93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1420 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_1420  prophage maintenance system killer protein (DOC)  100 
 
 
192 aa  391  1e-108  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0194  hypothetical protein  50 
 
 
319 aa  177  9e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2013  death-on-curing protein  46.71 
 
 
330 aa  163  1.0000000000000001e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0381  death-on-curing family protein  42.77 
 
 
332 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1798  hypothetical protein  41.8 
 
 
197 aa  162  3e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.520115  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0280  death-on-curing protein  42.53 
 
 
329 aa  160  1e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000133606 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0834  death-on-curing family protein  41.21 
 
 
324 aa  159  2e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.674738 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0685  death-on-curing family protein  41.21 
 
 
324 aa  159  2e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3598  death-on-curing family protein  44.89 
 
 
328 aa  159  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1373  death-on-curing protein  43.72 
 
 
336 aa  157  1e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.726784 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2487  hypothetical protein  57.85 
 
 
345 aa  155  3e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1636  death-on-curing family protein  41.24 
 
 
334 aa  151  4e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00686859  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1567  putative DNA-binding protein  55 
 
 
356 aa  150  1e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0208212  unclonable  0.0000160594 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4009  hypothetical protein  56 
 
 
340 aa  150  1e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2570  hypothetical protein  41.85 
 
 
210 aa  150  1e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0259  hypothetical protein  43.26 
 
 
334 aa  149  2e-35  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0243  hypothetical protein  48.59 
 
 
353 aa  146  1.0000000000000001e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1126  RhuM  43.65 
 
 
328 aa  142  2e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0996  death-on-curing family protein  43.82 
 
 
326 aa  142  4e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1123  death-on-curing protein  40.66 
 
 
333 aa  141  6e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.637266 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1805  death-on-curing protein  37.91 
 
 
337 aa  141  7e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3012  hypothetical protein  53.23 
 
 
331 aa  140  9.999999999999999e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.410222  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0687  putative DNA-binding protein  52.03 
 
 
342 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.30359  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0879  death-on-curing family protein  37.57 
 
 
330 aa  135  2e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.445143 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4076  hypothetical protein  49.58 
 
 
341 aa  129  3e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1490  hypothetical protein  52.14 
 
 
344 aa  128  6e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.507722  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0032  putative cytoplasmic protein  48.33 
 
 
341 aa  127  8.000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0367  hypothetical protein  49.18 
 
 
339 aa  127  9.000000000000001e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0969  hypothetical protein  40.56 
 
 
281 aa  125  3e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1340  virulence protein  41.1 
 
 
334 aa  125  4.0000000000000003e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0360  death-on-curing family protein  37.65 
 
 
198 aa  124  6e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1087  DNA-binding protein  47.33 
 
 
141 aa  123  2e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.251597 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0294  hypothetical protein  42.36 
 
 
337 aa  122  3e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0428  hypothetical protein  43.24 
 
 
340 aa  122  4e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1091  virulence protein-like protein  48.36 
 
 
332 aa  120  9.999999999999999e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2347  putative DNA-binding protein  44.8 
 
 
338 aa  117  9.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.169677  normal  0.0120651 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1469  death-on-curing protein  36.57 
 
 
327 aa  117  9.999999999999999e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.285933  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3353  virulence protein  38.78 
 
 
336 aa  116  1.9999999999999998e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0319779  normal  0.0105196 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0007  putative DNA-binding protein  42.06 
 
 
336 aa  116  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.341702  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1215  hypothetical protein  39.55 
 
 
344 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0513  putative DNA-binding protein  45.31 
 
 
291 aa  115  3.9999999999999997e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.63298  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0998  hypothetical protein  43.7 
 
 
356 aa  112  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000328283 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1487  hypothetical protein  39.33 
 
 
358 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.011312  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2422  hypothetical protein  41.6 
 
 
334 aa  112  5e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.419078  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0131  DNA-binding protein  39.86 
 
 
335 aa  111  8.000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.413083 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3721  putative DNA-binding protein  44.17 
 
 
352 aa  111  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.299367  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3988  putative cytoplasmic protein  45.9 
 
