More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1377 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_1377  aspartate kinase  100 
 
 
400 aa  808  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  3.78473e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0610  aspartate kinase  77.56 
 
 
400 aa  618  1e-176  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1087  aspartate kinase  76.06 
 
 
400 aa  611  1e-174  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0685  aspartate kinase  77.06 
 
 
400 aa  613  1e-174  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.985937  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1570  aspartate kinase  75.25 
 
 
399 aa  608  1e-173  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2018  aspartate kinase  75 
 
 
399 aa  610  1e-173  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  7.59653e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1650  aspartate kinase  73.95 
 
 
403 aa  599  1e-170  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00485759  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0999  aspartate kinase  70.65 
 
 
401 aa  574  1e-162  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.419107  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1116  aspartate kinase  73.33 
 
 
404 aa  564  1e-159  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  unclonable  2.16352e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0669  aspartate kinase  74 
 
 
400 aa  563  1e-159  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3627  aspartate kinase  58.17 
 
 
413 aa  458  1e-128  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  9.37685e-05  decreased coverage  1.09716e-07 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4611  aspartate kinase  56.93 
 
 
412 aa  455  1e-127  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0927  aspartate kinase  57.07 
 
 
413 aa  456  1e-127  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3762  aspartate kinase  56.82 
 
 
411 aa  456  1e-127  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.216913  normal  0.392085 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2515  aspartate kinase  58.17 
 
 
406 aa  454  1e-126  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00310544  normal  0.299295 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1006  aspartate kinase  59.95 
 
 
410 aa  454  1e-126  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  4.23126e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3978  aspartate kinase  56.33 
 
 
411 aa  454  1e-126  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1880  aspartate kinase  60.35 
 
 
405 aa  453  1e-126  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  2.66682e-14  hitchhiker  8.23679e-05 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52580  aspartate kinase  56.68 
 
 
412 aa  452  1e-126  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1442  aspartate kinase  56.33 
 
 
411 aa  450  1e-125  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0731797  normal  0.880113 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2902  aspartate kinase  57.18 
 
 
424 aa  449  1e-125  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34450  aspartate kinase  56.08 
 
 
411 aa  450  1e-125  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0250796  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3555  aspartate kinase  55.83 
 
 
410 aa  449  1e-125  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00961214  normal  0.594079 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4473  aspartate kinase  56.33 
 
 
411 aa  450  1e-125  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.246043 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1843  aspartate kinase, monofunctional class  55.83 
 
 
410 aa  449  1e-125  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.369756  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0966  aspartate kinase  58.17 
 
 
412 aa  449  1e-125  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00725941  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1799  aspartate kinase  58.6 
 
 
405 aa  451  1e-125  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00100247  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0969  aspartate kinase  57.49 
 
 
409 aa  447  1e-124  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0390  aspartate kinase  56.79 
 
 
409 aa  445  1e-124  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0358  aspartate kinase  57.86 
 
 
410 aa  445  1e-124  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00114688  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0407  aspartate kinase, monofunctional class  56.61 
 
 
408 aa  444  1e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0571  aspartate kinase  56.61 
 
 
408 aa  444  1e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4274  aspartate kinase  55.8 
 
 
413 aa  442  1e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  9.67452e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2318  aspartate kinase  59.1 
 
 
407 aa  443  1e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  2.67569e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1300  aspartate kinase  54.32 
 
 
408 aa  439  1e-122  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  1.8313e-10  normal  0.0162978 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1290  aspartate kinase  56.72 
 
 
409 aa  437  1e-121  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.686916  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3379  aspartate kinase  55.25 
 
 
410 aa  436  1e-121  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  1.24538e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1264  aspartate kinase  58.06 
 
 
404 aa  434  1e-120  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  2.23474e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3019  aspartate kinase  58.1 
 
 
405 aa  432  1e-120  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0567  aspartate kinase  55.88 
 
 
408 aa  432  1e-120  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.475671  normal  0.793189 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2531  aspartate kinase  56.61 
 
 
404 aa  430  1e-119  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  2.1173e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1589  aspartate kinase  54.93 
 
 
408 aa  429  1e-119  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  2.53157e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1639  aspartate kinase  52.04 
 
 
428 aa  421  1e-117  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  1.45942e-05  hitchhiker  0.000682871 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1461  aspartate kinase  52.16 
 
 
428 aa  422  1e-117  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  3.57046e-13  hitchhiker  3.74387e-05 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2262  aspartate kinase  56.36 
 
 
404 aa  424  1e-117  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  1.47386e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1480  aspartate kinase  56.11 
 
 
416 aa  422  1e-117  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.630457  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1613  aspartate kinase  55.33 
 
 
414 aa  418  1e-116  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.805125  normal  0.584087 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1044  aspartate kinase  54.89 
 
 
411 aa  417  1e-115  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0773  aspartate kinase  54.73 
 
