More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1378 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_1378  NUDIX hydrolase  100 
 
 
156 aa  319  9.000000000000001e-87  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000389327  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0668  dinucleoside polyphosphate hydrolase  63.46 
 
 
156 aa  218  3e-56  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0684  dinucleoside polyphosphate hydrolase  62.18 
 
 
156 aa  215  2e-55  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0609  dinucleoside polyphosphate hydrolase  62.18 
 
 
156 aa  215  2e-55  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1088  dinucleoside polyphosphate hydrolase  62.18 
 
 
156 aa  214  2e-55  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1117  dinucleoside polyphosphate hydrolase  63.46 
 
 
156 aa  212  9.999999999999999e-55  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000062607  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0998  dinucleoside polyphosphate hydrolase  60.53 
 
 
154 aa  199  9.999999999999999e-51  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.393526  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1571  dinucleoside polyphosphate hydrolase  64.47 
 
 
154 aa  197  3.9999999999999996e-50  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2017  dinucleoside polyphosphate hydrolase  55.92 
 
 
154 aa  197  6e-50  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00712308  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1651  dinucleoside polyphosphate hydrolase  61.33 
 
 
156 aa  191  4e-48  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.057152  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1230  NUDIX hydrolase  43.75 
 
 
165 aa  121  3e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.310052  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2457  NUDIX hydrolase  43.05 
 
 
168 aa  110  9e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.815124  normal  0.223342 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2509  dinucleoside polyphosphate hydrolase  42.11 
 
 
163 aa  108  4.0000000000000004e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.815631  normal  0.83484 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2173  NUDIX hydrolase  43.36 
 
 
176 aa  107  6e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.573949  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1831  NUDIX hydrolase  43.36 
 
 
174 aa  107  6e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.246744  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0092  NUDIX hydrolase  41.06 
 
 
160 aa  106  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0201302  normal  0.41925 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0582  dinucleoside polyphosphate hydrolase  42.31 
 
 
134 aa  106  1e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00967  dinucleoside polyphosphate hydrolase  41.56 
 
 
172 aa  104  4e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004431  adenosine (5')-pentaphospho-(5'')-adenosine pyrophosphohydrolase  41.56 
 
 
173 aa  104  4e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000169211  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2984  dinucleoside polyphosphate hydrolase  38.82 
 
 
162 aa  104  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.848091  normal  0.14985 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2930  NUDIX hydrolase  38.75 
 
 
167 aa  104  4e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.36611  normal  0.994412 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0569  dinucleoside polyphosphate hydrolase  40.26 
 
 
170 aa  104  5e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0412118  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3917  NUDIX hydrolase  41.06 
 
 
158 aa  104  5e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2590  dinucleoside polyphosphate hydrolase  39.74 
 
 
162 aa  103  7e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0931  dinucleoside polyphosphate hydrolase  39.07 
 
 
162 aa  102  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.906348  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0429  dinucleoside polyphosphate hydrolase  40.82 
 
 
159 aa  102  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.741123  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0901  dinucleoside polyphosphate hydrolase  38.56 
 
 
164 aa  102  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04390  dinucleoside polyphosphate hydrolase  40.82 
 
 
159 aa  102  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.164877  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2110  dinucleoside polyphosphate hydrolase  38.82 
 
 
183 aa  100  9e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.326827  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0203  dinucleoside polyphosphate hydrolase  40 
 
 
193 aa  100  1e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0645  dinucleoside polyphosphate hydrolase  41.22 
 
 
182 aa  99.8  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000308205  normal  0.147139 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2145  dinucleoside polyphosphate hydrolase  38.36 
 
 
172 aa  100  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.69652 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0542  (di)nucleoside polyphosphate hydrolase  40.79 
 
 
159 aa  99  2e-20  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.411915  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0199  dinucleoside polyphosphate hydrolase  38.85 
 
 
199 aa  99  2e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48240  dinucleoside polyphosphate hydrolase  39.22 
 
 
159 aa  97.8  4e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3020  dinucleoside polyphosphate hydrolase  36.08 
 
 
167 aa  97.8  4e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.614658  normal  0.0272519 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0382  NUDIX hydrolase  36.67 
 
 
153 aa  97.1  8e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1000  NUDIX hydrolase  40.14 
 
 
165 aa  96.3  1e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000136038  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5053  dinucleoside polyphosphate hydrolase  38.56 
 
 
159 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.483238  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2123  dinucleoside polyphosphate hydrolase  37.41 
 
 
172 aa  96.3  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0183314  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5146  dinucleoside polyphosphate hydrolase  38.56 
 
 
159 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.834479 
 
 
-
 
NC_002978  WD1119  dinucleoside polyphosphate hydrolase  33.12 
 
 
162 aa  96.3  2e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0217  dinucleoside polyphosphate hydrolase  38.22 
 
 
197 aa  95.9  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.269428 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5199  dinucleoside polyphosphate hydrolase  38.56 
 
 
159 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0319  dinucleoside polyphosphate hydrolase  38.56 
 
 
159 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.263917 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5285  mutT/nudix family protein  37.91 
 
 
159 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2931  dinucleoside polyphosphate hydrolase  40.82 
 
 
175 aa  95.1  3e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2785  dinucleoside polyphosphate hydrolase  40.82 
 
 
175 aa  95.1  3e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4843  dinucleoside polyphosphate hydrolase  37.91 
 
 
159 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5378  dinucleoside polyphosphate hydrolase  38.56 
 
 
159 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.290228  normal  0.0209843 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1755  NUDIX hydrolase  41.18 
 
 
161 aa  95.1  3e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0638574  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1550  NUDIX hydrolase  40 
 
