More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1931 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_0819  chemotaxis sensory transducer  64.97 
 
 
627 aa  804    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.113637  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1931  chemotaxis sensory transducer  100 
 
 
621 aa  1263    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1930  chemotaxis sensory transducer  66.61 
 
 
625 aa  837    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1073  chemotaxis sensory transducer  40 
 
 
633 aa  454  1.0000000000000001e-126  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00919731  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2035  putative transducer  32.49 
 
 
626 aa  285  2.0000000000000002e-75  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0631  chemotaxis sensory transducer  36.18 
 
 
656 aa  275  1.0000000000000001e-72  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00821954  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2141  chemotaxis sensory transducer  38.25 
 
 
708 aa  267  4e-70  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0113  chemotaxis sensory transducer  38.8 
 
 
563 aa  267  4e-70  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1205  chemotaxis sensory transducer  33.65 
 
 
713 aa  263  8.999999999999999e-69  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1826  chemotaxis sensory transducer  40.44 
 
 
650 aa  258  3e-67  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0112  chemotaxis sensory transducer  44.05 
 
 
563 aa  255  2.0000000000000002e-66  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1331  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40 
 
 
563 aa  244  3e-63  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.158014  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1039  protease htpx  31.36 
 
 
656 aa  241  4e-62  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0758551  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0840  cache domain-contain protein  38.87 
 
 
566 aa  236  8e-61  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.287851  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0525  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  27.67 
 
 
632 aa  235  2.0000000000000002e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0988  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.68 
 
 
652 aa  228  2e-58  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1932  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.61 
 
 
682 aa  228  4e-58  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1880  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  28.66 
 
 
628 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.454316  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0962  methyl-accepting chemotaxis protein  26.82 
 
 
643 aa  216  9.999999999999999e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000917898  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3477  putative methyl-accepting chemotaxis protein  28.98 
 
 
622 aa  214  3.9999999999999995e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000522984 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0316  methyl-accepting chemotaxis protein  30.2 
 
 
652 aa  210  7e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.36 
 
 
628 aa  209  9e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.228387  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2249  methyl-accepting chemotaxis transducer  28.66 
 
 
643 aa  209  1e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.477129  normal  0.786945 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4877  chemotactic transducer PctB  26.79 
 
 
629 aa  209  1e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.164155  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003139  methyl-accepting chemotaxis protein  28.27 
 
 
627 aa  208  2e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.116124  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001423  methyl-accepting chemotaxis protein  29.02 
 
 
623 aa  209  2e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.896179  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1586  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.34 
 
 
626 aa  207  4e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01884  hypothetical protein  28.03 
 
 
627 aa  207  5e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06314  histidine kinase  30.36 
 
 
623 aa  207  5e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56010  chemotactic transducer PctB  26.48 
 
 
629 aa  206  7e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4874  chemotactic transducer PctC  26.55 
 
 
632 aa  206  1e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.153332  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0237  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.62 
 
 
632 aa  206  1e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.997473 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4876  chemotactic transducer PctA  26.72 
 
 
629 aa  205  2e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.647167  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1432  chemotaxis sensory transducer  38.19 
 
 
546 aa  205  2e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.138665  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1723  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  26.11 
 
 
626 aa  205  2e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.372844  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1383  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.17 
 
 
636 aa  205  2e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00353653  normal  0.775857 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0173  methyl-accepting chemotaxis protein  29.28 
 
 
639 aa  203  8e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3309  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.41 
 
 
625 aa  200  6e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.776822 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3492  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  29.55 
 
 
626 aa  200  7e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0262  chemotaxis sensory transducer  31.72 
 
 
650 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1698  methyl-accepting chemotaxis protein  28.86 
 
 
653 aa  197  5.000000000000001e-49  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.130314  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0124  chemotaxis sensory transducer, Cache sensor  25.23 
 
 
626 aa  197  5.000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.201174  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55960  chemotactic transducer PctC  25.78 
 
 
632 aa  197  5.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.289325  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2154  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.62 
 
 
627 aa  196  8.000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0789614  normal  0.507372 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2364  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.95 
 
 
622 aa  196  9e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.493821  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56000  chemotactic transducer PctA  26.18 
 
 
629 aa  196  1e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0512673  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0869  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  28.25 
 
 
649 aa  195  2e-48  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0354  chemotaxis sensory transducer, Cache sensor  26.37 
 
 
630 aa  194  3e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2480  methyl-accepting chemotaxis protein  26.7 
 
