More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1662 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008787  CJJ81176_0536  penicillin-binding protein 1A  56.62 
 
 		 643 aa  748    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1074  penicillin-binding protein 1A  56.46 
 
 		 644 aa  734    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0048  succinate dehydrogenase, iron-sulfur protein subunit  60.47 
 
 		 642 aa  812    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0615  penicillin-binding protein 1A  56.62 
 
 		 643 aa  748    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1427  penicillin-binding protein 1A  56.15 
 
 		 643 aa  739    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1662  penicillin-binding protein, 1A family  100 
 
 		 641 aa  1320    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0230807  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1892  penicillin-binding protein 1A  54.64 
 
 		 655 aa  717    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.477214  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0983  penicillin-binding protein 1A (PBP-1a) (PBP1a) (penicillin-bindingprotein A)  57.55 
 
 		 638 aa  767    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0683  penicillin-binding protein 1A (PBP-1a) (PBP1a)  60.16 
 
 		 642 aa  807    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1032  penicillin-binding protein 1A (PBP-1a) (PBP1a)  60.51 
 
 		 645 aa  802    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00344643  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0135  1A family penicillin-binding protein  39.34 
 
 		 646 aa  420  1e-116  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000146416  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0858  penicillin-binding protein, 1A family  38.89 
 
 		 618 aa  388  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00486988  hitchhiker  0.00041503 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1056  penicillin-binding protein, 1A family  36.61 
 
 		 751 aa  374  1e-102  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1832  1A family penicillin-binding protein  36.51 
 
 		 713 aa  372  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.421648  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1773  1A family penicillin-binding protein  36.57 
 
 		 713 aa  372  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0214  penicillin-binding protein 1A  36.38 
 
 		 707 aa  369  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.560264 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0432  1A family penicillin-binding protein  36.57 
 
 		 713 aa  372  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4831  1A family penicillin-binding protein  36.91 
 
 		 709 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.982435 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1123  1A family penicillin-binding protein  36.51 
 
 		 713 aa  372  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.438177  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0832  1A family penicillin-binding protein  36.51 
 
 		 713 aa  372  1e-101  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.313161  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0339  1A family penicillin-binding protein  36.57 
 
 		 713 aa  372  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5424  penicillin-binding protein 1A  36.91 
 
 		 709 aa  369  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.122893  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5438  1A family penicillin-binding protein  36.91 
 
 		 709 aa  369  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.899041 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4779  1A family penicillin-binding protein  36.68 
 
 		 705 aa  365  2e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.819685 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0926  penicillin-binding protein 1A  34.95 
 
 		 640 aa  360  4e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3332  1A family penicillin-binding protein  36.09 
 
 		 714 aa  360  5e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.741858  hitchhiker  0.0086967 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05690  penicillin-binding protein, 1A family  35.44 
 
 		 806 aa  358  9.999999999999999e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5322  1A family penicillin-binding protein  36.33 
 
 		 714 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0217  penicillin-binding protein, 1A family  37.17 
 
 		 643 aa  358  1.9999999999999998e-97  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.380595  hitchhiker  0.00649941 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0220  penicillin-binding protein, 1A family  37.17 
 
 		 643 aa  358  1.9999999999999998e-97  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2145  1A family penicillin-binding protein  35.87 
 
 		 710 aa  356  7.999999999999999e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1696  penicillin-binding protein, 1A family  36.27 
 
 		 761 aa  354  2.9999999999999997e-96  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.235679  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3992  bifunctional peptidoglycan glycosyl transferase/transpeptidase  36.03 
 
 		 687 aa  354  2.9999999999999997e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.155009  normal  0.126986 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2535  penicillin-binding protein, 1A family  35.25 
 
 		 643 aa  353  8e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3673  penicillin-binding protein 1A  35.14 
 
 		 679 aa  352  1e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.52133  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2066  1A family penicillin-binding protein  34.65 
 
 		 640 aa  352  1e-95  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1671  penicillin-binding protein 1A  36.39 
 
 		 693 aa  350  4e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000000343648  normal  0.536303 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1561  1A family penicillin-binding protein  34.71 
 
 		 662 aa  345  1e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00865388  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0290  1A family penicillin-binding protein  35.98 
 
 		 757 aa  345  1e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2571  penicillin-binding protein 1A  35.71 
 
 		 625 aa  343  5.999999999999999e-93  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.558946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1300  penicillin-binding protein, 1A family  35.04 
 
 		 648 aa  343  7e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.396458  hitchhiker  0.0031785 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1369  1A family penicillin-binding protein  36.67 
 
 		 765 aa  342  1e-92  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1710  penicillin-binding protein 1A  35.35 
 
 		 905 aa  339  7e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000352248  normal  0.214747 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2430  1A family penicillin-binding protein  35.32 
 
 		 667 aa  339  8e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000145418  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0389  penicillin-binding protein, 1A family  34.12 
 
 		 656 aa  338  2.9999999999999997e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6778  1A family penicillin-binding protein  36.74 
 
 		 714 aa  335  1e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1128  penicillin-binding protein, 1A family  34.99 
 
 		 648 aa  336  1e-90  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0597  penicillin-binding protein, 1A family  33.85 
 
