More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_2029 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_2029  undecaprenol kinase  100 
 
 
255 aa  506  9.999999999999999e-143  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0072  undecaprenol kinase  63.92 
 
 
256 aa  322  3e-87  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3328  putative undecaprenol kinase  61.22 
 
 
254 aa  309  2e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1816  undecaprenol kinase, putative  54.33 
 
 
255 aa  293  2e-78  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1371  putative undecaprenol kinase  55.12 
 
 
255 aa  287  1e-76  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0409188  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1235  undecaprenol kinase, putative  49.62 
 
 
258 aa  234  9e-61  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0437  putative undecaprenol kinase  46.12 
 
 
258 aa  226  2e-58  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.222159  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0027  undecaprenol kinase, putative  48.41 
 
 
268 aa  225  5.0000000000000005e-58  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0198  undecaprenol kinase, putative  46.37 
 
 
267 aa  224  1e-57  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0237  undecaprenol kinase, putative  46.37 
 
 
267 aa  224  1e-57  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0215  putative undecaprenol kinase  46.37 
 
 
267 aa  223  3e-57  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3622  putative undecaprenol kinase  45.88 
 
 
254 aa  221  9e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1667  undecaprenol kinase  42.75 
 
 
254 aa  208  6e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1321  undecaprenol kinase  44.49 
 
 
252 aa  206  2e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2561  undecaprenol kinase  42.69 
 
 
252 aa  206  3e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000943331  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0452  undecaprenol kinase  40.71 
 
 
258 aa  200  1.9999999999999998e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.825456  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3674  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.49 
 
 
274 aa  195  5.000000000000001e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1705  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.76 
 
 
280 aa  195  7e-49  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0252604  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1864  undecaprenol kinase  43.18 
 
 
266 aa  195  7e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.114213  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1983  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.76 
 
 
280 aa  195  7e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0554985  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1803  undecaprenyl-diphosphatase  41.76 
 
 
274 aa  193  2e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0666  undecaprenol kinase, putative  41 
 
 
273 aa  192  3e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2175  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.07 
 
 
276 aa  192  4e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0169688 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3911  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.75 
 
 
274 aa  191  1e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.971471  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1257  undecaprenol kinase  44.44 
 
 
266 aa  191  1e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1408  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.89 
 
 
269 aa  189  4e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000703456  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4294  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.08 
 
 
274 aa  189  4e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000020273  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0949  undecaprenyl-diphosphatase  45.34 
 
 
263 aa  188  5.999999999999999e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.497251  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0285  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.26 
 
 
281 aa  188  7e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.782685  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2692  undecaprenyl-diphosphatase  41.7 
 
 
276 aa  188  8e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3618  undecaprenol kinase  41.13 
 
 
266 aa  187  1e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.359359 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2862  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.91 
 
 
277 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28720  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.38 
 
 
277 aa  186  3e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1356  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.45 
 
 
277 aa  186  3e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0826661 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0660  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.47 
 
 
266 aa  186  3e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.484694  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1829  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.91 
 
 
277 aa  186  3e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2827  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.86 
 
 
276 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2919  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.53 
 
 
276 aa  186  4e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.151391  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0259  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.07 
 
 
303 aa  185  5e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.560106  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0873  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.56 
 
 
278 aa  184  9e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.528066  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1245  undecaprenol kinase  43.15 
 
 
258 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.123014 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2286  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.44 
 
 
273 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2756  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.08 
 
 
276 aa  182  3e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3591  putative undecaprenol kinase  40.08 
 
 
286 aa  183  3e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.115804 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3599  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.89 
 
 
274 aa  182  3e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.59164  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3337  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.76 
 
 
277 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.712485  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0882  undecaprenol kinase  40.32 
 
 
259 aa  181  7e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.647913 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39190  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.38 
 
 
277 aa  180  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0708152  normal  0.2464 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4274  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.7 
 
