253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_2238 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_2238  flagellar biosynthetic protein FliQ  100 
 
 
88 aa  171  1.9999999999999998e-42  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2097  flagellar biosynthesis protein FliQ  72.41 
 
 
88 aa  133  9e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.621208  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0619  flagellar biosynthesis protein FliQ  70.11 
 
 
88 aa  122  2e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0203  flagellar biosynthesis protein FliQ  72.41 
 
 
88 aa  121  4e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2005  flagellar biosynthesis protein FliQ  65.52 
 
 
88 aa  117  4.9999999999999996e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.207342  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0155  flagellar biosynthesis protein FliQ  70.11 
 
 
88 aa  115  3e-25  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1847  flagellar biosynthesis protein FliQ  65.12 
 
 
89 aa  99.4  2e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1671  flagellar biosynthesis protein FliQ  65.12 
 
 
89 aa  99.4  2e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2049  flagellar biosynthesis protein FliQ  63.95 
 
 
89 aa  97.1  7e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.44431  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3096  flagellar biosynthesis protein FliQ  46.91 
 
 
89 aa  82  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0009  flagellar biosynthetic protein FliQ  45.68 
 
 
89 aa  80.5  0.000000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.716159  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0424  flagellar biosynthetic protein FliQ  43.21 
 
 
89 aa  78.6  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0762  flagellar biosynthesis protein FliQ  43.75 
 
 
83 aa  79  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.187731  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2911  flagellar biosynthesis protein FliQ  46.91 
 
 
89 aa  79  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.363485  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2540  flagellar biosynthesis protein FliQ  45.45 
 
 
89 aa  77  0.00000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.100837  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2034  flagellar biosynthetic protein FliQ  45.98 
 
 
89 aa  75.5  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.269793  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0701  flagellar biosynthetic protein FliQ  50 
 
 
89 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.356402  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0979  flagellar biosynthetic protein FliQ  45.12 
 
 
89 aa  75.1  0.0000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.277677  normal  0.0178906 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4066  export protein FliQ family 3  47.95 
 
 
91 aa  73.9  0.0000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0711  flagellar biosynthetic protein FliQ  42.86 
 
 
89 aa  73.2  0.000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3907  flagellar biosynthetic protein FliQ  45.57 
 
 
89 aa  72.8  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00325384 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3823  flagellar biosynthetic protein FliQ  45.57 
 
 
89 aa  72.8  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4198  flagellar biosynthetic protein FliQ  44.44 
 
 
89 aa  72  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2395  flagellar biosynthetic protein FliQ  41.86 
 
 
89 aa  72.4  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1125  flagellar biosynthetic protein FliQ  41.25 
 
 
89 aa  72  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.533326 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0483  flagellar biosynthetic protein FliQ  45.24 
 
 
89 aa  72  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.564628  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1565  flagellar biosynthesis protein FliQ  41.46 
 
 
89 aa  72  0.000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.101104  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1676  flagellar biosynthesis protein FliQ  44.58 
 
 
89 aa  71.6  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3441  flagellar biosynthetic protein FliQ  45.57 
 
 
89 aa  71.6  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3582  flagellar biosynthetic protein FliQ  39.76 
 
 
89 aa  71.2  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0742  export protein FliQ  39.53 
 
 
89 aa  70.9  0.000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2942  flagellar biosynthetic protein FliQ  43.59 
 
 
89 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16710  flagellar biosynthetic protein FliQ  43.68 
 
 
89 aa  70.5  0.000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.458183  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3681  flagellar biosynthesis protein FliQ  33.73 
 
 
89 aa  70.5  0.000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.123867  normal  0.80121 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3070  flagellar biosynthetic protein FliQ  43.59 
 
 
89 aa  70.5  0.000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0602281  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4758  flagellar biosynthesis protein FliQ  33.73 
 
 
89 aa  70.5  0.000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0972235  normal  0.81489 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0866  hypothetical protein  47.67 
 
 
90 aa  69.7  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1169  flagellar biosynthetic protein FliQ  40.74 
 
 
89 aa  69.7  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.843837  normal  0.0664804 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0374  flagellar biosynthesis protein FliQ  33.73 
 
 
89 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0649  flagellar biosynthetic protein FliQ  40.26 
 
 
89 aa  68.9  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3796  flagellar biosynthetic protein FliQ  42.31 
 
 
89 aa  69.3  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4179  flagellar biosynthetic protein FliQ  44.05 
 
 
89 aa  68.6  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1966  flagellar biosynthetic protein FliQ  41.25 
 
 
89 aa  68.6  0.00000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0576  flagellar biosynthesis protein  45.45 
 
 
89 aa  68.2  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1410  flagellar biosynthetic protein FliQ  41.86 
 
 
89 aa  68.2  0.00000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.741947  normal  0.72353 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0961  export protein FliQ family 3  38.37 
 
 
91 aa  67.8  0.00000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2330  export protein FliQ family 3  41.86 
 
 
90 aa  67.4  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0202535  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31050  flagellar biosynthetic protein FliQ  38.82 
 
 
90 aa  67.4  0.00000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0482  flagellar biosynthetic protein FliQ  48.61 
 
 
89 aa  67  0.00000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000227975  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5880  flagellar biosynthesis protein FliQ  38.46 
 
 
89 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.11552  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2823  flagellar biosynthesis protein FliQ  47.14 
 