 
406 aa  412  1e-114  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0117085  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0743  aspartate kinase  55.83 
 
 
406 aa  411  1e-114  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1652  aspartate kinase  54.98 
 
 
416 aa  412  1e-114  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2048  aspartate kinase  52.36 
 
 
409 aa  413  1e-114  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.122311  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04060  aspartate kinase  52.87 
 
 
427 aa  412  1e-114  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.53456 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1251  aspartate kinase  53.25 
 
 
408 aa  410  1e-113  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.545654 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3191  aspartate kinase  51.23 
 
 
412 aa  409  1e-113  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2452  aspartate kinase  53.85 
 
 
453 aa  409  1e-113  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.459441  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3086  aspartate kinase  55.02 
 
 
422 aa  409  1e-113  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0135  aspartate kinase  52.83 
 
 
411 aa  409  1e-113  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0420777  normal  0.197945 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1674  aspartate kinase  54.44 
 
 
422 aa  410  1e-113  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.998246 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1941  aspartate kinase  54.32 
 
 
409 aa  409  1e-113  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.122463  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0787  aspartate kinase  53.75 
 
 
404 aa  410  1e-113  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4503  aspartate kinase  53.17 
 
 
418 aa  406  1e-112  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0573198 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0966  aspartate kinase  53.6 
 
 
418 aa  406  1e-112  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0227813  hitchhiker  0.000505058 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0626  aspartate kinase  54.43 
 
 
414 aa  407  1e-112  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  1.47671e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0276  aspartate kinase  53.62 
 
 
409 aa  407  1e-112  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.067186 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1832  aspartate kinase  54.46 
 
 
410 aa  407  1e-112  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.722812  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0370  aspartate kinase  50.72 
 
 
417 aa  404  1e-111  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2702  aspartate kinase  51.24 
 
 
426 aa  403  1e-111  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1743  aspartate kinase  53.98 
 
 
419 aa  404  1e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.557086  normal  0.669364 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1370  aspartate kinase  53.62 
 
 
407 aa  400  1e-110  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4947  aspartate kinase  50.37 
 
 
412 aa  401  1e-110  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.599309  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2324  aspartate kinase  53.35 
 
 
423 aa  400  1e-110  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.752292  hitchhiker  0.000104056 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2173  aspartate kinase  52.36 
 
 
417 aa  401  1e-110  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1141  aspartate kinase  49.88 
 
 
411 aa  399  1e-110  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4940  aspartate kinase  52.52 
 
 
422 aa  400  1e-110  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.43762  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1353  aspartate kinase  53.35 
 
 
422 aa  400  1e-110  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0422902  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1034  aspartate kinase  49.76 
 
 
423 aa  397  1e-109  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0654239  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1167  aspartate kinase  50.62 
 
 
412 aa  396  1e-109  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  8.35866e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1008  aspartate kinase  52 
 
 
405 aa  398  1e-109  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2086  aspartate kinase  53.33 
 
 
422 aa  395  1e-109  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0950022  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08040  aspartate kinase  50.62 
 
 
427 aa  397  1e-109  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  8.87302e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1075  aspartate kinase  52.87 
 
 
410 aa  398  1e-109  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.352103  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1628  aspartate kinase  53.33 
 
 
422 aa  395  1e-109  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.539935 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2117  aspartate kinase  51.87 
 
 
404 aa  393  1e-108  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.203177 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2889  aspartate kinase  53.11 
 
 
422 aa  392  1e-108  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.428464  normal  0.0547466 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2860  aspartate kinase  53.35 
 
 
422 aa  392  1e-108  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3001  aspartate kinase  50.95 
 
 
424 aa  392  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.363596  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1612  aspartate kinase  49.76 
 
 
427 aa  392  1e-108  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  4.35622e-10  hitchhiker  1.29841e-08 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2511  aspartate kinase  52.39 
 
 
421 aa  390  1e-107  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.628463  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2625  aspartate kinase  51.33 
 
 
419 aa  390  1e-107  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.347653 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1304  aspartate kinase  51.12 
 
 
405 aa  388  1e-107  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.506172 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1562  aspartate kinase  53.3 
 
 
411 aa  391  1e-107  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.633798 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1934  aspartate kinase  49.75 
 
 
412 aa  388  1e-107  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.167611 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3519  aspartate kinase  54.86 
 
 
405 aa  391  1e-107  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0949457  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0574  aspartate kinase  48.76 
 
 
407 aa  389  1e-107  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2061  aspartokinase  49.02 
 
 
412 aa  385  1e-106  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.227299  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0132  aspartate kinase  51.34 
 
 
417 aa  386  1e-106  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.143811 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0921  aspartate kinase  51.6 
 
 
411 aa  387  1e-106  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.507077 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1979  aspartate kinase  53.12 
 
 
417 aa  386  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.28482  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1427  aspartate kinase  53.12 
 
 
416 aa  385  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>