 
158 aa  95.1  3e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.979768  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3272  dinucleoside polyphosphate hydrolase  37.01 
 
 
176 aa  95.1  3e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000105899  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1261  dinucleoside polyphosphate hydrolase  38.67 
 
 
174 aa  94.7  4e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000399476  normal  0.124645 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1228  dinucleoside polyphosphate hydrolase  38.67 
 
 
174 aa  94.7  4e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000133704  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3129  dinucleoside polyphosphate hydrolase  38.67 
 
 
174 aa  94.7  4e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000022986  normal  0.998128 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1184  dinucleoside polyphosphate hydrolase  38.67 
 
 
174 aa  94.7  4e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000515571  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4218  dinucleoside polyphosphate hydrolase  38.1 
 
 
159 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2865  dinucleoside polyphosphate hydrolase  38.67 
 
 
174 aa  94.4  5e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000404837  normal  0.876176 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2947  dinucleoside polyphosphate hydrolase  38.67 
 
 
174 aa  94.4  5e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000622219  normal  0.254979 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2577  NUDIX hydrolase  38.1 
 
 
193 aa  94.4  6e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2393  dinucleoside polyphosphate hydrolase  38.78 
 
 
221 aa  94  7e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.783924  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0427  dinucleoside polyphosphate hydrolase  40.82 
 
 
181 aa  94  7e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.751341  normal  0.0128679 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3101  dinucleoside polyphosphate hydrolase  38.16 
 
 
241 aa  94  8e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1132  dinucleoside polyphosphate hydrolase  39.22 
 
 
172 aa  94  8e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000912913  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5482  dinucleoside polyphosphate hydrolase  38.1 
 
 
229 aa  93.6  9e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.540126  normal  0.57899 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1142  dinucleoside polyphosphate hydrolase  38 
 
 
174 aa  93.6  9e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000333704  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1228  dinucleoside polyphosphate hydrolase  36.73 
 
 
197 aa  93.6  9e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00110033  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0845  dinucleoside polyphosphate hydrolase  36.84 
 
 
229 aa  93.2  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.206164  normal  0.713637 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3709  dinucleoside polyphosphate hydrolase  36.54 
 
 
206 aa  93.2  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.24468  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3671  dinucleoside polyphosphate hydrolase  36.84 
 
 
226 aa  93.6  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.017529  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0814  dinucleoside polyphosphate hydrolase  38.78 
 
 
176 aa  93.2  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0198094  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0774  dinucleoside polyphosphate hydrolase  36.84 
 
 
229 aa  93.2  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3043  dinucleoside polyphosphate hydrolase  38 
 
 
174 aa  93.2  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000556575  normal  0.544281 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0573  dinucleoside polyphosphate hydrolase  38.1 
 
 
203 aa  92.8  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.454249 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2817  dinucleoside polyphosphate hydrolase  37.5 
 
 
238 aa  92.8  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0131722  normal  0.240142 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1331  dinucleoside polyphosphate hydrolase  37.33 
 
 
174 aa  92.4  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1227  dinucleoside polyphosphate hydrolase  37.91 
 
 
173 aa  92.8  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000249848  hitchhiker  0.00278569 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0746  dinucleoside polyphosphate hydrolase  36.18 
 
 
235 aa  92.4  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00235884 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0449  dinucleoside polyphosphate hydrolase  38.1 
 
 
187 aa  92  2e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0852291  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0642  NUDIX hydrolase  35.85 
 
 
179 aa  92.8  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0138031 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3241  dinucleoside polyphosphate hydrolase  37.01 
 
 
175 aa  92.8  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000341046  normal  0.0858473 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0981  dinucleoside polyphosphate hydrolase  37.01 
 
 
175 aa  92.8  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  3.12815e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1033  dinucleoside polyphosphate hydrolase  37.01 
 
 
175 aa  92.8  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000236129  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2945  dinucleoside polyphosphate hydrolase  37.25 
 
 
172 aa  92  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.019417  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3748  dinucleoside polyphosphate hydrolase  38.1 
 
 
161 aa  92.8  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0251963 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02678  dinucleoside polyphosphate hydrolase  37.01 
 
 
176 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000336855  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0861  NUDIX hydrolase  37.01 
 
 
176 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000117938  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4096  dinucleoside polyphosphate hydrolase  37.01 
 
 
176 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000580084  hitchhiker  0.00923204 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0885  dinucleoside polyphosphate hydrolase  37.01 
 
 
176 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000193658  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3032  dinucleoside polyphosphate hydrolase  38 
 
 
176 aa  91.7  3e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  9.33004e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3151  dinucleoside polyphosphate hydrolase  37.01 
 
 
176 aa  92  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000021359  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0347  (di)nucleoside polyphosphate hydrolase, putative  36.99 
 
 
170 aa  92  3e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.163328  normal  0.0864315 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03710  dinucleoside polyphosphate hydrolase  40.91 
 
 
162 aa  92  3e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.626729  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3217  dinucleoside polyphosphate hydrolase  37.01 
 
 
176 aa  92  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000360016  hitchhiker  0.00252549 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3846  dinucleoside polyphosphate hydrolase  39.33 
 
 
174 aa  91.7  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3168  dinucleoside polyphosphate hydrolase  37.01 
 
 
176 aa  92  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000367916  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2976  dinucleoside polyphosphate hydrolase  37.01 
 
 
176 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.85852e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2977  dinucleoside polyphosphate hydrolase  37.01 
 
 
176 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000000801466  hitchhiker  0.0062852 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3150  dinucleoside polyphosphate hydrolase  37.01 
 
 
176 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000288941  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>