More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1621 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_1048  preprotein translocase subunit SecD  63.65 
 
 		 526 aa  667    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0707  preprotein translocase subunit SecD  68.27 
 
 		 521 aa  700    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.907979  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0071  preprotein translocase subunit SecD  67.58 
 
 		 510 aa  687    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0476  preprotein translocase subunit SecD  64.11 
 
 		 526 aa  660    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1621  protein-export membrane protein SecD  100 
 
 		 522 aa  1045    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0728  preprotein translocase subunit SecD  66.6 
 
 		 529 aa  685    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.347162  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1575  preprotein translocase subunit SecD  62.16 
 
 		 521 aa  629  1e-179  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1236  preprotein translocase subunit SecD  62.19 
 
 		 526 aa  623  1e-177  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.543695  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1111  preprotein translocase subunit SecD  62 
 
 		 526 aa  622  1e-177  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.789718  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0630  preprotein translocase subunit SecD  61.61 
 
 		 526 aa  619  1e-176  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1818  preprotein translocase subunit SecD  40.39 
 
 		 530 aa  375  1e-102  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00022831  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0846  preprotein translocase subunit SecD  39.14 
 
 		 533 aa  372  1e-101  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000476642  normal  0.132271 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0541  preprotein translocase subunit SecD  39.62 
 
 		 532 aa  368  1e-100  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0137043 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2433  preprotein translocase subunit SecD  41.09 
 
 		 532 aa  365  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.932422  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0681  preprotein translocase subunit SecD  39.52 
 
 		 531 aa  364  2e-99  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.565803  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1784  preprotein translocase subunit SecD  41.09 
 
 		 532 aa  363  5.0000000000000005e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00162006 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1718  preprotein translocase subunit SecD  39.88 
 
 		 533 aa  358  1.9999999999999998e-97  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1341  preprotein translocase subunit SecD  40.19 
 
 		 532 aa  356  5.999999999999999e-97  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.087277  normal  0.613358 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1798  preprotein translocase subunit SecD  40.54 
 
 		 530 aa  354  2e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1929  preprotein translocase subunit SecD  38.56 
 
 		 526 aa  352  1e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.991559  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2617  preprotein translocase subunit SecD  40.2 
 
 		 533 aa  350  2e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1892  preprotein translocase subunit SecD  40.23 
 
 		 533 aa  350  3e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000256259  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0854  preprotein translocase subunit SecD  40.08 
 
 		 533 aa  349  6e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2009  preprotein translocase subunit SecD  39.96 
 
 		 530 aa  348  2e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1416  preprotein translocase subunit SecD  38.79 
 
 		 554 aa  340  5e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.457453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1859  preprotein translocase subunit SecD  36.91 
 
 		 554 aa  337  1.9999999999999998e-91  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.182959  normal  0.940484 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3036  preprotein translocase subunit SecD  38.06 
 
 		 535 aa  336  5.999999999999999e-91  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4005  preprotein translocase subunit SecD  37.3 
 
 		 632 aa  335  1e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4644  preprotein translocase subunit SecD  35.6 
 
 		 632 aa  333  4e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3355  preprotein translocase subunit SecD  37.3 
 
 		 632 aa  333  4e-90  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1084  preprotein translocase subunit SecD  37.72 
 
 		 556 aa  333  4e-90  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.111435 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3212  protein-export membrane protein SecD  39.64 
 
 		 525 aa  333  4e-90  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2442  protein-export membrane protein SecD  38.77 
 
 		 524 aa  332  1e-89  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000311445  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1798  preprotein translocase subunit SecD  37.16 
 
 		 554 aa  331  2e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0444  preprotein translocase subunit SecD  37.16 
 
 		 554 aa  331  2e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0562014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1715  protein-export membrane protein SecD  38.54 
 
 		 594 aa  328  1.0000000000000001e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2057  protein-export membrane protein SecD  38.54 
 
 		 594 aa  328  1.0000000000000001e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0456  preprotein translocase subunit SecD  36.71 
 
 		 554 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.171448  normal  0.0964807 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0996  preprotein translocase subunit SecD  36.82 
 
 		 554 aa  327  3e-88  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1239  protein-export membrane protein SecD  40.21 
 
 		 533 aa  327  3e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2776  preprotein translocase subunit SecD  37.68 
 
 		 534 aa  324  3e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.336703  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4309  preprotein translocase subunit SecD  36.92 
 
 		 535 aa  323  6e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0503  preprotein translocase subunit SecD  38.46 
 
 		 534 aa  323  7e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.153104  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2777  preprotein translocase subunit SecD  39.57 
 
 		 533 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.626907  normal  0.768312 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1860  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  35.53 
 
 		 844 aa  320  3.9999999999999996e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3671  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  37.32 
 
 		 853 aa  320  3.9999999999999996e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0862684  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1796  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.31 
 
 		 856 aa  318  1e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1769  protein-export membrane protein SecD  38.16 
 
 		 512 aa  318  1e-85  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2732  preprotein translocase subunit SecD  38.35 
 
 		 533 aa  318  2e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735593  normal  0.282861 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1001  protein-export membrane protein SecD  38.04 
 
