More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1971 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_1971  Ribonuclease H  100 
 
 
182 aa  374  1e-103  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0578493  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0280  ribonuclease HII  54.35 
 
 
188 aa  204  6e-52  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.259622  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0342  ribonuclease HII  54.4 
 
 
184 aa  195  4.0000000000000005e-49  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0247134  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0430  ribonuclease HII  54.8 
 
 
185 aa  190  1e-47  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0083  ribonuclease HII  51.38 
 
 
183 aa  179  1e-44  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0010  ribonuclease HII  50.87 
 
 
191 aa  177  7e-44  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000542544  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0016  ribonuclease HII  49.2 
 
 
189 aa  177  1e-43  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1765  ribonuclease HII  49.44 
 
 
183 aa  175  2e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0654906  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0009  ribonuclease HII  50.87 
 
 
191 aa  166  2e-40  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0036  ribonuclease HII  50.87 
 
 
191 aa  166  2e-40  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00659063  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0974  ribonuclease HII  40.96 
 
 
206 aa  136  1e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000438708  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1516  RNase HII  42.46 
 
 
193 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0018  ribonuclease HII  42.02 
 
 
207 aa  130  1.0000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000987865  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0018  ribonuclease HII  41.58 
 
 
206 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000692909  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1492  ribonuclease HII  40 
 
 
202 aa  127  1.0000000000000001e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07010  ribonuclease HII  40.53 
 
 
262 aa  126  1.0000000000000001e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00000706526  normal  0.43338 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1428  ribonuclease HII  40 
 
 
202 aa  127  1.0000000000000001e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.982643  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1772  ribonuclease HII  41.34 
 
 
208 aa  126  2.0000000000000002e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0435907 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2681  ribonuclease HII  38.55 
 
 
199 aa  124  7e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.474695  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0038  ribonuclease HII  38.95 
 
 
205 aa  124  7e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2836  ribonuclease HII  41.34 
 
 
218 aa  124  8.000000000000001e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1418  ribonuclease HII  37.78 
 
 
236 aa  124  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.222636  normal  0.0561712 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0761  ribonuclease HII  39.56 
 
 
256 aa  123  1e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0868001  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0542  ribonuclease HII, putative  40.31 
 
 
207 aa  123  1e-27  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.597529  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1449  ribonuclease HII  40.78 
 
 
226 aa  123  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000143368  normal  0.271939 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1547  ribonuclease HII  40 
 
 
198 aa  122  2e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.040973  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1837  ribonuclease HII  40.68 
 
 
240 aa  123  2e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3054  Ribonuclease H  39.04 
 
 
197 aa  123  2e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1357  ribonuclease HII  39.33 
 
 
211 aa  123  2e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3776  ribonuclease HII  37.85 
 
 
197 aa  122  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0312514  hitchhiker  0.00441554 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2871  ribonuclease HII  41.24 
 
 
203 aa  122  3e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.035191  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1834  Ribonuclease H  39.36 
 
 
228 aa  121  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0349833 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3935  ribonuclease HII  38.86 
 
 
257 aa  121  6e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000395689  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2966  ribonuclease HII  39.2 
 
 
198 aa  121  6e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.208356  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0189  Ribonuclease H  39.55 
 
 
197 aa  121  7e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.682381  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2962  ribonuclease H  39.23 
 
 
204 aa  120  7e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.118797 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3425  ribonuclease HII  40.45 
 
 
230 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3421  ribonuclease HII  38.42 
 
 
198 aa  120  1.9999999999999998e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.329934  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0955  ribonuclease HII  38.07 
 
 
198 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0144418  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5315  ribonuclease HII  38.55 
 
 
214 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.120662  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2413  ribonuclease HII  39.78 
 
 
207 aa  119  1.9999999999999998e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1027  ribonuclease HII  38.42 
 
 
198 aa  120  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1080  ribonuclease HII  38.98 
 
 
198 aa  120  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1096  Ribonuclease H  40 
 
 
277 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0149417  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1271  ribonuclease HII  38.55 
 
 
210 aa  119  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.329181  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1907  ribonuclease HII  37.99 
 
 
217 aa  119  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.420407 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2038  ribonuclease HII  37.99 
 
 
217 aa  119  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0154  RNase HII  40.11 
 
 
198 aa  118  3.9999999999999996e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  hitchhiker  0.0000294513 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3346  ribonuclease HII  37.5 
 
