More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1289 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003912  CJE0855  arginine decarboxylase  71.38 
 
 		 611 aa  917    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1248  arginine decarboxylase  70.89 
 
 		 610 aa  912    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000273662  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1273  arginine decarboxylase  71.26 
 
 		 611 aa  911    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0487343  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1132  arginine decarboxylase  61.12 
 
 		 609 aa  793    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1289  arginine decarboxylase  100 
 
 		 616 aa  1261    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00657697  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0926  arginine decarboxylase  69.84 
 
 		 613 aa  893    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.355796  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0746  arginine decarboxylase  70.94 
 
 		 609 aa  922    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.274472  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0895  arginine decarboxylase  72.74 
 
 		 613 aa  923    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.262836  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0785  arginine decarboxylase  71.22 
 
 		 610 aa  914    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00102058  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2839  arginine decarboxylase  38.67 
 
 		 647 aa  442  1e-123  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3114  arginine decarboxylase  38.83 
 
 		 630 aa  438  1e-121  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.188561 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1771  arginine decarboxylase  40 
 
 		 706 aa  438  1e-121  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0026  arginine decarboxylase  37.14 
 
 		 650 aa  414  1e-114  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1675  arginine decarboxylase  37.95 
 
 		 635 aa  408  1.0000000000000001e-112  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00247787  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2606  arginine decarboxylase  38.13 
 
 		 635 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.455337  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1309  arginine decarboxylase  38.05 
 
 		 635 aa  405  1e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000212107 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2916  arginine decarboxylase  38.05 
 
 		 635 aa  405  1e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2537  arginine decarboxylase  37.69 
 
 		 635 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3789  arginine decarboxylase  37.35 
 
 		 636 aa  398  1e-109  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2097  arginine decarboxylase  37.42 
 
 		 636 aa  396  1e-109  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0904  arginine decarboxylase  37.52 
 
 		 635 aa  397  1e-109  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000284288 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0983  arginine decarboxylase  37.32 
 
 		 635 aa  393  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1536  arginine decarboxylase  36.14 
 
 		 643 aa  392  1e-107  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.649083  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3423  arginine decarboxylase  34.82 
 
 		 671 aa  387  1e-106  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1037  arginine decarboxylase  35.2 
 
 		 647 aa  383  1e-105  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.919876 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3349  arginine decarboxylase  35.73 
 
 		 659 aa  382  1e-105  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0843  arginine decarboxylase  35.73 
 
 		 659 aa  382  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0845  arginine decarboxylase  35.73 
 
 		 659 aa  382  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1846  arginine decarboxylase  35.19 
 
 		 669 aa  383  1e-105  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1119  arginine decarboxylase  36.82 
 
 		 639 aa  380  1e-104  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.139662  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2068  arginine decarboxylase  35.04 
 
 		 654 aa  382  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1658  arginine decarboxylase  36.95 
 
 		 645 aa  380  1e-104  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.944199  normal  0.0506092 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3934  arginine decarboxylase  35.25 
 
 		 655 aa  380  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.532155  normal  0.948508 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1983  arginine decarboxylase  35.04 
 
 		 654 aa  382  1e-104  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.119208  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3973  arginine decarboxylase  35.62 
 
 		 658 aa  378  1e-103  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0550  arginine decarboxylase  35.29 
 
 		 657 aa  377  1e-103  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.314322  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0508  arginine decarboxylase  35.13 
 
 		 658 aa  378  1e-103  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.595355  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1896  arginine decarboxylase  34.71 
 
 		 654 aa  379  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.907046  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2840  arginine decarboxylase  35.56 
 
 		 634 aa  376  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177287 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4038  arginine decarboxylase  34.94 
 
 		 679 aa  379  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.781244 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3124  arginine decarboxylase  34.09 
 
 		 627 aa  377  1e-103  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.791613  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3903  arginine decarboxylase  34.75 
 
 		 659 aa  373  1e-102  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0317541  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2057  arginine decarboxylase  34.59 
 
 		 637 aa  375  1e-102  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.126213  normal  0.137004 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3466  arginine decarboxylase  34.58 
 
 		 645 aa  374  1e-102  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.348577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3344  arginine decarboxylase  34.92 
 
 		 658 aa  373  1e-102  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0227178 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1698  arginine decarboxylase  34.85 
 
 		 636 aa  375  1e-102  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2480  arginine decarboxylase  34.12 
 
 		 637 aa  372  1e-102  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.46516  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2609  arginine decarboxylase  35.05 
 
 		 637 aa  374  1e-102  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.901624  normal  0.151183 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3333  arginine decarboxylase  34.92 
 
 		 632 aa  372  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.104142 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02768  arginine decarboxylase  34.59 
 
 		 658 aa  369  1e-101  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0756  arginine decarboxylase  34.59 
 
