More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1493 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_1493  ammonium transporter  100 
 
 
438 aa  847    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0046  ammonium transporter  71.36 
 
 
429 aa  582  1.0000000000000001e-165  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000652471  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0776  ammonium transporter  64.89 
 
 
431 aa  534  1e-150  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000446987  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0565  ammonium transporter  63.55 
 
 
428 aa  504  9.999999999999999e-143  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000907445  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0641  ammonium transporter  58.05 
 
 
416 aa  427  1e-118  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.117335  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0936  ammonium transporter  53.66 
 
 
433 aa  426  1e-118  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000377465  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1305  ammonium transporter  54.07 
 
 
444 aa  416  9.999999999999999e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.179882 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2862  ammonium transporter  52.37 
 
 
457 aa  403  1e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.33659  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1889  ammonium transporter  54.78 
 
 
434 aa  404  1e-111  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.39856  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1019  ammonium transporter  53.3 
 
 
451 aa  395  1e-109  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal  0.642415 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1129  ammonium transporter  54.9 
 
 
431 aa  387  1e-106  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0994  ammonium transporter  53.85 
 
 
436 aa  386  1e-106  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.540241  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2356  ammonium transporter  52.33 
 
 
435 aa  382  1e-105  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1061  ammonium transporter  54.27 
 
 
461 aa  381  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.379928  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0192  ammonium transporter  52.87 
 
 
467 aa  377  1e-103  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0959  ammonium transporter  51.95 
 
 
433 aa  372  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2068  ammonium transporter  51.59 
 
 
406 aa  364  2e-99  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000438744  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0142  ammonium transporter  50.58 
 
 
464 aa  361  1e-98  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000211671  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1401  ammonium transporter  50.96 
 
 
466 aa  360  3e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3217  ammonium transporter  50.96 
 
 
444 aa  360  3e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0192  ammonium transporter  50.96 
 
 
466 aa  360  3e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0653  ammonium transporter  50.96 
 
 
478 aa  360  3e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2828  ammonium transporter  50.96 
 
 
466 aa  360  3e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0488  ammonium transporter  50.96 
 
 
500 aa  360  3e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.256418  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0469  ammonium transporter  50.96 
 
 
500 aa  360  3e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.929058  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2526  ammonium transporter  51.44 
 
 
438 aa  357  1.9999999999999998e-97  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2911  ammonium transporter  51.44 
 
 
438 aa  357  1.9999999999999998e-97  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0408  ammonium transporter  50.72 
 
 
469 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.737141  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2784  ammonium transporter  50.12 
 
 
400 aa  357  2.9999999999999997e-97  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.174355 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2514  ammonium transporter  48.58 
 
 
461 aa  356  5e-97  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0323636  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1182  ammonium transporter  49.63 
 
 
432 aa  355  7.999999999999999e-97  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000100846 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0434  ammonium transporter  47.37 
 
 
434 aa  355  8.999999999999999e-97  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0771346  normal  0.5124 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6194  ammonium transporter  50.24 
 
 
504 aa  354  2e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2065  ammonium transporter  51.09 
 
 
431 aa  352  5.9999999999999994e-96  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000790161  normal  0.636143 
 
 
-
 
NC_004310  BR1896  ammonium transporter  51.72 
 
 
433 aa  352  1e-95  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.786334  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3537  ammonium transporter  50 
 
 
437 aa  351  1e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.945825  decreased coverage  0.00000925998 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1313  ammonium transporter  51.11 
 
 
410 aa  351  2e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000021179  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1269  ammonium transporter  50.86 
 
 
411 aa  350  3e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000200287  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5505  ammonium transporter  52.96 
 
 
445 aa  350  3e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.698175  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3728  ammonium transporter  49.75 
 
 
437 aa  350  3e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1059  ammonium transporter  50.37 
 
 
410 aa  350  4e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000580155  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2876  ammonium transporter  49.76 
 
 
500 aa  349  5e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0601179  normal  0.287688 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2251  ammonium transporter  49.76 
 
 
500 aa  349  5e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.112232  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2865  ammonium transporter  49.76 
 
 
500 aa  349  5e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00160968  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0706  ammonium transporter  49.75 
 
 
437 aa  349  5e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3995  ammonium transporter  47.07 
 
 
445 aa  349  6e-95  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.121366  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1831  ammonium transporter  49.88 
 
 
402 aa  349  6e-95  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3605  ammonium transporter  49.51 
 
 
437 aa  348  8e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0438  ammonium transporter  49.52 
 