 		 665 aa  332  1e-89  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7522  penicillin-binding protein, 1A family  36.07 
 
 		 714 aa  330  6e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.276054  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1109  peptidoglycan glycosyltransferase  34.44 
 
 		 795 aa  328  2.0000000000000001e-88  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000046818  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0908  1A family penicillin-binding protein  34.49 
 
 		 766 aa  327  4.0000000000000003e-88  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0080  1A family penicillin-binding protein  33.16 
 
 		 704 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2011  penicillin-binding protein, 1A family  35.27 
 
 		 676 aa  327  5e-88  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2389  penicillin-binding protein, 1A family  36.47 
 
 		 727 aa  326  6e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.390791  normal  0.221681 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0444  1A family penicillin-binding protein  33.16 
 
 		 654 aa  326  8.000000000000001e-88  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0008  1A family penicillin-binding protein  35.3 
 
 		 775 aa  325  1e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000321042 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5243  penicillin-binding protein, 1A family  36.05 
 
 		 727 aa  325  2e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.766198  normal  0.919451 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0897  1A family penicillin-binding protein  36.09 
 
 		 691 aa  324  3e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.376717 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4776  1A family penicillin-binding protein  36.05 
 
 		 727 aa  324  3e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.119918  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3352  penicillin-binding protein, 1A family  35.86 
 
 		 683 aa  323  4e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00461101  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0785  penicillin-binding protein 1A  34.65 
 
 		 712 aa  323  5e-87  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.649225 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0988  1A family penicillin-binding protein  34.36 
 
 		 746 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0823  1A family penicillin-binding protein  34.35 
 
 		 705 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5318  penicillin-binding protein, 1A family  35.44 
 
 		 728 aa  319  9e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2308  penicillin-binding protein 1A  38.46 
 
 		 761 aa  317  4e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0308818  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3571  penicillin-binding protein, 1A family  33.86 
 
 		 744 aa  317  5e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0506  penicillin-binding protein, 1A family  37.36 
 
 		 796 aa  316  6e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.396512  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2100  1A family penicillin-binding protein  36.44 
 
 		 661 aa  316  9e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0235  penicillin-binding protein, 1A family  34.19 
 
 		 880 aa  316  9.999999999999999e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1803  1A family penicillin-binding protein  33.61 
 
 		 708 aa  315  1.9999999999999998e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0343  penicillin-binding protein, 1A family  34.16 
 
 		 774 aa  314  2.9999999999999996e-84  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.314658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0316  penicillin-binding protein, 1A family  33.38 
 
 		 750 aa  313  9e-84  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.223118 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3175  1A family penicillin-binding protein  36.59 
 
 		 728 aa  312  1e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0163  1A family penicillin-binding protein  32.44 
 
 		 713 aa  312  1e-83  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3502  penicillin-binding protein, 1A family  32.96 
 
 		 701 aa  312  1e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.114695  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1166  penicillin-binding protein 1  34.46 
 
 		 746 aa  311  2e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0998  penicillin-binding protein 1  34.02 
 
 		 705 aa  311  2e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0983  penicillin-binding protein 1  33.86 
 
 		 705 aa  311  2e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2820  penicillin-binding protein, 1A family  35.48 
 
 		 727 aa  311  2e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.727063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0739  penicillin-binding protein, 1A family  31.99 
 
 		 668 aa  311  2e-83  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1069  penicillin-binding protein 1  34.02 
 
 		 705 aa  311  2e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2677  1A family penicillin-binding protein  35.19 
 
 		 724 aa  311  2.9999999999999997e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.288371  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1102  penicillin-binding protein 1  33.54 
 
 		 705 aa  311  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2868  1A family penicillin-binding protein  34.35 
 
 		 669 aa  311  2.9999999999999997e-83  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0010427  normal  0.721279 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1229  penicillin-binding protein 1  33.86 
 
 		 705 aa  310  4e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0883  1A family penicillin-binding protein  36.79 
 
 		 714 aa  310  4e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4203  penicillin-binding protein 1  34.25 
 
 		 705 aa  310  6.999999999999999e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0921  penicillin-binding protein  35.64 
 
 		 649 aa  310  6.999999999999999e-83  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0985  penicillin-binding protein 1  33.54 
 
 		 705 aa  309  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0583  1A family penicillin-binding protein  36.12 
 
 		 724 aa  308  1.0000000000000001e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5168  1A family penicillin-binding protein  33.11 
 
 		 683 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1151  penicillin-binding protein 1  33.54 
 
 		 705 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0950  penicillin-binding protein 1A  34.12 
 
 		 776 aa  308  2.0000000000000002e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2520  penicillin-binding protein 1A  36.4 
 
 		 750 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3888  1A family penicillin-binding protein  32.28 
 
 		 683 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.318045  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0878  1A family penicillin-binding protein  35.63 
 
 		 626 aa  308  2.0000000000000002e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.209414  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_004310  BR0583  1A family penicillin-binding protein  35.93 
 
 		 718 aa  307  3e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.161794  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1547  penicillin-binding protein  35.75 
 
 		 667 aa  307  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000544476 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1337  penicillin-binding protein 2A  35.91 
 
 		 680 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1510  penicillin-binding protein  35.3 
 
 		 680 aa  306  6e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00148274  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>