229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_2053 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_2053  selenide, water dikinase  100 
 
 
343 aa  702    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0830  selenophosphate synthase  50.15 
 
 
325 aa  340  2e-92  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0340  selenide, water dikinase  48.24 
 
 
317 aa  310  2e-83  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0597288  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1707  selenide, water dikinase  47.31 
 
 
348 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0134481  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1677  selenide, water dikinase  47.31 
 
 
340 aa  301  2e-80  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.309519  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2374  selenide, water dikinase  48.11 
 
 
343 aa  293  4e-78  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1778  selenide, water dikinase  42.86 
 
 
378 aa  291  1e-77  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1661  selenide, water dikinase  46.49 
 
 
342 aa  291  1e-77  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2086  selenide, water dikinase, selenocysteine-containing  47.45 
 
 
343 aa  290  2e-77  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3460  selenide, water dikinase  43.64 
 
 
343 aa  290  2e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2907  selenophosphate synthase  46.43 
 
 
343 aa  289  5.0000000000000004e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.547007  normal  0.430139 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0304  selenide, water dikinase  46.55 
 
 
347 aa  288  1e-76  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.480411  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0362  selenide, water dikinase (possible start at 335663)  47.85 
 
 
320 aa  285  7e-76  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3526  selenide, water dikinase  42.49 
 
 
343 aa  284  1.0000000000000001e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1241  selenide, water dikinase  46.75 
 
 
309 aa  281  1e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1496  selenide, water dikinase  47.51 
 
 
308 aa  281  1e-74  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.258981  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2761  selenide, water dikinase  44.31 
 
 
346 aa  280  2e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.124113  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3076  selenide, water dikinase  46.33 
 
 
347 aa  281  2e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000815299 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0607  selenide, water dikinase, selenocysteine-containing  45.88 
 
 
345 aa  278  7e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1625  selenophosphate synthase  48.58 
 
 
328 aa  278  1e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000489254  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2461  selenide, water dikinase (selenocysteine-containing)  44.54 
 
 
354 aa  270  2e-71  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000145839  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1535  selenide, water dikinase  45.51 
 
 
328 aa  267  2e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000657698  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0822  selenide, water dikinase  44.98 
 
 
326 aa  264  1e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.771892  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3849  selenide, water dikinase  43.75 
 
 
317 aa  264  2e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1486  selenide, water dikinase  42.22 
 
 
340 aa  261  1e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1116  selenophosphate synthase  44.22 
 
 
323 aa  261  1e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.418125  normal  0.456278 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3401  selenide, water dikinase  48.06 
 
 
317 aa  257  2e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0323823 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3249  selenide, water dikinase  43.61 
 
 
316 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2542  selenophosphate synthase  43.83 
 
 
315 aa  254  2.0000000000000002e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000270867  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0811  selenide, water dikinase  40.76 
 
 
344 aa  253  3e-66  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0884  selenide, water dikinase  42.86 
 
 
344 aa  251  1e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000463593 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0450  selenide, water dikinase  45 
 
 
354 aa  249  5e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2135  selenide, water dikinase  50 
 
 
248 aa  249  6e-65  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0252  selenide, water dikinase  42.98 
 
 
352 aa  248  1e-64  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0491527 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0844  selenide, water dikinase  38.91 
 
 
358 aa  239  5e-62  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000873496  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4589  selenide, water dikinase  40.36 
 
 
340 aa  238  1e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1753  selenide, water dikinase  39.59 
 
 
348 aa  234  1.0000000000000001e-60  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1736  selenide, water dikinase  42.9 
 
 
351 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.298189  normal  0.96466 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3427  selenide, water dikinase  42.43 
 
 
316 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3445  selenide, water dikinase  39.63 
 
 
351 aa  231  2e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.413976  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0368  selenide, water dikinase  40.19 
 
 
337 aa  229  4e-59  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3509  selenide, water dikinase  39.63 
 
 
355 aa  228  1e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.502042  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0099  selenophosphate synthase  41.83 
 
 
320 aa  227  2e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.574229 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2746  selenide, water dikinase  43.71 
 
 
321 aa  224  1e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.201658  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0107  selenide, water dikinase  41.78 
 
 
350 aa  224  2e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.317143 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2225  selenophosphate synthase  41.78 
 
 
297 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1061  selenophosphate synthase  44.09 
 
 
291 aa  220  3e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.309297  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3363  selenophosphate synthase  41.24 
 
 
314 aa  217  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1228  selenide, water dikinase  41.67 
 
 
327 aa  216  5e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10180  selenophosphate synthetase  37.94 
 