 
500 aa  348  8e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.481032  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4131  ammonium transporter  50.61 
 
 
410 aa  348  9e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000588768  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3048  ammonium transporter  47.91 
 
 
405 aa  348  1e-94  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0257  ammonium transporter  50.73 
 
 
501 aa  348  1e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0032  ammonium transporter  50.24 
 
 
462 aa  348  1e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1059  ammonium transporter  50.86 
 
 
410 aa  347  2e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  6.498340000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1056  ammonium transporter  50.86 
 
 
410 aa  347  2e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000003226  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2786  ammonium transporter  49.25 
 
 
398 aa  347  2e-94  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.879755  normal  0.191146 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1078  ammonium transporter  50.86 
 
 
410 aa  347  3e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000106824  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1210  ammonium transporter  50.61 
 
 
410 aa  347  3e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000809734  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1237  ammonium transporter  51.11 
 
 
410 aa  347  3e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0377  ammonium transporter  49.63 
 
 
433 aa  346  5e-94  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.182782  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1101  ammonium transporter  47.34 
 
 
432 aa  345  7e-94  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.991152  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2267  ammonium transporter  50.61 
 
 
405 aa  345  1e-93  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.828522  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3250  ammonium transporter  48.29 
 
 
430 aa  345  1e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0727  ammonium transporter  47.57 
 
 
449 aa  345  1e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.379173  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1061  ammonium transporter  48.29 
 
 
428 aa  343  2e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3769  ammonium transporter  47.34 
 
 
477 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.63779 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0292  ammonium transporter  47.37 
 
 
513 aa  343  4e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2504  ammonium transporter  49.01 
 
 
397 aa  343  4e-93  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.465742 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1917  ammonium transporter  49.28 
 
 
449 aa  342  5e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3160  ammonium transporter  46.62 
 
 
466 aa  342  5.999999999999999e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4237  ammonium transporter  48.17 
 
 
452 aa  342  5.999999999999999e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0807  ammonium transporter  48.77 
 
 
466 aa  341  1e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0598  ammonium transporter  49.29 
 
 
463 aa  342  1e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00419594 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0276  ammonium transporter  46.7 
 
 
443 aa  341  2e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0303  ammonium transporter  50.37 
 
 
457 aa  340  2.9999999999999998e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0448  ammonium transporter  46.29 
 
 
480 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.595017  normal  0.335861 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0084  ammonium transporter  54.81 
 
 
449 aa  340  2.9999999999999998e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0741  ammonium transporter  50.25 
 
 
397 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0796039  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0695  ammonium transporter  49.53 
 
 
488 aa  340  4e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.7335  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0778  ammonium transporter  46.17 
 
 
466 aa  339  5e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1699  ammonia permease  47.42 
 
 
413 aa  338  8e-92  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000279978  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0241  ammonium transporter  52.64 
 
 
468 aa  338  9e-92  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.943388 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0084  ammonium transporter  46.29 
 
 
402 aa  338  9.999999999999999e-92  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0940  ammonium transporter  48.02 
 
 
489 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4189  ammonium transporter  49.52 
 
 
499 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.793194 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0241  ammonium transporter  47.14 
 
 
510 aa  337  1.9999999999999998e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.60924  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0218  ammonium transporter  46.82 
 
 
524 aa  337  2.9999999999999997e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000738069 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0054  ammonium transporter  47.14 
 
 
499 aa  336  5e-91  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0265828  normal  0.286755 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4093  ammonium transporter  46.76 
 
 
476 aa  336  5.999999999999999e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1956  ammonium transporter  45.35 
 
 
494 aa  335  5.999999999999999e-91  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0292  ammonium transporter  43.51 
 
 
500 aa  336  5.999999999999999e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69795  ammonium transporter AmtB  52.34 
 
 
442 aa  336  5.999999999999999e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.155925  normal  0.25807 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47780  Ammonium transporter  52.74 
 
 
438 aa  336  5.999999999999999e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.261032  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0343  ammonium transporter  46.33 
 
 
436 aa  335  7e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0919  ammonium transporter  47.1 
 
 
428 aa  335  7e-91  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2782  ammonium transporter  50 
 
 
503 aa  335  7e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0900246  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2920  ammonium transporter  50 
 
 
497 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0617737  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0866  ammonium transporter  50.99 
 
 
402 aa  335  1e-90  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.366572 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0694  ammonium transporter  48.79 
 
 
452 aa  335  1e-90  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.561386  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0294  ammonium transporter  45.23 
 
 
436 aa  335  1e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.509038 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>