57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_2085 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_2085  flavocytochrome c heme subunit  100 
 
 		 146 aa  304  2.0000000000000002e-82  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.952774  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1830  flavocytochrome c heme subunit  53.62 
 
 		 144 aa  158  2e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1445  flavocytochrome c heme subunit  49.23 
 
 		 153 aa  134  5e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.390446  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0137  fumarate reductase flavoprotein subunit  40.35 
 
 		 130 aa  84.3  4e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.100425  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1004  hypothetical protein  37.62 
 
 		 165 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3112  flavocytochrome c  35.11 
 
 		 596 aa  55.8  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000541974 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3690  flavocytochrome c  35.11 
 
 		 583 aa  55.5  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1860  hypothetical protein  30.22 
 
 		 221 aa  54.3  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3877  succinate dehydrogenase  32.98 
 
 		 596 aa  53.9  0.0000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000270258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1781  hypothetical protein  30.22 
 
 		 221 aa  54.3  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.531778  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3693  hypothetical protein  39.29 
 
 		 118 aa  53.9  0.0000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.799168  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3625  flavocytochrome c  31.48 
 
 		 596 aa  53.9  0.0000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0509  tetraheme cytochrome c  37.5 
 
 		 118 aa  53.1  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3776  flavocytochrome c  31.91 
 
 		 596 aa  53.5  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235124 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2786  hypothetical protein  35.87 
 
 		 113 aa  52  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.12053 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0946  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  29.2 
 
 		 122 aa  52.8  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0722  flavocytochrome c  35.11 
 
 		 596 aa  52.8  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3388  hypothetical protein  35.42 
 
 		 116 aa  52  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2510  tetraheme cytochrome c  37.11 
 
 		 122 aa  51.2  0.000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3617  hypothetical protein  31.76 
 
 		 137 aa  50.8  0.000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2097  hypothetical protein  29.5 
 
 		 150 aa  50.8  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.206741  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0942  hypothetical protein  31.48 
 
 		 172 aa  49.7  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3683  hypothetical protein  31.76 
 
 		 137 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0274  tetraheme cytochrome c  32.22 
 
 		 117 aa  49.3  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010475 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0276  tetraheme cytochrome c  31.68 
 
 		 117 aa  48.9  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000156346 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04270  hypothetical protein  28.07 
 
 		 182 aa  49.3  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.379993  normal  0.356103 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2229  tetraheme cytochrome c  29.7 
 
 		 117 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.257402 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3769  hypothetical protein  38.64 
 
 		 155 aa  48.5  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2152  tetraheme cytochrome c  29.7 
 
 		 117 aa  47.8  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.738839  normal  0.0741814 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1158  hypothetical protein  32.99 
 
 		 114 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3597  flavocytochrome c  36.17 
 
 		 591 aa  47.8  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0339  cytochrome c  28.57 
 
 		 116 aa  47.8  0.00006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3182  hypothetical protein  28.46 
 
 		 118 aa  47  0.00008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3535  tetraheme cytochrome c  35 
 
 		 119 aa  46.2  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3938  tetraheme cytochrome c  29.41 
 
 		 117 aa  46.2  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3541  flavocytochrome c  32.63 
 
 		 589 aa  45.8  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000144139  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0257  tetraheme cytochrome c  35 
 
 		 117 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0255  tetraheme cytochrome c  35.59 
 
 		 101 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3623  tetraheme cytochrome c  44.26 
 
 		 116 aa  44.7  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3896  tetraheme cytochrome c  33.33 
 
 		 117 aa  44.7  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.486536  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3056  tetraheme cytochrome c  37.37 
 
 		 127 aa  44.3  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0887  hypothetical protein  28.68 
 
 		 136 aa  44.7  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.590211  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3300  cytochrome c  27.94 
 
 		 126 aa  44.3  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1491  tetraheme cytochrome c  33.59 
 
 		 127 aa  43.9  0.0007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4036  flavocytochrome c  33.33 
 
 		 598 aa  43.5  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2279  tetraheme cytochrome c  40 
 
 		 126 aa  42.4  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0855381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4179  tetraheme cytochrome c  30.68 
 
 		 120 aa  42.7  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.717177 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2535  tetraheme cytochrome c, putative  28.74 
 
 		 122 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.091656  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2586  flavocytochrome c  40 
 
 		 588 aa  42  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3370  tetraheme cytochrome c  44.07 
 
 		 126 aa  42  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.656549  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2430  tetraheme cytochrome c  39.29 
 
 		 135 aa  41.2  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.439789  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0611  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  32.91 
 
 		 593 aa  41.2  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0324  tetraheme cytochrome c, putative  28.74 
 
 		 122 aa  40.8  0.007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1413  tetraheme cytochrome c, putative  27.59 
 
 		 123 aa  40.4  0.008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4127  flavocytochrome c  30.84 
 
 		 598 aa  40.4  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.431024 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4185  tetraheme cytochrome c, putative  31.17 
 
 		 122 aa  40.4  0.009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.17754 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0300  tetraheme cytochrome c, putative  27.59 
 
 		 123 aa  40  0.01  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.42786  normal  0.0669072 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>