More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1267 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_1267  queuine tRNA-ribosyltransferase  100 
 
 
373 aa  780    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0980  queuine tRNA-ribosyltransferase  72.31 
 
 
374 aa  587  1e-167  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0907  queuine tRNA-ribosyltransferase  72.04 
 
 
372 aa  581  1.0000000000000001e-165  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1172  queuine tRNA-ribosyltransferase  71.16 
 
 
372 aa  569  1e-161  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0584  queuine tRNA-ribosyltransferase  70.62 
 
 
373 aa  566  1e-160  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0414152  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0093  queuine tRNA-ribosyltransferase  72.51 
 
 
376 aa  566  1e-160  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0899534  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1432  queuine tRNA-ribosyltransferase  68.67 
 
 
388 aa  552  1e-156  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0681966  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1090  queuine tRNA-ribosyltransferase  70.24 
 
 
373 aa  548  1e-155  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.50041  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1028  queuine tRNA-ribosyltransferase  70.51 
 
 
373 aa  549  1e-155  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0779  queuine tRNA-ribosyltransferase  69.97 
 
 
373 aa  545  1e-154  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.113002  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2026  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.55 
 
 
407 aa  412  1e-114  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0521  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.7 
 
 
371 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2844  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.59 
 
 
377 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1259  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.72 
 
 
379 aa  400  9.999999999999999e-111  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.527316  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2757  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.88 
 
 
386 aa  397  1e-109  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.717518 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0579  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.91 
 
 
370 aa  395  1e-109  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.350695  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2619  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.33 
 
 
373 aa  392  1e-108  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0852  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.79 
 
 
370 aa  392  1e-108  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1694  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.58 
 
 
373 aa  392  1e-108  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.556038 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0530  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.97 
 
 
373 aa  391  1e-108  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00176978  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2435  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.28 
 
 
372 aa  390  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1782  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.83 
 
 
372 aa  390  1e-107  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00114635 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0632  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.27 
 
 
392 aa  388  1e-107  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1894  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.84 
 
 
355 aa  387  1e-106  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.3829100000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1457  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.55 
 
 
375 aa  388  1e-106  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000844701  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2243  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.34 
 
 
375 aa  384  1e-105  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.982522 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2518  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.75 
 
 
380 aa  378  1e-104  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00624233  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4502  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.2 
 
 
379 aa  378  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000575969  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0907  queuine tRNA-ribosyltransferase  50 
 
 
372 aa  380  1e-104  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4312  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.2 
 
 
379 aa  378  1e-104  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000048864  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4150  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.2 
 
 
379 aa  378  1e-104  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000148017  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4161  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.2 
 
 
379 aa  378  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000310592  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4264  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.03 
 
 
379 aa  380  1e-104  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000851523  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12290  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.18 
 
 
373 aa  379  1e-104  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000356741  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3134  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.48 
 
 
379 aa  380  1e-104  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.212476  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4497  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.2 
 
 
379 aa  378  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000628432 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4647  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.2 
 
 
379 aa  378  1e-104  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000256565  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4551  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.2 
 
 
379 aa  378  1e-104  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000170513  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4536  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.2 
 
 
379 aa  378  1e-104  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000578318  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0699  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.2 
 
 
379 aa  378  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000227158  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0605  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.56 
 
 
395 aa  381  1e-104  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.522263 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00354  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.26 
 
 
375 aa  377  1e-103  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.520405  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3203  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.26 
 
 
375 aa  377  1e-103  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.372376  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1203  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.58 
 
 
379 aa  375  1e-103  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.261953  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1716  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.72 
 
 
371 aa  376  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.2965  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00358  hypothetical protein  48.26 
 
 
375 aa  377  1e-103  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.575633  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0325  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.26 
 
 
375 aa  377  1e-103  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0436  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.26 
 
 
375 aa  377  1e-103  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0451  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.53 
 
 
375 aa  375  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0945287  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3227  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.26 
 
 
375 aa  377  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000187089 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0444  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.53 
 
 
375 aa  375  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2011  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.25 
 
 
380 aa  377  1e-103  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.638578  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0505  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.53 
 
 
375 aa  375  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0476  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.26 
 
 
375 aa  377  1e-103  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0445  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.53 
 
 
375 aa  375  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0710  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.53 
 
 
376 aa  377  1e-103  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0438  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.26 
 
 
375 aa  377  1e-103  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1729  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.86 
 
 
379 aa  375  1e-103  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.37523  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1696  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.86 
 
 
379 aa  375  1e-103  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0464  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.53 
 
 
375 aa  375  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.992026  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0486  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.26 
 
 
375 aa  377  1e-103  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0565  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.47 
 
 
373 aa  377  1e-103  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.005662  normal  0.744875 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0514  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.4 
 
 
370 aa  372  1e-102  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2109  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.03 
 
 
379 aa  374  1e-102  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1315  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.21 
 
 
376 aa  372  1e-102  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2214  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.26 
 
 
374 aa  374  1e-102  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00238944  normal  0.155586 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0930  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.81 
 
 
380 aa  371  1e-102  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0958  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.92 
 
 
374 aa  373  1e-102  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0452051  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1120  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.04 
 
 
369 aa  371  1e-101  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0231453  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1524  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.77 
 
 
383 aa  369  1e-101  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000558338  normal  0.0203734 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2906  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.72 
 
 
387 aa  369  1e-101  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.905549  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1406  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.79 
 
 
374 aa  369  1e-101  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.937214  normal  0.212389 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1666  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.49 
 
 
370 aa  369  1e-101  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.098612  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0931  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.49 
 
 
394 aa  370  1e-101  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0875  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.72 
 
 
375 aa  369  1e-101  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.68635  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1187  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.05 
 
 
384 aa  368  1e-101  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00200873  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2647  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.46 
 
 
381 aa  370  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000956702  hitchhiker  0.00180241 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3622  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.37 
 
 
372 aa  367  1e-100  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00110996  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1305  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.39 
 
 
371 aa  366  1e-100  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1703  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.5 
 
 
383 aa  367  1e-100  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.108277  normal  0.62465 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0049  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.91 
 
 
392 aa  366  1e-100  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0707792  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1428  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.18 
 
 
369 aa  368  1e-100  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00175971  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0218  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.04 
 
 
376 aa  366  1e-100  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.989201  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2068  Queuine tRNA-ribosyltransferase  47.72 
 
 
371 aa  364  1e-99  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3097  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.38 
 
 
387 aa  364  1e-99  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.141745  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0270  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.92 
 
 
379 aa  364  1e-99  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.147453  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0052  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.63 
 
 
392 aa  364  2e-99  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3278  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.79 
 
 
369 aa  363  2e-99  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.275264  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1927  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.24 
 
 
383 aa  363  2e-99  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000713351  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3264  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.65 
 
 
374 aa  363  3e-99  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000400897  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3123  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.65 
 
 
374 aa  363  3e-99  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00561158  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3384  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.65 
 
 
374 aa  363  3e-99  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000344335  normal  0.488605 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1800  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.89 
 
 
374 aa  363  3e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1061  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.65 
 
 
374 aa  363  4e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00184616 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3520  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.85 
 
 
377 aa  362  4e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.1241  normal  0.323798 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01046  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.65 
 
 
378 aa  363  4e-99  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2435  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.31 
 
 
375 aa  362  5.0000000000000005e-99  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_52  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.03 
 
 
392 aa  362  5.0000000000000005e-99  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000223938  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2702  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.72 
 
 
374 aa  362  5.0000000000000005e-99  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000654614  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2484  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.45 
 
 
374 aa  362  7.0000000000000005e-99  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000574895  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>