 		 531 aa  317  4e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.541747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1799  preprotein translocase subunit SecD  37.87 
 
 		 533 aa  316  8e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.127943  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0321  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  37.55 
 
 		 848 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.898839 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0290  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  37.73 
 
 		 849 aa  315  1.9999999999999998e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.870898 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4087  preprotein translocase subunit SecD  35.77 
 
 		 636 aa  315  1.9999999999999998e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.15751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3280  preprotein translocase subunit SecD  34.56 
 
 		 625 aa  313  3.9999999999999997e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.527735  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1324  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.96 
 
 		 845 aa  313  5.999999999999999e-84  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0375911  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3172  preprotein translocase subunit SecD  36.27 
 
 		 533 aa  313  5.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.881845  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1769  preprotein translocase subunit SecD  38.36 
 
 		 532 aa  312  6.999999999999999e-84  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.462584  normal  0.0130342 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0838  preprotein translocase subunit SecD  35.49 
 
 		 640 aa  312  6.999999999999999e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2276  protein-export membrane protein SecD  36.89 
 
 		 534 aa  312  1e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.394363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4406  preprotein translocase subunit SecD  36.99 
 
 		 533 aa  311  2e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.638067  normal  0.207578 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0344  preprotein translocase subunit SecD  36.01 
 
 		 633 aa  311  2e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.296213 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1284  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.77 
 
 		 844 aa  311  2e-83  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6059  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  37.6 
 
 		 839 aa  309  6.999999999999999e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1453  preprotein translocase subunit SecD  35.99 
 
 		 531 aa  308  2.0000000000000002e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2855  protein-export membrane protein SecD  36.05 
 
 		 532 aa  306  7e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.20247 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03171  Acriflavin resistance protein  35.99 
 
 		 843 aa  304  2.0000000000000002e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2491  protein-export membrane protein SecD  35.28 
 
 		 534 aa  305  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.743414  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3866  preprotein translocase subunit SecD  35.1 
 
 		 626 aa  302  7.000000000000001e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1230  preprotein translocase subunit SecD  35.89 
 
 		 614 aa  302  1e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.181896  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2810  preprotein translocase subunit SecD  33.53 
 
 		 621 aa  300  4e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2079  preprotein translocase protein SecD  36.34 
 
 		 604 aa  299  7e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0181  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  36.83 
 
 		 844 aa  298  1e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1714  preprotein translocase subunit SecD  35.79 
 
 		 537 aa  298  2e-79  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2188  protein-export membrane protein SecD  34.87 
 
 		 534 aa  298  2e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.521622  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0007  preprotein translocase subunit SecD  34.43 
 
 		 595 aa  296  5e-79  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.211478 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2658  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.45 
 
 		 856 aa  296  5e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1116  protein-export membrane protein SecD  37.63 
 
 		 500 aa  294  2e-78  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2073  preprotein translocase subunit SecD  35.19 
 
 		 535 aa  294  3e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0512  protein-export membrane protein SecD  36.17 
 
 		 609 aa  293  5e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2527  preprotein translocase subunit SecD  33.08 
 
 		 681 aa  293  7e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0878  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  35.02 
 
 		 834 aa  293  7e-78  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.335263  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4747  protein-export membrane protein SecD  35.33 
 
 		 533 aa  292  1e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122054  normal  0.0344397 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0277  preprotein translocase subunit SecD  35.02 
 
 		 626 aa  291  2e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.130868  normal  0.176148 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3409  preprotein translocase subunit SecD  35.92 
 
 		 621 aa  291  2e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.768129  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0563  protein-export membrane protein SecD  42.71 
 
 		 473 aa  291  2e-77  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1063  preprotein translocase subunit SecD  34.72 
 
 		 615 aa  288  2e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00256647 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4598  protein-export membrane protein SecD  32.83 
 
 		 532 aa  288  2e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.278601  normal  0.122779 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1604  protein-export membrane protein SecD  40.41 
 
 		 399 aa  288  2e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0444022  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4228  protein-export membrane protein SecD  32.83 
 
 		 532 aa  288  2e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.250212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01347  preprotein translocase subunit SecD  38.26 
 
 		 599 aa  287  4e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.151962  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2715  preprotein translocase subunit SecD  32.61 
 
 		 626 aa  286  5.999999999999999e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.177706 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5119  preprotein translocase subunit SecD  33.33 
 
 		 627 aa  284  2.0000000000000002e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2946  preprotein translocase subunit SecD  33.4 
 
 		 621 aa  284  3.0000000000000004e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1122  preprotein translocase subunit SecD  35.87 
 
 		 615 aa  283  4.0000000000000003e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.276034  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2212  protein-export membrane protein SecD  35.86 
 
 		 620 aa  283  4.0000000000000003e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.363799  normal  0.0593357 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2427  preprotein translocase subunit SecD  36.68 
 
 		 614 aa  283  4.0000000000000003e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2959  preprotein translocase subunit SecD  33.47 
 
 		 629 aa  283  5.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3262  preprotein translocase subunit SecD  35.33 
 
 		 604 aa  283  5.000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.103027  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3382  preprotein translocase subunit SecD  35.33 
 
 		 615 aa  283  7.000000000000001e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00120261  normal  0.627671 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>