More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1549 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_1549  Ferritin Dps family protein  100 
 
 		 145 aa  295  1e-79  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.297142  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0191  DNA protection during starvation protein  50.34 
 
 		 144 aa  143  1e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.139372  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0080  starvation-inducible DNA-binding protein Dps  44.83 
 
 		 145 aa  137  4.999999999999999e-32  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0248  conserved hypothetical protein, putative bacterioferritin  46.81 
 
 		 149 aa  137  7e-32  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1705  bacterioferritin, putative  48.94 
 
 		 149 aa  136  1e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1519  bacterioferritin, putative  48.94 
 
 		 149 aa  136  1e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0992  DNA protection during starvation protein  44.83 
 
 		 145 aa  117  3.9999999999999996e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1541  Ferritin, Dps family protein  40.69 
 
 		 156 aa  116  9.999999999999999e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00103118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1620  putative DNA-binding protein, Dps  36.55 
 
 		 161 aa  104  5e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00952275  normal  0.23564 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1852  Ferritin and Dps  37.93 
 
 		 161 aa  104  5e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.206437  normal  0.245818 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0829  Ferritin Dps family protein  35.42 
 
 		 145 aa  100  8e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2788  Ferritin Dps family protein  41.26 
 
 		 146 aa  98.2  3e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0475826  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0585  Ferritin Dps family protein  38.19 
 
 		 146 aa  97.1  7e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3808  Ferritin Dps family protein  34.72 
 
 		 145 aa  94.7  4e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000002907  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3485  Ferritin, Dps family protein  33.57 
 
 		 157 aa  94.4  5e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1214  Ferritin Dps family protein  33.1 
 
 		 161 aa  93.2  1e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1520  Ferritin Dps family protein  39.16 
 
 		 147 aa  92.8  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.907687  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2829  Ferritin Dps family protein  32.39 
 
 		 161 aa  91.3  4e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.901584  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4875  Ferritin Dps family protein  38.46 
 
 		 146 aa  91.3  4e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000326402  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0090  Dps family protein  34.48 
 
 		 159 aa  90.1  1e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0858157 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3626  Ferritin Dps family protein  37.06 
 
 		 146 aa  89.7  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5191  general stress protein 20U  37.32 
 
 		 146 aa  88.2  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.137355  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1748  Dps family protein  34.51 
 
 		 148 aa  88.2  4e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4778  Dps family protein  37.32 
 
 		 146 aa  87.8  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000253155  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5196  DNA protection during starvation protein 2  37.32 
 
 		 146 aa  88.2  4e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00364208  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0052  DNA protection during starvation protein 2  37.32 
 
 		 146 aa  88.2  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000618139  hitchhiker  0.000000000000272675 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4914  general stress protein 20U  37.32 
 
 		 146 aa  87.4  5e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.770524  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4759  Dps family protein  37.32 
 
 		 146 aa  87.4  5e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00508779  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5290  general stress protein 20U  37.32 
 
 		 146 aa  87.4  5e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5159  DNA protection during starvation protein 2  37.32 
 
 		 146 aa  87.4  5e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.06041e-34 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5205  DNA protection during starvation protein 2  37.32 
 
 		 146 aa  87.4  5e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000105724  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1875  Ferritin Dps family protein  37.76 
 
 		 147 aa  87.4  6e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0581832  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1871  general stress protein  37.06 
 
 		 147 aa  86.7  9e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2013  general stress protein  37.06 
 
 		 147 aa  86.7  9e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2092  general stress protein  37.06 
 
 		 147 aa  86.3  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.233989  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1841  non-specific DNA-binding protein Dps  37.06 
 
 		 147 aa  86.3  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.150285  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1825  non-specific DNA-binding protein, Dps-like  37.06 
 
 		 147 aa  86.3  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2047  DNA protection during starvation protein 1  37.06 
 
 		 147 aa  86.3  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00820011 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2126  DNA protection during starvation protein 1  37.06 
 
 		 147 aa  86.3  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.334442  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2015  DNA protection during starvation protein 1  37.06 
 
 		 147 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3294  DNA protection during starvation protein 1  37.06 
 
 		 147 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.623838 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2953  Ferritin and Dps  31.25 
 
 		 157 aa  84.3  5e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2213  Ferritin Dps family protein  32.39 
 
 		 147 aa  84  6e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.716736  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2175  Ferritin, Dps family protein  32.39 
 
 		 147 aa  84  6e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.728461  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2688  Ferritin Dps family protein  31.94 
 
 		 163 aa  83.2  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.119326  hitchhiker  0.00386206 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001469  non-specific DNA-binding protein Dps/iron-binding ferritin-like antioxidant protein/ferroxidase  35.94 
 
 		 159 aa  82.8  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0744  hypothetical protein  34.97 
 
 		 146 aa  82.8  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0725  hypothetical protein  34.97 
 
 		 146 aa  82.8  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05408  hypothetical protein  35.16 
 
