More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1952 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_1952  ribosomal protein L18  100 
 
 		 118 aa  233  9e-61  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0075  50S ribosomal protein L18  65.25 
 
 		 118 aa  161  3e-39  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.820764  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1859  50S ribosomal protein L18  66.95 
 
 		 118 aa  161  4.0000000000000004e-39  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1688  50S ribosomal protein L18  66.95 
 
 		 118 aa  161  4.0000000000000004e-39  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.949463  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2065  50S ribosomal protein L18  66.1 
 
 		 118 aa  159  1e-38  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0100  50S ribosomal protein L18  62.71 
 
 		 118 aa  149  2e-35  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1017  50S ribosomal protein L18  64.41 
 
 		 118 aa  133  9.999999999999999e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000395061  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1760  50S ribosomal protein L18  63.56 
 
 		 118 aa  132  1.9999999999999998e-30  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00341283  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0050  50S ribosomal protein L18  62.71 
 
 		 118 aa  125  2.0000000000000002e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.341657  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0302  50S ribosomal protein L18  56.03 
 
 		 118 aa  122  1e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.488983  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0306  50S ribosomal protein L18  56.48 
 
 		 119 aa  115  3e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.38344e-28 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0696  50S ribosomal protein L18  46.55 
 
 		 121 aa  106  9.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.499558  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0774  ribosomal protein L18  44.74 
 
 		 122 aa  99.8  1e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3312  50S ribosomal protein L18  43.59 
 
 		 122 aa  99.4  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000452303 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2049  ribosomal protein L18  48.11 
 
 		 116 aa  99.4  2e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00570654  normal  0.0179917 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1891  50S ribosomal protein L18  50.46 
 
 		 118 aa  99.4  2e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.865797  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0074  50S ribosomal protein L18  48.6 
 
 		 118 aa  98.2  3e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.966065  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1749  50S ribosomal protein L18  47.71 
 
 		 119 aa  98.6  3e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.637683 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0783  50S ribosomal protein L18  48.6 
 
 		 120 aa  97.4  6e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0707511  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0211  50S ribosomal protein L18  48.11 
 
 		 117 aa  97.4  6e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl139  50S ribosomal protein L18  47.62 
 
 		 115 aa  97.4  7e-20  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1852  ribosomal protein L18  43.52 
 
 		 118 aa  97.1  8e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000002579  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0610  50S ribosomal protein L18P  48.6 
 
 		 118 aa  96.3  1e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0267024  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0642  50S ribosomal protein L18  44.83 
 
 		 121 aa  95.9  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000862342  hitchhiker  0.0000000324401 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2385  50S ribosomal protein L18  53.76 
 
 		 115 aa  94.4  5e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00226335  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0680  50S ribosomal protein L18  47.27 
 
 		 116 aa  94  6e-19  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1467  50S ribosomal protein L18  44.86 
 
 		 118 aa  94  7e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000595755  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4359  ribosomal protein L18  46.73 
 
 		 117 aa  92.8  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000257389  normal  0.0751525 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0949  50S ribosomal protein L18  44.44 
 
 		 122 aa  91.7  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00265725  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2891  ribosomal protein L18  47.57 
 
 		 112 aa  91.7  3e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16290  Plastid ribosomal protein L18 large ribosomal subunit  39.84 
 
 		 123 aa  91.3  4e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0898056 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1815  50S ribosomal protein L18  41.28 
 
 		 120 aa  90.9  5e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1922  50S ribosomal protein L18  44.76 
 
 		 114 aa  90.9  6e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0126  50S ribosomal protein L18  44.64 
 
 		 120 aa  90.5  7e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000140079  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0126  50S ribosomal protein L18  44.64 
 
 		 120 aa  90.5  7e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0122  50S ribosomal protein L18  44.64 
 
 		 120 aa  90.5  7e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000109989  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0120  50S ribosomal protein L18  44.64 
 
 		 120 aa  90.5  7e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000618216  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0157  50S ribosomal protein L18  44.64 
 
 		 120 aa  90.5  7e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000109054  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0126  50S ribosomal protein L18  44.64 
 
 		 120 aa  90.5  7e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0315012  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5179  50S ribosomal protein L18  44.64 
 
 		 120 aa  90.5  7e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311819  unclonable  1.18579e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0147  50S ribosomal protein L18  44.64 
 
 		 120 aa  90.5  7e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000702498  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2841  50S ribosomal protein L18  42.34 
 
 		 114 aa  90.1  8e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0800912  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1082  50S ribosomal protein L18  40.17 
 
 		 122 aa  90.1  8e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.180279  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0505  50S ribosomal protein L18  46.24 
 
 		 119 aa  90.5  8e-18  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2317  ribosomal protein L18  41.74 
 
 		 121 aa  90.1  9e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00125147  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0618  ribosomal protein L18  45.13 
 
 		 117 aa  89.7  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.969603 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5771  ribosomal protein L18  48 
 
 		 117 aa  89.7  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.74936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2302  50S ribosomal protein L18  41.67 
 
 		 119 aa  89.7  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0220849  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2261  50S ribosomal protein L18  41.67 
 
