More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_2032 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_2032  EAL domain protein  100 
 
 		 396 aa  818    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1033  diguanylate phosphodiesterase  33.5 
 
 		 413 aa  224  2e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1754  diguanylate phosphodiesterase  32.66 
 
 		 431 aa  201  3e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2479  diguanylate phosphodiesterase  30.27 
 
 		 416 aa  193  4e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2288  diguanylate phosphodiesterase  30.65 
 
 		 419 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000327147  normal  0.604082 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2662  EAL domain-containing protein  30.81 
 
 		 428 aa  164  3e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.31527  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2792  diguanylate phosphodiesterase  28.35 
 
 		 427 aa  159  6e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6290  diguanylate phosphodiesterase  29.31 
 
 		 428 aa  159  7e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0993  diguanylate phosphodiesterase  28.96 
 
 		 441 aa  158  2e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.457608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2985  diguanylate phosphodiesterase  28.87 
 
 		 428 aa  157  3e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2960  diguanylate phosphodiesterase  28.79 
 
 		 428 aa  156  6e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.735556  normal  0.776936 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2324  diguanylate phosphodiesterase  28.79 
 
 		 428 aa  156  6e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00890506  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2938  diguanylate phosphodiesterase  28.79 
 
 		 428 aa  156  6e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.200549  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2848  diguanylate phosphodiesterase  28.61 
 
 		 428 aa  156  7e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.423911  normal  0.493577 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4326  diguanylate phosphodiesterase  36 
 
 		 426 aa  151  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0277437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0359  diguanylate phosphodiesterase  29.23 
 
 		 423 aa  151  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.834381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1101  diguanylate phosphodiesterase  36.44 
 
 		 426 aa  149  9e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0737  diguanylate phosphodiesterase  37.1 
 
 		 426 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1394  EAL domain-containing protein  28.61 
 
 		 403 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1218  diguanylate phosphodiesterase  37.1 
 
 		 426 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.048247  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1523  EAL domain-containing protein  28.36 
 
 		 427 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1101  diguanylate phosphodiesterase  36.44 
 
 		 426 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1389  EAL domain-containing protein  28.93 
 
 		 403 aa  147  3e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1191  diguanylate phosphodiesterase  36.65 
 
 		 447 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0738047  normal  0.284826 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2085  diguanylate phosphodiesterase  35.84 
 
 		 423 aa  145  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3887  diguanylate phosphodiesterase  28.93 
 
 		 421 aa  145  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0192627  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0140  diguanylate phosphodiesterase  29.92 
 
 		 424 aa  144  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.537566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2214  diguanylate phosphodiesterase  27.92 
 
 		 428 aa  144  3e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.706339  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1766  EAL domain-containing protein  36.24 
 
 		 474 aa  143  5e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.561967  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1744  diguanylate phosphodiesterase  34.22 
 
 		 424 aa  143  5e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.943154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0415  diguanylate phosphodiesterase  28.97 
 
 		 422 aa  143  5e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.404943 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1192  EAL domain-containing protein  36.24 
 
 		 474 aa  143  5e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.252573  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0677  EAL domain-containing protein  36.24 
 
 		 482 aa  143  5e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0823154  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2848  EAL domain-containing protein  29.63 
 
 		 427 aa  143  6e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.197533  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0330  EAL domain-containing protein  26.94 
 
 		 429 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4292  diguanylate phosphodiesterase  28.46 
 
 		 425 aa  139  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.843441 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0400  cyclic diguanylate phosphodiesterase  27.69 
 
 		 464 aa  137  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0565  EAL domain-containing protein  27.69 
 
 		 515 aa  137  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0380  cyclic diguanylate phosphodiesterase  27.69 
 
 		 464 aa  137  4e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1618  diguanylate phosphodiesterase  33.19 
 
 		 446 aa  134  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.991621  normal  0.575282 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0467  EAL domain protein  32.64 
 
 		 351 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0116221  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2834  diguanylate phosphodiesterase  33.19 
 
 		 440 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0894  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29.93 
 
 		 605 aa  126  9e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.396651  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0770  diguanylate phosphodiesterase  27.05 
 
 		 414 aa  125  2e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.294803  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1320  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  36.21 
 
 		 584 aa  125  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00692574  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51660  EAL/GGDEF domain-containing protein  34.33 
 
 		 592 aa  124  3e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1176  diguanylate phosphodiesterase  26.77 
 
