72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1445 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_1445  flavocytochrome c heme subunit  100 
 
 		 153 aa  317  3e-86  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.390446  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2085  flavocytochrome c heme subunit  48.55 
 
 		 146 aa  137  4.999999999999999e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.952774  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1830  flavocytochrome c heme subunit  46.98 
 
 		 144 aa  128  3e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0137  fumarate reductase flavoprotein subunit  40 
 
 		 130 aa  70.1  0.00000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.100425  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04270  hypothetical protein  29.76 
 
 		 182 aa  64.7  0.0000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.379993  normal  0.356103 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1158  hypothetical protein  37.63 
 
 		 114 aa  62  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2430  tetraheme cytochrome c  33.83 
 
 		 135 aa  61.6  0.000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.439789  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1004  hypothetical protein  34.04 
 
 		 165 aa  60.8  0.000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3370  tetraheme cytochrome c  46.07 
 
 		 126 aa  60.8  0.000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.656549  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1491  tetraheme cytochrome c  42.05 
 
 		 127 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3056  tetraheme cytochrome c  43.53 
 
 		 127 aa  60.1  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0509  tetraheme cytochrome c  37.78 
 
 		 118 aa  57.4  0.00000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0342  tetraheme cytochrome c  41.38 
 
 		 126 aa  56.2  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2786  hypothetical protein  31.4 
 
 		 113 aa  55.1  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.12053 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2402  tetraheme cytochrome c, putative  35.06 
 
 		 122 aa  54.7  0.0000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3693  hypothetical protein  36.05 
 
 		 118 aa  54.3  0.0000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.799168  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0339  cytochrome c  35.8 
 
 		 116 aa  53.9  0.0000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3388  hypothetical protein  31.67 
 
 		 116 aa  53.9  0.0000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3617  hypothetical protein  37.21 
 
 		 137 aa  53.5  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1781  hypothetical protein  38.89 
 
 		 221 aa  53.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.531778  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1860  hypothetical protein  37.78 
 
 		 221 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2279  tetraheme cytochrome c  39.29 
 
 		 126 aa  52.8  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0855381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3683  hypothetical protein  37.21 
 
 		 137 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2229  tetraheme cytochrome c  32 
 
 		 117 aa  51.6  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.257402 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0942  hypothetical protein  32.22 
 
 		 172 aa  51.2  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3769  hypothetical protein  33.33 
 
 		 155 aa  51.2  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2152  tetraheme cytochrome c  32 
 
 		 117 aa  50.8  0.000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.738839  normal  0.0741814 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03150  hypothetical protein  34.48 
 
 		 186 aa  50.8  0.000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2892  hypothetical protein  43.28 
 
 		 122 aa  50.1  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2097  hypothetical protein  36.67 
 
 		 150 aa  49.7  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.206741  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4185  tetraheme cytochrome c, putative  37.97 
 
 		 122 aa  49.3  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.17754 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0255  tetraheme cytochrome c  36.14 
 
 		 101 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0257  tetraheme cytochrome c  35.8 
 
 		 117 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3625  flavocytochrome c  34.48 
 
 		 596 aa  48.9  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2535  tetraheme cytochrome c, putative  29.37 
 
 		 122 aa  48.9  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.091656  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0275  tetraheme cytochrome c, putative  36.36 
 
 		 122 aa  48.5  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000173309 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0274  tetraheme cytochrome c  35.8 
 
 		 117 aa  48.1  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010475 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3896  tetraheme cytochrome c  34.57 
 
 		 117 aa  48.1  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.486536  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3535  tetraheme cytochrome c  37.18 
 
 		 119 aa  47.8  0.00005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3776  flavocytochrome c  28.16 
 
 		 596 aa  47.8  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235124 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3877  succinate dehydrogenase  26.42 
 
 		 596 aa  47.8  0.00006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000270258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3182  hypothetical protein  29.47 
 
 		 118 aa  47.4  0.00006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0887  hypothetical protein  34.29 
 
 		 136 aa  47.8  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.590211  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0300  tetraheme cytochrome c, putative  35.06 
 
 		 123 aa  47.4  0.00008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.42786  normal  0.0669072 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3938  tetraheme cytochrome c  35.37 
 
 		 117 aa  47  0.00008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1413  tetraheme cytochrome c, putative  35.06 
 
 		 123 aa  47  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3623  tetraheme cytochrome c  36.36 
 
 		 116 aa  46.6  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0324  tetraheme cytochrome c, putative  35.06 
 
 		 122 aa  46.2  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3112  flavocytochrome c  26.85 
 
 		 596 aa  46.6  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000541974 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0276  tetraheme cytochrome c  35.37 
 
 		 117 aa  47  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000156346 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0946  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  31.78 
 
 		 122 aa  45.8  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0627  hypothetical protein  40 
 
 		 125 aa  45.4  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.593343 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2510  tetraheme cytochrome c  31.52 
 
 		 122 aa  45.1  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4179  tetraheme cytochrome c  33.33 
 
 		 120 aa  45.1  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.717177 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3300  cytochrome c  36.17 
 
 		 126 aa  45.1  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0722  flavocytochrome c  27.96 
 
 		 596 aa  44.7  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4127  flavocytochrome c  29.09 
 
 		 598 aa  44.3  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.431024 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0810  flavocytochrome c  34.21 
 
 		 589 aa  44.3  0.0006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3690  flavocytochrome c  27.37 
 
 		 583 aa  43.9  0.0007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3541  flavocytochrome c  29.17 
 
 		 589 aa  43.9  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000144139  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0611  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  29.33 
 
 		 593 aa  43.5  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2586  flavocytochrome c  39.66 
 
 		 588 aa  43.1  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0588  hypothetical protein  26 
 
 		 607 aa  43.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.221838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1444  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  34.44 
 
 		 114 aa  43.5  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000626372 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0299  hypothetical protein  29.25 
 
 		 627 aa  42.7  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0533  hypothetical protein  27.07 
 
 		 222 aa  43.1  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.738429  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1421  fumarate reductase flavoprotein subunit  27.96 
 
 		 589 aa  41.6  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0345  hypothetical protein  26.55 
 
 		 644 aa  41.2  0.006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3088  cytochrome c family protein  27.93 
 
 		 454 aa  41.2  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2201  cytochrome c family protein  33.78 
 
 		 456 aa  40.4  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.826403  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1031  cytochrome c family protein  31.43 
 
 		 459 aa  40.4  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1034  cytochrome c family protein  31.43 
 
 		 459 aa  40.4  0.009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>