 
345 aa  213  2.9999999999999995e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3631  selenophosphate synthetase  38.05 
 
 
344 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.571871  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43280  selenophosphate synthetase  38.05 
 
 
344 aa  212  7e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.823398 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0689  selenide, water dikinase  41.94 
 
 
328 aa  211  1e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00779233  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2036  selenide, water dikinase  41.67 
 
 
318 aa  211  2e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0154042  hitchhiker  0.000215589 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2455  selenophosphate synthetase  37.65 
 
 
344 aa  210  3e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.53362  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1754  selenophosphate synthetase  36.23 
 
 
357 aa  209  5e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.207511  normal  0.482616 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3860  selenophosphate synthase  35.44 
 
 
357 aa  209  8e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0190  selenophosphate synthetase  36.86 
 
 
352 aa  208  1e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0742475 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04230  selenophosphate synthase  39.81 
 
 
357 aa  207  2e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.776099  normal  0.124051 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3731  selenide, water dikinase  38.72 
 
 
354 aa  207  3e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0493824  normal  0.0271033 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16910  selenophosphate synthase  38.32 
 
 
333 aa  206  3e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.254595  normal  0.381057 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5279  selenide, water dikinase  40.46 
 
 
335 aa  206  4e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0135  selenophosphate synthetase  35.78 
 
 
347 aa  206  6e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.397327 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2135  selenophosphate synthetase  35.67 
 
 
356 aa  206  6e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1473  selenophosphate synthetase  35.67 
 
 
354 aa  206  7e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0819  selenophosphate synthetase  35.67 
 
 
354 aa  206  7e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.765639  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1987  selenide, water dikinase  43.22 
 
 
319 aa  205  7e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0793  selenide, water dikinase  38.44 
 
 
344 aa  205  1e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5238  selenophosphate synthetase  35.8 
 
 
354 aa  204  1e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2116  selenophosphate synthetase  35.67 
 
 
389 aa  205  1e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.113835  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4708  selenophosphate synthetase  35.8 
 
 
357 aa  204  1e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.262495  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2385  selenophosphate synthase  37.08 
 
 
351 aa  205  1e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.510286 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3330  selenide, water dikinase  35.78 
 
 
348 aa  204  1e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.456858 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2555  selenophosphate synthetase  36.44 
 
 
354 aa  204  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0503  selenophosphate synthetase  35.38 
 
 
356 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0405  selenophosphate synthetase  35.38 
 
 
385 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1832  selenophosphate synthetase  35.38 
 
 
421 aa  203  3e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3367  selenophosphate synthetase  35.5 
 
 
357 aa  203  4e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0161  selenophosphate synthetase  35.38 
 
 
346 aa  202  5e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0280932  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3481  selenide, water dikinase  34.81 
 
 
671 aa  202  5e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.409241  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1627  selenide, water dikinase  38.34 
 
 
339 aa  202  5e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5214  selenophosphate synthase  38.67 
 
 
333 aa  202  6e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5302  selenophosphate synthase  38.67 
 
 
333 aa  202  6e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2052  selenophosphate synthetase  33.82 
 
 
357 aa  202  6e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.752159  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5594  selenophosphate synthase  38.67 
 
 
333 aa  202  6e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.161181 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1505  selenophosphate synthetase  36.01 
 
 
360 aa  202  9e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.252621  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0696  selenophosphate synthetase  37.46 
 
 
344 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0300  selenophosphate synthetase  36.53 
 
 
347 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0228  selenophosphate synthetase  35.45 
 
 
347 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0643475  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2723  selenophosphate synthetase  37.31 
 
 
347 aa  201  9.999999999999999e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.280916  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3479  selenophosphate synthase  35.42 
 
 
356 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.160372  normal  0.547237 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2860  selenide, water dikinase  34.42 
 
 
350 aa  201  9.999999999999999e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2802  selenide, water dikinase  35.42 
 
 
356 aa  200  1.9999999999999998e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.543452  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2243  selenophosphate synthetase  38.22 
 
 
346 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.466152  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1925  selenophosphate synthase  35.42 
 
 
349 aa  200  1.9999999999999998e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.303741  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6563  selenophosphate synthetase  36.28 
 
 
358 aa  200  3e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.207959  hitchhiker  0.00495665 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0287  selenophosphate synthetase  35.38 
 
 
357 aa  200  3e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4912  selenophosphate synthetase  35.17 
 
 
354 aa  200  3e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.462232  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3008  selenophosphate synthetase  35.17 
 
 
357 aa  200  3e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5358  selenophosphate synthetase  35.17 
 
 
357 aa  200  3e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>