More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1477 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_1477  response regulator receiver  100 
 
 		 222 aa  452  1.0000000000000001e-126  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.932866  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1458  two component transcriptional regulator  53.18 
 
 		 218 aa  239  2e-62  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1579  response regulator receiver  47.49 
 
 		 225 aa  212  3.9999999999999995e-54  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.410227  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1806  two-component response regulator  39.73 
 
 		 220 aa  159  4e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0884  two component transcriptional regulator  35.16 
 
 		 218 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.68851  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0257  response regulator receiver  36.36 
 
 		 219 aa  141  8e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0386  two component transcriptional regulator  32.14 
 
 		 222 aa  134  9.999999999999999e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1917  DNA-binding response regulator  31.25 
 
 		 222 aa  128  7.000000000000001e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0272  response regulator receiver  33.18 
 
 		 223 aa  125  4.0000000000000003e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0258  two component transcriptional regulator  31.67 
 
 		 217 aa  123  2e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0200742  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1180  response regulator receiver  34.1 
 
 		 214 aa  123  2e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0136  two component transcriptional regulator  30.49 
 
 		 220 aa  121  9e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.235991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1365  two component transcriptional regulator  36.07 
 
 		 219 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00130586  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1773  two component transcriptional regulator  29.55 
 
 		 217 aa  119  3.9999999999999996e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0076  two component transcriptional regulator  30.97 
 
 		 223 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.225452 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2384  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.77 
 
 		 219 aa  119  3.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23421  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5497  DNA-binding response regulator  31.67 
 
 		 221 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.553345  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1969  response regulator receiver domain-containing protein  30.91 
 
 		 219 aa  116  1.9999999999999998e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.478098  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4516  two component transcriptional regulator  31.28 
 
 		 225 aa  116  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.158523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1433  two component transcriptional regulator  29.41 
 
 		 223 aa  116  3e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0776  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.3 
 
 		 224 aa  115  6e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0107208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4436  two component transcriptional regulator  29.49 
 
 		 227 aa  115  6e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.177006  normal  0.889846 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3067  two component transcriptional regulator  29.09 
 
 		 224 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.43316  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1103  two-component response regulator  35.65 
 
 		 221 aa  115  6.9999999999999995e-25  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63150  two-component response regulator  31.67 
 
 		 221 aa  114  7.999999999999999e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.388672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1997  winged helix family two component transcriptional regulator  29.09 
 
 		 224 aa  114  8.999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.981118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1324  extracellular solute-binding protein  31.36 
 
 		 220 aa  114  1.0000000000000001e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.273971  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3820  two component transcriptional regulator  30.32 
 
 		 221 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1280  DNA-binding response regulator  32.27 
 
 		 220 aa  114  1.0000000000000001e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000547046  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4171  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.49 
 
 		 225 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0120  response regulator receiver  31.94 
 
 		 221 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3176  two component transcriptional regulator  30.45 
 
 		 223 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.987704  normal  0.0233237 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0693  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.53 
 
 		 229 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003617  DNA-binding response regulator  33.48 
 
 		 218 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.831618  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1187  two component transcriptional regulatory protein  29.28 
 
 		 223 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0498  two component transcriptional regulator  30.57 
 
 		 223 aa  113  2.0000000000000002e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00313695 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2126  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.96 
 
 		 224 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.245988  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3105  two component transcriptional regulator  30.04 
 
 		 219 aa  113  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.136173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1727  two component transcriptional regulator  29.91 
 
 		 228 aa  112  3e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.284746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0097  response regulator receiver  30.88 
 
 		 222 aa  112  3e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3444  two component transcriptional regulator  27.93 
 
 		 220 aa  112  4.0000000000000004e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.112849  normal  0.384843 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3674  two component transcriptional regulator  30.04 
 
 		 219 aa  112  5e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0559  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.58 
 
 		 228 aa  110  1.0000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.276329  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3454  two component transcriptional regulator  28.64 
 
 		 257 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.215717 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0699  two component transcriptional regulator  30.45 
 
 		 220 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0434  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.28 
 
 		 236 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.569156 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3354  two component transcriptional regulator  29.78 
 
 		 220 aa  109  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.44436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1358  two component response regulator  27.73 
 
