More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1884 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_1884  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  100 
 
 
464 aa  944    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0017284  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3497  RND efflux system outer membrane lipoprotein  47.7 
 
 
470 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3584  outer membrane protein oprM  49.04 
 
 
468 aa  404  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2477  RND efflux system outer membrane lipoprotein  45.18 
 
 
484 aa  402  1e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4008  outer membrane protein oprM  49.04 
 
 
468 aa  403  1e-111  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3717  RND efflux system outer membrane lipoprotein  49.04 
 
 
468 aa  404  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3798  RND efflux system outer membrane lipoprotein  47.35 
 
 
462 aa  403  1e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0532  RND efflux system outer membrane lipoprotein  42.77 
 
 
475 aa  385  1e-105  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.17075 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0506  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  44.59 
 
 
492 aa  375  1e-103  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1834  multidrug efflux outer membrane protein EefC  42.27 
 
 
457 aa  375  1e-103  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000044393 
 
 
-
 
NC_003296  RS01890  outer membrane drug efflux lipoprotein  45.94 
 
 
491 aa  372  1e-102  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0642226  normal  0.753424 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0811  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  43.38 
 
 
517 aa  374  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000173561 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0329  RND efflux system outer membrane lipoprotein  43.82 
 
 
474 aa  374  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2695  outer membrane efflux protein  44.28 
 
 
512 aa  370  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1929  multidrug efflux outer membrane protein EefC  41.61 
 
 
457 aa  370  1e-101  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000583054 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2510  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  43.76 
 
 
465 aa  370  1e-101  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2052  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  43.35 
 
 
499 aa  365  1e-100  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0289  outer membrane protein OmpK  41.99 
 
 
474 aa  364  2e-99  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2367  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  42.74 
 
 
474 aa  360  2e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3433  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  41.42 
 
 
477 aa  357  2.9999999999999997e-97  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3836  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  42.29 
 
 
471 aa  356  3.9999999999999996e-97  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.232227  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1278  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  42.15 
 
 
486 aa  354  1e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00202436  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1337  RND efflux system outer membrane lipoprotein  43.64 
 
 
471 aa  353  4e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1416  RND efflux system outer membrane lipoprotein NodT  41.28 
 
 
469 aa  352  7e-96  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05550  major intrinsic multiple antibiotic resistance efflux outer membrane protein OprM precursor  40.65 
 
 
485 aa  350  4e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.203755  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4027  RND efflux system outer membrane lipoprotein  44.18 
 
 
467 aa  349  5e-95  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.296212  normal  0.401422 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0527  outer membrane protein OprM precursor  40.65 
 
 
485 aa  350  5e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71666  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4009  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  40.26 
 
 
486 aa  348  1e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0874069  normal  0.0174443 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0121  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  40.56 
 
 
469 aa  347  2e-94  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3717  RND efflux system outer membrane lipoprotein  41.32 
 
 
477 aa  345  1e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2963  putative outer membrane drug efflux lipoprotein  44.03 
 
 
487 aa  344  2e-93  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1024  RND efflux system outer membrane lipoprotein  39.74 
 
 
484 aa  342  5.999999999999999e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.484622  normal  0.130102 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0775  RND efflux system outer membrane lipoprotein  40.08 
 
 
476 aa  342  7e-93  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4305  outer membrane efflux protein  40.47 
 
 
486 aa  341  2e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2864  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  44.4 
 
 
468 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0383351  normal  0.128914 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1195  RND efflux system outer membrane lipoprotein  40.8 
 
 
482 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000171892  normal  0.38657 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3369  RND efflux system outer membrane lipoprotein  41.23 
 
 
489 aa  340  4e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.413443  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2606  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  39.83 
 
 
478 aa  339  5.9999999999999996e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0037798  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1851  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  42.05 
 
 
474 aa  339  5.9999999999999996e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.170655 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2838  RND efflux system outer membrane lipoprotein  39.16 
 
 
528 aa  338  9.999999999999999e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.207275 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2327  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  38.96 
 
 
528 aa  337  3.9999999999999995e-91  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.356993  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5237  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  37.61 
 
 
516 aa  332  6e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.776503  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51570  multidrug efflux pump RND-family outer membrane protein  38.33 
 
 
505 aa  332  1e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0329698  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2110  RND efflux system outer membrane lipoprotein  40.95 
 
 
520 aa  331  2e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.277325  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3925  multidrug efflux system protein  39.82 
 
 
499 aa  330  3e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000707781  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1384  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  38.79 
 
 
484 aa  329  7e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.285433 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4429  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38.79 
 
