More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_2043 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_2043  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  100 
 
 		 208 aa  417  1e-116  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000125036  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2500  lysine exporter protein LysE/YggA  53.14 
 
 		 213 aa  216  2e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.106725  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1031  hypothetical protein  53.23 
 
 		 212 aa  206  2e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.332162  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1798  amino acid transport protein, LysE type  47.83 
 
 		 213 aa  203  2e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.701098  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0286  lysine exporter protein LysE/YggA  49.5 
 
 		 211 aa  198  3.9999999999999996e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1333  lysine exporter protein LysE/YggA  50.73 
 
 		 212 aa  196  2.0000000000000003e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003627  putative threonine efflux protein  49.53 
 
 		 231 aa  194  7e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02476  hypothetical protein  48.56 
 
 		 211 aa  194  9e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1483  lysine exporter protein LysE/YggA  47.8 
 
 		 215 aa  170  2e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2786  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.61 
 
 		 206 aa  151  5.9999999999999996e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2562  lysine exporter protein LysE/YggA  40.1 
 
 		 211 aa  149  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2019  lysine exporter protein LysE/YggA  35.06 
 
 		 248 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.318946 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1731  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 		 209 aa  132  3e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.820642  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2321  putative homoserine/threonine efflux protein  33.17 
 
 		 210 aa  131  6e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2194  homoserine/threonine efflux protein  33 
 
 		 210 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0534032  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2131  homoserine/threonine efflux protein  33 
 
 		 210 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000187844  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2117  homoserine/threonine efflux protein  33 
 
 		 210 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.045272  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2162  lysine exporter protein LysE/YggA  32.04 
 
 		 209 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0727412  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2374  putative homoserine/threonine efflux protein  33 
 
 		 210 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2355  homoserine/threonine efflux protein  33 
 
 		 210 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2456  putative homoserine/threonine efflux protein  32.51 
 
 		 210 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.506268  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29500  putative threonine efflux protein  34.65 
 
 		 207 aa  129  3e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.585854  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2383  homoserine/threonine efflux protein, putative  33.68 
 
 		 210 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.168172  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3003  putative homoserine/threonine efflux protein  32.34 
 
 		 210 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.132575 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4247  putative homoserine/threonine efflux protein  33.17 
 
 		 208 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000239469 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1730  amino acid transporter LysE  32.67 
 
 		 208 aa  125  7e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000126843  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1701  amino acid transporter LysE  31.68 
 
 		 208 aa  122  3e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0912104  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1341  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.46 
 
 		 245 aa  122  3e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.40784 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1925  putative homoserine/threonine efflux protein  31.68 
 
 		 208 aa  122  5e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.82308e-38 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1388  amino acid transporter LysE  34.33 
 
 		 228 aa  121  9e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0501572  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0029  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.9 
 
 		 214 aa  121  9e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1744  lysine exporter protein LysE/YggA  32.67 
 
 		 208 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0257251  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1752  homoserine/threonine efflux protein  32.18 
 
 		 208 aa  119  3e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000289008  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1890  homoserine/threonine efflux protein  32.18 
 
 		 208 aa  119  3e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.131548  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1442  lysine exporter protein LysE/YggA  35.58 
 
 		 217 aa  117  7.999999999999999e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.754857 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3063  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.73 
 
 		 210 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4180  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.83 
 
 		 207 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3865  lysine exporter protein LysE/YggA  34.78 
 
 		 210 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.149729 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2495  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.7 
 
 		 211 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000331121  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3676  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.88 
 
 		 218 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4465  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.33 
 
 		 207 aa  116  3e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3353  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.35 
 
 		 218 aa  115  3e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4075  LysE family efflux protein  33.33 
 
 		 221 aa  115  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0153  LysE family translocator protein  34.91 
 
 		 211 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4264  lysine exporter protein LysE/YggA  33.82 
 
 		 210 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.269909  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4719  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.92 
 
 		 212 aa  114  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4133  lysine exporter protein LysE/YggA  33.82 
 
 		 210 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1467  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 		 210 aa  113  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3434  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.12 
 
 		 218 aa  112  3e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0073  transporter transmembrane protein  34.45 
 
 		 215 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.163554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1992  lysine exporter protein LysE/YggA  34.5 
 
 		 206 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0349  lysine exporter protein LysE/YggA  38.42 
 
