238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1319 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_1319  Rubrerythrin  100 
 
 		 216 aa  447  1e-125  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000115937  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0081  rubrerythrin  76.74 
 
 		 215 aa  348  5e-95  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1910  enolase (2-phosphoglycerate dehydratase; 2-phospho-D-glycerate hydro-lyase)  70.7 
 
 		 214 aa  319  1.9999999999999998e-86  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00000289321  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0011  rubrerythrin  77.05 
 
 		 183 aa  298  3e-80  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0012  rubrerythrin  77.05 
 
 		 183 aa  298  3e-80  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000245189  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0038  rubrerythrin  76.5 
 
 		 183 aa  297  7e-80  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0308291  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0323  rubrerythrin  62.5 
 
 		 215 aa  272  3e-72  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.280139  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1286  rubrerythrin  42.93 
 
 		 191 aa  153  2e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0599979  hitchhiker  0.000011253 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1869  Rubrerythrin  46.63 
 
 		 179 aa  150  1e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.390232  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2235  Rubrerythrin  42.13 
 
 		 392 aa  148  7e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00102881  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2313  Rubrerythrin  42.78 
 
 		 178 aa  145  5e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000307395  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1910  Rubrerythrin  44.51 
 
 		 178 aa  144  8.000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.43857 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2379  rubrerythrin  42.55 
 
 		 191 aa  144  8.000000000000001e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0439288  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0972  rubrerythrin  42.25 
 
 		 194 aa  144  1e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.367114  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1657  rubrerythrin  42.78 
 
 		 194 aa  143  2e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0195  rubrerythrin  45.56 
 
 		 192 aa  143  3e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.766512 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0860  rubrerythrin  39.9 
 
 		 197 aa  142  5e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.069269  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2346  rubrerythrin  42.22 
 
 		 190 aa  141  8e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000333134  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0524  rubrerythrin  45.88 
 
 		 179 aa  141  9e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08560  rubrerythrin  46.15 
 
 		 179 aa  140  9.999999999999999e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.249013 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0256  rubrerythrin  41.71 
 
 		 194 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0999  hypothetical protein  46.75 
 
 		 180 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0268457  normal  0.36555 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12020  rubrerythrin  41.1 
 
 		 221 aa  139  3e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000256435  normal  0.664088 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2797  rubrerythrin  41.24 
 
 		 178 aa  139  4.999999999999999e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.31636e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1311  rubrerythrin  41.11 
 
 		 190 aa  137  1e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.395984  normal  0.0129823 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2716  Rubrerythrin  41.11 
 
 		 190 aa  137  2e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.275247 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2367  Rubrerythrin  41.54 
 
 		 191 aa  136  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.565711 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3459  Rubrerythrin  43.89 
 
 		 192 aa  136  3.0000000000000003e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1986  Rubrerythrin  44.97 
 
 		 177 aa  135  4e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.079110000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1036  rubrerythrin  43.79 
 
 		 179 aa  135  5e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.264339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0009  rubrerythrin  40 
 
 		 191 aa  134  9.999999999999999e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.195637  hitchhiker  0.00235505 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0847  rubrerythrin  44.97 
 
 		 179 aa  134  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0490534  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0840  rubrerythrin  44.97 
 
 		 179 aa  134  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0543  rubrerythrin  43.79 
 
 		 178 aa  134  9.999999999999999e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.37944  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2277  rubrerythrin  41.11 
 
 		 190 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.197935  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2613  rubrerythrin  41.99 
 
 		 191 aa  132  6e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000875235  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1668  Rubrerythrin  40.22 
 
 		 233 aa  131  6.999999999999999e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.428689 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1565  rubrerythrin  40.64 
 
 		 194 aa  131  6.999999999999999e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0163  Rubrerythrin  44.97 
 
 		 178 aa  131  7.999999999999999e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000002418  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0122  Rubrerythrin  43.1 
 
 		 181 aa  131  7.999999999999999e-30  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000148271  normal  0.250808 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2647  rubrerythrin  38.1 
 
 		 191 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000377128  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0667  rubrerythrin  38.3 
 
 		 191 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.946538 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0938  periplasmic [Fe] hydrogenase 1  43.2 
 
 		 696 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0625857  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2072  Rubrerythrin  42.05 
 
 		 191 aa  129  3e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.813169  normal  0.122422 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1680  Rubrerythrin  40.56 
 
 		 188 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0670  rubrerythrin  44.97 
 
 		 179 aa  129  5.0000000000000004e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0740275  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12890  rubrerythrin  42.94 
 
 		 179 aa  128  8.000000000000001e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.199021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1965  rubrerythrin  38.1 
 