 
629 aa  193  8e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1854  chemotaxis sensory transducer  32.95 
 
 
536 aa  192  2e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1061  methyl-accepting chemotaxis protein  28.3 
 
 
626 aa  192  2e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.646209  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3491  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  27.36 
 
 
626 aa  192  2e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2246  histidine kinase, HAMP region:Cache: chemotaxis sensory transducer  28.02 
 
 
629 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.265681  normal  0.412954 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4431  chemotaxis sensory transducer, Cache sensor  27.53 
 
 
629 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0799  methyl-accepting chemotaxis protein  30.38 
 
 
624 aa  191  5e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1056  methyl-accepting chemotaxis protein  25.9 
 
 
630 aa  191  5e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3603  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.63 
 
 
630 aa  189  1e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.840663  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3480  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.63 
 
 
630 aa  189  1e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0882  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.63 
 
 
630 aa  189  1e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3405  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  26.63 
 
 
630 aa  189  1e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0425  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  27.3 
 
 
630 aa  188  2e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.461628  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1434  chemotaxis sensory transducer  37.26 
 
 
530 aa  188  2e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1178  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.24 
 
 
530 aa  189  2e-46  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0194  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.95 
 
 
623 aa  188  2e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3111  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  27.93 
 
 
596 aa  188  3e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0712  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  26.11 
 
 
627 aa  187  4e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0412159  hitchhiker  0.0000400753 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0906  histidine kinase, HAMP region:Cache: chemotaxis sensory transducer  25.55 
 
 
626 aa  187  4e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1741  methyl-accepting chemotaxis protein  29.69 
 
 
623 aa  187  6e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0895  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.75 
 
 
630 aa  186  8e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.174985 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2544  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.63 
 
 
633 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00517521  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3042  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.02 
 
 
630 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.397129 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0930  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.02 
 
 
630 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.257402 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4216  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.04 
 
 
647 aa  186  2.0000000000000003e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00119  methyl-accepting chemotaxis protein  29.9 
 
 
626 aa  184  5.0000000000000004e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0969  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.99 
 
 
631 aa  182  1e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3282  methyl-accepting chemotaxis protein  27.96 
 
 
660 aa  182  1e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0397  methyl-accepting chemotaxis protein  29.79 
 
 
655 aa  182  2e-44  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0908  methyl-accepting chemotaxis protein  27.33 
 
 
633 aa  182  2e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000172893  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3056  methyl-accepting chemotaxis protein  27.96 
 
 
650 aa  182  2e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3534  histidine kinase, HAMP region:Cache: chemotaxis sensory transducer  28.71 
 
 
629 aa  181  2e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.667463  normal  0.0882884 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3291  methyl-accepting chemotaxis protein  27.96 
 
 
650 aa  182  2e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.279097  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1409  methyl-accepting chemotaxis protein  29.79 
 
 
655 aa  182  2e-44  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2273  methyl-accepting chemotaxis protein  27.68 
 
 
650 aa  180  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.487735  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3501  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  25.47 
 
 
600 aa  180  7e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.112529 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2121  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.76 
 
 
622 aa  180  8e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4029  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.95 
 
 
630 aa  179  1e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2920  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  26.35 
 
 
596 aa  179  1e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.115472  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1405  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.37 
 
 
599 aa  179  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.05 
 
 
660 aa  178  2e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1699  methyl-accepting chemotaxis protein  27.37 
 
 
660 aa  179  2e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.606414  hitchhiker  0.000000000000351139 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1011  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  29.25 
 
 
624 aa  178  3e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.752503  hitchhiker  0.0000000000251926 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1307  methyl-accepting chemotaxis protein  30.56 
 
 
596 aa  177  4e-43  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000917497  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2718  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  29.5 
 
 
599 aa  177  4e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0190  methyl-accepting chemotaxis protein  27.32 
 
 
657 aa  176  8e-43  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.145639  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3307  putative methyl-accepting chemotaxis transmembrane protein  25.24 
 
 
646 aa  176  9e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.154231  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3839  methyl-accepting chemotaxis protein  29.46 
 
 
636 aa  176  9.999999999999999e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.406017  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3825  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.05 
 
 
623 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0036  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.45 
 
 
599 aa  175  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.226397  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3950  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.85 
 
 
623 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3298  methyl-accepting chemotaxis protein  26.37 
 
 
660 aa  175  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.220146 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>