More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_2089 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_2089  flavocytochrome c  100 
 
 
519 aa  1065    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.455233  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2084  flavocytochrome c  87.12 
 
 
520 aa  906    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0139  radical SAM domain-containing protein  55.85 
 
 
511 aa  557  1e-157  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1803  FAD binding domain-containing protein  53.73 
 
 
521 aa  546  1e-154  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000300511  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0270  flavocytochrome c flavin subunit  53.5 
 
 
511 aa  532  1e-150  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1444  flavocytochrome c  49.42 
 
 
512 aa  490  1e-137  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0002  flavocytochrome c flavin subunit  49.23 
 
 
518 aa  483  1e-135  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000401985  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0003  flavocytochrome c flavin subunit  46.91 
 
 
508 aa  435  1e-121  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000666036  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0136  flavocytochrome c flavin subunit  45.28 
 
 
517 aa  411  1e-113  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.584631  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0344  flavocytochrome c flavin subunit, putative  44.4 
 
 
519 aa  394  1e-108  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.892888 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0943  flavocytochrome c  43.42 
 
 
517 aa  390  1e-107  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0511  flavocytochrome c  42.56 
 
 
510 aa  389  1e-107  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3368  flavocytochrome c  44.08 
 
 
519 aa  382  1e-104  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2281  flavocytochrome c  44.19 
 
 
519 aa  381  1e-104  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3058  flavocytochrome c flavin subunit, putative  43.46 
 
 
517 aa  378  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2432  flavocytochrome c  42.66 
 
 
517 aa  369  1e-101  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.77876  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1489  flavocytochrome c  42.88 
 
 
517 aa  371  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.803318 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3768  flavocytochrome c  42.31 
 
 
515 aa  368  1e-100  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.226332  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2153  flavocytochrome c  40.12 
 
 
506 aa  357  3.9999999999999996e-97  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0615938 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0256  flavocytochrome c  39.96 
 
 
506 aa  356  5e-97  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2230  flavocytochrome c  39.73 
 
 
506 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3536  flavocytochrome c  39.39 
 
 
506 aa  352  8.999999999999999e-96  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0273  flavocytochrome c  39.47 
 
 
506 aa  341  2e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000188956 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3897  flavocytochrome c  40.95 
 
 
506 aa  341  2e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.513243  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3939  flavocytochrome c  40.2 
 
 
506 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0275  flavocytochrome c  40.33 
 
 
506 aa  337  3.9999999999999995e-91  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000326146 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3301  flavocytochrome c flavin subunit  39.92 
 
 
499 aa  334  3e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0340  flavocytochrome c  38.88 
 
 
500 aa  329  8e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0276  flavocytochrome c  39.5 
 
 
505 aa  327  4.0000000000000003e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00106606 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0913  flavocytochrome c  40.25 
 
 
483 aa  326  5e-88  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.387235  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0325  flavocytochrome c  38.96 
 
 
507 aa  324  3e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1414  flavocytochrome c flavin subunit, putative  39.01 
 
 
506 aa  319  7e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2534  flavocytochrome c  39.26 
 
 
506 aa  318  1e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.135835  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0299  flavocytochrome c  38.81 
 
 
506 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0588345 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4184  flavocytochrome c  37.88 
 
 
503 aa  306  8.000000000000001e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.159689 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2933  flavocytochrome c  36.58 
 
 
521 aa  303  7.000000000000001e-81  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4178  flavocytochrome c flavin subunit  37.73 
 
 
500 aa  302  1e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.630459 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2511  flavocytochrome c  37.65 
 
 
507 aa  298  1e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.842513  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3624  flavocytochrome c flavin subunit  37.45 
 
 
494 aa  297  3e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2401  flavocytochrome c flavin subunit  36.49 
 
 
505 aa  288  1e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1548  flavocytochrome c flavin subunit  36.42 
 
 
501 aa  275  2.0000000000000002e-72  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00203617  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0254  flavocytochrome c  40.76 
 
 
367 aa  264  3e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1643  FAD binding domain-containing protein  36.17 
 
 
491 aa  258  2e-67  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3795  flavocytochrome c  34.26 
 
 
582 aa  224  4e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.343394  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0694  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  34.03 
 
 
584 aa  220  5e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4620  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  34.26 
 
 
582 aa  218  2e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3885  flavocytochrome c  35.34 
 
 
609 aa  215  1.9999999999999998e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000688641  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2096  flavocytochrome c  34.71 
 