 
198 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.114641  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17230  ribonuclease HII  38.55 
 
 
201 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1867  ribonuclease HII  39.78 
 
 
218 aa  118  6e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0144978  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1993  ribonuclease HII  40.21 
 
 
206 aa  117  6e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1292  ribonuclease HII  37.78 
 
 
232 aa  117  7e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.060784  normal  0.581124 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1356  ribonuclease HII  38.33 
 
 
232 aa  117  7.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1497  ribonuclease HII  37.99 
 
 
201 aa  117  9e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1324  ribonuclease HII  37.29 
 
 
191 aa  117  9e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10380  ribonuclease HII  40.64 
 
 
258 aa  117  9.999999999999999e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000218298  unclonable  0.00000000118399 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2025  ribonuclease HII  37.99 
 
 
214 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.179353  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3151  ribonuclease HII  39.2 
 
 
198 aa  116  9.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0033757  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1237  ribonuclease HII  37.95 
 
 
209 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3660  ribonuclease HII  39.43 
 
 
257 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00273984  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6072  ribonuclease HII  37.99 
 
 
214 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.236887  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2571  ribonuclease HII  37.95 
 
 
209 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.480513  normal  0.0641 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2005  ribonuclease HII  37.99 
 
 
214 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03223  ribonuclease HII  38.89 
 
 
212 aa  115  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3039  ribonuclease HII  36.51 
 
 
208 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.982104  normal  0.582676 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1327  ribonuclease HII  36.72 
 
 
191 aa  116  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0921  ribonuclease H  40.56 
 
 
210 aa  116  1.9999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952016  normal  0.218653 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2613  ribonuclease HII  38.55 
 
 
240 aa  116  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.750571  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0256  ribonuclease HII  37.29 
 
 
198 aa  115  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0721  ribonuclease HII  37.85 
 
 
198 aa  115  3e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0918027  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0271  ribonuclease HII  37.29 
 
 
198 aa  115  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.259033  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2534  ribonuclease H  36.11 
 
 
227 aa  115  3e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0780  ribonuclease HII  39.44 
 
 
211 aa  115  3.9999999999999997e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0252  ribonuclease HII  37.29 
 
 
198 aa  115  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.653457 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0268  ribonuclease HII  37.29 
 
 
198 aa  115  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.443462  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0554  Ribonuclease H  40.86 
 
 
214 aa  115  3.9999999999999997e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.14554 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0252  ribonuclease HII  37.29 
 
 
198 aa  115  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.553168 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1531  Ribonuclease H  42.54 
 
 
203 aa  115  3.9999999999999997e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00536473  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1910  ribonuclease HII  36.36 
 
 
216 aa  115  5e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1837  ribonuclease HII  38.42 
 
 
206 aa  115  5e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0508  RNase HII  38.67 
 
 
213 aa  115  5e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.261807  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1286  ribonuclease H  44.26 
 
 
199 aa  114  6e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0717  ribonuclease HII  39.66 
 
 
255 aa  114  6e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00641691  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3420  Ribonuclease H  36.72 
 
 
198 aa  114  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00118566  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0185  ribonuclease HII  36.72 
 
 
198 aa  114  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000292767  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0187  ribonuclease HII  36.72 
 
 
198 aa  114  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000269157  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2783  ribonuclease HII  34.43 
 
 
227 aa  114  7.999999999999999e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00722116  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0012  ribonuclease HII  39.43 
 
 
238 aa  114  8.999999999999998e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0012  ribonuclease HII  39.43 
 
 
238 aa  114  8.999999999999998e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2583  ribonuclease HII  40.21 
 
 
199 aa  114  8.999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.584045  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0747  ribonuclease HII  39.04 
 
 
198 aa  114  8.999999999999998e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_686  ribonuclease HII  39.44 
 
 
211 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1460  ribonuclease HII  36.05 
 
 
196 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1176  Ribonuclease H  36.05 
 
 
196 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.593352  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1335  ribonuclease HII  35.75 
 
 
245 aa  112  2.0000000000000002e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1452  ribonuclease HII  36.9 
 
 
209 aa  112  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4934  ribonuclease HII  37.57 
 
 
235 aa  113  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207973  normal  0.116655 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0706  ribonuclease HII  40.22 
 
 
212 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2441  ribonuclease HII  37.91 
 
 
248 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0813221  normal  0.0206101 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>