More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1459 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_1459  TonB-dependent receptor  100 
 
 
647 aa  1316    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.208108  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0963  TonB-dependent receptor  31.65 
 
 
614 aa  253  1e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1271  TonB-dependent receptor plug  29.11 
 
 
634 aa  233  9e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.732381  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1925  TonB-dependent receptor  27.24 
 
 
642 aa  219  8.999999999999998e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.55144  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3556  TonB-dependent receptor plug  27.32 
 
 
634 aa  218  2.9999999999999998e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000211979  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3340  TonB-dependent receptor, plug  26.63 
 
 
613 aa  209  1e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1065  TonB-dependent receptor  28.43 
 
 
611 aa  193  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.362217 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2402  putative TonB dependent vitamin B12 outer membrane receptor  28.2 
 
 
611 aa  192  2e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1957  TonB-dependent receptor, putative  26.26 
 
 
638 aa  188  3e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0488183  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  26.77 
 
 
646 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1004  TonB-dependent receptor  26.3 
 
 
618 aa  180  8e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0684927  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3189  TonB-dependent receptor, plug  24.88 
 
 
623 aa  177  6e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1012  TonB-dependent receptor  24.37 
 
 
626 aa  176  1.9999999999999998e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1382  TonB-dependent receptor  25.31 
 
 
655 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00890122  normal  0.0713693 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2063  TonB-dependent receptor  26.21 
 
 
645 aa  175  2.9999999999999996e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.785465  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1096  TonB-dependent receptor  24.2 
 
 
626 aa  172  2e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5676  TonB-dependent receptor plug  26.9 
 
 
662 aa  169  1e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2648  TonB-dependent receptor  24.71 
 
 
602 aa  169  2e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2547  TonB-dependent receptor plug  25.6 
 
 
615 aa  167  4e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.792273  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1110  TonB-dependent receptor  25.3 
 
 
625 aa  168  4e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000459108  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2368  TonB-dependent receptor, plug  24.84 
 
 
617 aa  167  5.9999999999999996e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.848515  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0628  Outer membrane cobalamin receptor protein-like  26.38 
 
 
638 aa  166  1.0000000000000001e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000288278  normal  0.81106 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2342  TonB-dependent receptor  25.81 
 
 
611 aa  166  1.0000000000000001e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.499314  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2621  TonB-dependent receptor, plug  24.64 
 
 
695 aa  165  3e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6079  putative TonB-dependent receptor  24.77 
 
 
680 aa  164  5.0000000000000005e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0972806  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0488  TonB-dependent receptor  25.35 
 
 
682 aa  164  5.0000000000000005e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2219  TonB-dependent receptor  24.04 
 
 
692 aa  164  6e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0123  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  25 
 
 
631 aa  162  2e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000105264  normal  0.11479 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3807  TonB-dependent receptor plug  24.3 
 
 
655 aa  162  2e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002156  outer membrane vitamin B12 receptor BtuB  24.75 
 
 
611 aa  160  7e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000122091  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1186  TonB-dependent receptor  24.09 
 
 
634 aa  160  7e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.874956  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0509  TonB-dependent outer membrane cobalamin receptor  23.18 
 
 
614 aa  160  8e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.194967  normal  0.193806 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2735  TonB-dependent receptor  23.94 
 
 
641 aa  159  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00964506  normal  0.0993289 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1162  tonB-dependent vitamin B12 receptor  25.72 
 
 
622 aa  159  2e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5290  TonB-dependent receptor plug  26.01 
 
 
673 aa  158  3e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3730  TonB-dependent receptor  25.91 
 
 
637 aa  158  4e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0159073  normal  0.0113192 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4372  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  26.47 
 
 
614 aa  157  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0258695  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4459  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  26.47 
 
 
614 aa  157  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0519388  hitchhiker  0.0000109547 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4341  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  26.47 
 
 
614 aa  157  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.139999  normal  0.582372 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4462  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  26.47 
 
 
614 aa  156  9e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0180001  hitchhiker  0.0000000000824718 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4536  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  26.3 
 
 
614 aa  155  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.329693  hitchhiker  0.0000000267555 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6080  putative TonB-dependent receptor  23.92 
 
 
690 aa  155  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.341343  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4770  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  25.25 
 
 
623 aa  154  4e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000262019  normal  0.0314633 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5430  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  26.25 
 
 
614 aa  154  4e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0043717  normal  0.0207602 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4413  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  26.25 
 
 
614 aa  154  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000903793  hitchhiker  0.00898611 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03647  TonB-dependent receptor  25 
 
 
640 aa  152  2e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00288042  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4020  TonB-dependent vitamin B12 receptor  25.91 
 
 
614 aa  151  3e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00348064  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4773  TonB-dependent receptor  22.92 
 
 
624 aa  151  3e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.386912  normal  0.53176 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0654  TonB-dependent receptor  26.8 
 
 
638 aa  151  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.561107  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4050  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  25.91 
 
 
614 aa  151  3e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00780594  decreased coverage  0.000540594 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1537  TonB-dependent receptor  23.04 
 
