More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1432 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_1432  chemotaxis sensory transducer  100 
 
 
546 aa  1098    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.138665  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0631  chemotaxis sensory transducer  45.03 
 
 
656 aa  285  1.0000000000000001e-75  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00821954  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1331  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.35 
 
 
563 aa  280  3e-74  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.158014  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0988  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.66 
 
 
652 aa  279  8e-74  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0112  chemotaxis sensory transducer  51.33 
 
 
563 aa  275  1.0000000000000001e-72  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0113  chemotaxis sensory transducer  51.49 
 
 
563 aa  275  2.0000000000000002e-72  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1039  protease htpx  44.03 
 
 
656 aa  265  1e-69  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0758551  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1826  chemotaxis sensory transducer  49.5 
 
 
650 aa  265  1e-69  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0840  cache domain-contain protein  47.83 
 
 
566 aa  263  6.999999999999999e-69  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.287851  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1932  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.64 
 
 
682 aa  261  2e-68  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2141  chemotaxis sensory transducer  43.5 
 
 
708 aa  261  3e-68  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1205  chemotaxis sensory transducer  39.13 
 
 
713 aa  249  9e-65  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1854  chemotaxis sensory transducer  43.3 
 
 
536 aa  241  2.9999999999999997e-62  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1860  chemotaxis sensory transducer  37.28 
 
 
533 aa  233  7.000000000000001e-60  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00521087  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1073  chemotaxis sensory transducer  40.88 
 
 
633 aa  229  1e-58  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00919731  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0819  chemotaxis sensory transducer  37.4 
 
 
627 aa  216  9.999999999999999e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.113637  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1930  chemotaxis sensory transducer  33.78 
 
 
625 aa  215  9.999999999999999e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0262  chemotaxis sensory transducer  38.37 
 
 
650 aa  214  2.9999999999999995e-54  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1178  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.6 
 
 
530 aa  212  1e-53  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1931  chemotaxis sensory transducer  38.19 
 
 
621 aa  205  1e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2035  putative transducer  36.62 
 
 
626 aa  179  9e-44  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2942  methyl-accepting chemotaxis protein  28.63 
 
 
544 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1391  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.93 
 
 
557 aa  158  3e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2710  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.48 
 
 
581 aa  150  7e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.196378 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0529  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.6 
 
 
544 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0209  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.56 
 
 
658 aa  147  6e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.603066  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1202  chemotaxis sensory transducer  34.49 
 
 
380 aa  145  1e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0197  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.79 
 
 
542 aa  144  4e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3611  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.6 
 
 
540 aa  144  4e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2779  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.4 
 
 
566 aa  143  7e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0160  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.14 
 
 
513 aa  143  8e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1418  chemotaxis sensory transducer  25.99 
 
 
541 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0377  Nitrate and nitrite sensing domain protein  31.25 
 
 
661 aa  142  9.999999999999999e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.000413313  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1955  methyl-accepting chemotaxis protein  26.69 
 
 
685 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1197  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.3 
 
 
582 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.118848  hitchhiker  0.00410847 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2263  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.73 
 
 
525 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.284544  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1077  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.27 
 
 
369 aa  141  3e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000998008  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0683  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  29.74 
 
 
568 aa  139  1e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.268569  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0627  methyl-accepting chemotaxis protein  28.94 
 
 
616 aa  139  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.202062  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2013  methyl-accepting chemotaxis protein  29.21 
 
 
634 aa  139  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0559  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.12 
 
 
773 aa  139  1e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1884  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.44 
 
 
547 aa  139  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.114501  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0719  methyl-accepting chemotaxis protein  28.94 
 
 
616 aa  139  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.152122  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2773  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.86 
 
 
540 aa  139  2e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1221  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.83 
 
 
564 aa  137  6.0000000000000005e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000139892  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1439  methyl-accepting chemotaxis protein  27.16 
 
 
571 aa  136  8e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.181327  hitchhiker  0.0000921474 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1434  chemotaxis sensory transducer  33.69 
 
 
530 aa  136  9e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0379  methyl-accepting chemotaxis protein  27.88 
 
 
579 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0793  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.9 
 
 
582 aa  136  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.291791 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2263  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.95 
 
 
541 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1098  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.95 
 
 
637 aa  135  3e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0167241  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0466  methyl-accepting chemotaxis protein  27.87 
 
 
541 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2828  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.43 
 
 
550 aa  134  5e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000014913 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1674  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.9 
 
 
543 aa  134  6e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1653  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.65 
 
 
372 aa  133  6e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.409493  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3311  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.49 
 
 
547 aa  134  6e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.691655  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2845  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.63 
 
 
549 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000597879  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3580  methyl-accepting chemotaxis protein  26.49 
 
 
546 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0931  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.3 
 
 
541 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.476721 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1608  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.87 
 
 
558 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0982  domain of unknown function DUF1745  48.85 
 
 
666 aa  131  3e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.505903  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0948  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.84 
 
 
587 aa  131  3e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.352371 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0897  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.27 
 
 
541 aa  131  3e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2112  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.92 
 
 
571 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3441  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.27 
 
 
541 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3719  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.18 
 
 
540 aa  130  6e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2634  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  26.73 
 
 
542 aa  130  7.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.917034  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2782  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.65 
 
 
601 aa  130  7.000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.163256  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0516  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.06 
 
 
664 aa  130  8.000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0344435  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0798  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.99 
 
 
541 aa  129  9.000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0821  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.49 
 
 
545 aa  129  9.000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000877148  hitchhiker  0.00000558474 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0619  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.51 
 
 
634 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1434  methyl-accepting chemotaxis protein  26.45 
 
 
543 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1630  chemotaxis sensory transducer  25.68 
 
 
541 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0250136 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2961  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.09 
 
 
542 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0581  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.44 
 
 
562 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0281709  decreased coverage  0.00474558 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0397  methyl-accepting chemotaxis protein  61.32 
 
 
655 aa  129  1.0000000000000001e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1409  methyl-accepting chemotaxis protein  61.32 
 
 
655 aa  129  1.0000000000000001e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0395  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase (UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanine synthetase)  62.26 
 
 
663 aa  129  1.0000000000000001e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1561  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.4 
 
 
528 aa  129  2.0000000000000002e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1373  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.4 
 
 
571 aa  129  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3611  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.61 
 
 
634 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0934  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.25 
 
 
667 aa  128  3e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0921  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.18 
 
 
541 aa  128  3e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0612  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.84 
 
 
543 aa  128  3e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2091  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.91 
 
 
541 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.596764  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2579  methyl-accepting chemotaxis protein  26.38 
 
 
543 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0447  chemotaxis sensory transducer  26.63 
 
 
541 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3063  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.81 
 
 
533 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.378908  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1035  methyl-accepting chemotaxis protein  29.69 
 
 
549 aa  127  5e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.640997  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5569  methyl-accepting chemotaxis protein  25.54 
 
 
541 aa  127  5e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0680  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.81 
 
 
679 aa  127  5e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3356  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.25 
 
 
667 aa  127  5e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.386472  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2119  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.47 
 
 
548 aa  127  6e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2647  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.11 
 
 
554 aa  127  6e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.910941  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0549  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.76 
 
 
640 aa  127  6e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.43692  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4053  methyl-accepting chemotaxis protein  30.49 
 
 
634 aa  126  9e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3378  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.04 
 
 
563 aa  126  9e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.104618  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6319  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.91 
 
 
549 aa  126  9e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.249944  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19740  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.51 
 
 
667 aa  126  9e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>