More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1722 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_1722  DNA-cytosine methyltransferase  100 
 
 
335 aa  701    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000269653  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0079  DNA-cytosine methyltransferase  63.69 
 
 
335 aa  437  1e-121  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0160  DNA-cytosine methyltransferase  62.73 
 
 
328 aa  424  1e-117  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2320  DNA-cytosine methyltransferase  41.28 
 
 
334 aa  225  8e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5355  modification methylase HaeIII  37.57 
 
 
313 aa  203  4e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000134666  hitchhiker  1.11891e-16 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5354  modification methylase HaeIII  36.65 
 
 
313 aa  193  3e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000130575  hitchhiker  4.94055e-16 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0272  DNA-cytosine methyltransferase  35.12 
 
 
308 aa  179  5.999999999999999e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.861301  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0271  DNA-cytosine methyltransferase  35.52 
 
 
310 aa  179  5.999999999999999e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1633  DNA-cytosine methyltransferase  34.84 
 
 
368 aa  173  5e-42  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00134402  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4319  DNA-cytosine methyltransferase family protein  35.87 
 
 
312 aa  172  1e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00165512 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1155  DNA-cytosine methyltransferase  36.45 
 
 
317 aa  169  5e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0082  DNA-cytosine methyltransferase  32.46 
 
 
423 aa  159  4e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0084  DNA-cytosine methyltransferase  31.99 
 
 
423 aa  160  4e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1968  DNA-cytosine methyltransferase  31.94 
 
 
324 aa  157  3e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0060  DNA-cytosine methyltransferase  30.95 
 
 
329 aa  156  5.0000000000000005e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2549  DNA-cytosine methyltransferase  31.12 
 
 
338 aa  153  4e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.149278  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0102  DNA-cytosine methyltransferase  30.41 
 
 
438 aa  152  1e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.557518  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0587  DNA-cytosine methyltransferase  33.01 
 
 
319 aa  151  1e-35  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  decreased coverage  0.00791678  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3855  DNA-cytosine methyltransferase  33.04 
 
 
313 aa  150  3e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  3.45727e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3438  DNA modification cytosine-specific methyltransferase protein  31.11 
 
 
364 aa  149  9e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1616  C-5 cytosine-specific DNA methylase family protein  32.54 
 
 
345 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1565  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  32.8 
 
 
328 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf138  cytosine-specific methyltransferase, related to HhaI  30.65 
 
 
327 aa  147  3e-34  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  decreased coverage  0.000711386  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0731  site-specific DNA methylase  43.18 
 
 
406 aa  147  3e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00265008  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1205  DNA-cytosine methyltransferase  32.16 
 
 
632 aa  144  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.649135 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0535  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  29.55 
 
 
357 aa  139  7.999999999999999e-32  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373164 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0419  C-5 cytosine-specific DNA methylase  32.02 
 
 
405 aa  137  2e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000336169  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2889  DNA-cytosine methyltransferase  30.33 
 
 
373 aa  136  5e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000172243  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1529  DNA-cytosine methyltransferase  30.45 
 
 
402 aa  135  8e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000344499  unclonable  0.000000000227525 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4262  DNA-cytosine methyltransferase  30.87 
 
 
415 aa  135  8e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4810  DNA-cytosine methyltransferase  31.14 
 
 
379 aa  135  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1132  DNA-cytosine methyltransferase  28.68 
 
 
395 aa  134  1.9999999999999998e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.53813  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0232  C-5 cytosine-specific DNA methylase  30.05 
 
 
415 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.547554  decreased coverage  0.000406028 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2257  DNA-cytosine methyltransferase  30.14 
 
 
323 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120501 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00371  site-specific DNA methylase  30.65 
 
 
305 aa  134  3e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1568  DNA-cytosine methyltransferase  30.65 
 
 
662 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0406485  hitchhiker  0.00122877 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1473  DNA-cytosine methyltransferase  30.28 
 
 
360 aa  133  5e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1018  DNA-cytosine methyltransferase  28.61 
 
 
418 aa  132  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.928901 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0989  DNA-cytosine methyltransferase  28.61 
 
 
418 aa  132  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2666  DNA-cytosine methyltransferase  35.5 
 
 
460 aa  132  9e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.566614  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3758  cytosine-specific DNA methylase  29.69 
 
 
443 aa  132  9e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.00145147  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3450  DNA-cytosine methyltransferase  35.5 
 
 
460 aa  132  9e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6992  DNA-cytosine methyltransferase  30.45 
 
 
454 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2280  DNA-cytosine methyltransferase  30.99 
 
 
313 aa  131  2.0000000000000002e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.977909 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2462  DNA-cytosine methyltransferase  32.52 
 
 
412 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.017331  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0531  DNA-cytosine methyltransferase  29.29 
 
 
421 aa  130  5.0000000000000004e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.247848 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0652  DNA-cytosine methyltransferase  28.44 
 
 
329 aa  129  5.0000000000000004e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000019493  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1008  cytosine-specific methyltransferase NlaX  29.2 
 
 
350 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.02363e-62 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1510  DNA-cytosine methyltransferase  31.05 
 
 
414 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04735  DNA (cytosine-5)-methyltransferase PliMCI  28.83 
 