 
344 aa  110  9e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1866  putative DNA-binding protein  42.52 
 
 
335 aa  108  3e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1180  virulence protein-like protein  32.95 
 
 
354 aa  108  7.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0828  hypothetical protein  43.86 
 
 
355 aa  107  9.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0966  hypothetical protein  43.86 
 
 
355 aa  107  9.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.248022  normal  0.835513 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4371  hypothetical protein  41.73 
 
 
343 aa  107  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.634323 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0596  hypothetical protein  40.15 
 
 
342 aa  105  5e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3664  putative DNA-binding protein  38.03 
 
 
343 aa  103  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.676016 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1093  hypothetical protein  41.27 
 
 
342 aa  102  3e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2544  hypothetical protein  42.5 
 
 
127 aa  102  5e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.712716  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1889  hypothetical protein  40.98 
 
 
369 aa  101  6e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0598  hypothetical protein  35.57 
 
 
333 aa  101  6e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52340  cytoplasmic protein  34.97 
 
 
357 aa  100  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0348  hypothetical protein  40.74 
 
 
342 aa  99.8  2e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.0000520981  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2655  hypothetical protein  39.02 
 
 
352 aa  99.4  3e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1273  hypothetical protein  41.67 
 
 
126 aa  99  4e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2497  hypothetical protein  41.23 
 
 
351 aa  99  4e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0074171  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4145  virulence protein  38.52 
 
 
345 aa  98.6  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.373189  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4082  virulence protein  38.52 
 
 
345 aa  99  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.276809  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0891  hypothetical protein  36.07 
 
 
359 aa  98.6  5e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  unclonable  0.00000000006304  unclonable  0.000000000000289019 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1214  hypothetical protein  39.84 
 
 
342 aa  98.2  7e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4168  hypothetical protein  37.5 
 
 
366 aa  97.1  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2189  hypothetical protein  40.35 
 
 
353 aa  97.1  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3119  putative DNA-binding protein  35.94 
 
 
342 aa  95.9  3e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0640  hypothetical protein  40.35 
 
 
352 aa  95.9  3e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.914788  normal  0.827759 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4765  hypothetical protein  37.7 
 
 
344 aa  96.3  3e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4641  hypothetical protein  34.9 
 
 
333 aa  95.9  4e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1243  hypothetical protein  39.47 
 
 
353 aa  94.4  9e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.568171  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0354  hypothetical protein  37.72 
 
 
352 aa  94  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2815  hypothetical protein  36.36 
 
 
344 aa  94  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.213356  normal  0.859247 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2041  hypothetical protein  37.7 
 
 
350 aa  93.6  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2605  virulence protein  36.3 
 
 
365 aa  94  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4094  hypothetical protein  36.89 
 
 
256 aa  92.8  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0656  putative virulence protein  36.75 
 
 
135 aa  88.2  6e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0746  hypothetical protein  36.52 
 
 
350 aa  84.3  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.126739 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1500  hypothetical protein  34.15 
 
 
242 aa  81.3  0.000000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.510294 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0293  putative cytoplasmic protein  33.04 
 
 
361 aa  78.2  0.00000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2318  Virulence protein-like protein  38 
 
 
121 aa  78.2  0.00000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0821  DNA-binding protein  47.83 
 
 
164 aa  75.5  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.496709  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0644  hypothetical protein  36.45 
 
 
144 aa  74.3  0.0000000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.628012  normal  0.733979 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1011  hypothetical protein  44.93 
 
 
81 aa  63.5  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000108458  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1749  DNA-binding protein  34.88 
 
 
90 aa  62  0.000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3988  death-on-curing family protein  46.3 
 
 
55 aa  53.9  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0780  Virulence protein-like protein  40.98 
 
 
108 aa  52.8  0.000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3008  hypothetical protein  39.29 
 
 
77 aa  45.1  0.0006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.610277  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2024  hypothetical protein  33.96 
 
 
88 aa  43.1  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.454055 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1807  HTH-type DNA-binding domain/DOC/FIC domain-containing protein  37.5 
 
 
81 aa  43.5  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>