 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000555494 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0002  tRNA-Ala  94.29 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.552178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00080  tRNA-Ala  94.29 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000907858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28340  tRNA-Ala  94.29 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.146579 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0014  tRNA-Ala  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000564752  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0017  tRNA-Ala  87.27 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR_t40  tRNA-Ala  86.21 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0060  tRNA-Ala  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0034  tRNA-Ala  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000924303  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0037  tRNA-Ala  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.386213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0035  tRNA-Ala  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.221378 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0040  tRNA-Ala  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1917  tRNA-Ala  86.21 
 
 		 78 bp  52  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0040  tRNA-Val  100 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0104  tRNA-Ala  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000000207184  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_4339  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.838936  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA3  tRNA-Ala  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0015  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0016  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.703833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0054  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0194635  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0094  tRNA-Ala  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000040365  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0096  tRNA-Ala  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000883074  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_R0046  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0007  tRNA-Ala  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0111  tRNA-Ala  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000942112  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0068  tRNA-Ala  84.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.781599  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0701  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0025  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.03724  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>