56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1558 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_1558  hypothetical protein  100 
 
 		 322 aa  653    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.000000039017  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1346  putative sulfonate/nitrate transport system substrate-binding protein  56.58 
 
 		 327 aa  365  1e-100  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000809029  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1805  putative periplasmic component of ABC-type transport system  47.04 
 
 		 334 aa  310  2e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0502884  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2687  putative periplasmic component of ABC-type transport system  42.19 
 
 		 376 aa  290  3e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.130525  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3902  hypothetical protein  32.43 
 
 		 344 aa  172  5.999999999999999e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000029197  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0424  hypothetical protein  32.12 
 
 		 320 aa  158  1e-37  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4036  ABC sulfate transport system, periplasmic binding protein  32.08 
 
 		 331 aa  156  4e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.7213  normal  0.0122121 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1453  putative sulfonate/nitrate transport system substrate-binding protein  30.59 
 
 		 327 aa  155  1e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.892723  normal  0.0689078 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4169  putative sulfonate/nitrate transport system substrate-binding protein  30.59 
 
 		 331 aa  152  1e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.555902 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0136  ABC transporter substrate-binding protein  27.07 
 
 		 330 aa  149  8e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.778502  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0491  putative sulfonate/nitrate transport system substrate-binding protein  28.79 
 
 		 327 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00141878  normal  0.493343 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1931  ABC sulfate transport system, periplasmic binding protein  29.21 
 
 		 330 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.10366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0437  hypothetical protein  28.48 
 
 		 312 aa  125  7e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.760359  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0212  hypothetical protein  28.94 
 
 		 325 aa  124  2e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000728433  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0746  hypothetical protein  26.46 
 
 		 300 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0722  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  25 
 
 		 300 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1466  hypothetical protein  24.82 
 
 		 322 aa  104  2e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0764811  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1738  hypothetical protein  24.45 
 
 		 322 aa  103  5e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0611482  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0244  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  25.23 
 
 		 306 aa  100  5e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.576373  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3870  hypothetical protein  23.69 
 
 		 354 aa  99.8  6e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000795104  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0341  putative sulfonate transport system substrate-binding protein  22.67 
 
 		 323 aa  92.8  7e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1148  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  23.85 
 
 		 308 aa  92.4  9e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000156737  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2281  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  23.64 
 
 		 327 aa  85.5  0.000000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1488  putative sulfonate/nitrate transport system substrate-binding protein  24.68 
 
 		 300 aa  79  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0878  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  24.69 
 
 		 299 aa  78.6  0.0000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00683705  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03210  hypothetical protein  22.47 
 
 		 368 aa  77.4  0.0000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0198758 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2612  hypothetical protein  21.17 
 
 		 347 aa  75.1  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0016523  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0951  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  21.61 
 
 		 338 aa  75.1  0.000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00952521  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0490  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, periplasmic component  21.37 
 
 		 299 aa  72.4  0.00000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000043628  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0427  hypothetical protein  23.44 
 
 		 337 aa  70.5  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0564  hypothetical protein  22.1 
 
 		 299 aa  60.8  0.00000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.52849  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4555  NMT1/THI5 like domain protein  26.15 
 
 		 337 aa  50.8  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2293  membrane lipoprotein lipid attachment site  22.58 
 
 		 336 aa  50.1  0.00005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7380  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplsmic ligand-binding protein  27.35 
 
 		 374 aa  49.7  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2834  twin-arginine translocation pathway signal  30.77 
 
 		 411 aa  49.7  0.00007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.960299 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1528  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  25.75 
 
 		 321 aa  49.3  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.208633 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3932  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  26.09 
 
 		 349 aa  49.3  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0335865  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1182  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplsmic ligand-binding protein  28.88 
 
 		 342 aa  49.3  0.00008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.794723  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5871  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.09 
 
 		 322 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.146779 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4434  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.09 
 
 		 322 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4052  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26 
 
 		 354 aa  48.5  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.577447 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1212  NMT1/THI5 like domain protein  25.81 
 
 		 326 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0153956  normal  0.631224 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4326  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.32 
 
 		 321 aa  46.2  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0308  twin-arginine translocation pathway signal  25.42 
 
 		 414 aa  46.2  0.0008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.263961 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0857  ABC-type transport system, periplasmic component  22.09 
 
 		 334 aa  46.2  0.0008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.416217  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1411  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  30.86 
 
 		 320 aa  46.2  0.0008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.214398 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1540  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25 
 
 		 396 aa  45.4  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3501  putative ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  26.95 
 
 		 347 aa  44.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00652225  normal  0.464247 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2107  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like  30.49 
 
 		 529 aa  44.3  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.287431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1423  extracellular solute-binding protein family 3  25.16 
 
 		 326 aa  43.5  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4301  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplsmic ligand-binding protein  21.34 
 
 		 365 aa  43.9  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.389589  hitchhiker  0.0000586034 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1262  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.16 
 
 		 326 aa  43.5  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.302787 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1347  NMT1/THI5-like domain-containing protein  23.15 
 
 		 330 aa  42.7  0.008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0409  putative substrate-binding protein of aliphatic sulfonate ABC transporter  26.62 
 
 		 348 aa  42.7  0.008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.830213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3032  twin-arginine translocation pathway signal  25 
 
 		 348 aa  42.7  0.009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000338526  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1928  phosphonate ABC transporter, periplasmic phosphonate-binding protein  35.71 
 
 		 287 aa  42.7  0.009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.368653  normal  0.70306 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>