More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1359 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_1359  GrpE protein  100 
 
 		 186 aa  372  1e-102  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000141941  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0150  co-chaperone GrpE  50 
 
 		 179 aa  172  1.9999999999999998e-42  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0073017  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2045  co-chaperone GrpE  49.73 
 
 		 180 aa  165  2.9999999999999998e-40  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00817363  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0849  heat shock protein GrpE  49.69 
 
 		 175 aa  160  1e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0774  heat shock protein GrpE  48.17 
 
 		 176 aa  152  2.9999999999999998e-36  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.142311  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1259  heat shock protein GrpE  46.95 
 
 		 176 aa  147  8e-35  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.481119  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1120  co-chaperone GrpE  44.1 
 
 		 194 aa  144  5e-34  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0675757  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1090  co-chaperone GrpE  46.36 
 
 		 173 aa  141  4e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000331967  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0936  heat shock protein GrpE  47.47 
 
 		 169 aa  141  5e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0941203  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1643  GrpE protein  46.67 
 
 		 185 aa  140  9.999999999999999e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000000000120336  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0012  heat shock protein GrpE  40.59 
 
 		 208 aa  118  3.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.976347  hitchhiker  0.000405819 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0069  GrpE protein  45.32 
 
 		 217 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.311586  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1857  GrpE protein  39.51 
 
 		 185 aa  117  6e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4214  heat shock protein GrpE  37.5 
 
 		 188 aa  117  9e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.121908  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4052  heat shock protein GrpE  37.5 
 
 		 188 aa  117  9e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00116461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4062  heat shock protein GrpE  37.5 
 
 		 188 aa  117  9e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4337  heat shock protein GrpE  37.5 
 
 		 188 aa  117  9e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.21014e-34 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4540  heat shock protein GrpE  37.5 
 
 		 188 aa  117  9e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.002362  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0802  heat shock protein GrpE  37.5 
 
 		 188 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000114529  hitchhiker  2.29846e-19 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4434  heat shock protein GrpE  37.5 
 
 		 188 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000213644  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2533  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.86 
 
 		 217 aa  116  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4166  heat shock protein GrpE  36.7 
 
 		 188 aa  115  3e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0177219  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0704  heat shock protein GrpE  40.12 
 
 		 184 aa  115  5e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.94046  hitchhiker  0.000436359 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4728  heat shock protein GrpE  43.51 
 
 		 185 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.079881  hitchhiker  0.00247949 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0399  heat shock protein GrpE  40.27 
 
 		 204 aa  114  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3041  heat shock protein GrpE  40.67 
 
 		 198 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.004999  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4729  heat shock protein GrpE  42.33 
 
 		 184 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2184  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.26 
 
 		 207 aa  112  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0403299  normal  0.673418 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4448  heat shock protein GrpE  39.63 
 
 		 192 aa  112  3e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000207397  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3544  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.72 
 
 		 204 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.741634 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1035  GrpE protein  43.05 
 
 		 189 aa  112  4.0000000000000004e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00038029  hitchhiker  0.000654048 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1146  GrpE protein  40.94 
 
 		 226 aa  111  5e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.702649  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2438  GrpE protein  38.82 
 
 		 208 aa  111  5e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0240587  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4594  heat shock protein GrpE  41.56 
 
 		 185 aa  112  5e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.243186 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0008  heat shock protein GrpE  39.87 
 
 		 210 aa  111  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0916725 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0415  GrpE protein  41.96 
 
 		 202 aa  111  5e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4396  heat shock protein GrpE  40 
 
 		 192 aa  110  9e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0382773  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02254  heat shock protein GrpE  41.32 
 
 		 211 aa  110  1.0000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.781248  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2080  heat shock protein GrpE  40.88 
 
 		 195 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0383  Ribulose-phosphate 3-epimerase  36.36 
 
 		 202 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0929159  normal  0.322075 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2812  GrpE protein  38.41 
 
 		 210 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0237715  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1012  heat shock protein GrpE  38.56 
 
 		 213 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2666  co-chaperone GrpE  39.38 
 
 		 171 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.832748  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2292  GrpE protein  39.38 
 
 		 171 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0174464 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1713  heat shock protein GrpE  40.37 
 
 		 179 aa  110  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.385192  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0821  heat shock protein GrpE  35.83 
 
 		 192 aa  109  2.0000000000000002e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.085613  normal  0.503339 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0008  heat shock protein GrpE  39.74 
 
 		 210 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000108771 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0336  ribulose-phosphate 3-epimerase  36.36 
 
 		 202 aa  108  3e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1639  heat shock protein GrpE  38.67 
 