 		 119 aa  89.7  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00249191  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0676  50S ribosomal protein L18  44.95 
 
 		 119 aa  89.7  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.864338  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1494  hypothetical protein  43.75 
 
 		 116 aa  89.7  1e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.256346 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0724  ribosomal protein L18  43.22 
 
 		 124 aa  89.4  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.111204  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0858  ribosomal protein L18  41.74 
 
 		 119 aa  89  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0121  50S ribosomal protein L18  43.75 
 
 		 120 aa  89  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000538516  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3146  50S ribosomal protein L18P  43.64 
 
 		 116 aa  89  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00662623  normal  0.561423 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0322  50S ribosomal protein L18P  44.74 
 
 		 128 aa  89  2e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00166637 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0138  50S ribosomal protein L18  43.75 
 
 		 120 aa  88.6  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.4273e-62 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0731  ribosomal protein L18  40 
 
 		 125 aa  88.2  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2695  ribosomal protein L18  42.99 
 
 		 119 aa  87.8  4e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0120  50S ribosomal protein L18  44.64 
 
 		 120 aa  88.2  4e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000542863  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1558  ribosomal protein L18  49.48 
 
 		 121 aa  88.2  4e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000783356  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0947  ribosomal protein L18  47.27 
 
 		 127 aa  87  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0241036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6033  50S ribosomal protein L18  41.59 
 
 		 124 aa  87.4  7e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.133993 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1723  50S ribosomal protein L18  45.22 
 
 		 123 aa  87  8e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00474742  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1122  ribosomal protein L18  41.44 
 
 		 122 aa  86.7  9e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.805171  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1631  ribosomal protein L18  43.48 
 
 		 117 aa  86.3  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1508  50S ribosomal protein L18  45.05 
 
 		 121 aa  86.3  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.175326  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3008  50S ribosomal protein L18  41.82 
 
 		 120 aa  85.5  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.156671  hitchhiker  0.00901101 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1269  ribosomal protein L18  44.25 
 
 		 120 aa  85.9  2e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2752  ribosomal protein L18  45.54 
 
 		 118 aa  85.1  3e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.333327  normal  0.200711 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0123  50S ribosomal protein L18  43.64 
 
 		 120 aa  84.7  3e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1924  50S ribosomal protein L18  50.54 
 
 		 120 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.845183  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0337  50S ribosomal protein L18  49.46 
 
 		 120 aa  84  6e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0127  50S ribosomal protein L18  41.82 
 
 		 120 aa  84.3  6e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1729  50S ribosomal protein L18  41.82 
 
 		 124 aa  84  6e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000500708  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2919  50S ribosomal protein L18P  39.09 
 
 		 122 aa  83.6  9e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000202022  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2241  50S ribosomal protein L18  43.43 
 
 		 120 aa  83.6  9e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.272684  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2960  50S ribosomal protein L18P  43.1 
 
 		 127 aa  83.6  9e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00477287  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5031  50S ribosomal protein L18  39.32 
 
 		 136 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00000697313  normal  0.548641 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0361  50S ribosomal protein L18  44.04 
 
 		 122 aa  83.2  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0731775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1242  50S ribosomal protein L18P  39.81 
 
 		 124 aa  82.8  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0425166  hitchhiker  0.0030984 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2162  ribosomal protein L18  38.66 
 
 		 122 aa  82  0.000000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0201582  normal  0.950902 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf425  ribosomal protein L18  44.57 
 
 		 115 aa  82.4  0.000000000000002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2217  50S ribosomal protein L18  44.44 
 
 		 120 aa  82  0.000000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.442401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2672  ribosomal protein L18  43.1 
 
 		 127 aa  82  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3651  50S ribosomal protein L18  39.47 
 
 		 122 aa  81.6  0.000000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000455959  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0381  ribosomal protein L18  42.45 
 
 		 116 aa  82  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.958382  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1163  ribosomal protein L18  40.38 
 
 		 118 aa  81.6  0.000000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000618231  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0095  50S ribosomal protein L18  44.33 
 
 		 119 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0507743 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2148  50S ribosomal protein L18  42.73 
 
 		 120 aa  81.3  0.000000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1851  50S ribosomal protein L18  42.34 
 
 		 112 aa  81.3  0.000000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.662264 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2139  50S ribosomal protein L18P  44.68 
 
 		 116 aa  81.3  0.000000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0432612  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2672  50S ribosomal protein L18P  51.61 
 
 		 120 aa  81.3  0.000000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.159839  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3989  ribosomal protein L18  40.19 
 
 		 123 aa  80.9  0.000000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.142208  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05800  RplR  44.33 
 
 		 117 aa  80.5  0.000000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1970  50S ribosomal protein L18  45.45 
 
 		 122 aa  80.5  0.000000000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0883  50S ribosomal protein L18  40.91 
 
 		 121 aa  80.1  0.000000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.418113  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3127  ribosomal protein L18  40.91 
 
 		 125 aa  79.7  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0237  50S ribosomal protein L18  40.17 
 
 		 120 aa  79.7  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0234  50S ribosomal protein L18  40.17 
 
 		 120 aa  79.7  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.875475 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>