 		 191 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00228469  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0285  rubrerythrin  37.95 
 
 		 191 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.026265 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0382  Rubrerythrin  40.44 
 
 		 194 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000024183  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2814  rubrerythrin  38.89 
 
 		 190 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.773613  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3252  rubrerythrin  37.57 
 
 		 191 aa  127  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.63877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2264  Rubrerythrin  40.11 
 
 		 196 aa  126  3e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0219984  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1076  [Fe] hydrogenase  42.6 
 
 		 696 aa  126  3e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.723256  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1797  Rubrerythrin  40 
 
 		 192 aa  125  5e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0136768  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1222  rubrerythrin  38.1 
 
 		 191 aa  125  5e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000672055  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0102  Rubrerythrin  41.95 
 
 		 172 aa  125  5e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000956858  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0133  rubrerythrin  40.56 
 
 		 195 aa  124  1e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000905635  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1538  rubrerythrin  40.45 
 
 		 178 aa  124  1e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0174784  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0132  rubrerythrin  40.56 
 
 		 195 aa  124  1e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1331  rubrerythrin  40.45 
 
 		 178 aa  124  1e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0282824  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1657  Rubrerythrin  41.21 
 
 		 196 aa  122  4e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0633  Rubrerythrin  38.89 
 
 		 191 aa  122  4e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000654398  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2212  rubrerythrin  44.97 
 
 		 177 aa  122  5e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0893  Rubrerythrin  35.14 
 
 		 194 aa  121  9e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.180396  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0434  rubrerythrin  39.01 
 
 		 191 aa  120  1.9999999999999998e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0325  rubrerythrin  37.43 
 
 		 195 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.560367  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1205  Rubrerythrin  40 
 
 		 192 aa  118  9e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.521926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0385  rubrerythrin  44.05 
 
 		 165 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2276  rubrerythrin  36.16 
 
 		 190 aa  115  3.9999999999999997e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.430774 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0897  Rubrerythrin  40.94 
 
 		 167 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000170126  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0406  rubrerythrin/rubredoxin  41.92 
 
 		 165 aa  108  6e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1320  rubrerythrin, putative  39.88 
 
 		 165 aa  107  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000383486  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1978  rubrerythrin  42.24 
 
 		 166 aa  107  2e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.603623  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2197  Rubrerythrin  42.07 
 
 		 166 aa  106  3e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3282  rubrerythrin  39.64 
 
 		 166 aa  105  5e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000199245  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1185  Rubrerythrin  35.76 
 
 		 164 aa  105  7e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000958071  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_349  rubrerythrin/rubredoxin  41.32 
 
 		 165 aa  104  8e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0818  Rubrerythrin  42.59 
 
 		 166 aa  103  1e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0782088  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1247  Rubrerythrin  37.8 
 
 		 165 aa  103  1e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2740  rubrerythrin  39.18 
 
 		 173 aa  103  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1646  Rubrerythrin  40.25 
 
 		 166 aa  102  4e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.636053 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3154  rubrerythrin  39.26 
 
 		 166 aa  101  8e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0916  rubrerythrin  38.89 
 
 		 165 aa  101  9e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2624  rubrerythrin  40.88 
 
 		 168 aa  101  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0940  rubrerythrin  41.52 
 
 		 164 aa  101  1e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.828203  normal  0.659027 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3175  Rubrerythrin  39.88 
 
 		 164 aa  100  2e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.738943 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0583  rubrerythrin  39.16 
 
 		 166 aa  99.8  3e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0179451  normal  0.228925 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19080  Rubrerythrin  33.7 
 
 		 185 aa  99.8  3e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00100041  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0082  rubrerythrin  39.77 
 
 		 167 aa  99.4  3e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0168  rubrerythrin  38.92 
 
 		 166 aa  98.6  7e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.364022  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0743  rubrerythrin  38.46 
 
 		 165 aa  97.4  1e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2460  Rubrerythrin  41.07 
 
 		 166 aa  97.8  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1794  Rubrerythrin  39.76 
 
 		 168 aa  96.3  3e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000201822  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1606  rubrerythrin  34.07 
 
 		 185 aa  95.5  6e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0475668  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0668  rubrerythrin  36.84 
 
 		 166 aa  95.1  7e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.807065 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0955  Rubrerythrin  38.32 
 
 		 166 aa  94  2e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2474  Rubrerythrin  39.51 
 
 		 164 aa  93.6  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1044  rubrerythrin  39.08 
 
 		 163 aa  93.6  2e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1571  rubrerythrin  38.82 
 
 		 166 aa  94  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>