More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1754 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_1754  Shikimate kinase  100 
 
 		 184 aa  367  1e-101  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0776  shikimate kinase  63.41 
 
 		 173 aa  199  1.9999999999999998e-50  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1187  shikimate kinase  57.74 
 
 		 174 aa  194  7e-49  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1340  shikimate kinase  57.74 
 
 		 177 aa  189  2e-47  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0052  shikimate kinase  57.76 
 
 		 170 aa  182  2.0000000000000003e-45  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0495  shikimate kinase  57.79 
 
 		 171 aa  164  6.9999999999999995e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1571  shikimate kinase  47.31 
 
 		 165 aa  141  4e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0436  shikimate kinase  46.11 
 
 		 165 aa  140  8e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0410  shikimate kinase  45.51 
 
 		 165 aa  140  9.999999999999999e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0535  shikimate kinase  44.05 
 
 		 165 aa  135  2e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2368  Shikimate kinase  42.11 
 
 		 165 aa  102  3e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0733676  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2532  shikimate kinase  33.53 
 
 		 173 aa  97.4  9e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.884272  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1517  shikimate kinase  36.31 
 
 		 171 aa  95.1  5e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06600  shikimate kinase  34.71 
 
 		 188 aa  95.1  5e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0528  Shikimate kinase  34.5 
 
 		 166 aa  94  1e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.276227  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4020  shikimate kinase  33.72 
 
 		 181 aa  92.4  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.263055  normal  0.623088 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1457  Shikimate kinase  35.29 
 
 		 172 aa  91.7  5e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2922  shikimate kinase  38.07 
 
 		 165 aa  91.3  6e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0894  shikimate kinase  33.87 
 
 		 190 aa  89  4e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00120765  hitchhiker  0.000836884 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3880  shikimate kinase  31.61 
 
 		 170 aa  88.6  4e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1819  shikimate kinase  34.5 
 
 		 169 aa  88.2  6e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0893  shikimate kinase  33.33 
 
 		 165 aa  87.8  7e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0392  shikimate kinase  31.07 
 
 		 184 aa  87.8  8e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2137  shikimate kinase  31.43 
 
 		 174 aa  87.8  9e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.628527  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0311  shikimate kinase  33.33 
 
 		 184 aa  87  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0053  shikimate kinase  38.07 
 
 		 172 aa  86.3  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.541651  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4313  shikimate kinase  31.84 
 
 		 170 aa  86.3  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3489  shikimate kinase  31.07 
 
 		 184 aa  86.7  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0696  shikimate kinase  36.14 
 
 		 163 aa  86.7  2e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4089  shikimate kinase  32.95 
 
 		 165 aa  86.7  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0091  shikimate kinase  33.72 
 
 		 173 aa  85.9  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.10625 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01390  shikimate kinase  35.15 
 
 		 185 aa  85.9  3e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0536542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3729  shikimate kinase  31.61 
 
 		 184 aa  85.5  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.427035  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3206  shikimate kinase  31.61 
 
 		 209 aa  85.5  4e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.289523  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0731  shikimate kinase  35.09 
 
 		 170 aa  85.5  4e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000355155  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3758  shikimate kinase  31.61 
 
 		 177 aa  85.1  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.485321  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2747  shikimate kinase  31.61 
 
 		 177 aa  85.1  5e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2797  shikimate kinase  31.61 
 
 		 177 aa  85.1  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.135069  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1757  shikimate kinase  31.61 
 
 		 177 aa  85.1  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3700  shikimate kinase  31.61 
 
 		 177 aa  85.1  5e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.049823  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0441  shikimate kinase  34.91 
 
 		 176 aa  84.7  6e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.567872  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0528  shikimate kinase  35.84 
 
 		 168 aa  85.1  6e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.361692  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1308  shikimate kinase  33.71 
 
 		 172 aa  84.7  7e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0211808 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3024  shikimate kinase  31.03 
 
 		 199 aa  84.3  8e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_407  shikimate kinase  34.1 
 
 		 176 aa  84.3  9e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0359  shikimate kinase  31.82 
 
 		 183 aa  84.3  9e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0471264 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0678  shikimate kinase  30.56 
 
 		 182 aa  84  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.211914 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4366  shikimate kinase  32.37 
 
 		 165 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0792  Shikimate kinase  35.37 
 
 		 180 aa  83.2  0.000000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  3.5919e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1529  shikimate kinase  32.73 
 
 		 180 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.140024  normal  0.642585 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3267  shikimate kinase  29.63 
 
 		 229 aa  83.2  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2549  Shikimate kinase  30.59 
 
 		 189 aa  82.8  0.000000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2437  shikimate kinase  33.53 
 
