65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1796 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_1796  DNA ligase (ATP)  100 
 
 		 271 aa  564  1e-160  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1324  DNA ligase  46.86 
 
 		 269 aa  269  2.9999999999999997e-71  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0465  DNA ligase  49.46 
 
 		 275 aa  266  2.9999999999999995e-70  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.51001  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1225  DNA ligase  51.76 
 
 		 302 aa  265  4e-70  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0877468  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0782  DNA ligase  48.43 
 
 		 275 aa  256  2e-67  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.200091  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1395  DNA ligase  48.43 
 
 		 272 aa  255  5e-67  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.168291  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1672  DNA ligase  45.67 
 
 		 266 aa  236  4e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0584  DNA ligase  42.28 
 
 		 272 aa  231  1e-59  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000000250691  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0036  DNA ligase  41.9 
 
 		 312 aa  231  1e-59  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2043  DNA ligase  41.34 
 
 		 282 aa  225  6e-58  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000183031  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1665  DNA ligase  41.34 
 
 		 282 aa  224  1e-57  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1841  DNA ligase  40.64 
 
 		 282 aa  219  5e-56  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.867286  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0073  DNA ligase  40.23 
 
 		 279 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.555561  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2401  DNA ligase  42.04 
 
 		 304 aa  206  3e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.980486 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3695  DNA ligase  41.25 
 
 		 295 aa  206  4e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2639  DNA ligase  40.32 
 
 		 281 aa  206  4e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00943925  normal  0.0523485 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2416  DNA ligase  40.93 
 
 		 306 aa  203  2e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1484  DNA ligase  39.16 
 
 		 282 aa  203  3e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.159526  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3497  DNA ligase  42.37 
 
 		 337 aa  200  1.9999999999999998e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.105029 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1587  DNA ligase  42.21 
 
 		 270 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.382464  normal  0.257911 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1838  DNA ligase  37.87 
 
 		 315 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00105408  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2439  DNA ligase  37.87 
 
 		 309 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.488176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2019  DNA ligase  39.77 
 
 		 295 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1148  DNA ligase  40.6 
 
 		 282 aa  196  4.0000000000000005e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.269751  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2204  DNA ligase  36.26 
 
 		 311 aa  195  5.000000000000001e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1235  DNA ligase  38.19 
 
 		 279 aa  194  1e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1852  DNA ligase  37.5 
 
 		 315 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0107738  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1748  DNA ligase  38.98 
 
 		 309 aa  194  2e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2268  DNA ligase  38.13 
 
 		 302 aa  194  2e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.819174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2191  DNA ligase  38.52 
 
 		 302 aa  194  2e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.163072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1886  DNA ligase  41.08 
 
 		 315 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0219866  normal  0.840695 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0812  DNA ligase  38.52 
 
 		 306 aa  194  2e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.35337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1157  DNA ligase  41.5 
 
 		 279 aa  192  5e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00148017  normal  0.132142 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03421  DNA ligase  37.17 
 
 		 317 aa  191  1e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4404  DNA ligase  39.26 
 
 		 292 aa  189  5e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2739  DNA ligase  39.44 
 
 		 283 aa  188  7e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1359  DNA ligase  38.74 
 
 		 290 aa  186  3e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0077  DNA ligase  39.24 
 
 		 298 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.285949  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2511  DNA ligase  38.19 
 
 		 291 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1990  DNA ligase  39.17 
 
 		 288 aa  183  3e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00542431 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2251  DNA ligase  38.58 
 
 		 375 aa  171  1e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1436  DNA ligase  35.83 
 
 		 298 aa  170  2e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.532256  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2712  DNA ligase  37.25 
 
 		 303 aa  170  2e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0226859 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2369  DNA ligase  35.93 
 
 		 279 aa  169  4e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.815308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2761  DNA ligase  38.58 
 
 		 326 aa  169  4e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1366  DNA ligase  33.86 
 
 		 284 aa  169  6e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.332373  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003526  ATP-dependent DNA ligase  35.71 
 
 		 281 aa  167  2e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1995  DNA ligase  34.47 
 
 		 282 aa  153  4e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0244293  normal  0.371724 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1648  PBCV-1 DNA ligase  25.96 
 
 		 306 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.176774  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1534  DNA ligase, ATP-dependent  27.24 
 
 		 432 aa  49.7  0.00005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120841  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0832  DNA ligase D  27.42 
 
 		 656 aa  49.7  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2438  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  35.53 
 
 		 509 aa  48.1  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.126191  normal  0.0460021 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18891  ATP-dependent DNA ligase  27.07 
 
 		 437 aa  47.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.986725  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2156  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  27.78 
 
 		 550 aa  46.6  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.521071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18701  ATP-dependent DNA ligase  34.15 
 
 		 412 aa  46.2  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1799  ATP-dependent DNA ligase  34.83 
 
 		 520 aa  45.8  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.07397  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1846  ATP-dependent DNA ligase  34.83 
 
 		 520 aa  45.8  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.297739  normal  0.661172 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1780  ATP-dependent DNA ligase  34.83 
 
 		 520 aa  45.8  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.161511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18701  ATP-dependent DNA ligase  27.07 
 
 		 437 aa  45.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.570895  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0026  DNA ligase D  26.89 
 
 		 825 aa  44.7  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.282762  hitchhiker  0.00000000359668 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1772  ATP-dependent DNA ligase  35.9 
 
 		 437 aa  44.3  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0620  hypothetical protein  25.62 
 
 		 546 aa  44.7  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2882  DNA ligase I, ATP-dependent (dnl1)  27.67 
 
 		 547 aa  43.5  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.812327  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5341  ATP-dependent DNA ligase  25.23 
 
 		 881 aa  42.4  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0581605 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1695  ATP dependent DNA ligase  22.92 
 
 		 843 aa  42.4  0.009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.616199  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>