 		 224 aa  109  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.333715  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1685  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.57 
 
 		 225 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00118059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1411  response regulator receiver  28.57 
 
 		 225 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.110033 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3267  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.6 
 
 		 220 aa  108  5e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.387524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2066  two component transcriptional regulator  28.38 
 
 		 225 aa  108  5e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1407  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.57 
 
 		 225 aa  108  5e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.440596  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0801  two component transcriptional regulator  28.51 
 
 		 221 aa  108  6e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0203691 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3146  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.65 
 
 		 218 aa  108  8.000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.149495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0625  two component transcriptional regulator  32.88 
 
 		 217 aa  108  8.000000000000001e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3359  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.6 
 
 		 231 aa  108  8.000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0894  two component transcriptional regulator  28.51 
 
 		 222 aa  108  9.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0128  two-component response regulator  34.96 
 
 		 228 aa  107  1e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.4797  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0086  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.49 
 
 		 223 aa  107  1e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000430601  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0917  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.13 
 
 		 223 aa  107  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.349593 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3362  DNA-binding transcriptional regulator QseB  27.85 
 
 		 219 aa  107  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3358  DNA-binding transcriptional regulator QseB  27.85 
 
 		 219 aa  107  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3433  DNA-binding transcriptional regulator QseB  27.85 
 
 		 219 aa  107  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2004  response regulator receiver  31.19 
 
 		 215 aa  107  1e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.230205  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3528  DNA-binding transcriptional regulator QseB  27.85 
 
 		 219 aa  107  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3427  DNA-binding transcriptional regulator QseB  27.85 
 
 		 219 aa  107  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.374419  normal  0.844658 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0057  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.63 
 
 		 225 aa  107  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1878  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  28.25 
 
 		 229 aa  106  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0470  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.32 
 
 		 236 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0454  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.32 
 
 		 235 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1764  DNA-binding response regulator  29.46 
 
 		 224 aa  106  3e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0998  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.7 
 
 		 223 aa  106  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0123  DNA-binding response regulator  28.05 
 
 		 223 aa  105  4e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0465  two component transcriptional regulator  29.2 
 
 		 229 aa  106  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1066  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.69 
 
 		 223 aa  105  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3340  two component transcriptional regulator  29.6 
 
 		 224 aa  105  5e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0836001  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6288  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.53 
 
 		 224 aa  105  5e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0171319  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0630  two component transcriptional regulator  26.82 
 
 		 223 aa  105  6e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0672917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2913  two component transcriptional regulator  30.49 
 
 		 227 aa  105  6e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0379396  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1830  two component transcriptional regulator  28.37 
 
 		 229 aa  105  6e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.000334727  normal  0.705517 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1139  DNA-binding response regulator  30.67 
 
 		 227 aa  105  6e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.034136  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4988  two component transcriptional regulator  27.19 
 
 		 225 aa  105  6e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000131605 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0644  two component transcriptional regulator  27.73 
 
 		 222 aa  105  7e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.553024  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1272  response regulator receiver  29.82 
 
 		 216 aa  105  7e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1620  two component transcriptional regulator  29.02 
 
 		 227 aa  105  7e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000174219  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3276  winged helix family two component transcriptional regulator  27.88 
 
 		 234 aa  105  7e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.208422  normal  0.192837 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0642  DNA-binding response regulator  29.65 
 
 		 291 aa  105  8e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.743353  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1718  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  25.45 
 
 		 228 aa  104  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.348336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0649  two component transcriptional regulator  29.2 
 
 		 252 aa  104  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1445  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.8 
 
 		 225 aa  104  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3643  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.76 
 
 		 225 aa  104  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5326  two component transcriptional regulator  29.26 
 
 		 235 aa  103  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1759  two component transcriptional regulator  28.83 
 
 		 220 aa  104  1e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0809  DNA-binding response regulator  29.2 
 
 		 247 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5224  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  28.76 
 
 		 225 aa  104  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.57611  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5335  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  25.45 
 
 		 228 aa  104  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.733276  normal  0.970872 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0738  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.84 
 
 		 226 aa  104  1e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000482292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1416  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.8 
 
 		 225 aa  104  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0813  DNA-binding response regulator  29.2 
 
 		 247 aa  104  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0618873  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>