More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1932 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_1932  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  100 
 
 
218 aa  455  1e-127  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3382  HAD family hydrolase  43.93 
 
 
217 aa  189  4e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.424816 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1237  HAD family hydrolase  43.66 
 
 
229 aa  186  2e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1684  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  42.59 
 
 
220 aa  186  3e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000256212  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0937  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  42.33 
 
 
219 aa  186  3e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.171636 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2097  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  43.72 
 
 
221 aa  184  1.0000000000000001e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284323  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0824  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  41.67 
 
 
219 aa  181  1e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1252  HAD family hydrolase  40.95 
 
 
220 aa  176  2e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0976  HAD family hydrolase  42.52 
 
 
225 aa  176  2e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1144  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  40.85 
 
 
217 aa  176  3e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0258  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  38.5 
 
 
220 aa  174  7e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1222  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  40.28 
 
 
220 aa  171  6.999999999999999e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2834  HAD family hydrolase  39.07 
 
 
224 aa  155  4e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.46316  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1080  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.73 
 
 
218 aa  152  4e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00830882  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1395  HAD family hydrolase  37.09 
 
 
215 aa  151  5.9999999999999996e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3114  HAD family hydrolase  37.79 
 
 
216 aa  146  2.0000000000000003e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1646  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  35.35 
 
 
217 aa  142  4e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0414  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.21 
 
 
217 aa  136  2e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2716  HAD family hydrolase  33.02 
 
 
218 aa  128  6e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000772309  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14060  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  31.75 
 
 
217 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3061  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  35.11 
 
 
216 aa  125  4.0000000000000003e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00150  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  36.68 
 
 
218 aa  125  7e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0696  phosphoglycolate phosphatase  35.16 
 
 
220 aa  124  1e-27  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.202819  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1102  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  33.33 
 
 
219 aa  115  6.9999999999999995e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3132  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.82 
 
 
226 aa  111  8.000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1367  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  35.14 
 
 
209 aa  111  1.0000000000000001e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1177  phosphoglycolate phosphatase  31.48 
 
 
209 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2290  HAD family hydrolase  33.51 
 
 
223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.783453  normal  0.134252 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0156  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.29 
 
 
216 aa  109  4.0000000000000004e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3084  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.55 
 
 
218 aa  108  6e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1156  phosphoglycolate phosphatase  33.02 
 
 
209 aa  108  6e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.53294 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0347  phosphoglycolate phosphatase  28.24 
 
 
235 aa  107  9.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0220  phosphoglycolate phosphatase  31.46 
 
 
231 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0486776 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1117  phosphoglycolate phosphatase  30.56 
 
 
209 aa  107  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.31485  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1245  phosphoglycolate phosphatase  31.02 
 
 
209 aa  107  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3246  phosphoglycolate phosphatase  30.91 
 
 
227 aa  107  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.181824  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2847  phosphoglycolate phosphatase  30.91 
 
 
227 aa  107  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.212796  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0057  phosphoglycolate phosphatase  33.16 
 
 
232 aa  105  4e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.049028  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20950  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  30.99 
 
 
216 aa  105  5e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2124  phosphoglycolate phosphatase  31.82 
 
 
230 aa  105  6e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.305125  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0416  phosphoglycolate phosphatase  29.63 
 
 
272 aa  104  8e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1410  phosphoglycolate phosphatase  30 
 
 
225 aa  104  1e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3482  phosphoglycolate phosphatase  30.16 
 
 
226 aa  103  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.824519  normal  0.190106 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2370  phosphoglycolate phosphatase  29.86 
 
 
227 aa  104  1e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3574  phosphoglycolate phosphatase  31.25 
 
 
242 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.952116  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3555  phosphoglycolate phosphatase  31.25 
 
 
245 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.221388  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3582  phosphoglycolate phosphatase  31.25 
 
 
245 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0925  phosphoglycolate phosphatase  31.22 
 
 
224 aa  102  3e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0643  phosphoglycolate phosphatase  31.25 
 
 
242 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0534  phosphoglycolate phosphatase  31.25 
 
 
242 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0250125  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0939  phosphoglycolate phosphatase  31.25 
 
 
242 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1909  phosphoglycolate phosphatase  31.25 
 
 
242 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02117  indigoidine synthesis like protein  30.33 
 
 
214 aa  102  4e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0450  phosphoglycolate phosphatase  29.17 
 
