78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1960 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_1960  ribosomal protein L29  100 
 
 		 62 aa  122  2e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.430573  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0042  50S ribosomal protein L29  83.05 
 
 		 61 aa  99  2e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.118761  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0067  50S ribosomal protein L29  77.97 
 
 		 61 aa  94.7  4e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00273848  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1867  50S ribosomal protein L29  72.88 
 
 		 61 aa  90.1  1e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1769  50S ribosomal protein L29  76.27 
 
 		 64 aa  89.4  1e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000104669  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2073  50S ribosomal protein L29  72.88 
 
 		 61 aa  90.1  1e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0466832  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1696  50S ribosomal protein L29  72.88 
 
 		 61 aa  90.1  1e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00133107  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1025  50S ribosomal protein L29  71.19 
 
 		 61 aa  86.7  1e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00341949  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0294  50S ribosomal protein L29  52.54 
 
 		 61 aa  60.5  0.000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00124097  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0092  50S ribosomal protein L29  71.19 
 
 		 61 aa  50.1  0.000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.786092  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1153  ribosomal protein L29  43.64 
 
 		 71 aa  48.9  0.00002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000020056  hitchhiker  0.0000241726 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0356  50S ribosomal protein L29  52.17 
 
 		 64 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000200225  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0275  50S ribosomal protein L29  52.17 
 
 		 64 aa  47  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000476905  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2751  50S ribosomal protein L29  52.17 
 
 		 64 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000361638  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0257  50S ribosomal protein L29  52.17 
 
 		 64 aa  47  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00213265  normal  0.0167068 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3455  50S ribosomal protein L29  52.17 
 
 		 64 aa  47  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252439  decreased coverage  0.00364799 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0335  50S ribosomal protein L29  52.17 
 
 		 64 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000122941  normal  0.019257 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0284  50S ribosomal protein L29  52.17 
 
 		 64 aa  47  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000204837  normal  0.0231887 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2832  50S ribosomal protein L29  43.55 
 
 		 65 aa  46.2  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000129889  normal  0.463435 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1932  50S ribosomal protein L29  50 
 
 		 64 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000362681  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3161  50S ribosomal protein L29  50 
 
 		 64 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000176836  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3486  50S ribosomal protein L29  50 
 
 		 64 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000914257  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3738  50S ribosomal protein L29  50 
 
 		 64 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000269759  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3796  50S ribosomal protein L29  50 
 
 		 64 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6041  50S ribosomal protein L29  49.06 
 
 		 83 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.127214 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0322  50S ribosomal protein L29  43.55 
 
 		 64 aa  46.2  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000137645  decreased coverage  0.00229804 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3659  50S ribosomal protein L29  50 
 
 		 69 aa  46.2  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152137  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3060  50S ribosomal protein L29  50 
 
 		 64 aa  45.8  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000156067  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3768  50S ribosomal protein L29  50 
 
 		 64 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000105209  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2624  50S ribosomal protein L29  50 
 
 		 64 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.319258  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3636  50S ribosomal protein L29  43.55 
 
 		 64 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000030517  decreased coverage  0.00000000000115697 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23390  LSU ribosomal protein L29P  41.67 
 
 		 69 aa  45.4  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000127538  hitchhiker  0.000000855419 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0989  ribosomal protein L29  50.94 
 
 		 67 aa  44.7  0.0004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3330  50S ribosomal protein L29  47.46 
 
 		 64 aa  45.1  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000258995  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2170  ribosomal protein L29  41.67 
 
 		 64 aa  45.1  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.37818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3171  50S ribosomal protein L29  41.94 
 
 		 64 aa  43.5  0.0009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000183391  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0590  50S ribosomal protein L29  47.17 
 
 		 88 aa  43.5  0.0009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3427  ribosomal protein L29  47.06 
 
 		 76 aa  43.5  0.0009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.93339  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3309  50S ribosomal protein L29  41.94 
 
