More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1466 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_1466  Phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 198 aa  410  1e-114  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.570916  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3137  alpha-ribazole phosphatase  41.36 
 
 		 197 aa  146  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000105722  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3431  Phosphoglycerate mutase  39.44 
 
 		 201 aa  142  2e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1544  phosphoglycerate mutase  38.2 
 
 		 256 aa  142  3e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1007  phosphoglycerate mutase  35.68 
 
 		 241 aa  142  4e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1553  Phosphoglycerate mutase  37.57 
 
 		 200 aa  139  3e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233017  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1317  metal dependent phosphohydrolase  39.89 
 
 		 591 aa  139  3e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.678364  hitchhiker  0.000242648 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2741  phosphoglycerate mutase/fructose-2,6-bisphosphatase  39.01 
 
 		 213 aa  138  6e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.195547  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0229  fructose-2,6-bisphosphatase  39.56 
 
 		 223 aa  137  1e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2288  phosphoglycerate mutase  44.03 
 
 		 155 aa  118  6e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1815  Phosphoglycerate mutase  35.14 
 
 		 193 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.230674  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4185  phosphoglycerate mutase  33.7 
 
 		 200 aa  112  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2815  phosphoglycerate mutase  32.96 
 
 		 202 aa  111  7.000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3895  alpha-ribazole phosphatase  34.64 
 
 		 198 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0234787 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3811  alpha-ribazole phosphatase  34.64 
 
 		 198 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3084  alpha-ribazole phosphatase  30.39 
 
 		 200 aa  108  5e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.237454  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3007  phosphoglycerate mutase family protein, putative  32.04 
 
 		 217 aa  107  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1817  Phosphoglycerate mutase  32.96 
 
 		 208 aa  107  1e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0469  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  32.42 
 
 		 201 aa  107  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1379  Phosphoglycerate mutase  31.32 
 
 		 197 aa  104  7e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  35.75 
 
 		 214 aa  102  3e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0515  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  32.04 
 
 		 442 aa  100  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.85164  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05791  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  31.49 
 
 		 442 aa  99.4  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.840151  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  34.64 
 
 		 213 aa  99  4e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05711  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  32.04 
 
 		 442 aa  97.8  8e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1847  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  34.25 
 
 		 442 aa  97.1  1e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0233931  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05411  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  31.49 
 
 		 442 aa  97.4  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  34.64 
 
 		 213 aa  97.4  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  31.18 
 
 		 208 aa  95.9  4e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1928  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  31.64 
 
 		 201 aa  95.5  5e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0314739  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05721  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  33.7 
 
 		 442 aa  94.4  9e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.169271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1583  phosphoglycerate mutase  31.76 
 
 		 216 aa  93.2  3e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  30 
 
 		 200 aa  91.3  8e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3651  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  32.07 
 
 		 449 aa  90.5  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.79129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0808  Phosphoglycerate mutase  30.22 
 
 		 214 aa  89.7  3e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0275634 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  31.11 
 
 		 200 aa  89.7  3e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1900  phosphoglycerate mutase  27.62 
 
 		 188 aa  89  4e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02509  phosphoglycerate mutase  31.89 
 
 		 214 aa  89  5e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1508  Phosphoglycerate mutase  28.34 
 
 		 459 aa  87.8  9e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.980913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0701  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  31.32 
 
 		 442 aa  87.8  1e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3590  Phosphoglycerate mutase  29.35 
 
 		 448 aa  87.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0571749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4586  phosphoglycerate mutase  32.12 
 
 		 253 aa  87.4  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.616156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2516  Phosphoglycerate mutase  29.35 
 
 		 448 aa  87.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  30.56 
 
 		 200 aa  86.7  2e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  30.56 
 
 		 200 aa  86.7  2e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3133  Phosphoglycerate mutase  32.22 
 
 		 200 aa  87  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2494  Phosphoglycerate mutase  30.77 
 
 		 210 aa  87  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.439678  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0651  phosphoglycerate mutase  29.73 
 
 		 235 aa  86.3  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.761339 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  30.54 
 
 		 224 aa  87  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  28.92 
 
 		 196 aa  86.7  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  28.16 
 
 		 226 aa  86.3  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0485  phosphoglycerate mutase  30.39 
 