 
395 aa  129  6e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.584322  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3989  DNA-cytosine methyltransferase  30.61 
 
 
348 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.519304  normal  0.0147961 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4296  DNA-cytosine methyltransferase  37 
 
 
456 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4374  DNA-cytosine methyltransferase  27.46 
 
 
417 aa  128  1.0000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.423632  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4356  DNA-cytosine methyltransferase  37 
 
 
456 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.593221  normal  0.193587 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4525  DNA-cytosine methyltransferase  30.47 
 
 
337 aa  127  2.0000000000000002e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.301699 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2867  DNA-cytosine methyltransferase  28.99 
 
 
416 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000939229  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0816  DNA-cytosine methyltransferase  28.61 
 
 
350 aa  127  3e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1847  DNA-cytosine methyltransferase  28.61 
 
 
446 aa  126  5e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139503  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4605  DNA-cytosine methyltransferase family protein  31.32 
 
 
362 aa  125  9e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000208195  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2522  transcriptional regulator, XRE family  31.16 
 
 
468 aa  125  1e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153243  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0022  DNA-cytosine methyltransferase  29.87 
 
 
465 aa  125  1e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0809764  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1078  hypothetical protein  28.99 
 
 
320 aa  123  5e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1243  DNA-cytosine methyltransferase  30.59 
 
 
325 aa  123  6e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0139  DNA-cytosine methyltransferase  28.61 
 
 
361 aa  122  6e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00921515  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1675  DNA-cytosine methyltransferase  29.6 
 
 
319 aa  122  6e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0148653 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4919  DNA-cytosine methyltransferase  28.77 
 
 
416 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00440588 
 
 
-
 
NC_012790  GWCH70_3472  DNA-cytosine methyltransferase  34.98 
 
 
370 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000168758  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1050  DNA-cytosine methyltransferase  29.87 
 
 
361 aa  122  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00805794  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0568  DNA-cytosine methyltransferase  30.05 
 
 
652 aa  122  9.999999999999999e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.905473  normal 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2371  DNA-cytosine methyltransferase  28.61 
 
 
419 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0692329  hitchhiker  0.000000223127 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1093  DNA-cytosine methyltransferase  28 
 
 
386 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3736  DNA-cytosine methyltransferase  39.55 
 
 
434 aa  120  3e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.730052  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1383  DNA-cytosine methyltransferase  31.38 
 
 
309 aa  120  3e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1526  DNA-cytosine methyltransferase  29.91 
 
 
311 aa  120  3e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.5111e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4337  cytosine-specific methyltransferase NlaX  31.18 
 
 
348 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0259442  hitchhiker  0.000000011708 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4962  DNA-cytosine methyltransferase  30.89 
 
 
342 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2360  DNA-cytosine methyltransferase  28.15 
 
 
336 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00768264  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2695  DNA-cytosine methyltransferase  30.45 
 
 
320 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2644  C-5 cytosine-specific DNA methylase  37.43 
 
 
362 aa  119  7.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0416  DNA-cytosine methyltransferase  31.2 
 
 
320 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0644  DNA-cytosine methyltransferase  29 
 
 
390 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000274432  normal  0.895055 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3927  DNA-cytosine methyltransferase  34.52 
 
 
500 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.427822  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3399  DNA-cytosine methyltransferase  28.7 
 
 
356 aa  117  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.273087  hitchhiker  0.000000104958 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0121  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  29.53 
 
 
395 aa  116  3.9999999999999997e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0819  modification methylase HaeIII (cytosine-specificmethyltransferase HaeIII; M.HaeIII)  28.61 
 
 
388 aa  116  3.9999999999999997e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.230352  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2793  DNA-cytosine methyltransferase  27.49 
 
 
727 aa  116  5e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1270  DNA-cytosine methyltransferase  30.18 
 
 
406 aa  116  6e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2314  DNA-cytosine methyltransferase  29.41 
 
 
340 aa  115  2.0000000000000002e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.704291 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2163  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  26.72 
 
 
375 aa  114  2.0000000000000002e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.41914  normal  0.896778 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0047  cytosine-specific methyltransferase NlaX (M.NlaX)  28.07 
 
 
352 aa  114  2.0000000000000002e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00306927  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1322  DNA-cytosine methyltransferase  30.75 
 
 
429 aa  114  3e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000848316  hitchhiker  0.000198005 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0206  DNA-cytosine methyltransferase  30.19 
 
 
398 aa  114  3e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.711166  hitchhiker  0.00000436024 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4252  DNA-cytosine methyltransferase  30.21 
 
 
318 aa  114  3e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0263417 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1127  DNA-cytosine methyltransferase  28.66 
 
 
359 aa  113  4.0000000000000004e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000503374  unclonable  0.0000088158 
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4233  DNA-cytosine methyltransferase  34.81 
 
 
283 aa  113  4.0000000000000004e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3307  DNA-cytosine methyltransferase  28.27 
 
 
331 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.594869 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0756  DNA-cytosine methyltransferase  28.08 
 
 
671 aa  112  7.000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.967927  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0298  DNA-cytosine methyltransferase  26.63 
 
 
415 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2535  DNA-cytosine methyltransferase  28.69 
 
 
400 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0727  DNA-cytosine methyltransferase  26.92 
 
 
372 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00617337  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>