 
267 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1538  undecaprenol kinase, putative  40.74 
 
 
280 aa  179  4e-44  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.634552 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0234  undecaprenol kinase  38.23 
 
 
293 aa  179  4e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02927  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.07 
 
 
273 aa  178  5.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00198226  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0643  undecaprenol kinase  40.07 
 
 
273 aa  178  5.999999999999999e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0008288  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2042  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.53 
 
 
274 aa  178  5.999999999999999e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.493495  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0642  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.07 
 
 
273 aa  178  5.999999999999999e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000274172  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0559  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.86 
 
 
272 aa  178  5.999999999999999e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000591232  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0297  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.86 
 
 
272 aa  178  5.999999999999999e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00789183  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02877  hypothetical protein  40.07 
 
 
273 aa  178  5.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00183865  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3344  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.82 
 
 
277 aa  178  5.999999999999999e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3235  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.07 
 
 
273 aa  178  5.999999999999999e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4369  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.07 
 
 
273 aa  178  5.999999999999999e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.934613  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2504  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.91 
 
 
284 aa  179  5.999999999999999e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000583007  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0640  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.86 
 
 
272 aa  178  5.999999999999999e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0192783  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3488  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.07 
 
 
273 aa  178  8e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0541  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.09 
 
 
283 aa  178  8e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0858873  unclonable  0.00000000134855 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3520  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.07 
 
 
273 aa  178  8e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.483237  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0223  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.31 
 
 
268 aa  178  9e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3008  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.2 
 
 
276 aa  177  1e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112856  normal  0.65432 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2602  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40 
 
 
276 aa  177  1e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.273889  normal  0.522739 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2184  Undecaprenyl-diphosphatase  39.7 
 
 
269 aa  177  1e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3350  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.23 
 
 
270 aa  178  1e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3460  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.7 
 
 
273 aa  177  2e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0059068  normal  0.174069 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4278  putative undecaprenol kinase  38.64 
 
 
306 aa  177  2e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000318908  normal  0.0359854 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0805  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.4 
 
 
276 aa  176  3e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.838445  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0215  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.17 
 
 
284 aa  176  4e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00007225  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3561  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.84 
 
 
273 aa  175  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0840276 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0887  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.4 
 
 
276 aa  175  6e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.763797  normal  0.521518 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2527  undecaprenyl-diphosphatase  40.52 
 
 
269 aa  175  6e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0438  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.4 
 
 
276 aa  175  6e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0621374  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1912  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.08 
 
 
270 aa  175  6e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.148488 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0917  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.4 
 
 
276 aa  175  6e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.319747  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3409  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.5 
 
 
272 aa  175  7e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0149932  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0610  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.08 
 
 
293 aa  175  7e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00505052  normal  0.427706 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3395  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.84 
 
 
273 aa  175  7e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.501058  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3391  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.84 
 
 
273 aa  175  7e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000584329  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3459  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.84 
 
 
273 aa  175  7e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.184869 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0858  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.55 
 
 
278 aa  175  7e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3465  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.84 
 
 
273 aa  175  7e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0701  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.03 
 
 
293 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0205173  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2269  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.82 
 
 
275 aa  174  9.999999999999999e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.887716  normal  0.0632294 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3141  undecaprenol kinase, putative  39.85 
 
 
276 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0312713  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0757  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.77 
 
 
293 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0165  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.6 
 
 
268 aa  174  9.999999999999999e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3568  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.5 
 
 
272 aa  174  9.999999999999999e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0180564  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0651  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.87 
 
 
293 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0689284 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3826  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.29 
 
 
277 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.98827 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0184  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.37 
 
 
268 aa  173  2.9999999999999996e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0395  undecaprenol kinase  40.93 
 
 
256 aa  172  3.9999999999999995e-42  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0363405  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2705  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.73 
 
 
293 aa  172  3.9999999999999995e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.965795 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0172  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.37 
 
 
268 aa  172  5e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>