168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1928 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_1928  tRNA synthetase class II (G H P and S)  100 
 
 
284 aa  583  1e-166  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2132  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  53.09 
 
 
286 aa  315  6e-85  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1783  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  52.73 
 
 
286 aa  308  5e-83  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.529991  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0074  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  52.88 
 
 
282 aa  300  2e-80  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0369  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  51.43 
 
 
283 aa  295  8e-79  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.10851  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1369  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  49.28 
 
 
282 aa  292  4e-78  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1472  histidyl-tRNA synthetase  24.76 
 
 
418 aa  67  0.0000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000135965  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0999  histidine--tRNA ligase  33.59 
 
 
380 aa  66.2  0.0000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.357666  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0552  histidyl-tRNA synthetase  22.29 
 
 
417 aa  63.5  0.000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1326  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  25.6 
 
 
420 aa  62.8  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2359  histidine--tRNA ligase  33.33 
 
 
401 aa  62.8  0.000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0744  histidyl-tRNA synthetase  24.84 
 
 
419 aa  62.4  0.000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.100604  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1255  histidyl-tRNA synthetase  27.95 
 
 
426 aa  61.6  0.00000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.505298  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2267  histidyl-tRNA synthetase  26.87 
 
 
430 aa  62  0.00000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.921097  normal  0.960691 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1524  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  26.63 
 
 
420 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1563  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  26.63 
 
 
420 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1315  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  27.22 
 
 
420 aa  61.2  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1288  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  27.22 
 
 
420 aa  61.2  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1424  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  27.22 
 
 
420 aa  61.2  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2280  histidyl-tRNA synthetase  24.91 
 
 
419 aa  61.2  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000301062  unclonable  0.000000000414505 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0756  histidyl-tRNA synthetase  23.67 
 
 
419 aa  61.2  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000330653  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1495  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  27.22 
 
 
420 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1289  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  26.63 
 
 
420 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0749  histidyl-tRNA synthetase 2  28.35 
 
 
389 aa  59.7  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1457  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  28.24 
 
 
420 aa  59.7  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0830  histidyl-tRNA synthetase  26.51 
 
 
428 aa  59.3  0.00000006  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3887  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  28.24 
 
 
420 aa  59.3  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2189  histidyl-tRNA synthetase  23.46 
 
 
415 aa  57.4  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2348  histidyl-tRNA synthetase  21.52 
 
 
377 aa  57.4  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.901013  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1900  histidyl-tRNA synthetase  23.46 
 
 
415 aa  57.4  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1272  histidyl-tRNA synthetase  24.06 
 
 
408 aa  56.6  0.0000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0694221  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3587  histidyl-tRNA synthetase  23.37 
 
 
424 aa  56.2  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000170234  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1453  histidyl-tRNA synthetase  31.75 
 
 
421 aa  56.6  0.0000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1381  histidyl-tRNA synthetase  22.41 
 
 
414 aa  55.8  0.0000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.158923  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1489  Histidine--tRNA ligase  33.33 
 
 
383 aa  55.8  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00266166  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1726  histidyl-tRNA synthetase  30 
 
 
420 aa  55.1  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0748  histidyl-tRNA synthetase  24.11 
 
 
415 aa  55.5  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1677  histidyl-tRNA synthetase  23.75 
 
 
423 aa  55.1  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0038851 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1653  histidyl-tRNA synthetase  30 
 
 
420 aa  55.5  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.52822  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0905  histidyl-tRNA synthetase  23.51 
 
 
420 aa  54.3  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1688  histidyl-tRNA synthetase  27.78 
 
 
420 aa  54.3  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0106909  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1721  histidyl-tRNA synthetase  27.78 
 
 
420 aa  54.3  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000299078  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3452  histidyl-tRNA synthetase  22.26 
 
 
409 aa  53.9  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.192864 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2228  histidyl-tRNA synthetase  27.24 
 
 
430 aa  53.9  0.000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2981  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  23.89 
 
 
392 aa  53.5  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3303  histidyl-tRNA synthetase  23.4 
 
 
421 aa  53.5  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.375458 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0564  histidyl-tRNA synthetase  25.54 
 
 
406 aa  52.8  0.000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1804  histidyl-tRNA synthetase  31.75 
 
 
421 aa  52.8  0.000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000951278  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2038  histidyl-tRNA synthetase  27.69 
 
 
420 aa  52.4  0.000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.292734  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2108  histidyl-tRNA synthetase  23.91 
 
 
426 aa  51.6  0.00001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2507  histidyl-tRNA synthetase  25.93 
 
 
423 aa  51.6  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000231867  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02180  histidyl-tRNA synthetase  26.56 
 