 
84 aa  66.6  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2958  flagellar biosynthesis protein FliQ  45.24 
 
 
89 aa  66.2  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1667  export protein FliQ family 3  37.21 
 
 
92 aa  66.2  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00810896  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0858  flagellar biosynthetic protein FliQ  38.37 
 
 
91 aa  66.6  0.0000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.387191  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1752  flagellar biosynthetic protein FliQ  50 
 
 
89 aa  64.7  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1752  flagellar biosynthetic protein FliQ  50 
 
 
89 aa  64.7  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2403  flagellar biosynthesis protein FliQ  45.24 
 
 
89 aa  64.7  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2975  flagellar biosynthetic protein FliQ  41.1 
 
 
91 aa  64.7  0.0000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2303  flagellar biosynthesis protein FliQ  45.24 
 
 
89 aa  64.7  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1550  flagellar biosynthesis protein FliQ  39.51 
 
 
89 aa  63.9  0.0000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00974617  normal  0.553883 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04966  flagellar biosynthesis pathway, component FliQ  46.03 
 
 
89 aa  63.9  0.0000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1880  flagellar biosynthesis protein FliQ  46.34 
 
 
89 aa  64.3  0.0000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001179  flagellar biosynthesis protein FliQ  46.03 
 
 
89 aa  63.9  0.0000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.824092  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1407  flagellar biosynthetic protein FliQ  36.71 
 
 
89 aa  63.9  0.0000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1983  flagellar biosynthesis protein FliQ  48.28 
 
 
89 aa  63.9  0.0000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.487259  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3289  flagellar biosynthetic protein FliQ  46.84 
 
 
89 aa  63.5  0.0000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0561  flagellar biosynthetic protein FliQ  42.31 
 
 
85 aa  63.2  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.68477  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0185  flagellar biosynthetic protein FliQ  42.86 
 
 
89 aa  63.5  0.000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.67904e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0764  flagellar biosynthetic protein FliQ  40 
 
 
89 aa  62.8  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1262  flagellar biosynthesis protein FliQ  48.05 
 
 
89 aa  62  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.1618  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0067  flagellar biosynthetic protein FliQ  49.06 
 
 
91 aa  62.4  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2216  flagellar biosynthetic protein FliQ  42.17 
 
 
89 aa  62.8  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.886542 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2586  flagellar biosynthesis protein FliQ  45.12 
 
 
89 aa  62.8  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1027  flagellar biosynthetic protein FliQ  44.16 
 
 
89 aa  62.4  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2196  flagellar biosynthesis protein FliQ  48.05 
 
 
89 aa  62  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.15457  normal  0.786149 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1139  flagellar biosynthesis protein FliQ  48.05 
 
 
89 aa  62  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00184506  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2138  flagellar biosynthesis protein FliQ  48.05 
 
 
89 aa  62  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.19907 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3433  flagellar biosynthetic protein FliQ  47.54 
 
 
89 aa  62.8  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4354  flagellar biosynthesis protein FliQ  36.14 
 
 
89 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.793303  normal  0.271158 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2156  flagellar biosynthetic protein FliQ  47.95 
 
 
89 aa  61.6  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.504575  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3680  flagellar biosynthesis protein FliQ  36.9 
 
 
89 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0305386  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3916  flagellar biosynthesis protein FliQ  36.14 
 
 
89 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.413536  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1967  flagellar biosynthetic protein FliQ  40.26 
 
 
89 aa  61.6  0.000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0103073  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1512  flagellar biosynthesis protein FliQ  34.94 
 
 
89 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.294208  normal  0.120584 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0625  flagellar biosynthetic protein FliQ  39.24 
 
 
90 aa  61.2  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2010  flagellar biosynthetic protein FliQ  34.94 
 
 
90 aa  61.2  0.000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0656  flagellar biosynthetic protein FliQ  42.67 
 
 
89 aa  61.2  0.000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2811  flagellar biosynthesis protein FliQ  36.59 
 
 
89 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.369637  normal  0.0394695 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1096  flagellar biosynthetic protein FliQ  41.03 
 
 
84 aa  60.8  0.000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.111441  normal  0.639319 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1704  flagellar biosynthesis protein FliQ  38.55 
 
 
89 aa  60.5  0.000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1973  flagellar biosynthetic protein FliQ  34.94 
 
 
89 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00808662  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3443  flagellar biosynthesis protein FliQ  34.94 
 
 
89 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.407013 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0240  flagellar biosynthetic protein FliQ  39.24 
 
 
90 aa  59.7  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.331629  normal  0.0227388 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1633  flagellar biosynthetic protein FliQ  41.03 
 
 
89 aa  60.1  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.621306  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3482  flagellar biosynthetic protein FliQ  42.37 
 
 
89 aa  60.1  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0705  flagellar biosynthetic protein FliQ  39.24 
 
 
90 aa  59.7  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00473714  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0156  flagellar biosynthetic protein FliQ  32.94 
 
 
91 aa  60.1  0.00000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0090  flagellar biosynthetic protein FliQ  41.27 
 
 
89 aa  59.7  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2297  flagellar biosynthesis protein FliQ  35.29 
 
 
89 aa  59.7  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03150  flagellar biosynthesis protein FliQ  37.35 
 
 
89 aa  58.9  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>