 
593 aa  149  1.0000000000000001e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00891985  normal  0.735799 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2886  putative outer membrane associated TonB dependent receptor  26.44 
 
 
618 aa  149  1.0000000000000001e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0141972  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1368  TonB-dependent receptor  25.29 
 
 
627 aa  149  2.0000000000000003e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.249969  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4073  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  26.18 
 
 
630 aa  147  4.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000943492  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1502  TonB-dependent receptor  26.22 
 
 
613 aa  147  4.0000000000000006e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0198  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  24.79 
 
 
631 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0194454  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0142  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  26.18 
 
 
630 aa  147  4.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000593825  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0192  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  24.83 
 
 
631 aa  147  5e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.051851  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2789  TonB-dependent receptor  26.33 
 
 
698 aa  145  3e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.973502 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2209  TonB-dependent receptor  24.79 
 
 
624 aa  144  4e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.400233 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3206  TonB-dependent receptor plug  25.52 
 
 
617 aa  144  4e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00965358  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0250  TonB-dependent receptor plug  25.26 
 
 
597 aa  144  6e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0132  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  22.93 
 
 
631 aa  144  7e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00107286  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2667  TonB-dependent receptor  23.97 
 
 
627 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0986558  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2514  TonB-dependent receptor  24.36 
 
 
632 aa  143  9.999999999999999e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47800  putative tonB-dependent receptor  24.17 
 
 
616 aa  141  3e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.173562  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33130  TonB-dependent vitamin B12 receptor  24.71 
 
 
1023 aa  141  3.9999999999999997e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6077  TonB-dependent receptor plug  23.18 
 
 
656 aa  141  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.762724  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2092  TonB-dependent receptor  23.22 
 
 
670 aa  141  4.999999999999999e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0812  TonB-dependent receptor plug  24.04 
 
 
659 aa  140  7.999999999999999e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.183722  normal  0.24775 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3735  TonB-dependent receptor plug  24.88 
 
 
628 aa  139  1e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000331916  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0969  outer membrane receptor for transport of vitamin B  28.24 
 
 
645 aa  139  2e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.01117 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1826  TonB-dependent receptor  24.33 
 
 
621 aa  137  5e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.568285  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0461  TonB-dependent vitamin B12 receptor  23.34 
 
 
613 aa  137  6.0000000000000005e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00224002  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2165  TonB-dependent vitamin B12 receptor  25.09 
 
 
616 aa  137  7.000000000000001e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0571  TonB-dependent receptor plug  23.93 
 
 
628 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.487741  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0852  TonB-dependent outer membrane receptor for Fe3+/colicin I  24.26 
 
 
633 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000258389  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0521  TonB-dependent receptor  25.09 
 
 
617 aa  134  6.999999999999999e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00261  phosphatidylglycerophosphatase  25.67 
 
 
617 aa  133  1.0000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02166  TonB-dependent outer membrane Receptor  25.17 
 
 
619 aa  132  2.0000000000000002e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0721  Outer membrane cobalamin receptor protein-like  23.84 
 
 
640 aa  131  4.0000000000000003e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2815  TonB-dependent receptor  22.66 
 
 
619 aa  130  5.0000000000000004e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.186668  normal  0.478128 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4119  TonB-dependent vitamin B12 receptor  24.24 
 
 
616 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0122  TonB-dependent receptor  24.84 
 
 
624 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1651  TonB-dependent receptor  26.26 
 
 
648 aa  129  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.613844 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2426  TonB-dependent receptor, plug  22.76 
 
 
652 aa  128  4.0000000000000003e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000164352  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1339  TonB-dependent receptor  22.61 
 
 
714 aa  127  4.0000000000000003e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.368228 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2400  outer membrane receptor protein  23.36 
 
 
621 aa  127  6e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.901841 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0834  vitamin B12 receptor BtuB, putative  23.98 
 
 
680 aa  127  6e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.162621  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1245  TonB-dependent receptor, plug  23.53 
 
 
636 aa  127  7e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0339996 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1028  putative TonB-dependent vitamin B12 receptor BtuB  24.2 
 
 
685 aa  126  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.15146  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1187  outer membrane receptor for transport of vitamin B  24.2 
 
 
821 aa  126  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.096047  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1926  TonB-dependent receptor  23.2 
 
 
627 aa  126  1e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.201933  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5373  TonB-dependent outer-membrane transporter  23.72 
 
 
661 aa  126  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0456572  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3886  TonB-dependent receptor  22.68 
 
 
642 aa  126  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.322303 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1035  putative TonB-dependent vitamin B12 receptor BtuB  24.2 
 
 
685 aa  126  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.127064  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1639  putative TonB-dependent vitamin B12 receptor BtuB  24.03 
 
 
685 aa  125  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.18341  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2327  putative TonB-dependent vitamin B12 receptor BtuB  24.03 
 
 
685 aa  125  3e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.52571  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2959  putative TonB-dependent vitamin B12 receptor BtuB  24.03 
 
 
685 aa  125  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3502  putative outer membrane cobalamin receptor, TonB dependent  23.33 
 
 
623 aa  124  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.86203  normal  0.929142 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>