 
418 aa  52.4  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000127032  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1288  histidyl-tRNA synthetase  23.57 
 
 
402 aa  52  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.373559  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1848  histidyl-tRNA synthetase  23.21 
 
 
425 aa  52  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1510  histidyl-tRNA synthetase  24.91 
 
 
426 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.707902  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12150  histidyl-tRNA synthetase  25 
 
 
419 aa  50.8  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000175223  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1291  histidyl-tRNA synthetase  22.37 
 
 
421 aa  50.8  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0371866  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3533  histidyl-tRNA synthetase 2  27.78 
 
 
346 aa  50.8  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217945  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2037  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  29.07 
 
 
389 aa  50.4  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0030  histidyl-tRNA synthetase  28.35 
 
 
418 aa  50.4  0.00003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.289573  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0324  histidyl-tRNA synthetase  28.36 
 
 
414 aa  50.1  0.00004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.272027  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0592  histidyl-tRNA synthetase  22.19 
 
 
421 aa  50.1  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000556243  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf392  histidyl-tRNA synthetase  25.08 
 
 
417 aa  50.1  0.00004  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.438879  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4250  histidyl-tRNA synthetase  27.61 
 
 
423 aa  49.7  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000611517  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1261  histidyl-tRNA synthetase  24.36 
 
 
410 aa  49.7  0.00006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.848478  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2357  histidyl-tRNA synthetase  24.55 
 
 
414 aa  49.3  0.00008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.99285  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0944  histidyl-tRNA synthetase  24.02 
 
 
426 aa  49.3  0.00008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0415  histidyl-tRNA synthetase  24.68 
 
 
410 aa  48.9  0.00009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.11603  hitchhiker  0.00165896 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0136  histidyl-tRNA synthetase  35.04 
 
 
415 aa  48.5  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.179291 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0615  tRNA synthetase, class II (G, H, P and S)  21.64 
 
 
370 aa  48.1  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.542186  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1770  histidine--tRNA ligase  28.21 
 
 
387 aa  48.9  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0828194  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0659  histidyl-tRNA synthetase  27.03 
 
 
431 aa  48.9  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1887  histidyl-tRNA synthetase  26.43 
 
 
415 aa  48.1  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3119  histidyl-tRNA synthetase  26.87 
 
 
423 aa  48.5  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0109936  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1041  histidyl-tRNA synthetase  23.15 
 
 
419 aa  47.8  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000286548  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0623  histidyl-tRNA synthetase  24.64 
 
 
426 aa  47.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0811  histidine--tRNA ligase  27.19 
 
 
422 aa  48.1  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000276292  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0859  histidyl-tRNA synthetase  24.42 
 
 
428 aa  47.8  0.0002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1310  histidyl-tRNA synthetase  30.94 
 
 
433 aa  48.1  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1171  histidyl-tRNA synthetase  23.47 
 
 
429 aa  48.1  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06881  histidyl-tRNA synthetase  26.09 
 
 
429 aa  47.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06491  histidyl-tRNA synthetase  24.64 
 
 
426 aa  47.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1901  histidyl-tRNA synthetase  25.18 
 
 
436 aa  47.8  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00983416  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2313  histidyl-tRNA synthetase  28.18 
 
 
415 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.335262 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1193  histidyl-tRNA synthetase  27.16 
 
 
424 aa  47.4  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000346938  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0622  histidyl-tRNA synthetase  23.53 
 
 
426 aa  47  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1761  histidyl-tRNA synthetase  21.61 
 
 
419 aa  47.4  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.210094  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1950  histidyl-tRNA synthetase  23.58 
 
 
426 aa  47.4  0.0003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2445  histidyl-tRNA synthetase  24.19 
 
 
414 aa  47.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.228667  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1435  histidyl-tRNA synthetase  24.25 
 
 
423 aa  47  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.122406  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0924  histidyl-tRNA synthetase  27.42 
 
 
418 aa  46.6  0.0004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1734  histidyl-tRNA synthetase  23.44 
 
 
410 aa  46.6  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4486  histidyl-tRNA synthetase  26.12 
 
 
423 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.451544  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4298  histidyl-tRNA synthetase  26.12 
 
 
423 aa  46.6  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.408041  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4136  histidyl-tRNA synthetase  26.12 
 
 
423 aa  46.6  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4146  histidyl-tRNA synthetase  26.12 
 
 
423 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0483726  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4633  histidyl-tRNA synthetase  26.12 
 
 
423 aa  46.6  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4414  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1555  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit / ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  23.22 
 
 
535 aa  46.2  0.0005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4523  histidyl-tRNA synthetase  26.12 
 
 
423 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.845471  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4483  histidyl-tRNA synthetase  26.12 
 
 
423 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6071e-17 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>