 		 64 aa  43.5  0.0009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000526811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0223  50S ribosomal protein L29  45.45 
 
 		 65 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000355433  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf434  50S ribosomal protein L29  43.55 
 
 		 88 aa  43.5  0.001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09920  LSU ribosomal protein L29P  41.67 
 
 		 64 aa  42.7  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0238741  hitchhiker  0.0000015632 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1257  50S ribosomal protein L29  52.73 
 
 		 68 aa  42.7  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.681642  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1345  50S ribosomal protein L29  46.3 
 
 		 67 aa  42.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0714582 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2810  50S ribosomal protein L29  46.3 
 
 		 67 aa  42  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.902927  normal  0.445457 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3011  50S ribosomal protein L29  41.94 
 
 		 64 aa  42  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000000636591  normal  0.0461975 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3289  50S ribosomal protein L29  41.94 
 
 		 64 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000215489  hitchhiker  0.00000182798 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2942  50S ribosomal protein L29  41.94 
 
 		 64 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.000229225  hitchhiker  0.00000342543 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0113  50S ribosomal protein L29  41.38 
 
 		 66 aa  41.6  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000302541  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2703  ribosomal protein L29  47.27 
 
 		 65 aa  41.6  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.859678  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0466  50S ribosomal protein L29  40.32 
 
 		 65 aa  41.6  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3516  ribosomal protein L29  48.39 
 
 		 63 aa  41.6  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000165704  hitchhiker  0.00000095159 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4499  ribosomal protein L29  49.02 
 
 		 77 aa  41.6  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0112  50S ribosomal protein L29  42.11 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000225905  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0139  50S ribosomal protein L29  42.11 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000056255  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5187  50S ribosomal protein L29  42.11 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000115107  unclonable  8.22707e-26 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0130  50S ribosomal protein L29  42.11 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.72927e-62 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01250  ribosomal protein L29  45.45 
 
 		 71 aa  41.2  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.774041  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0273  ribosomal protein L29  43.55 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000123805  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0118  50S ribosomal protein L29  42.11 
 
 		 74 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000370217  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0118  50S ribosomal protein L29  42.11 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000549386  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0114  50S ribosomal protein L29  42.11 
 
 		 74 aa  41.2  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.02215e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0112  50S ribosomal protein L29  42.11 
 
 		 74 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000108927  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0118  50S ribosomal protein L29  42.11 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000392079  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2911  50S ribosomal protein L29  43.86 
 
 		 67 aa  41.2  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1475  50S ribosomal protein L29  42.37 
 
 		 68 aa  41.2  0.005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000032863  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0149  50S ribosomal protein L29  42.11 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000829957  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0156  50S ribosomal protein L29  46.03 
 
 		 63 aa  40.4  0.007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000000636656  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1566  ribosomal protein L29  41.82 
 
 		 68 aa  40.8  0.007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00135889  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0327  50S ribosomal protein L29  43.86 
 
 		 64 aa  40.8  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  5.65874e-22  unclonable  0.0000000398692 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1516  ribosomal protein L29  42.11 
 
 		 69 aa  40.8  0.007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.380444  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4162  50S ribosomal protein L29  46.03 
 
 		 63 aa  40.4  0.008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000240623  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0178  50S ribosomal protein L29  42.86 
 
 		 63 aa  40.4  0.008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000674798  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0204  50S ribosomal protein L29  46.03 
 
 		 63 aa  40.4  0.008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000392928  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0208  50S ribosomal protein L29  46.03 
 
 		 63 aa  40.4  0.008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000719733  unclonable  0.00000802476 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4048  50S ribosomal protein L29  46.03 
 
 		 63 aa  40.4  0.008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000000921137  unclonable  0.00000000000376809 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0766  50S ribosomal protein L29  43.86 
 
 		 67 aa  40.4  0.009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346597  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0192  50S ribosomal protein L29  44.44 
 
 		 63 aa  40  0.01  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000996098  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>