More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1905 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_1905  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  100 
 
 
386 aa  786    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.273133  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0033  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  69.79 
 
 
387 aa  562  1.0000000000000001e-159  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0097  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  57.81 
 
 
394 aa  443  1e-123  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1555  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  57.82 
 
 
388 aa  434  1e-120  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1122  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  57.56 
 
 
388 aa  432  1e-120  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1578  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  56.28 
 
 
392 aa  431  1e-120  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000305256  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0558  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  55.01 
 
 
391 aa  434  1e-120  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0829  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  56.66 
 
 
388 aa  431  1e-119  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1128  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  56.5 
 
 
388 aa  429  1e-119  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.55377  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0302  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  54.57 
 
 
392 aa  430  1e-119  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000751651  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0143  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  55.58 
 
 
392 aa  411  1e-113  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0160  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  54.24 
 
 
392 aa  410  1e-113  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000791072  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1053  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  53.39 
 
 
393 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000113017  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1457  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  53.39 
 
 
393 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.164878 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1468  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  52.21 
 
 
393 aa  395  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3406  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  53.12 
 
 
393 aa  397  1e-109  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.630931  normal  0.629093 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4264  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  53.12 
 
 
393 aa  395  1e-109  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1062  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  53.12 
 
 
393 aa  396  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1014  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  52.21 
 
 
393 aa  394  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.218372 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3193  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  51.3 
 
 
392 aa  394  1e-108  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000478447  hitchhiker  1.55264e-21 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1966  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  53.8 
 
 
393 aa  391  1e-108  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2756  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  53.28 
 
 
393 aa  389  1e-107  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.966815 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39610  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  51.3 
 
 
393 aa  388  1e-107  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1277  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  51.66 
 
 
393 aa  390  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.05935  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2246  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  52.56 
 
 
393 aa  389  1e-107  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4162  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  53.53 
 
 
393 aa  391  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.24478 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2087  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  50 
 
 
404 aa  385  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0891562 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1245  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  49.74 
 
 
404 aa  386  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.816462 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2132  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  50.38 
 
 
393 aa  385  1e-106  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000381873  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3070  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  51.15 
 
 
396 aa  385  1e-106  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.636645  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1390  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  51.02 
 
 
394 aa  388  1e-106  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.833755  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2009  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  50.25 
 
 
400 aa  384  1e-105  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2767  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  53.11 
 
 
393 aa  383  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3301  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  49.49 
 
 
404 aa  382  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.225182  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0549  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  53.24 
 
 
393 aa  380  1e-104  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3197  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  50.52 
 
 
391 aa  379  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.862074 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2807  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  54.25 
 
 
392 aa  380  1e-104  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2238  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  50.54 
 
 
404 aa  375  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.335743  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1367  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  51.63 
 
 
393 aa  376  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5661  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  50.54 
 
 
404 aa  375  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.541626  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0958  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  50.81 
 
 
404 aa  375  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1107  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  52.27 
 
 
395 aa  375  1e-103  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.881865  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1929  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  51.34 
 
 
403 aa  375  1e-103  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.268202  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1188  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  50.54 
 
 
404 aa  375  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.265969  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0635  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  51.28 
 
 
402 aa  375  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04451  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  50.13 
 
 
400 aa  376  1e-103  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3020  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  50.26 
 
 
391 aa  377  1e-103  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.190979 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3101  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  50.26 
 
 
391 aa  378  1e-103  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.313356 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15890  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  51.63 
 
 
393 aa  375  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.17999 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0318  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  50.27 
 
 
404 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0201005  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3613  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  52.15 
 
 
378 aa  374  1e-102  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1922  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  50.27 
 
 
404 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.244182  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1035  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  50.27 
 
 
404 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.240382  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3552  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  50 
 
 
399 aa  374  1e-102  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.229559  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1349  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  50.27 
 
 
464 aa  373  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.608306  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4943  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  51.03 
 
 
400 aa  372  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1001  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  51.3 
 
 
391 aa  372  1e-102  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.670352  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1707  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  50.54 
 
 
404 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1196  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  50.27 
 
 
404 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.517415  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2358  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  50.81 
 
 
404 aa  374  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.739555  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0832  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  50.27 
 
 
404 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.815383  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2319  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  50.54 
 
 
404 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.613049  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0122  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  51.67 
 
 
405 aa  372  1e-102  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0126311 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2478  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  49.49 
 
 
400 aa  371  1e-102  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00049074  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01820  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  50.91 
 
 
392 aa  369  1e-101  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1941  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  50.91 
 
 
392 aa  369  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1092  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  50.78 
 
 
391 aa  371  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.630998 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2584  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  50.91 
 
 
392 aa  370  1e-101  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.303586  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0775  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  50.4 
 
 
398 aa  368  1e-101  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.486774  normal  0.246438 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1686  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  51.04 
 
 
391 aa  368  1e-101  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.10474  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1059  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  50.52 
 
 
391 aa  369  1e-101  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0979  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  49.46 
 
 
476 aa  369  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2079  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  50.91 
 
 
392 aa  369  1e-101  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2342  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  50.27 
 
 
404 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0158257 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01808  hypothetical protein  50.91 
 
 
392 aa  369  1e-101  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1783  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  50.91 
 
 
392 aa  369  1e-101  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.163487 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2039  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  51.03 
 
 
400 aa  370  1e-101  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0527923  normal  0.319514 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3300  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  50.78 
 
 
391 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0989  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  50.78 
 
 
391 aa  371  1e-101  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1338  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  50.91 
 
 
392 aa  369  1e-101  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003700  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  50.38 
 
 
391 aa  370  1e-101  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.497623  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1792  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  50.65 
 
 
392 aa  368  1e-100  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00174349  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2124  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  50.65 
 
 
392 aa  368  1e-100  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0871  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  49.22 
 
 
391 aa  365  1e-100  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000494924  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3571  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  51.02 
 
 
401 aa  367  1e-100  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02115  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  48.34 
 
 
391 aa  366  1e-100  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1820  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  51.69 
 
 
400 aa  367  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00220765 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0850  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  49.22 
 
 
393 aa  366  1e-100  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0148242  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2234  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  50.26 
 
 
396 aa  367  1e-100  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.331336 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1241  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  51.44 
 
 
392 aa  364  1e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4380  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  52.07 
 
 
395 aa  364  1e-99  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.722448  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2097  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  51.44 
 
 
392 aa  364  1e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.310007  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2042  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  51.17 
 
 
392 aa  363  2e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.489284 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2037  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  51.17 
 
 
392 aa  363  2e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1800  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  50.77 
 
 
413 aa  363  2e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2447  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  50.13 
 
 
393 aa  363  3e-99  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1366  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  51.17 
 
 
392 aa  363  3e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000213864 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2242  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  49.87 
 
 
393 aa  363  3e-99  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1634  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  50.13 
 
 
393 aa  363  3e-99  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2351  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  50.13 
 
 
393 aa  363  3e-99  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.975631  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>