More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1947 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_1947  translation initiation factor IF-1  100 
 
 
72 aa  149  1e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1012  translation initiation factor IF-1  91.67 
 
 
72 aa  139  9.999999999999999e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.631834  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1755  translation initiation factor IF-1  90.28 
 
 
72 aa  138  1.9999999999999998e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0524428  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0209  translation initiation factor IF-1  91.67 
 
 
72 aa  139  1.9999999999999998e-32  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.285011  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0055  translation initiation factor IF-1  90.28 
 
 
72 aa  138  1.9999999999999998e-32  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0090  translation initiation factor IF-1  88.89 
 
 
72 aa  137  4.999999999999999e-32  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.146045  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0307  translation initiation factor IF-1  84.72 
 
 
72 aa  136  1e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1762  translation initiation factor IF-1  87.5 
 
 
72 aa  135  2e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1944  translation initiation factor IF-1  87.5 
 
 
72 aa  135  2e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.25939  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1578  translation initiation factor IF-1  87.5 
 
 
72 aa  135  2e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0130  translation initiation factor IF-1  66.67 
 
 
72 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2688  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 
72 aa  114  3.9999999999999997e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00223234  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0134  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 
72 aa  114  6e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000106677  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5172  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 
72 aa  113  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000623661  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0133  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 
72 aa  113  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000119555  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0133  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 
72 aa  113  7.999999999999999e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000219097  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0129  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 
72 aa  113  7.999999999999999e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  3.6060100000000006e-24  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0127  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 
72 aa  113  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000150239  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0128  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 
72 aa  113  7.999999999999999e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000687625  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0154  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 
72 aa  113  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000709815  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0133  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 
72 aa  113  7.999999999999999e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000000769266  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0127  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 
72 aa  113  7.999999999999999e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000431634  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01400  translation initiation factor 1  70.83 
 
 
72 aa  113  7.999999999999999e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0644583  normal  0.998737 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0146  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 
72 aa  113  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.72927e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0164  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 
72 aa  113  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000048346  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19760  translation initiation factor 1  69.44 
 
 
72 aa  112  2.0000000000000002e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00431201  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2132  translation initiation factor 1  66.67 
 
 
73 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0444568  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2809  translation initiation factor IF-1  68.06 
 
 
72 aa  111  3e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000000371749  hitchhiker  0.00000000419913 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1461  translation initiation factor IF-1  68.06 
 
 
72 aa  110  5e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000000527108  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1916  translation initiation factor IF-1  68.06 
 
 
72 aa  110  1.0000000000000001e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3623  translation initiation factor IF-1  66.67 
 
 
72 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000249232  hitchhiker  0.0000000000154943 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0270  translation initiation factor IF-1  66.67 
 
 
72 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.712061  normal  0.0408075 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0426  translation initiation factor IF-1  66.67 
 
 
72 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.249384  normal  0.130241 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0297  translation initiation factor IF-1  66.67 
 
 
72 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00110331  normal  0.109612 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3755  translation initiation factor IF-1  66.67 
 
 
72 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0935334  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0348  translation initiation factor IF-1  66.67 
 
 
72 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.101425 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3468  translation initiation factor IF-1  66.67 
 
 
72 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.623681  normal  0.410728 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3047  translation initiation factor IF-1  66.67 
 
 
72 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.119475  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3783  translation initiation factor IF-1  66.67 
 
 
72 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.752054  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0335  translation initiation factor IF-1  66.67 
 
 
72 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.170612  normal  0.0103305 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2818  translation initiation factor IF-1  66.67 
 
 
72 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.196542  normal  0.235424 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2738  translation initiation factor IF-1  66.67 
 
 
72 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3725  translation initiation factor IF-1  66.67 
 
 
72 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0238444  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0288  translation initiation factor IF-1  66.67 
 
 
72 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.460296  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0369  translation initiation factor IF-1  66.67 
 
 
72 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0502306  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1578  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 
73 aa  109  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000164388  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1945  translation initiation factor IF-1  66.67 
 
 
72 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2611  translation initiation factor IF-1  66.67 
 
 
72 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.430163  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2436  translation initiation factor 1  63.89 
 
 
72 aa  108  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1160  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 
72 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000283848  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2042  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 
72 aa  108  2.0000000000000002e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000556493  normal  0.276902 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3276  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 
72 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000759571 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0782  translation initiation factor IF-1  63.89 
 