 		 658 aa  369  1e-101  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1619  arginine decarboxylase  34.59 
 
 		 637 aa  372  1e-101  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000092888  normal  0.0751508 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1761  arginine decarboxylase  35.6 
 
 		 637 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0168893  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1870  arginine decarboxylase  35.22 
 
 		 637 aa  370  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3281  arginine decarboxylase  34.59 
 
 		 658 aa  369  1e-101  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3249  arginine decarboxylase  34.92 
 
 		 632 aa  372  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.225168  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3371  arginine decarboxylase  34.59 
 
 		 658 aa  369  1e-101  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.575173  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2517  arginine decarboxylase  35.6 
 
 		 637 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.977379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1650  arginine decarboxylase  34.79 
 
 		 681 aa  369  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1805  arginine decarboxylase  35.44 
 
 		 637 aa  369  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0026532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0773  arginine decarboxylase  34.59 
 
 		 658 aa  369  1e-101  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00439854 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3096  arginine decarboxylase  34.59 
 
 		 658 aa  369  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3081  arginine decarboxylase  34.59 
 
 		 632 aa  369  1e-101  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.602145  hitchhiker  0.00168239 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1598  arginine decarboxylase  36.12 
 
 		 639 aa  372  1e-101  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0503845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2280  arginine decarboxylase  35.08 
 
 		 636 aa  370  1e-101  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000837435  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3260  arginine decarboxylase  34.92 
 
 		 632 aa  372  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.55052 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1964  arginine decarboxylase  34.72 
 
 		 660 aa  371  1e-101  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.015476  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3325  arginine decarboxylase  34.92 
 
 		 632 aa  372  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.591958  normal  0.70504 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3430  arginine decarboxylase  34.92 
 
 		 632 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000516135 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4241  arginine decarboxylase  34.59 
 
 		 632 aa  369  1e-101  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02731  hypothetical protein  34.59 
 
 		 658 aa  369  1e-101  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3706  arginine decarboxylase  34.75 
 
 		 660 aa  371  1e-101  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0526106  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1768  arginine decarboxylase  35.6 
 
 		 637 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0174014  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1647  arginine decarboxylase  35.38 
 
 		 637 aa  369  1e-101  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4842  biosynthetic arginine decarboxylase  34.84 
 
 		 637 aa  366  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.540433  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1557  arginine decarboxylase  35.28 
 
 		 637 aa  368  1e-100  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1632  arginine decarboxylase  35.28 
 
 		 637 aa  368  1e-100  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.386766  normal  0.0176215 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0072  arginine decarboxylase  33.6 
 
 		 628 aa  367  1e-100  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1624  arginine decarboxylase  35.06 
 
 		 637 aa  367  1e-100  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0743651 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1963  arginine decarboxylase  35.24 
 
 		 636 aa  368  1e-100  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.143441 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0727  arginine decarboxylase  34.52 
 
 		 637 aa  365  1e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.594395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0557  arginine decarboxylase  34.21 
 
 		 629 aa  365  1e-99  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.321507  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1677  arginine decarboxylase  33.18 
 
 		 681 aa  365  2e-99  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.814883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3873  arginine decarboxylase  35.71 
 
 		 642 aa  365  2e-99  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2321  arginine decarboxylase  35.47 
 
 		 655 aa  363  4e-99  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2513  arginine decarboxylase  36.38 
 
 		 642 aa  362  1e-98  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.494839 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1142  arginine decarboxylase  32.59 
 
 		 693 aa  360  3e-98  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.344888  hitchhiker  0.00702994 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4381  arginine decarboxylase  34.19 
 
 		 637 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2172  arginine decarboxylase  35.01 
 
 		 642 aa  359  9.999999999999999e-98  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00521  arginine decarboxylase  35.52 
 
 		 648 aa  358  1.9999999999999998e-97  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.234716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03894  arginine decarboxylase  34.45 
 
 		 639 aa  357  2.9999999999999997e-97  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.0027527  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4598  arginine decarboxylase  34.52 
 
 		 637 aa  356  7.999999999999999e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0659709 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0606  arginine decarboxylase  34.68 
 
 		 637 aa  355  1e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0567  arginine decarboxylase  34.52 
 
 		 637 aa  355  2e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.390352  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0612  arginine decarboxylase  34.52 
 
 		 637 aa  354  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0473517 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0861  arginine decarboxylase  35.34 
 
 		 637 aa  353  4e-96  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.221481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0627  arginine decarboxylase  34.35 
 
 		 637 aa  353  8e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.424029 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0901  arginine decarboxylase  35.63 
 
 		 638 aa  352  1e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000100122  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00481  arginine decarboxylase  33.33 
 
 		 648 aa  352  2e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0419  arginine decarboxylase  34.34 
 
 		 661 aa  351  2e-95  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00340731  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>