 		 208 aa  108  4.0000000000000004e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.980219  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1673  heat shock protein GrpE  38.67 
 
 		 208 aa  108  4.0000000000000004e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0666687  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1149  heat shock protein GrpE  36.75 
 
 		 210 aa  108  5e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.67207  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0165  heat shock protein GrpE  41.45 
 
 		 205 aa  108  6e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.261628  normal  0.409706 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0509  GrpE protein  37.87 
 
 		 210 aa  107  7.000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.552704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0736  heat shock protein GrpE  39.22 
 
 		 194 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.273487  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42980  heat shock protein GrpE  38.46 
 
 		 187 aa  106  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5482  heat shock protein GrpE  39.22 
 
 		 189 aa  107  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.601194  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0032  heat shock protein GrpE  42.03 
 
 		 200 aa  106  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2635  heat shock protein GrpE  39.31 
 
 		 181 aa  106  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0667  heat shock protein GrpE  40 
 
 		 181 aa  106  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.151401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3506  heat shock protein GrpE  42.75 
 
 		 188 aa  106  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.175972  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1485  heat shock protein GrpE  35.63 
 
 		 182 aa  106  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0644  heat shock protein GrpE  40 
 
 		 181 aa  106  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0162  heat shock protein GrpE  38.56 
 
 		 204 aa  106  2e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0498  heat shock protein GrpE  37.93 
 
 		 185 aa  105  3e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.755488  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2328  heat shock protein GrpE  37.93 
 
 		 185 aa  105  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1101  heat shock protein GrpE  37.93 
 
 		 185 aa  105  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.322152  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3313  heat shock protein GrpE  37.93 
 
 		 185 aa  105  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3324  heat shock protein GrpE  37.93 
 
 		 185 aa  105  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3837  heat shock protein GrpE  40 
 
 		 181 aa  105  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1306  heat shock protein GrpE  37.93 
 
 		 178 aa  105  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3575  heat shock protein GrpE  42.03 
 
 		 186 aa  105  3e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2208  heat shock protein GrpE  37.93 
 
 		 185 aa  105  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3280  heat shock protein GrpE  37.93 
 
 		 185 aa  105  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.135957  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3533  heat shock protein GrpE  38.57 
 
 		 189 aa  105  5e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00974284  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0171  heat shock protein GrpE  38.85 
 
 		 230 aa  104  7e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0719  heat shock protein GrpE  39.31 
 
 		 181 aa  104  7e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.76077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0266  heat shock protein GrpE  39.31 
 
 		 181 aa  104  7e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0750  heat shock protein GrpE  39.31 
 
 		 181 aa  104  7e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.680261  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0180  heat shock protein GrpE  38.93 
 
 		 228 aa  104  8e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0599175  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1253  GrpE protein  35.5 
 
 		 181 aa  103  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.329053 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0165  heat shock protein GrpE  38.85 
 
 		 230 aa  103  1e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.507974  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2656  GrpE protein  36.84 
 
 		 186 aa  103  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.23931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1004  heat shock protein GrpE  38.32 
 
 		 180 aa  103  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.324391 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4506  heat shock protein GrpE  37.82 
 
 		 187 aa  103  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.316473  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3330  heat shock protein GrpE  40.27 
 
 		 209 aa  103  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000166428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0869  GrpE protein  34.25 
 
 		 186 aa  102  2e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.555049  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1970  GrpE protein  38.24 
 
 		 187 aa  103  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000003831  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0210  heat shock protein GrpE  41.3 
 
 		 199 aa  102  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000213319  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3125  heat shock protein GrpE  38.22 
 
 		 186 aa  103  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00453853  normal  0.177698 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0705  GrpE protein  36.48 
 
 		 190 aa  103  2e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0594473  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5230  heat shock protein GrpE  38.06 
 
 		 181 aa  103  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62990  heat shock protein GrpE  37.91 
 
 		 186 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.142705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2880  Fis family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 186 aa  102  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4196  heat shock protein GrpE  37.97 
 
 		 187 aa  102  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00395445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1219  putative chaperone protein GrpE (heat shock protein)  35.1 
 
 		 189 aa  102  3e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0108  heat shock protein nucleotide exchange factor GrpE  39.57 
 
 		 198 aa  102  3e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000378149  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2570  heat shock protein GrpE  39.61 
 
 		 178 aa  102  3e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1405  GrpE protein  34.9 
 
 		 190 aa  102  4e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1040  heat shock protein GrpE  39.07 
 
 		 184 aa  102  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2126  GrpE protein  36.6 
 
 		 200 aa  102  4e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.743495  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>