 
72 aa  108  2.0000000000000002e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000198783  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3499  translation initiation factor IF-1  66.67 
 
 
72 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2949  translation initiation factor IF-1  68.06 
 
 
72 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3148  translation initiation factor IF-1  66.67 
 
 
72 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0655502  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4222  translation initiation factor IF-1  63.89 
 
 
72 aa  108  3e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.271914  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0496  translation initiation factor IF-1  63.89 
 
 
72 aa  108  3e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0218  translation initiation factor 1 (bIF-1)  62.5 
 
 
85 aa  108  3e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2927  translation initiation factor IF-1  62.5 
 
 
72 aa  108  3e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000377018  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1809  translation initiation factor IF-1  63.89 
 
 
72 aa  107  4.0000000000000004e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.23928  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0238  translation initiation factor IF-1  61.11 
 
 
72 aa  107  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.197943  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3769  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 
72 aa  107  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00277571  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3928  translation initiation factor IF-1  63.89 
 
 
72 aa  107  4.0000000000000004e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0376  translation initiation factor IF-1  63.38 
 
 
71 aa  108  4.0000000000000004e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3972  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 
72 aa  107  4.0000000000000004e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0312  translation initiation factor IF-1  64.79 
 
 
83 aa  108  4.0000000000000004e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000120042  unclonable  9.19989e-29 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0329  translation initiation factor 1  67.14 
 
 
73 aa  108  4.0000000000000004e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.208578  decreased coverage  0.000347298 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2929  translation initiation factor IF-1  63.89 
 
 
72 aa  107  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000204255 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2255  translation initiation factor IF-1  63.89 
 
 
72 aa  107  5e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0195898  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2296  translation initiation factor IF-1  63.89 
 
 
72 aa  107  5e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0203  translation initiation factor IF-1  62.5 
 
 
72 aa  107  5e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00000000310182  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2998  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 
72 aa  107  6e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.155386 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3422  translation initiation factor IF-1  62.5 
 
 
72 aa  107  6e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.198765 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0311  translation initiation factor IF-1  62.5 
 
 
72 aa  107  7.000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000252323  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0718  translation initiation factor 1  62.5 
 
 
87 aa  107  7.000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2132  translation initiation factor IF-1  66.67 
 
 
72 aa  107  8.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0729  translation initiation factor IF-1  63.89 
 
 
72 aa  106  1e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000728141  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3317  translation initiation factor IF-1  63.89 
 
 
72 aa  106  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.795368  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0624  translation initiation factor IF-1  66.67 
 
 
72 aa  106  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3296  translation initiation factor IF-1  62.5 
 
 
72 aa  106  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2274  translation initiation factor IF-1  62.5 
 
 
72 aa  106  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00199811  hitchhiker  0.00298742 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2379  translation initiation factor IF-1  62.5 
 
 
72 aa  106  1e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0001894  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0680  translation initiation factor IF-1  63.89 
 
 
72 aa  105  1e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.453286 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1168  translation initiation factor IF-1  63.38 
 
 
71 aa  105  2e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.143107  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1837  translation initiation factor IF-1  62.5 
 
 
72 aa  105  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000118565  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2309  translation initiation factor IF-1  61.11 
 
 
72 aa  105  2e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000804366  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0336  translation initiation factor IF-1  62.5 
 
 
72 aa  105  2e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1750  translation initiation factor IF-1  62.5 
 
 
72 aa  105  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000829048  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1729  translation initiation factor IF-1  61.11 
 
 
72 aa  105  3e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.616662  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1138  translation initiation factor IF-1  63.89 
 
 
72 aa  105  3e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000117845  normal  0.0449626 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1501  translation initiation factor IF-1  61.11 
 
 
72 aa  105  3e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05825  translation initiation factor IF-1  64.79 
 
 
71 aa  104  4e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.193917  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0788  translation initiation factor IF-1  58.33 
 
 
72 aa  104  4e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0427715  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2207  translation initiation factor IF-1  61.11 
 
 
72 aa  104  4e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000268658  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0650  translation initiation factor IF-1  67.14 
 
 
73 aa  104  4e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0738  translation initiation factor IF-1  62.86 
 
 
73 aa  104  5e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0445  translation initiation factor IF-1  59.72 
 
 
72 aa  104  5e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.25567  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23570  translation initiation factor 1  64.29 
 
 
73 aa  103  5e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0498  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 
72 aa  103  6e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>