More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_2034 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_2034  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 		 309 aa  611  9.999999999999999e-175  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2760  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.6 
 
 		 311 aa  305  9.000000000000001e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.184188  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0021  nickel ABC transporter, permease subunit NikB  48.55 
 
 		 311 aa  299  4e-80  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00143513  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0350  nickel ABC transporter, permease subunit NikB  48.53 
 
 		 310 aa  290  2e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0369  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.38 
 
 		 316 aa  264  1e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0274  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.19 
 
 		 312 aa  258  7e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2276  nickel transporter permease NikB  44.95 
 
 		 314 aa  252  6e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.293593  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0386  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.39 
 
 		 312 aa  249  4e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6075  nickel transporter permease NikB  42.02 
 
 		 319 aa  242  6e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0803  nickel transporter permease NikB  41.37 
 
 		 314 aa  234  1.0000000000000001e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.226349  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3006  nickel transporter permease NikB  42.72 
 
 		 313 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0438476  normal  0.3014 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0753  nickel transporter permease NikB  41.04 
 
 		 314 aa  233  4.0000000000000004e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03326  nickel transporter subunit  41.04 
 
 		 314 aa  232  5e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0238  nickel ABC transporter, permease subunit NikB  41.04 
 
 		 314 aa  232  5e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3844  nickel transporter permease NikB  41.04 
 
 		 314 aa  232  5e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3959  nickel transporter permease NikB  41.04 
 
 		 314 aa  232  5e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03279  hypothetical protein  41.04 
 
 		 314 aa  232  5e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0239  nickel transporter permease NikB  41.04 
 
 		 314 aa  232  5e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3676  nickel transporter permease NikB  41.04 
 
 		 314 aa  232  5e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4817  nickel transporter permease NikB  41.04 
 
 		 314 aa  232  6e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7614  nickel transporter permease NikB  40.72 
 
 		 314 aa  232  7.000000000000001e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2542  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.45 
 
 		 311 aa  232  8.000000000000001e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000910352  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2493  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.45 
 
 		 311 aa  232  8.000000000000001e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.277015  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3761  nickel transporter permease NikB  41.04 
 
 		 314 aa  231  1e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3343  nickel transporter permease NikB  42.39 
 
 		 313 aa  230  2e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2371  peptide ABC transporter, permease protein, putative  39.61 
 
 		 311 aa  227  2e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1835  nickel transporter permease NikB  42.35 
 
 		 314 aa  220  1.9999999999999999e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.829834  hitchhiker  0.0019148 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1322  nickel transport system permease protein NikB  38.44 
 
 		 310 aa  219  6e-56  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00196564  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1031  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.32 
 
 		 312 aa  216  4e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0169288  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2401  nickel transporter permease NikB  43.73 
 
 		 313 aa  211  9e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1869  ABC-type transport system protein  38.87 
 
 		 324 aa  210  2e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1978  oligopeptide ABC transporter, permease protein  38.51 
 
 		 314 aa  210  3e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0511  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.57 
 
 		 314 aa  209  4e-53  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0538  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.72 
 
 		 311 aa  208  1e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.396259 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2014  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.7 
 
 		 325 aa  206  6e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.169122  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0521  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.19 
 
 		 321 aa  205  7e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0202  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.16 
 
 		 313 aa  204  1e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.650812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0692  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.44 
 
 		 321 aa  204  1e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1620  peptide ABC transporter, permease protein  38.08 
 
 		 321 aa  202  4e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.911317 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0586  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.81 
 
 		 321 aa  202  5e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0692911 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4385  oligopeptide ABC transporter, permease protein  37.62 
 
 		 316 aa  201  9e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.02052e-22 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2033  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.85 
 
 		 324 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0946  oligopeptide ABC transporter, permease protein  37.3 
 
 		 316 aa  200  3e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.170303  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1591  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.15 
 
 		 326 aa  200  3e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.75386 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0823  oligopeptide ABC transporter, permease  37.62 
 
 		 316 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.164685  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0719  hypothetical protein  37.42 
 
 		 316 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.870853 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2643  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.15 
 
 		 326 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0196  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.69 
 
 		 328 aa  198  9e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1434  peptide ABC transporter, permease protein  38.39 
 