 
272 aa  102  4e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.416285 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2908  phosphoglycolate phosphatase  31.22 
 
 
242 aa  101  9e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2192  phosphoglycolate phosphatase  29.53 
 
 
217 aa  100  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0447  phosphoglycolate phosphatase  28.7 
 
 
272 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.558752 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1983  Phosphoglycolate phosphatase  33.86 
 
 
257 aa  100  2e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3361  phosphoglycolate phosphatase  29.49 
 
 
227 aa  99.8  3e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2570  phosphoglycolate phosphatase  30.73 
 
 
254 aa  99.8  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0507  phosphoglycolate phosphatase  30.73 
 
 
254 aa  99.8  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.263743  normal  0.890695 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1630  phosphoglycolate phosphatase  30.14 
 
 
224 aa  99.8  3e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0535  phosphoglycolate phosphatase  30.73 
 
 
254 aa  99.8  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3022  phosphoglycolate phosphatase  30.04 
 
 
241 aa  99  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.116956  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0956  phosphoglycolate phosphatase  29.36 
 
 
222 aa  99.4  4e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1573  phosphoglycolate phosphatase  30.14 
 
 
229 aa  99  5e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0179  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.19 
 
 
233 aa  98.6  7e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.31745 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2581  phosphoglycolate phosphatase  29.72 
 
 
221 aa  98.2  9e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0464  phosphoglycolate phosphatase  30.73 
 
 
251 aa  98.2  9e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.992467  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0581  putative phosphoglycolate phosphatase protein  29.79 
 
 
233 aa  97.4  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3998  phosphoglycolate phosphatase  29.15 
 
 
226 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739792  normal  0.543367 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03140  phosphoglycolate phosphatase  30.19 
 
 
216 aa  97.8  1e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2446  phosphoglycolate phosphatase  29.59 
 
 
225 aa  97.4  1e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0571  phosphoglycolate phosphatase  31.53 
 
 
242 aa  97.1  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3622  2-phosphoglycolate phosphatase  30.21 
 
 
254 aa  96.7  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2251  phosphoglycolate phosphatase  27.78 
 
 
229 aa  97.1  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0440  phosphoglycolate phosphatase  30.21 
 
 
251 aa  97.1  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.122838  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00378  phosphoglycolate phosphatase  29.86 
 
 
250 aa  96.3  3e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.590108  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4786  phosphoglycolate phosphatase  28.7 
 
 
272 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.602175 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002270  phosphoglycolate phosphatase  32.13 
 
 
228 aa  96.3  3e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2859  phosphoglycolate phosphatase  30.21 
 
 
256 aa  96.3  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.430899  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0065  hypothetical protein  29 
 
 
221 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0752  phosphoglycolate phosphatase  27.93 
 
 
272 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00770  hypothetical protein  29 
 
 
221 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07930  phosphoglycolate phosphatase  27.48 
 
 
272 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00282972 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1575  phosphoglycolate phosphatase  29.91 
 
 
229 aa  94.7  9e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.099799  unclonable  0.000000163733 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3996  phosphoglycolate phosphatase  27.91 
 
 
225 aa  94.4  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1058  phosphoglycolate phosphatase  28.1 
 
 
227 aa  94.7  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.234796  normal  0.363243 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3122  HAD family hydrolase  28.06 
 
 
214 aa  94.4  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4106  phosphoglycolate phosphatase  27.91 
 
 
225 aa  94.4  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4555  phosphoglycolate phosphatase  28.35 
 
 
461 aa  94  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.82365  normal  0.133597 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3898  phosphoglycolate phosphatase  28.23 
 
 
221 aa  93.6  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.67393 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4076  phosphoglycolate phosphatase  27.44 
 
 
225 aa  93.6  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1730  phosphoglycolate phosphatase  27.83 
 
 
238 aa  93.6  2e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0457  phosphoglycolate phosphatase  27.7 
 
 
227 aa  93.6  2e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2324  phosphoglycolate phosphatase  28.24 
 
 
223 aa  94  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.289687  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.67 
 
 
222 aa  93.6  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1973  phosphoglycolate phosphatase  31.02 
 
 
213 aa  93.2  3e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.662433 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3215  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.91 
 
 
217 aa  92.8  3e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.246246 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2697  phosphoglycolate phosphatase  28.9 
 
 
240 aa  93.2  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>