264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1655 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_1655  glycyl-tRNA synthetase, alpha subunit  100 
 
 
285 aa  599  1e-170  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.000000011952  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0284  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  79.64 
 
 
287 aa  484  1e-136  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000951554  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1439  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  79.72 
 
 
286 aa  485  1e-136  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.224233  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1047  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  78.65 
 
 
285 aa  486  1e-136  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0708  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  74.91 
 
 
301 aa  472  1e-132  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1857  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  77.58 
 
 
293 aa  471  1e-132  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.123358  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1002  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  77.58 
 
 
286 aa  468  1.0000000000000001e-131  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.607985  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0727  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  76.51 
 
 
287 aa  465  9.999999999999999e-131  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0153019  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1302  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  76.51 
 
 
287 aa  465  9.999999999999999e-131  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.476364  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0804  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  75.8 
 
 
287 aa  463  1e-129  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3256  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  67.38 
 
 
306 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0007  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  67.14 
 
 
301 aa  401  1e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00110  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  65.11 
 
 
318 aa  399  9.999999999999999e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0009  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  66.79 
 
 
301 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0111842  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2050  glycyl-tRNA synthetase, alpha subunit  66.19 
 
 
308 aa  399  9.999999999999999e-111  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.19493  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2049  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  64.39 
 
 
309 aa  395  1e-109  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0015  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  66.79 
 
 
301 aa  397  1e-109  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0010  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  66.79 
 
 
317 aa  395  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000663268  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0013  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  66.43 
 
 
301 aa  396  1e-109  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0007  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  66.79 
 
 
301 aa  397  1e-109  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0014  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  65.47 
 
 
315 aa  397  1e-109  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0013  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  66.43 
 
 
301 aa  396  1e-109  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000239617 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0009  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  66.43 
 
 
301 aa  396  1e-109  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00009  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  66.19 
 
 
301 aa  395  1e-109  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0009  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  65.47 
 
 
301 aa  394  1e-109  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.424313  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0013  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  66.43 
 
 
301 aa  396  1e-109  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0098701 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0009  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  66.79 
 
 
301 aa  397  1e-109  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000785129 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0009  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  66.79 
 
 
301 aa  397  1e-109  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.061235 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0017  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  66.79 
 
 
301 aa  397  1e-109  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000187933 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0026  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  66.79 
 
 
301 aa  395  1e-109  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0127788 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0039  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  66.07 
 
 
364 aa  397  1e-109  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0010  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  65.71 
 
 
301 aa  392  1e-108  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00552655 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0372  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  65.83 
 
 
314 aa  393  1e-108  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2575  glycyl-tRNA synthetase, alpha subunit  66.19 
 
 
314 aa  393  1e-108  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000932417 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0069  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  68.21 
 
 
304 aa  392  1e-108  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.055597  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11020  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.68 
 
 
310 aa  394  1e-108  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.244614  hitchhiker  0.000000479429 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0012  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  65.47 
 
 
317 aa  392  1e-108  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.569318 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00100  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  65.11 
 
 
315 aa  393  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0009  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  64.75 
 
 
315 aa  393  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0061  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  64.75 
 
 
315 aa  387  1e-107  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000378016 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0077  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  64.75 
 
 
315 aa  387  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000417626  normal  0.0864281 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2211  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  64.16 
 
 
317 aa  390  1e-107  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0184  glycyl-tRNA synthetase, alpha subunit  65.11 
 
 
315 aa  390  1e-107  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0012  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  64.75 
 
 
335 aa  389  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3978  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  67.14 
 
 
303 aa  388  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.805  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0080  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  64.75 
 
 
315 aa  388  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.352778  decreased coverage  0.00000000000895825 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0013  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  65.33 
 
 
287 aa  389  1e-107  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000247076 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4038  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  67.14 
 
 
303 aa  388  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.300559 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0077  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  64.75 
 
 
315 aa  388  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.189656  hitchhiker  0.000000000112208 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0060  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  66.79 
 
 
304 aa  388  1e-107  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0007  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  65.48 
 
 
323 aa  389  1e-107  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2056  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.7 
 
 
350 aa  389  1e-107  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.518988  normal  0.447026 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0162  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  66.79 
 
 
303 aa  387  1e-107  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3932  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  67.14 
 
 
303 aa  388  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3869  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  67.14 
 
 
303 aa  388  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3727  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  64.39 
 
 
302 aa  389  1e-107  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03411  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  66.79 
 
 
303 aa  386  1e-106  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0151  glycyl-tRNA synthetase, alpha subunit  66.79 
 
 
303 aa  386  1e-106  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0005  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.59 
 
 
311 aa  385  1e-106  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4450  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  66.79 
 
 
309 aa  387  1e-106  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3762  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  66.79 
 
 
303 aa  386  1e-106  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1774  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.35 
 
 
329 aa  387  1e-106  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0563652  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0155  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  66.79 
 
 
303 aa  386  1e-106  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3965  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  66.79 
 
 
303 aa  386  1e-106  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0007  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  64.6 
 
 
287 aa  386  1e-106  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3783  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  66.43 
 
 
304 aa  386  1e-106  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4255  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  65.48 
 
 
296 aa  387  1e-106  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00424245  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4055  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  66.79 
 
 
303 aa  386  1e-106  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1220  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  64.26 
 
 
304 aa  385  1e-106  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4935  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  66.79 
 
 
303 aa  386  1e-106  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.167741 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0013  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.8 
 
 
318 aa  387  1e-106  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.583173  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03362  hypothetical protein  66.79 
 
 
303 aa  386  1e-106  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4168  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  66.79 
 
 
304 aa  387  1e-106  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1232  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  66.79 
 
 
303 aa  386  1e-106  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3882  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  66.79 
 
 
303 aa  386  1e-106  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.943552  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3850  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  66.79 
 
 
303 aa  386  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4131  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  66.43 
 
 
304 aa  386  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0543  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.35 
 
 
317 aa  384  1e-106  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0022  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  66.43 
 
 
304 aa  386  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.535702  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0042  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  66.79 
 
 
304 aa  387  1e-106  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.772956  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0527  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.35 
 
 
317 aa  384  1e-106  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0240153 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3048  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.72 
 
 
296 aa  383  1e-105  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0314071  normal  0.0184819 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0354  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.57 
 
 
308 aa  382  1e-105  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1111  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.6 
 
 
322 aa  382  1e-105  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3330  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.25 
 
 
310 aa  382  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2498  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  67.5 
 
 
330 aa  379  1e-104  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0598  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  64.87 
 
 
290 aa  380  1e-104  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.4959400000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0603  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.28 
 
 
319 aa  379  1e-104  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1140  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.41 
 
 
303 aa  379  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0015  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.87 
 
 
287 aa  380  1e-104  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000278552 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2115  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.93 
 
 
319 aa  379  1e-104  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.160845  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0208  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.93 
 
 
319 aa  379  1e-104  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.11769  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2473  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.28 
 
 
295 aa  378  1e-104  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000559349  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0870  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.7 
 
 
308 aa  378  1e-104  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1265  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.8 
 
 
289 aa  380  1e-104  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.127189  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2964  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  67.86 
 
 
310 aa  379  1e-104  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3419  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.89 
 
 
312 aa  375  1e-103  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.268141  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1288  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.7 
 
 
312 aa  375  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.652722 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3099  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.89 
 
 
312 aa  376  1e-103  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0281521  normal  0.928263 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0443  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.06 
 
 
308 aa  375  1e-103  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0692449  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>