 		 209 aa  112  5e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2355  LysE family translocator protein  34.43 
 
 		 211 aa  111  6e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0144  homoserine/threonine efflux protein, putative  34.43 
 
 		 211 aa  111  6e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2059  LysE family amino acid efflux protein  33.33 
 
 		 217 aa  111  6e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.513091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2803  LysE family translocator protein  34.43 
 
 		 211 aa  111  6e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2277  LysE family translocator protein  34.43 
 
 		 211 aa  111  6e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0348  homoserine/homoserine lactone efflux protein  34.43 
 
 		 211 aa  111  9e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0162  LysE family translocator protein  34.43 
 
 		 211 aa  111  9e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0744  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32 
 
 		 213 aa  110  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.295219  normal  0.475947 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0277  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.66 
 
 		 208 aa  110  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0798  lysine exporter protein LysE/YggA  36.02 
 
 		 206 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0905  hypothetical protein  36.23 
 
 		 208 aa  110  1.0000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.772442  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2383  lysine exporter protein LysE/YggA  32.69 
 
 		 217 aa  110  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.77882  normal  0.612853 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4520  lysine exporter protein LysE/YggA  36.1 
 
 		 211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.286419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6008  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.47 
 
 		 208 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.435355 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1611  lysine exporter protein LysE/YggA  33.96 
 
 		 207 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0311017  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0334  lysine exporter protein LysE/YggA  35.61 
 
 		 204 aa  107  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0494  LysE family protein  35.61 
 
 		 204 aa  107  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.515429  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4453  lysine exporter protein LysE/YggA  36.19 
 
 		 216 aa  107  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2243  amino acid efflux pump, RhtB family protein  33.5 
 
 		 208 aa  106  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.810397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4844  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.33 
 
 		 212 aa  106  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3931  amino acid transporter LysE  31.4 
 
 		 213 aa  105  3e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0577  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.62 
 
 		 219 aa  105  4e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3385  lysine exporter protein LysE/YggA  32.54 
 
 		 214 aa  105  5e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00201071 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8095  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.95 
 
 		 225 aa  105  6e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0556  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.73 
 
 		 208 aa  104  7e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0531  lysine exporter protein LysE/YggA  32.2 
 
 		 203 aa  104  8e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1343  LysE family translocator protein  34.5 
 
 		 210 aa  104  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.478822 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0929  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.86 
 
 		 209 aa  104  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0322  lysine exporter protein LysE/YggA  37.96 
 
 		 209 aa  103  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.279488  normal  0.801106 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4942  lysine exporter protein LysE/YggA  38.21 
 
 		 208 aa  102  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.774081  normal  0.20679 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2405  lysine exporter protein LysE/YggA  32.49 
 
 		 208 aa  102  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3040  lysine exporter protein LysE/YggA  38.21 
 
 		 208 aa  102  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.408857  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3094  lysine exporter protein LysE/YggA  31.37 
 
 		 205 aa  103  3e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2223  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.64 
 
 		 209 aa  102  3e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.172152  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5326  lysine exporter protein LysE/YggA  38.21 
 
 		 208 aa  102  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.692371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0774  LysE type translocator  34.15 
 
 		 204 aa  102  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0589  LysE family translocator protein  34.15 
 
 		 204 aa  102  4e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.327685  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1045  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.8 
 
 		 211 aa  101  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3591  lysine exporter protein LysE/YggA  32.12 
 
 		 209 aa  101  7e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5436  lysine exporter protein LysE/YggA  32.12 
 
 		 209 aa  101  7e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0605  LysE family translocator protein  34.15 
 
 		 204 aa  101  7e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2266  lysine exporter protein LysE/YggA  30.95 
 
 		 211 aa  101  8e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000228935  hitchhiker  0.000000285135 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003307  putative threonine efflux protein  33.49 
 
 		 208 aa  101  9e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2583  hypothetical protein  32.11 
 
 		 208 aa  101  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.258371  normal  0.140618 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2073  lysine exporter protein LysE/YggA  33.17 
 
 		 208 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.106619  normal  0.299626 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3817  lysine exporter protein LysE/YggA  31.25 
 
 		 208 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0893485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8263  homoserine/homoserine lactone efflux protein  33 
 
 		 206 aa  100  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0435022 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3704  lysine exporter protein LysE/YggA  31.25 
 
 		 208 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.326067  normal  0.173855 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>