 		 411 aa  124  4e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3724  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.9 
 
 		 580 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0883602  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3527  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.19 
 
 		 581 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1510  diguanylate phosphodiesterase  32.77 
 
 		 475 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0058  diguanylate phosphodiesterase  34.02 
 
 		 357 aa  121  3e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0436  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.07 
 
 		 590 aa  119  7e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2035  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.86 
 
 		 790 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0244946 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3475  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.2 
 
 		 583 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5831  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.98 
 
 		 777 aa  117  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.36212 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1678  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.11 
 
 		 596 aa  117  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.684126  normal  0.910388 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21870  EAL domain/GGDEF domain-containing protein  33.19 
 
 		 601 aa  117  3e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.220571  hitchhiker  0.00056029 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0514  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.61 
 
 		 585 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00136052  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3754  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.61 
 
 		 585 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000868734  normal  0.0557959 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0555  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.79 
 
 		 583 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3936  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.61 
 
 		 585 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.573208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3700  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  27.62 
 
 		 780 aa  117  5e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.973532 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1867  hypothetical protein  33.19 
 
 		 582 aa  116  5e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.145916  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0554  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.22 
 
 		 584 aa  117  5e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0111263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3319  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.8 
 
 		 584 aa  116  5e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.777593  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4345  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.34 
 
 		 572 aa  116  6.9999999999999995e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3810  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.61 
 
 		 585 aa  116  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000137032  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0555  hypothetical protein  32.51 
 
 		 584 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1949  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29.02 
 
 		 773 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3003  diguanylate phosphodiesterase  32.89 
 
 		 387 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000176635 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1747  diguanylate phosphodiesterase  30.74 
 
 		 291 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.087315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3571  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.06 
 
 		 611 aa  114  3e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0176  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.65 
 
 		 786 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000781405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0192  diguanylate phosphodiesterase  33.48 
 
 		 429 aa  114  4.0000000000000004e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.11093  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1718  diguanylate phosphodiesterase  31.91 
 
 		 379 aa  113  5e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0187822  normal  0.029577 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0635  diguanylate phosphodiesterase  26.92 
 
 		 340 aa  113  5e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3188  diguanylate phosphodiesterase  25.96 
 
 		 436 aa  113  5e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.338182  normal  0.117578 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1310  diguanylate phosphodiesterase  31.78 
 
 		 306 aa  113  5e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.016111  normal  0.292811 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0731  diguanylate phosphodiesterase  32.14 
 
 		 263 aa  113  5e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3093  cyclic-di-GMP regulatory protein  34.89 
 
 		 239 aa  113  5e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0272737 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0758  diguanylate phosphodiesterase  31.08 
 
 		 424 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.121187  normal  0.125569 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0751  EAL domain-containing protein  30.3 
 
 		 424 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0778  diguanylate phosphodiesterase  25.77 
 
 		 436 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.263766  normal  0.696218 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0558  cyclic diguanylate phosphodiesterase  31.08 
 
 		 422 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4001  diguanylate phosphodiesterase  32.31 
 
 		 357 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00838727  normal  0.748991 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2138  cyclic diguanylate phosphodiesterase  31.08 
 
 		 422 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2261  EAL domain-containing protein  31.08 
 
 		 424 aa  112  9e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.807134  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1094  EAL domain-containing protein  31.08 
 
 		 424 aa  112  9e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.464012  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2455  diguanylate phosphodiesterase  31.08 
 
 		 424 aa  112  9e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000463502 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0943  cyclic diguanylate phosphodiesterase  31.08 
 
 		 422 aa  112  9e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0939  EAL domain-containing protein  31.08 
 
 		 422 aa  112  9e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.876817  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2585  diguanylate phosphodiesterase  31.08 
 
 		 424 aa  112  9e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0503461  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1628  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  27.31 
 
 		 766 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0546  diguanylate phosphodiesterase  26.12 
 
 		 424 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.49841  normal  0.628054 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4726  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.2 
 
 		 676 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0452393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4934  diguanylate phosphodiesterase  29.91 
 
 		 256 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000539515  normal  0.673945 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1560  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.48 
 
 		 800 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0426061  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0705  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29.66 
 
 		 590 aa  110  3e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2537  diguanylate phosphodiesterase  31.08 
 
 		 424 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0119746  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2103  cyclic-di-GMP regulatory protein  34.63 
 
 		 409 aa  111  3e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.444099  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>