 		 326 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.393954  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0469  nickel ABC transporter, permease protein  35.92 
 
 		 309 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1766  peptide ABC transporter, permease protein  37.5 
 
 		 321 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.147265  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1235  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  37.77 
 
 		 333 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.391976  normal  0.26803 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1572  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.4 
 
 		 307 aa  196  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3675  oligopeptide ABC transporter, permease  37.1 
 
 		 316 aa  196  3e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0490538 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0449  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.69 
 
 		 316 aa  196  3e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.143195 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2757  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.83 
 
 		 306 aa  196  6e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0804  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.68 
 
 		 316 aa  195  6e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00583871  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0568  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.01 
 
 		 321 aa  195  6e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2031  ABC transporter, permease protein  38.26 
 
 		 313 aa  194  1e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.381274  normal  0.768388 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1001  oligopeptide ABC transporter, permease protein  36.68 
 
 		 316 aa  194  2e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2050  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.04 
 
 		 325 aa  193  3e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0615  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.39 
 
 		 321 aa  193  3e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.793124  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4049  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.14 
 
 		 313 aa  192  4e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0859  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.82 
 
 		 333 aa  192  5e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000322853  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0004  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.44 
 
 		 320 aa  192  7e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.101832  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0953  peptide ABC transporter, permease protein, putative  35.5 
 
 		 333 aa  191  1e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.353357  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0808  oligopeptide ABC transporter, permease  35.74 
 
 		 316 aa  191  1e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.282065  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1136  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.5 
 
 		 309 aa  191  2e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000195869  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0997  oligopeptide ABC transporter, permease protein  36.36 
 
 		 316 aa  190  2e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.28482e-62 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4104  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.93 
 
 		 315 aa  190  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2404  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.3 
 
 		 308 aa  190  2.9999999999999997e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000311261  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0145  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.22 
 
 		 306 aa  189  4e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.022065  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0951  glutathione ABC transporter permease  35.83 
 
 		 306 aa  189  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.258662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0980  glutathione ABC transporter permease  35.83 
 
 		 306 aa  189  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0211  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.33 
 
 		 311 aa  189  4e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000854239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1223  Nickel-transporting ATPase  33.13 
 
 		 339 aa  189  4e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0308435 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2985  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.51 
 
 		 313 aa  189  5e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.348462  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0918  inner membrane ABC transporter permease protein YddR  35.83 
 
 		 306 aa  189  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.145156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0891  glutathione ABC transporter, permease protein  35.83 
 
 		 306 aa  189  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.976092  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1001  glutathione ABC transporter permease  35.83 
 
 		 306 aa  189  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0859  oligopeptide ABC transporter permease  36.05 
 
 		 316 aa  189  7e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0909  oligopeptide ABC transporter permease protein  36.05 
 
 		 316 aa  189  7e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0836804  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2003  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.9 
 
 		 315 aa  188  9e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.872908 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1187  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.14 
 
 		 317 aa  188  9e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4392  oligopeptide ABC transporter permease  36.48 
 
 		 306 aa  188  1e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0644  oligopeptide ABC transporter, permease protein  34.62 
 
 		 314 aa  188  1e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4732  oligopeptide ABC transporter permease protein  36.48 
 
 		 306 aa  188  1e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3115  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35 
 
 		 322 aa  187  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0010  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.98 
 
 		 308 aa  188  1e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0478  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.96 
 
 		 321 aa  188  1e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4610  oligopeptide ABC transporter, permease protein  36.48 
 
 		 306 aa  187  2e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4233  oligopeptide transport, system permease  36.48 
 
 		 306 aa  187  2e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4245  oligopeptide ABC transporter, permease  36.48 
 
 		 306 aa  187  2e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5762  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.51 
 
 		 313 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0000799384  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.51 
 
 		 313 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.000789572  normal  0.0157107 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0959  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.19 
 
 		 311 aa  187  2e-46  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2849  ABC transporter permease protein  36.83 
 
 		 313 aa  187  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.585703  normal  0.643564 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0216  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.83 
 
 		 313 aa  187  2e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00533013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2259  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35 
 
 		 320 aa  186  3e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000183272  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1752  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.16 
 
 		 306 aa  186  4e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0655426  normal  0.0792402 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>