109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1614 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_1614  protein of unknown function DUF583  100 
 
 
130 aa  261  3e-69  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1954  hypothetical protein  46.15 
 
 
159 aa  105  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0585612  normal  0.0588157 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0637  hypothetical protein  44 
 
 
131 aa  103  1e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1040  conserved hypothetical protein (DUF583 domain protein)  42.4 
 
 
134 aa  101  4e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.468261  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1996  hypothetical protein  37.5 
 
 
228 aa  90.9  5e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.775695  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0736  hypothetical protein  41.75 
 
 
137 aa  87.4  5e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00177042  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1104  hypothetical protein  44 
 
 
131 aa  87  8e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1229  hypothetical protein  44 
 
 
131 aa  86.3  1e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.043612  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0799  hypothetical protein  37.5 
 
 
166 aa  85.9  2e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000040318  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1545  hypothetical protein  30.97 
 
 
157 aa  79  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.353518  normal  0.46336 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0615  hypothetical protein  38.3 
 
 
125 aa  75.9  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000174199  hitchhiker  0.000000485982 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1567  hypothetical protein  41.18 
 
 
118 aa  74.7  0.0000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0199  hypothetical protein  34.62 
 
 
133 aa  72.4  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.84429  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1890  hypothetical protein  35.14 
 
 
154 aa  72.8  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0396  protein of unknown function DUF583  32.29 
 
 
183 aa  63.5  0.0000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0446304  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0352  hypothetical protein  32.29 
 
 
183 aa  62.4  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.111379  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4353  hypothetical protein  26.45 
 
 
142 aa  60.8  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.671855  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4489  protein of unknown function DUF583  26.45 
 
 
140 aa  60.8  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4508  protein of unknown function DUF583  26.45 
 
 
140 aa  60.8  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2122  protein of unknown function DUF583  30.17 
 
 
131 aa  60.5  0.000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04806  cell shape determination protein CcmA  38.46 
 
 
102 aa  58.9  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23470  cell shape determination protein CcmA  34.02 
 
 
138 aa  58.9  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000002252  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1382  hypothetical protein  31.9 
 
 
137 aa  57.8  0.00000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0604  hypothetical protein  30.7 
 
 
137 aa  57.4  0.00000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.527043  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2174  hypothetical protein  28.93 
 
 
132 aa  57  0.00000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2923  protein of unknown function DUF583  31.31 
 
 
125 aa  55.8  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0628  hypothetical protein  32.69 
 
 
132 aa  54.3  0.0000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4500  hypothetical protein  23.33 
 
 
185 aa  54.3  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0759985 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1317  protein of unknown function DUF583  31 
 
 
106 aa  54.3  0.0000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.080306 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0607  protein of unknown function DUF583  32.69 
 
 
132 aa  54.3  0.0000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.613637  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6068  protein of unknown function DUF583  28.07 
 
 
154 aa  53.1  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.419888  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1480  hypothetical protein  31.48 
 
 
149 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000228441  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1475  hypothetical protein  31.48 
 
 
149 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000135685  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2872  protein of unknown function DUF583  31.48 
 
 
149 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000301369  hitchhiker  0.000000894597 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1888  hypothetical protein  28.43 
 
 
125 aa  51.6  0.000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000131762  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0724  hypothetical protein  31.3 
 
 
133 aa  52  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1444  hypothetical protein  32.98 
 
 
141 aa  51.6  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000522592  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1511  hypothetical protein  31.48 
 
 
149 aa  51.6  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0283593  normal  0.818291 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1758  hypothetical protein  29.31 
 
 
145 aa  50.8  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0573572  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0111  hypothetical protein  31.63 
 
 
139 aa  50.8  0.000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4166  hypothetical protein  27.5 
 
 
210 aa  50.8  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4192  hypothetical protein  27.5 
 
 
210 aa  50.8  0.000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.719656  hitchhiker  0.00623524 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4236  hypothetical protein  27.5 
 
 
223 aa  50.4  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0331  protein of unknown function DUF583  25.2 
 
 
138 aa  50.4  0.000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.198743 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0721  cell shape determination protein CcmA  33 
 
 
282 aa  49.7  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.511119 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0042  protein of unknown function DUF583  32 
 
 
128 aa  50.1  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000175069  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2641  hypothetical protein  25.76 
 
 
134 aa  49.3  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0670539  normal  0.639585 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4436  protein of unknown function DUF583  30.48 
 
 
187 aa  49.3  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1325  hypothetical protein  29.29 
 
 
119 aa  48.1  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2409  cell shape determination protein CcmA  27.73 
 