 		 445 aa  86.3  3e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.081071 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  28.16 
 
 		 226 aa  86.3  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1079  phosphoglycerate mutase  32.43 
 
 		 214 aa  85.5  4e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119918  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4242  phosphoglycerate mutase  30.43 
 
 		 447 aa  85.9  4e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0960  phosphoglycerate mutase  32.43 
 
 		 214 aa  85.5  5e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000000442989  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0171  phosphoglycerate mutase  31.93 
 
 		 205 aa  85.5  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.693324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5329  phosphoglycerate mutase  34.15 
 
 		 197 aa  85.5  5e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13512  normal  0.0708418 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05171  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  29.83 
 
 		 443 aa  85.5  5e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3502  Phosphoglycerate mutase  31.69 
 
 		 200 aa  85.1  5e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2273  Phosphoglycerate mutase  29.65 
 
 		 208 aa  85.1  6e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1249  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  30.9 
 
 		 207 aa  85.1  7e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.29402  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  28.79 
 
 		 213 aa  84.3  9e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3550  fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  28.51 
 
 		 316 aa  84.3  9e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1897  phosphatase PhoE  30.06 
 
 		 203 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1859  phosphatase PhoE  30.06 
 
 		 203 aa  84  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.324195  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  26.95 
 
 		 209 aa  84.3  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  27.22 
 
 		 205 aa  83.6  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1849  phosphatase PhoE  30.46 
 
 		 203 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0488  fructose-2,6-bisphosphatase-like protein  27.75 
 
 		 207 aa  83.2  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2078  phosphoglycerate mutase  31.05 
 
 		 212 aa  83.6  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2076  phosphatase PhoE  30.23 
 
 		 205 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1894  phosphatase PhoE  29.48 
 
 		 203 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00837019  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  34.16 
 
 		 237 aa  82.8  0.000000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2113  phosphatase PhoE  29.48 
 
 		 203 aa  82.4  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0276195  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0590  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 196 aa  82.4  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.57208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2145  phosphatase PhoE  29.65 
 
 		 203 aa  81.6  0.000000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2034  phosphatase PhoE  28.9 
 
 		 203 aa  81.6  0.000000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3275  phosphatase PhoE  28.9 
 
 		 203 aa  81.6  0.000000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5889  bifunctional RNase H/acid phosphatase  31.84 
 
 		 427 aa  81.3  0.000000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00607  predicted alpha-ribazole-5'-P phosphatase  26.7 
 
 		 203 aa  80.5  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000725652  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 213 aa  80.5  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1414  phosphoglycerate mutase  30.68 
 
 		 195 aa  80.9  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0727  alpha-ribazole phosphatase  26.7 
 
 		 203 aa  80.5  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000487704  normal  0.192993 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0769  phosphoglycerate mutase  30.72 
 
 		 197 aa  80.9  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.578842  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00596  hypothetical protein  26.7 
 
 		 203 aa  80.5  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000603804  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1855  phosphoglycerate mutase  29.38 
 
 		 209 aa  80.5  0.00000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.54332  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3007  alpha-ribazole phosphatase  26.7 
 
 		 203 aa  79.7  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000150204  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5852  Phosphoglycerate mutase  32.93 
 
 		 197 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.415555  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0269  phosphoglycerate mutase  31.15 
 
 		 207 aa  79.7  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0664  alpha-ribazole phosphatase  26.7 
 
 		 203 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000732678  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0690  alpha-ribazole phosphatase  26.7 
 
 		 203 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194009  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  26.23 
 
 		 214 aa  79.3  0.00000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  30.12 
 
 		 209 aa  79  0.00000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  31.43 
 
 		 382 aa  78.6  0.00000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0511  6-phosphofructo-2-kinase  30.95 
 
 		 410 aa  78.6  0.00000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0045  phosphoglycerate mutase  29.52 
 
 		 217 aa  78.6  0.00000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.192648  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1007  Phosphoglycerate mutase  27.81 
 
 		 204 aa  78.2  0.00000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.628079 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3348  Phosphoglycerate mutase  32.18 
 
 		 223 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27148  hitchhiker  0.000518506 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  27.18 
 
 		 227 aa  77.4  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>