 		 169 aa  82.4  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00281475  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3977  shikimate kinase  32.37 
 
 		 165 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.537604  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3987  shikimate kinase  31.79 
 
 		 165 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.585593  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0207  shikimate kinase  32.6 
 
 		 183 aa  82.8  0.000000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.807253  normal  0.16478 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2817  shikimate kinase  33.73 
 
 		 181 aa  82.8  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.248239  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4255  shikimate kinase  32.37 
 
 		 165 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1479  shikimate kinase  33.73 
 
 		 193 aa  82.8  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.298287  normal  0.404477 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2255  shikimate kinase  30.81 
 
 		 166 aa  82.4  0.000000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0472  shikimate kinase  33.9 
 
 		 172 aa  82  0.000000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0810879  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0372  shikimate kinase  30.99 
 
 		 167 aa  82.4  0.000000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0374428  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0977  shikimate kinase  30.64 
 
 		 168 aa  82  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.937224  normal  0.13223 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4010  shikimate kinase I  31.58 
 
 		 196 aa  82  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2486  Shikimate kinase  33.52 
 
 		 192 aa  82.4  0.000000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1840  Shikimate kinase  31.07 
 
 		 188 aa  81.6  0.000000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0636308  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4137  shikimate kinase  32.37 
 
 		 165 aa  82  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.151576  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4457  shikimate kinase  32.37 
 
 		 165 aa  82  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.745283  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0994  shikimate kinase I  34.09 
 
 		 175 aa  81.3  0.000000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0963  shikimate kinase I  34.09 
 
 		 175 aa  81.3  0.000000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2794  shikimate kinase  28.57 
 
 		 183 aa  81.6  0.000000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0652  shikimate kinase  32.77 
 
 		 195 aa  81.6  0.000000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0461  Shikimate kinase  31.06 
 
 		 182 aa  81.6  0.000000000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.196484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0553  shikimate kinase  32.95 
 
 		 181 aa  81.3  0.000000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.387005  normal  0.100064 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2345  shikimate kinase  32.2 
 
 		 199 aa  81.3  0.000000000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3598  shikimate kinase  30.29 
 
 		 183 aa  81.3  0.000000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000887516  hitchhiker  0.0000000252706 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3757  shikimate kinase  34.09 
 
 		 220 aa  81.3  0.000000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.28547 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0952  Shikimate kinase  34.48 
 
 		 187 aa  80.9  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1431  shikimate kinase  33.52 
 
 		 196 aa  80.9  0.000000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.373345  normal  0.0895571 
 
 
-
 
NC_002936  DET0464  shikimate kinase  31.76 
 
 		 176 aa  80.5  0.00000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3130  shikimate kinase  30.68 
 
 		 192 aa  80.5  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3966  shikimate kinase I  34.29 
 
 		 173 aa  80.5  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  1.60057e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0225  shikimate kinase I  34.29 
 
 		 173 aa  80.5  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000000752096  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4053  shikimate kinase  33.53 
 
 		 197 aa  80.5  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.477248  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3727  shikimate kinase I  34.29 
 
 		 173 aa  80.5  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000000014395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2170  shikimate kinase  29.78 
 
 		 201 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.987325  normal  0.0949629 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1589  Shikimate kinase, 3-dehydroquinate synthase  31.84 
 
 		 579 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.025257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2456  shikimate kinase  30.81 
 
 		 170 aa  79.7  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.209695  normal  0.679915 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0979  Shikimate kinase  34.48 
 
 		 187 aa  80.1  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0506883 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2745  shikimate kinase  36.16 
 
 		 173 aa  79.7  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.164945  normal  0.272805 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1030  shikimate 5-dehydrogenase  34.5 
 
 		 454 aa  79  0.00000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2686  shikimate kinase  34.68 
 
 		 169 aa  79  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.536815  normal  0.0662498 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1506  shikimate kinase  34.91 
 
 		 184 aa  79.3  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.494789 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2014  shikimate kinase  31.58 
 
 		 169 aa  78.6  0.00000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4605  shikimate kinase I  33.71 
 
 		 173 aa  78.6  0.00000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000116276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2646  shikimate kinase  33.33 
 
 		 220 aa  78.6  0.00000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.323516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0613  shikimate kinase  32.95 
 
 		 180 aa  78.6  0.00000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2413  shikimate kinase  32.56 
 
 		 183 aa  78.2  0.00000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.237491  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3883  shikimate kinase I  33.71 
 
 		 173 aa  77.8  0.00000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000719849  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1132  shikimate kinase  29.21 
 
 		 200 aa  78.2  0.00000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.220163  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>