 
152 aa  47.8  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0441319  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1716  hypothetical protein  30.68 
 
 
202 aa  47.4  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0478971  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1711  hypothetical protein  31.07 
 
 
135 aa  47.4  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00527708  normal  0.712251 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2564  hypothetical protein  28.07 
 
 
131 aa  47  0.00008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0178  hypothetical protein  27.66 
 
 
122 aa  47  0.00009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0812  cell shape determination protein CcmA  36.56 
 
 
191 aa  46.6  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.484596 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3685  hypothetical protein  23.66 
 
 
143 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.275009  normal  0.0102541 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2787  hypothetical protein  28.7 
 
 
191 aa  45.8  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.78265  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0693  hypothetical protein  27.87 
 
 
148 aa  46.2  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.424779  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1431  hypothetical protein  26.56 
 
 
151 aa  46.2  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000096503  normal  0.140917 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2934  hypothetical protein  31.63 
 
 
131 aa  45.8  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000305173  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0597  hypothetical protein  29.91 
 
 
121 aa  45.8  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000358877  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1271  protein of unknown function DUF583  25.96 
 
 
158 aa  45.8  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.385232  normal  0.476408 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3835  hypothetical protein  27.68 
 
 
119 aa  45.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3530  hypothetical protein  27.68 
 
 
119 aa  45.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2691  hypothetical protein  24.78 
 
 
145 aa  45.1  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00055475  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0308  protein of unknown function DUF583  23.89 
 
 
152 aa  45.1  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000311103  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0191  protein of unknown function DUF583  31.37 
 
 
123 aa  45.4  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2165  hypothetical protein  21.93 
 
 
138 aa  44.7  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08500  hypothetical protein  34.21 
 
 
140 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000020428 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1454  protein of unknown function DUF583  27.55 
 
 
195 aa  44.7  0.0004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0250  hypothetical protein  26.61 
 
 
184 aa  44.7  0.0004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4110  hypothetical protein  28.7 
 
 
148 aa  44.7  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3966  hypothetical protein  29.09 
 
 
168 aa  44.7  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.359315  normal  0.361845 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1331  hypothetical protein  24.78 
 
 
139 aa  44.3  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.431556  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1713  protein of unknown function DUF583  20.69 
 
 
136 aa  44.7  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.150728  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1784  protein of unknown function DUF583  20.69 
 
 
136 aa  44.3  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.517753  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2785  hypothetical protein  27.27 
 
 
147 aa  44.3  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.668707  hitchhiker  0.00289407 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0991  hypothetical protein  25.25 
 
 
133 aa  43.9  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0189849  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0805  hypothetical protein  34.21 
 
 
137 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.109784  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1854  hypothetical protein  26.42 
 
 
172 aa  43.9  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.303394 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2104  hypothetical protein  23.31 
 
 
148 aa  43.5  0.0009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.724366  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1303  hypothetical protein  26.27 
 
 
184 aa  43.5  0.0009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.729885  normal  0.802702 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3273  hypothetical protein  29.13 
 
 
197 aa  43.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.666049  normal  0.894626 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2975  hypothetical protein  26.42 
 
 
172 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.773473  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0413  hypothetical protein  29.82 
 
 
164 aa  42.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00223609  normal  0.0324489 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3101  hypothetical protein  33.33 
 
 
262 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0871  hypothetical protein  33.33 
 
 
262 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1621  hypothetical protein  26.42 
 
 
172 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.12526 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1175  protein of unknown function DUF583  24.53 
 
 
185 aa  42.4  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0118209  normal  0.643318 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1831  hypothetical protein  27.68 
 
 
145 aa  42.4  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1764  hypothetical protein  27.68 
 
 
145 aa  42.4  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.765709  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4734  hypothetical protein  21.77 
 
 
160 aa  42.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.122203  normal  0.160052 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2825  protein of unknown function DUF583  26.88 
 
 
113 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1585  protein of unknown function DUF583  27.27 
 
 
218 aa  42  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.397214  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2678  hypothetical protein  26.77 
 
 
148 aa  42  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.185603  hitchhiker  0.000395785 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1928  hypothetical protein  27.62 
 
 
220 aa  42  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.238689  normal  0.284182 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5896  protein of unknown function DUF583  23.44 
 
 
144 aa  42  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1662  hypothetical protein  26.13 
 
 
135 aa  41.6  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1088  hypothetical protein  25.74 
 
 
173 aa  41.2  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2611  hypothetical protein  26.77 
 
 
148 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.135268  hitchhiker  0.000000504618 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>