 		 159 aa  82  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2021  DNA-binding protein; DPS family protein  30.94 
 
 		 158 aa  81.3  0.000000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0711  neutrophil activating protein A (napA)  33.8 
 
 		 178 aa  79  0.00000000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00577  putative DNA-binding stress protein  34.75 
 
 		 157 aa  78.2  0.00000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3841  Ferritin and Dps  34.75 
 
 		 156 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000127863  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0734  Ferritin Dps family protein  31.29 
 
 		 157 aa  77.4  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0131  DNA-binding stress protein  28.68 
 
 		 159 aa  77.4  0.00000000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0379  Ferritin Dps family protein  33.8 
 
 		 158 aa  77.4  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.46661 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0327  Ferritin Dps family protein  30.99 
 
 		 159 aa  76.3  0.0000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2381  DPS family protein  31.25 
 
 		 156 aa  75.5  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2338  Ferritin Dps family protein  31.62 
 
 		 175 aa  75.5  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.301965 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1985  ferritin DPS family DNA-binding protein  32.41 
 
 		 168 aa  74.7  0.0000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.596457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2598  Dps family protein  30.5 
 
 		 157 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00000451482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08150  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)  30.83 
 
 		 143 aa  74.3  0.0000000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.609982  normal  0.110032 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0395  Ferritin and Dps  33.33 
 
 		 161 aa  73.9  0.0000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.680559  normal  0.268333 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2466  Ferritin, Dps family protein  36.46 
 
 		 175 aa  73.6  0.0000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22760  Ferritin, Dps family protein  32.39 
 
 		 164 aa  72.8  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.240603  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0102  Ferritin Dps family protein  30.07 
 
 		 156 aa  72  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.923698  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1840  Ferritin, Dps family protein  33.79 
 
 		 156 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1219  Ferritin Dps family protein  31.25 
 
 		 168 aa  71.6  0.000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2302  Ferritin Dps family protein  32.64 
 
 		 155 aa  72  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.112088  normal  0.237053 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13178  DPS family protein  30.77 
 
 		 163 aa  71.2  0.000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2946  Ferritin Dps family protein  30 
 
 		 156 aa  71.2  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0759  Ferritin and Dps  32.17 
 
 		 163 aa  70.9  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.833664 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0085  Ferritin Dps family protein  30.83 
 
 		 143 aa  71.2  0.000000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3732  Ferritin, Dps family protein  28.37 
 
 		 159 aa  70.9  0.000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4066  Ferritin Dps family protein  31.47 
 
 		 158 aa  70.5  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3983  Dps family protein  30.5 
 
 		 157 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.257808  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1404  Ferritin and Dps  30.5 
 
 		 157 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6797  putative DNA-binding stress protein (oxydative damage protectant)  26.39 
 
 		 175 aa  70.5  0.000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.226915 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0710  Ferritin Dps family protein  27.82 
 
 		 181 aa  70.5  0.000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2804  Ferritin and Dps  30.77 
 
 		 161 aa  70.1  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4766  Ferritin, Dps family protein  31.06 
 
 		 159 aa  69.7  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4105  Ferritin Dps family protein  31.47 
 
 		 158 aa  70.1  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1333  Ferritin Dps family protein  33.33 
 
 		 178 aa  69.3  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0377707  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4559  Ferritin Dps family protein  27.27 
 
 		 158 aa  70.1  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.276191 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1265  Ferritin, Dps family protein  31.25 
 
 		 156 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.758544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3094  Ferritin Dps family protein  31.69 
 
 		 160 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0217734  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4414  Ferritin and Dps  29.79 
 
 		 156 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0174703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5247  Ferritin, Dps family protein  27.27 
 
 		 163 aa  69.3  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2045  Ferritin, Dps family protein  31.69 
 
 		 156 aa  68.6  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0289299  normal  0.419788 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1750  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)  28.87 
 
 		 160 aa  68.6  0.00000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1431  Ferritin Dps family protein  32.5 
 
 		 178 aa  68.2  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.103908  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4600  Ferritin and Dps  30.43 
 
 		 147 aa  68.2  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3839  Ferritin Dps family protein  31.21 
 
 		 165 aa  67.8  0.00000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3102  Ferritin Dps family protein  29.86 
 
 		 182 aa  67.4  0.00000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0800  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  29.73 
 
 		 163 aa  67.4  0.00000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.388043 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4208  Ferritin Dps family protein  29.08 
 
 		 157 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.857368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0281  Ferritin and Dps  27.74 
 
 		 222 aa  67  0.00000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.826391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0327  Ferritin Dps family protein  27.34 
 
 		 159 aa  67  0.00000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.743454  hitchhiker  0.00750622 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2320  Ferritin, Dps family protein  32.33 
 
 		 157 aa  67  0.00000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1239  Ferritin, Dps family protein  29.08 
 
 		 157 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.698815  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>