 
484 aa  329  8e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.305214  normal  0.0579633 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2885  RND efflux system outer membrane lipoprotein  39.52 
 
 
495 aa  328  9e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.183945  normal  0.24109 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4339  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38.79 
 
 
484 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0952934  normal  0.254961 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2896  RND efflux system outer membrane lipoprotein  42.19 
 
 
477 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0545  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  39.39 
 
 
470 aa  326  6e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4088  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  39.48 
 
 
489 aa  325  8.000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.947344  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0549  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  39.56 
 
 
501 aa  325  1e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.569542  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2037  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  39.87 
 
 
489 aa  325  1e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248346  normal  0.0238408 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3442  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  38 
 
 
496 aa  324  2e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.811835  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2209  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  40.27 
 
 
472 aa  325  2e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3678  outer membrane efflux protein  39.65 
 
 
469 aa  324  2e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0849669  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0516  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  38.99 
 
 
500 aa  318  1e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0482869  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0329  RND efflux system outer membrane lipoprotein  37.58 
 
 
472 aa  315  8e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.378923 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0499  RND efflux system outer membrane lipoprotein  39.61 
 
 
485 aa  315  8e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0480  RND efflux system outer membrane lipoprotein  39.45 
 
 
505 aa  315  8e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0104002 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2654  RND efflux system outer membrane lipoprotein  39 
 
 
507 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0354944  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2527  RND efflux system outer membrane lipoprotein  39 
 
 
507 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.10146 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2869  RND efflux system outer membrane lipoprotein  37.26 
 
 
480 aa  311  1e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.451085  normal  0.401715 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5938  RND efflux system outer membrane lipoprotein  39.04 
 
 
507 aa  311  2e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0183223  normal  0.547092 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2064  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  39.82 
 
 
499 aa  311  2e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0321  RND efflux system outer membrane lipoprotein  39.12 
 
 
480 aa  311  2e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.877077 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3466  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  39.25 
 
 
461 aa  310  2.9999999999999997e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4833  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  39.96 
 
 
474 aa  309  9e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.820871  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1737  RND efflux system outer membrane lipoprotein NodT  35.68 
 
 
497 aa  309  9e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00746142  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0316  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  39.16 
 
 
481 aa  308  1.0000000000000001e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.464824  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1154  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  37.96 
 
 
501 aa  307  3e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.039626  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3490  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38.56 
 
 
503 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.350691 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3841  RND efflux system outer membrane lipoprotein  41.31 
 
 
490 aa  306  7e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.626052  normal  0.467321 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0690  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38.8 
 
 
507 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.491395 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3271  outer membrane efflux protein OprA  39.25 
 
 
467 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0682  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38.97 
 
 
519 aa  303  6.000000000000001e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.323921  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1286  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38.97 
 
 
543 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.556611  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1220  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  42.72 
 
 
467 aa  302  7.000000000000001e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.373524  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2607  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38.62 
 
 
507 aa  302  9e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1997  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  38.62 
 
 
507 aa  302  9e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0794932  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2636  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38.62 
 
 
507 aa  300  3e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3424  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  38.3 
 
 
514 aa  300  5e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0567  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38.43 
 
 
483 aa  299  6e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0009  drug efflux lipoprotein  38.72 
 
 
514 aa  299  9e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.347699  normal  0.0645676 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3256  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  35.53 
 
 
525 aa  298  9e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.865648 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3444  RND efflux system outer membrane lipoprotein  36.13 
 
 
495 aa  297  2e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.960604 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0387  Fis family transcriptional regulator  37.99 
 
 
492 aa  298  2e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1450  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  36.58 
 
 
471 aa  297  2e-79  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3747  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  38.09 
 
 
514 aa  298  2e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.846743  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0080  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38.33 
 
 
551 aa  297  3e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1020  outer membrane efflux protein  38.33 
 
 
514 aa  296  4e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.224609  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0856  outer membrane efflux protein OprB  38.33 
 
 
514 aa  296  4e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2544  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  36.54 
 
 
467 aa  296  4e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.109213  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0710  RND efflux system outer membrane lipoprotein  37.24 
 
 
515 aa  296  4e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.437206  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0861  outer membrane efflux protein OprB  38.33 
 
 
514 aa  296  4e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.89354  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1582  outer membrane efflux protein OprB  38.33 
 
 
512 aa  296  4e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6609  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38.09 
 
 
510 aa  296  5e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.64888  normal  0.8754 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1499  outer membrane efflux protein OprB  38.33 
 
 
512 aa  296  5e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.112473  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3590  RND efflux system outer membrane lipoprotein NodT  37.98 
 
 
491 aa  296  5e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>