 
515 aa  213  5.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.148795  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1861  flavocytochrome c  34.33 
 
 
515 aa  212  1e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4004  flavocytochrome c  35.38 
 
 
582 aa  211  2e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1782  flavocytochrome c  34.33 
 
 
515 aa  211  2e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.283775  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4193  flavocytochrome c  33.86 
 
 
582 aa  204  5e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4325  flavocytochrome c  33.86 
 
 
582 aa  204  5e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1545  putative flavocytochrome c flavin subunit  30.42 
 
 
447 aa  202  9e-51  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2586  flavocytochrome c  31.61 
 
 
588 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3318  flavocytochrome c  35.42 
 
 
596 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.5959  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0970  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  35.55 
 
 
596 aa  201  3e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3574  flavocytochrome c  33.95 
 
 
586 aa  201  3e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4036  flavocytochrome c  33.4 
 
 
598 aa  199  7e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3505  flavocytochrome c  35.67 
 
 
596 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3628  flavocytochrome c  35.67 
 
 
596 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3433  flavocytochrome c  35.67 
 
 
596 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0859  flavocytochrome c  35.67 
 
 
596 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0808  flavocytochrome c  35.21 
 
 
596 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.587828  normal  0.0624147 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3215  flavocytochrome c  35 
 
 
596 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.57421 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3625  flavocytochrome c  31.25 
 
 
596 aa  197  3e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0905  flavocytochrome c  35.34 
 
 
597 aa  197  3e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.604755  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0378  flavocytochrome c  33.77 
 
 
591 aa  196  6e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000382997  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4127  flavocytochrome c  32.85 
 
 
598 aa  196  7e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.431024 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3912  flavocytochrome c  33.74 
 
 
586 aa  196  1e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3299  flavocytochrome c  32.46 
 
 
597 aa  194  4e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0488  flavocytochrome c  31.8 
 
 
606 aa  188  2e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.203471 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4309  flavocytochrome c  31.54 
 
 
598 aa  187  6e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000651715  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10160  flavocytochrome c  32.79 
 
 
603 aa  186  9e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.23612  normal  0.0211586 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2466  flavocytochrome c  31.17 
 
 
599 aa  183  5.0000000000000004e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0611  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  32.46 
 
 
593 aa  183  8.000000000000001e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0810  flavocytochrome c  30.78 
 
 
589 aa  182  9.000000000000001e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0264  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  52.84 
 
 
174 aa  179  2e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1530  flavocytochrome c  30.72 
 
 
464 aa  175  1.9999999999999998e-42  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000593943  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0848  fumarate reductase, flavoprotein subunit  31.78 
 
 
457 aa  174  1.9999999999999998e-42  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000988882  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3495  flavocytochrome c  32.92 
 
 
925 aa  175  1.9999999999999998e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3541  flavocytochrome c  32.73 
 
 
589 aa  171  3e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000144139  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_10064  predicted protein  30.57 
 
 
561 aa  168  2e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.14351 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1226  fumarate reductase flavoprotein subunit  30.23 
 
 
502 aa  167  2.9999999999999998e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00121043  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3126  flavocytochrome c  33.05 
 
 
925 aa  168  2.9999999999999998e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2625  flavocytochrome c  30.6 
 
 
957 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.809387  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3877  succinate dehydrogenase  33.06 
 
 
596 aa  166  6.9999999999999995e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000270258  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1421  fumarate reductase flavoprotein subunit  31.12 
 
 
589 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3597  flavocytochrome c  32.74 
 
 
591 aa  161  2e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0722  flavocytochrome c  31.4 
 
 
596 aa  160  5e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3776  flavocytochrome c  30.83 
 
 
596 aa  160  5e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235124 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3112  flavocytochrome c  31.05 
 
 
596 aa  159  1e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000541974 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11650  flavocytochrome c  30.45 
 
 
504 aa  158  3e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_51720  fumarate reductase flavoprotein  29.26 
 
 
668 aa  155  1e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.744935  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3690  flavocytochrome c  31.45 
 
 
583 aa  155  2e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13430  flavocytochrome c  30.72 
 
 
616 aa  154  5e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2558  flavocytochrome c  31.15 
 
 
926 aa  153  5.9999999999999996e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0327685 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13640  flavocytochrome c  30.58 
 
 
650 aa  152  1e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2741  flavocytochrome c  29.39 
 
 
637 aa  152  2e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0098  fumarate reductase, flavoprotein subunit  28 
 
 
465 aa  150  4e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>